Result of SIM4 for
pF1KSDA1438
seq1 = pF1KSDA1438.tfa, 2793 bp
seq2 = pF1KSDA1438/gi568815576r_40311393.tfa (gi568815576r:40311393_40535554), 224162 bp
>pF1KSDA1438 2793
>gi568815576r:40311393_40535554 (Chr22)
(complement)
1-63 (99996-100056) 93% ->
64-139 (104075-104150) 100% ->
140-301 (105788-105949) 100% ->
302-477 (111174-111349) 100% ->
478-627 (111870-112019) 100% ->
628-881 (114455-114708) 100% ->
882-1053 (114979-115150) 100% ->
1054-2064 (116171-117181) 100% ->
2065-2217 (118062-118214) 100% ->
2218-2278 (118509-118569) 100% ->
2279-2793 (123648-124162) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCGCCTTTGAAAAGTCCAGCCGCATTTCATGAGCAGAGAAGGAGCTT
| -| ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99996 AA CAGC TTTGAAAAGTCCAGCCGCATTTCATGAGCAGAGAAGGAGCTT
50 . : . : . : . : . :
51 GGAGCGGGCCAGG ACAGAGGACTATCTCAAACGGAAGATTC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
100044 GGAGCGGGCCAGGGTA...TAGACAGAGGACTATCTCAAACGGAAGATTC
100 . : . : . : . : . :
92 GTTCCCGGCCGGAGAGATCGGAGCTGGTCAGGATGCACATTTTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
104103 GTTCCCGGCCGGAGAGATCGGAGCTGGTCAGGATGCACATTTTGGAAGGT
150 . : . : . : . : . :
140 AGACCTCGGCTGAGCCATCCCTCCAGGCCAAGCAGCTGAAGCT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104153 G...CAGAGACCTCGGCTGAGCCATCCCTCCAGGCCAAGCAGCTGAAGCT
200 . : . : . : . : . :
183 GAAGAGAGCCAGACTAGCCGATGACCTCAATGAGAAGATTGCACAGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105831 GAAGAGAGCCAGACTAGCCGATGACCTCAATGAGAAGATTGCACAGAGGC
250 . : . : . : . : . :
233 CTGGCCCCATGGAGCTGGTGGAGAAGAACATCCTTCCTGTTGAGTCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105881 CTGGCCCCATGGAGCTGGTGGAGAAGAACATCCTTCCTGTTGAGTCCAGC
300 . : . : . : . : . :
283 CTGAAGGAAGCCATCATTG TGGGCCAGGTGAACTATCCCAA
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
105931 CTGAAGGAAGCCATCATTGGTG...CAGTGGGCCAGGTGAACTATCCCAA
350 . : . : . : . : . :
324 AGTAGCAGACAGCTCTTCCTTCGATGAGGACAGCAGCGATGCCTTATCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111196 AGTAGCAGACAGCTCTTCCTTCGATGAGGACAGCAGCGATGCCTTATCCC
400 . : . : . : . : . :
374 CCGAGCAGCCTGCCAGCCATGAGTCCCAGGGTTCTGTGCCGTCACCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111246 CCGAGCAGCCTGCCAGCCATGAGTCCCAGGGTTCTGTGCCGTCACCCCTG
450 . : . : . : . : . :
424 GAGGCCCGAGTCAGCGAACCACTGCTCAGTGCCACCTCTGCATCCCCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111296 GAGGCCCGAGTCAGCGAACCACTGCTCAGTGCCACCTCTGCATCCCCCAC
500 . : . : . : . : . :
474 CCAG GTTGTGTCTCAACTTCCGATGGGCCGGGATTCCAGAG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111346 CCAGGTG...CAGGTTGTGTCTCAACTTCCGATGGGCCGGGATTCCAGAG
550 . : . : . : . : . :
515 AAATGCTTTTCCTGGCAGAGCAGCCTCCTCTGCCTCCCCCACCTCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111907 AAATGCTTTTCCTGGCAGAGCAGCCTCCTCTGCCTCCCCCACCTCTGCTG
600 . : . : . : . : . :
