seq1 = pF1KSDA1388.tfa, 1746 bp
seq2 = pF1KSDA1388/gi568815582r_57896520.tfa (gi568815582r:57896520_58098175), 201656 bp

>pF1KSDA1388 1746
>gi568815582r:57896520_58098175 (Chr16)

(complement)

1-1746  (99911-101656)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGAAAGCTGGCAACAGCCGCCACAGACGCAGCCGCAGCAGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99911 ATGTCGGAAAGCTGGCAACAGCCGCCACAGACGCAGCCGCAGCAGCCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCACCGCAGCCTCAGCACCATGCAGAGCCACCGCCAGCCCTGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99961 GCCACCGCAGCCTCAGCACCATGCAGAGCCACCGCCAGCCCTGGCAGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACACGCTGCCTCCGGGCACGGCGGAGAACCCCCTGGGCTGTGCTGTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100011 ACACGCTGCCTCCGGGCACGGCGGAGAACCCCCTGGGCTGTGCCGTCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCATCCTCCTGCAGCCAGACCCCGGCCTGCAGCCCCCACAACACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 GGCATCCTCCTGCAGCCAGACCCCGGCCTGCAGCCCCCACAACACGCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCAGGCAGCAGGAGAGCCAGGCCCCAAATGTGGCGTGTGTGGTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100111 CCTGCAGGCAGCAGGAGAGCCAGGCCCCAAATGTGGCGTGTGTGGTCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGGCGCACCTGTCCAGTCCGCATGAGCACCAGTGTCTGGCGGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100161 ACCTGGCGCACCTGTCCAGTCCGCATGAGCACCAGTGTCTGGCGGGCCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCGCTCATTCCAGTGCACACAGTGTCTCAAGATCTTCCACCAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100211 GACCGCTCATTCCAGTGCACACAGTGTCTCAAGATCTTCCACCAGGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGACCTGCTGGAGCACCAGTGCGTGCAGGCTGAGCAGAAGCCCTTCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100261 TGACCTGCTGGAGCACCAGTGCGTGCAGGCTGAGCAGAAGCCCTTCGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGGGGTCTGCAAGATGGGCTTCTCACTACTCACCTCACTGGCACAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100311 GTGGGGTCTGCAAGATGGGCTTCTCACTACTCACCTCACTGGCACAGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACAGCTCCCACAGTGGCCTGGTGAAGTGTTCCATCTGTGAAAAGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100361 CACAGCTCCCACAGTGGCCTGGTGAAGTGTTCCATCTGTGAAAAGACCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAGCCAGCTGAGGCAGCGGAGCCAGCCACCACAGCCGCCCCGTCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100411 CAAGCCAGCTGAGGCAGCGGAGCCAGCCACCACAGCCGCCCCGTCGCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCGCAGCACCCGCGCCTTCCACTGTCACCCCTGCTGAACAGGCCGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100461 CCGCAGCACCCGCGCCTTCCACTGTCACCCCTGCTGAACAGGCCGACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCTACAGCTGCCCCATCTGCCAAAAGCCCTTCAAGCACCTGTCGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100511 CCCTACAGCTGCCCCATCTGCCAAAAGCCCTTCAAGCACCTGTCGGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCTCGGCATGAGCGGATCCACACCGGTGAGAAGCCCTACAAGTGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100561 CTCTCGGCATGAGCGGATCCACACCGGTGAGAAGCCCTACAAGTGCACGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGTGTGACAAAAGCTTCAGCCAGTCGTCGCACCTGGTGCACCACAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100611 TGTGTGACAAAAGCTTCAGCCAGTCGTCGCACCTGGTGCACCACAAGCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACGCACAGCTCCGAGCGGCCCTACAAGTGCGCAGTCTGCGAGAAGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100661 ACGCACAGCTCCGAGCGGCCCTACAAGTGCGCAGTCTGCGAGAAGACCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGCACCGCTCTCACCTGGTGCGCCACATGTACGCGCACTCGGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100711 