seq1 = pF1KSDA1369.tfa, 1890 bp
seq2 = pF1KSDA1369/gi568815591r_5924676.tfa (gi568815591r:5924676_6159083), 234408 bp

>pF1KSDA1369 1890
>gi568815591r:5924676_6159083 (Chr7)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-277  (104380-104538)   100% ->
278-411  (109039-109172)   100% ->
412-449  (110240-110277)   100% ->
450-549  (111993-112092)   100% ->
550-630  (112933-113013)   100% ->
631-730  (114423-114522)   100% ->
731-791  (116091-116151)   100% ->
792-1119  (117865-118192)   100% ->
1120-1231  (120413-120524)   100% ->
1232-1332  (121560-121660)   100% ->
1333-1447  (130052-130166)   100% ->
1448-1530  (130387-130469)   100% ->
1531-1764  (132123-132356)   100% ->
1765-1890  (134283-134408)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGGGGCAACTCCGGGGTCCGCAAGCGCGAAGAGGAGGGCGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGGGGCAACTCCGGGGTCCGCAAGCGCGAAGAGGAGGGCGACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGGGGCTGTGGCTGCGCCGCCGGCCATCGACTTTCCCGCCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGGGGCTGTGGCTGCGCCGCCGGCCATCGACTTTCCCGCCGAGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACCCCGAATATGACG         AATCTGATGTTCCAGCAGAAATC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACCCCGAATATGACGGTG...TAGAATCTGATGTTCCAGCAGAAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGGTGTTAAAAGAACCCCTACAACAGCCAACCTTCCCTTTTGCAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104403 CAGGTGTTAAAAGAACCCCTACAACAGCCAACCTTCCCTTTTGCAGTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAACCAACTCTTGCTGGTTTCTTTGCTGGAGCACTTGAGCCACGTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104453 AAACCAACTCTTGCTGGTTTCTTTGCTGGAGCACTTGAGCCACGTGCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACCAAACCCACTTCGTTCAAGACAGGTGTTTAAGC         TACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104503 AACCAAACCCACTTCGTTCAAGACAGGTGTTTAAGCGTA...TAGTACTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCCAGACGTTTATCAAAATGGGGCTGCTGTCTTCTTTCACTTGTAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109044 TGCCAGACGTTTATCAAAATGGGGCTGCTGTCTTCTTTCACTTGTAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAGTTTAGCTCATTGAGACTACATCACAACAGAGCTATTACTCACTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109094 CGAGTTTAGCTCATTGAGACTACATCACAACAGAGCTATTACTCACTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGAGGTCTGCTAAAGAGAGAGTTCGTCAG         GATCCTTGTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109144 TGAGGTCTGCTAAAGAGAGAGTTCGTCAGGTA...TAGGATCCTTGTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATATTTCTCGTATCCAGAAAATCAG         ATCAAGGGAAGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 110252 GATATTTCTCGTATCCAGAAAATCAGGTA...CAGATCAAGGGAAGTAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTGGAAGCACAAACTTCACGTTACTTAAATGAATTTGAAGAACTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112008 CTTGGAAGCACAAACTTCACGTTACTTAAATGAATTTGAAGAACTTGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCTTAGGAAAAGGTGGATACGGAAGAGTATACAAG         GTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 112058 TCTTAGGAAAAGGTGGATACGGAAGAGTATACAAGGTT...CAGGTCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AATAAATTAGATGGTCAGTATTATGCAATAAAAAAAATCCTGATTAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112939 AATAAATTAGATGGTCAGTATTATGCAATAAAAAAAATCCTGATTAAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCAACTAAAACAGTTTGCATGAAG         GTCCTACGGGAAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 112989 TGCAACTAAAACAGTTTGCATGAAGGTA...TAGGTCCTACGGGAAGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGGTGCTGGCAGGTCTTCAGCACCCCAATATTGTTGGCTATCACACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114439 AGGTGCTGGCAGGTCTTCAGCACCCCAATATTGTTGGCTATCACACCGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TGGATAGAACATGTTCATGTGATTCAGCCACGAG         CAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114489 TGGATAGAACATGTTCATGTGATTCAGCCACGAGGTA...CAGCAGACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCTGCCATTGAGTTGCCATCTCTGGAAGTGCTCTCCGACCAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116098 AGCTGCCATTGAGTTGCCATCTCTGGAAGTGCTCTCCGACCAGGAAGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACAG         AGAGCAATGTGGTGTTAAAAATGATGAAAGTAGCAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116148 ACAGGTA...CAGAGAGCAATGTGGTGTTAAAAATGATGAAAGTAGCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCATCCATTATCTTTGCTGAGCCCACCCCAGAAAAAGAAAAACGCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117902 TCATCCATTATCTTTGCTGAGCCCACCCCAGAAAAAGAAAAACGCTTTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGAATCTGACACTGAAAATCAGAATAACAAGTCGGTGAAGTACACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117952 AGAATCTGACACTGAAAATCAGAATAACAAGTCGGTGAAGTACACCACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATTTAGTCATAAGAGAATCTGGTGAACTTGAGTCGACCCTGGAGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118002 ATTTAGTCATAAGAGAATCTGGTGAACTTGAGTCGACCCTGGAGCTCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAAATGGCTTGGCTGGTTTGTCTGCCAGTTCAATTGTGGAACAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118052 GAAAATGGCTTGGCTGGTTTGTCTGCCAGTTCAATTGTGGAACAGCAGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCCACTCAGGCGTAATTCCCACCTAGAGGAGAGTTTCACATCCACCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118102 GCCACTCAGGCGTAATTCCCACCTAGAGGAGAGTTTCACATCCACCGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AATCTTCCGAAGAAAATGTCAACTTTTTGGGTCAGACAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118152 AATCTTCCGAAGAAAATGTCAACTTTTTGGGTCAGACAGAGGTA...TAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCACAGTACCACCTGATGCTGCACATCCAGATGCAGCTGTGTGAGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120413 GCACAGTACCACCTGATGCTGCACATCCAGATGCAGCTGTGTGAGCTCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCTGTGGGATTGGATAGTCGAGAGAAACAAGCGGGGCCGGGAGTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120463 GCTGTGGGATTGGATAGTCGAGAGAAACAAGCGGGGCCGGGAGTATGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ACGAGTCTGCCT         GTCCTTATGTTATGGCCAATGTTGCAACA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 120513 ACGAGTCTGCCTGTG...AAGGTCCTTATGTTATGGCCAATGTTGCAACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AAAATTTTTCAAGAATTGGTAGAAGGTGTGTTTTACATACATAACATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121589 AAAATTTTTCAAGAATTGGTAGAAGGTGTGTTTTACATACATAACATGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AATTGTGCACCGAGATCTGAAG         CCAAGAAATATTTTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 121639 AATTGTGCACCGAGATCTGAAGGTA...TAGCCAAGAAATATTTTTCTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ATGGCCCTGATCAGCAAGTAAAAATAGGAGACTTTGGTCTGGCCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130071 ATGGCCCTGATCAGCAAGTAAAAATAGGAGACTTTGGTCTGGCCTGCACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GACATCCTACAGAAGAACACAGACTGGACCAACAGAAACGGGAAGA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 130121 GACATCCTACAGAAGAACACAGACTGGACCAACAGAAACGGGAAGAGTA.