565 CCTCCCAGCCTCACCAATGGAACCACTATCCCCACTGCCAAGTCCACCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111957 CCTCCCAGCCTCACCAATGGAACCACTATCCCCACTGCCAAGTCCACCCC
650 . : . : . : . : . :
615 CACACTCATTAAG CAAAGCCAACCCAAGTCTGCCAGTGAGA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
112007 CACACTCATTAAGGTA...CAGCAAAGCCAACCCAAGTCTGCCAGTGAGA
700 . : . : . : . : . :
656 AGTCACAGCGCAGCAAGAAGGCCAAGGAGCTGAAGCCAAAGGTGAAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114483 AGTCACAGCGCAGCAAGAAGGCCAAGGAGCTGAAGCCAAAGGTGAAGAAG
750 . : . : . : . : . :
706 CTCAAGTACCACCAGTACATCCCCCCGGACCAGAAGCAGGACAGGGGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114533 CTCAAGTACCACCAGTACATCCCCCCGGACCAGAAGCAGGACAGGGGGGC
800 . : . : . : . : . :
756 ACCCCCCATGGACTCATCCTACGCCAAGATCCTGCAGCAGCAGCAGCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114583 ACCCCCCATGGACTCATCCTACGCCAAGATCCTGCAGCAGCAGCAGCTCT
850 . : . : . : . : . :
806 TCCTCCAGCTGCAGATCCTCAACCAGCAGCAGCAGCAGCACCACAACTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114633 TCCTCCAGCTGCAGATCCTCAACCAGCAGCAGCAGCAGCACCACAACTAC
900 . : . : . : . : . :
856 CAGGCCATCCTGCCTGCCCCGCCAAA GTCAGCAGGCGAGGC
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
114683 CAGGCCATCCTGCCTGCCCCGCCAAAGTA...CAGGTCAGCAGGCGAGGC
950 . : . : . : . : . :
897 CCTGGGAAGCAGCGGGACCCCCCCAGTACGCAGCCTCTCCACTACCAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114994 CCTGGGAAGCAGCGGGACCCCCCCAGTACGCAGCCTCTCCACTACCAATA
1000 . : . : . : . : . :
947 GCAGCTCCAGCTCGGGCGCCCCTGGGCCCTGTGGGCTGGCACGTCAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115044 GCAGCTCCAGCTCGGGCGCCCCTGGGCCCTGTGGGCTGGCACGTCAGAAC
1050 . : . : . : . : . :
997 AGCACCTCACTGACTGGCAAGCCGGGAGCCCTGCCGGCCAACCTGGACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115094 AGCACCTCACTGACTGGCAAGCCGGGAGCCCTGCCGGCCAACCTGGACGA
1100 . : . : . : . : . :
1047 CATGAAG GTGGCAGAGCTGAAGCAGGAGCTGAAGTTGCGAT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
115144 CATGAAGGTA...CAGGTGGCAGAGCTGAAGCAGGAGCTGAAGTTGCGAT
1150 . : . : . : . : . :
1088 CACTGCCTGTCTCGGGCACCAAAACTGAGCTGATTGAGCGCCTTCGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116205 CACTGCCTGTCTCGGGCACCAAAACTGAGCTGATTGAGCGCCTTCGAGCC
1200 . : . : . : . : . :
1138 TATCAAGACCAAATCAGCCCTGTGCCAGGAGCCCCCAAGGCCCCTGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116255 TATCAAGACCAAATCAGCCCTGTGCCAGGAGCCCCCAAGGCCCCTGCCGC
1250 . : . : . : . : . :
1188 CACCTCTATCCTGCACAAGGCTGGCGAGGTGGTGGTAGCCTTCCCAGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116305 CACCTCTATCCTGCACAAGGCTGGCGAGGTGGTGGTAGCCTTCCCAGCGG
1300 . : . : . : . : . :
1238 CCCGGCTGAGCACGGGGCCAGCCCTGGTGGCAGCAGGCCTGGCTCCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116355 CCCGGCTGAGCACGGGGCCAGCCCTGGTGGCAGCAGGCCTGGCTCCAGCT
1350 . : . : . : . : . :
1288 GAGGTGGTGGTGGCCACGGTGGCCAGCAGTGGGGTGGTGAAGTTTGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116405 GAGGTGGTGGTGGCCACGGTGGCCAGCAGTGGGGTGGTGAAGTTTGGCAG