CAAGCACCGCTCTCACCTGGTGCGCCACATGTACGCGCACTCGGGCGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCACCTGTTCCGCTGCAACGTGTGCGAGTTGCATTTCAAGGAGTCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100761 ACCACCTGTTCCGCTGCAACGTGTGCGAGTTGCATTTCAAGGAGTCGTCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGCTGCTGCAGCACCCGTGCACGCCAAGTGGGGAGCGGCCCTTCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100811 GAGCTGCTGCAGCACCCGTGCACGCCAAGTGGGGAGCGGCCCTTCCGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGGCGAGTGCCAGAAGGCCTTCAAGCGGCCCTCGGACCTGCGGCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100861 CGGCGAGTGCCAGAAGGCCTTCAAGCGGCCCTCGGACCTGCGGCAGCATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCGCACACACAGCGCCGAGCGGCCCTTCAAGTGCGACCTGTGCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100911 AGCGCACACACAGCGCCGAGCGGCCCTTCAAGTGCGACCTGTGCCCCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCTTCAAGCAGCAGTACGCACTGATGCGCCACCGGCGCACACACAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100961 GGCTTCAAGCAGCAGTACGCACTGATGCGCCACCGGCGCACACACAAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGAGGAGCCCTTCAAATGCGGCCTATGTGAGAAGGGCTTTGGGCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101011 CGAGGAGCCCTTCAAATGCGGCCTATGTGAGAAGGGCTTTGGGCAGCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCACCTGCTCTACCACCAGCACGTGCACACCCTCGAGACTCTCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101061 GCCACCTGCTCTACCACCAGCACGTGCACACCCTCGAGACTCTCTTCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TGCCCCGTGTGCCAGAAAGGCTTTGACCAATCTGCCGAGCTGCTGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101111 TGCCCCGTGTGCCAGAAAGGCTTTGACCAATCTGCCGAGCTGCTGCGGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAAGTGCCTGCCCGGCGCGGCCGAGCGGCCCTTCAAGTGCCCTGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101161 CAAGTGCCTGCCCGGCGCGGCCGAGCGGCCCTTCAAGTGCCCTGTGTGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACAAGGCCTACAAGCGCGCGTCGGCCCTGCAGAAGCACCAGCTGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101211 ACAAGGCCTACAAGCGCGCGTCGGCCCTGCAGAAGCACCAGCTGGCCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TGTGCGGCGGCAGAGAAGCCCCTGCGCTGCACGCTTTGCGAACGCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101261 TGTGCGGCGGCAGAGAAGCCCCTGCGCTGCACGCTTTGCGAACGCCGCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTTCTCCTCTTCCGAGTTCGTGCAGCACCGCTGCGATCCGGCCCGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101311 CTTCTCCTCTTCCGAGTTCGTGCAGCACCGCTGCGATCCGGCCCGCGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGCCACTCAAGTGCCCAGACTGCGAGAAACGCTTCAAGTACGCGTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101361 AGCCACTCAAGTGCCCAGACTGCGAGAAACGCTTCAAGTACGCGTCAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTGCAGCGGCACCGGCGGGTACACACAGGCGAGAAACCCTACAAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 101411 CTGCAGCGGCACCGGCGGGTACACACAGGCGAGAAGCCCTACAAGTGCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CAACTGCGACAAGGCCTTCAAGCAGCGGGAGCATCTCAACAAGCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101461 CAACTGCGACAAGGCCTTCAAGCAGCGGGAGCATCTCAACAAGCACCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GCGTGCACGCCCGCGAGCAGCAGTTCAAGTGTGTATGGTGCGGGGAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101511 GCGTGCACGCCCGCGAGCAGCAGTTCAAGTGTGTATGGTGCGGGGAGCGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTCCTAGACGTGGCCTTGTTGCAGGAGCACAGCGCGCAGCACAGTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101561 TTCCTAGACGTGGCCTTGTTGCAGGAGCACAGCGCGCAGCACAGTGCCGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1701 CGCCGCGGCAGCGGAGGGCGCCTACCAGGTAGCCGCCTGCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101611 CGCCGCGGCAGCGGAGGGCGCCTACCAGGTAGCCGCCTGCCTGCCC