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1448      GAACACCAACACATACGTCCAGAGTGGGTACTTGTCTGTACGCTT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130171 ..TAGGAACACCAACACATACGTCCAGAGTGGGTACTTGTCTGTACGCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CACCCGAACAGTTGGAAGGATCTGAGTATGATGCCAAG         TCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 130432 CACCCGAACAGTTGGAAGGATCTGAGTATGATGCCAAGGTA...CAGTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GATATGTACAGCTTGGGTGTGGTCCTGCTAGAGCTCTTTCAGCCGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132126 GATATGTACAGCTTGGGTGTGGTCCTGCTAGAGCTCTTTCAGCCGTTTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 AACAGAAATGGAGCGAGCAGAAGTTCTAACAGGTTTAAGAACTGGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132176 AACAGAAATGGAGCGAGCAGAAGTTCTAACAGGTTTAAGAACTGGTCAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TGCCGGAATCCCTCCGTAAAAGGTGTCCAGTGCAAGCCAAGTATATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132226 TGCCGGAATCCCTCCGTAAAAGGTGTCCAGTGCAAGCCAAGTATATCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CACTTAACGAGAAGGAACTCATCGCAGAGACCATCTGCCATTCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132276 CACTTAACGAGAAGGAACTCATCGCAGAGACCATCTGCCATTCAGCTGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCAGAGTGAACTTTTCCAAAATTCTGGAAAT         GTTAACCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 132326 GCAGAGTGAACTTTTCCAAAATTCTGGAAATGTA...CAGGTTAACCTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CCCTACAGATGAAGATAATAGAGCAAGAAAAAGAAATTGCAGAACTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134293 CCCTACAGATGAAGATAATAGAGCAAGAAAAAGAAATTGCAGAACTAAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 AAGCAGCTAAACCTCCTTTCTCAAGACAAAGGGGTGAGGGATGACGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134343 AAGCAGCTAAACCTCCTTTCTCAAGACAAAGGGGTGAGGGATGACGGAAA

   2000     .    :    .
   1875 GGATGGGGGCGTGGGA
        ||||||||||||||||
 134393 GGATGGGGGCGTGGGA