1400 . : . : . : . : . :
1338 CACGGGCTCCACGCCCCCCGTGTCTCCCACCCCCTCGGAGCGCTCACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116455 CACGGGCTCCACGCCCCCCGTGTCTCCCACCCCCTCGGAGCGCTCACTGC
1450 . : . : . : . : . :
1388 TCAGCACGGGCGATGAAAACTCCACCCCCGGGGACACCTTTGGTGAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116505 TCAGCACGGGCGATGAAAACTCCACCCCCGGGGACACCTTTGGTGAGATG
1500 . : . : . : . : . :
1438 GTGACATCACCTCTGACGCAGCTGACCCTGCAGGCCTCGCCACTGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116555 GTGACATCACCTCTGACGCAGCTGACCCTGCAGGCCTCGCCACTGCAGAT
1550 . : . : . : . : . :
1488 CCTCGTGAAGGAGGAGGGCCCCCGGGCCGGGTCCTGTTGCCTGAGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116605 CCTCGTGAAGGAGGAGGGCCCCCGGGCCGGGTCCTGTTGCCTGAGCCCTG
1600 . : . : . : . : . :
1538 GGGGGCGGGCGGAGCTAGAGGGGCGCGACAAGGACCAGATGCTGCAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116655 GGGGGCGGGCGGAGCTAGAGGGGCGCGACAAGGACCAGATGCTGCAGGAG
1650 . : . : . : . : . :
1588 AAAGACAAGCAGATCGAGGCGCTGACGCGCATGCTCCGGCAGAAGCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116705 AAAGACAAGCAGATCGAGGCGCTGACGCGCATGCTCCGGCAGAAGCAGCA
1700 . : . : . : . : . :
1638 GCTGGTGGAGCGGCTCAAGCTGCAGCTGGAGCAGGAGAAGCGAGCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116755 GCTGGTGGAGCGGCTCAAGCTGCAGCTGGAGCAGGAGAAGCGAGCCCAGC
1750 . : . : . : . : . :
1688 AGCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCCTCGGCACCCCCGTGAAGCAGGAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116805 AGCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCCCTCGGCACCCCCGTGAAGCAGGAGAAC
1800 . : . : . : . : . :
1738 AGCTTCTCCAGCTGCCAGCTGAGCCAGCAGCCCCTGGGCCCCGCTCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116855 AGCTTCTCCAGCTGCCAGCTGAGCCAGCAGCCCCTGGGCCCCGCTCACCC
1850 . : . : . : . : . :
1788 ATTCAACCCCAGCCTGGCGGCCCCAGCCACCAACCACATAGACCCTTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116905 ATTCAACCCCAGCCTGGCGGCCCCAGCCACCAACCACATAGACCCTTGTG
1900 . : . : . : . : . :
1838 CTGTGGCCCCGGGGCCCCCGTCCGTGGTGGTGAAGCAGGAAGCCTTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116955 CTGTGGCCCCGGGGCCCCCGTCCGTGGTGGTGAAGCAGGAAGCCTTGCAG
1950 . : . : . : . : . :
1888 CCTGAGCCCGAGCCGGTCCCCGCCCCCCAGTTGCTTCTGGGGCCTCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117005 CCTGAGCCCGAGCCGGTCCCCGCCCCCCAGTTGCTTCTGGGGCCTCAGGG
2000 . : . : . : . : . :
1938 CCCCAGCCTCATCAAGGGGGTTGCACCTCCCACCCTCATCACCGACTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117055 CCCCAGCCTCATCAAGGGGGTTGCACCTCCCACCCTCATCACCGACTCCA
2050 . : . : . : . : . :
1988 CAGGGACCCACCTTGTCCTCACCGTGACCAATAAGAATGCAGACAGCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117105 CAGGGACCCACCTTGTCCTCACCGTGACCAATAAGAATGCAGACAGCCCT
2100 . : . : . : . : . :
2038 GGCCTGTCCAGTGGGAGCCCCCAGCAG CCCTCGTCCCAGCC
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
117155 GGCCTGTCCAGTGGGAGCCCCCAGCAGGTA...CAGCCCTCGTCCCAGCC
2150 . : . : . : . : . :
2079 TGGCTCTCCAGCGCCTGCCCCCTCTGCCCAGATGGACCTGGAGCACCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118076 TGGCTCTCCAGCGCCTGCCCCCTCTGCCCAGATGGACCTGGAGCACCCAC
2200 . : . : . : . : . :
2129 TGCAGCCCCTCTTTGGGACCCCCACTTCTCTGCTGAAGAAGGAACCACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118126 TGCAGCCCCTCTTTGGGACCCCCACTTCTCTGCTGAAGAAGGAACCACCT
2250 . : . : . : . : . :
2179 GGCTATGAGGAAGCCATGAGCCAGCAGCCCAAACAGCAG GA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
118176 GGCTATGAGGAAGCCATGAGCCAGCAGCCCAAACAGCAGGTG...CAGGA
2300 . : . : . : . : . :
2220 AAATGGTTCCTCAAGCCAGCAGATGGACGACCTGTTTGACATTCTCATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118511 AAATGGTTCCTCAAGCCAGCAGATGGACGACCTGTTTGACATTCTCATTC
2350 . : . : . : . : . :
2270 AGAGCGGAG AAATTTCAGCAGATTTCAAGGAGCCGCCATCC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
118561 AGAGCGGAGGTA...CAGAAATTTCAGCAGATTTCAAGGAGCCGCCATCC
2400 . : . : . : . : . :
2311 CTGCCAGGGAAGGAGAAGCCATCCCCGAAGACAGTCTGTGGGTCCCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123680 CTGCCAGGGAAGGAGAAGCCATCCCCGAAGACAGTCTGTGGGTCCCCCCT
2450 . : . : . : . : . :
2361 GGCAGCACAGCCATCACCTTCTGCTGAGCTCCCCCAGGCTGCCCCACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123730 GGCAGCACAGCCATCACCTTCTGCTGAGCTCCCCCAGGCTGCCCCACCTC
2500 . : . : . : . : . :
2411 CTCCAGGCTCACCCTCCCTCCCTGGACGCCTGGAGGACTTCCTGGAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123780 CTCCAGGCTCACCCTCCCTCCCTGGACGCCTGGAGGACTTCCTGGAGAGC
2550 . : . : . : . : . :
2461 AGCACGGGGCTGCCCCTGCTGACCAGTGGGCATGACGGGCCAGAGCCCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123830 AGCACGGGGCTGCCCCTGCTGACCAGTGGGCATGACGGGCCAGAGCCCCT
2600 . : . : . : . : . :
2511 TTCCCTCATTGACGACCTCCATAGCCAGATGCTGAGCAGCACTGCCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123880 TTCCCTCATTGACGACCTCCATAGCCAGATGCTGAGCAGCACTGCCATCC
2650 . : . : . : . : . :
2561 TGGACCACCCCCCGTCACCCATGGACACCTCGGAATTGCACTTTGTTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123930 TGGACCACCCCCCGTCACCCATGGACACCTCGGAATTGCACTTTGTTCCT
2700 . : . : . : . : . :
2611 GAGCCCAGCAGCACCATGGGCCTGGACCTGGCTGATGGCCACCTGGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123980 GAGCCCAGCAGCACCATGGGCCTGGACCTGGCTGATGGCCACCTGGACAG
2750 . : . : . : . : . :
2661 CATGGACTGGCTGGAGCTGTCGTCAGGTGGTCCCGTGCTGAGCCTAGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124030 CATGGACTGGCTGGAGCTGTCGTCAGGTGGTCCCGTGCTGAGCCTAGCCC
2800 . : . : . : . : . :
2711 CCCTCAGCACCACAGCCCCCAGCCTCTTCTCCACAGACTTCCTCGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124080 CCCTCAGCACCACAGCCCCCAGCCTCTTCTCCACAGACTTCCTCGATGGC
2850 . : . : . :
2761 CATGATTTGCAGCTGCACTGGGATTCCTGCTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||
124130 CATGATTTGCAGCTGCACTGGGATTCCTGCTTG