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seq2 = pF1KSDA1355/gi568815597r_159827348.tfa (gi568815597r:159827348_160043454), 216107 bp

>pF1KSDA1355 3537
>gi568815597r:159827348_160043454 (Chr1)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-247  (100304-100492)   100% ->
248-400  (105617-105769)   100% ->
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556-673  (106939-107056)   100% ->
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1105-1245  (110803-110943)   100% ->
1246-1362  (111527-111643)   100% ->
1363-1513  (111852-112002)   100% ->
1514-1637  (112194-112317)   100% ->
1638-1813  (112588-112763)   100% ->
1814-2064  (113016-113266)   100% ->
2065-2149  (113480-113564)   100% ->
2150-2326  (113641-113817)   100% ->
2327-2369  (114062-114104)   100% ->
2370-3230  (114437-115297)   100% ->
3231-3358  (115568-115695)   100% ->
3359-3537  (115929-116107)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTGGTGCCTCGGCCTGGCCGTCCTCAGCCTGGTCATCAGCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTGGTGCCTCGGCCTGGCCGTCCTCAGCCTGGTCATCAGCCAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGACG         GTCGAGGGAAGCCTGAGGTGGTATCGGTGGTGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGACGGTA...CAGGTCGAGGGAAGCCTGAGGTGGTATCGGTGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCGGGCTGGGGAGAGTGTGGTGCTGGGCTGTGACCTGCTGCCCCCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100337 GCCGGGCTGGGGAGAGTGTGGTGCTGGGCTGTGACCTGCTGCCCCCGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCCGGCCCCCCCTGCATGTCATCGAGTGGCTGCGCTTTGGATTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100387 GGCCGGCCCCCCCTGCATGTCATCGAGTGGCTGCGCTTTGGATTCCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCCATCTTCATCCAGTTCGGCCTCTACTCTCCCCGAATTGACCCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100437 TCCCATCTTCATCCAGTTCGGCCTCTACTCTCCCCGAATTGACCCTGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGTGG         GACGAGTCCGGCTGCAGAAGGGGGCCTCTCTCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100487 ACGTGGGTA...CAGGACGAGTCCGGCTGCAGAAGGGGGCCTCTCTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTGAGGGTCTCCGGGTGGAAGACCAGGGCTGGTACGAGTGCCGCGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105652 ATTGAGGGTCTCCGGGTGGAAGACCAGGGCTGGTACGAGTGCCGCGTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTCCTGGACCAGCACATCCCTGAAGACGATTTTGCTAACGGCTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105702 CTTCCTGGACCAGCACATCCCTGAAGACGATTTTGCTAACGGCTCCTGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCATCTGACAGTCAATT         CACCCCCTCAATTCCAGGAGACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105752 TGCATCTGACAGTCAATTGTA...CAGCACCCCCTCAATTCCAGGAGACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTCCTGCTGTGTTGGAAGTGCAGGAACTGGAGCCTGTGACCCTGCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106570 CCTCCTGCTGTGTTGGAAGTGCAGGAACTGGAGCCTGTGACCCTGCGTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTGGCCCGTGGCAGCCCCCTGCCTCATGTGACGTGGAAGCTCCGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106620 TGTGGCCCGTGGCAGCCCCCTGCCTCATGTGACGTGGAAGCTCCGAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGACCTTGGCCAGGGCCAGGGCCAGGTGCAA         GTGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106670 AGGACCTTGGCCAGGGCCAGGGCCAGGTGCAAGTG...TAGGTGCAGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGGACGCTGCGGATCCGCCGGGTAGAGCGAGGCAGCTCTGGGGTCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106948 GGGACGCTGCGGATCCGCCGGGTAGAGCGAGGCAGCTCTGGGGTCTACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTGCCAAGCCTCCAGCACTGAGGGCAGCGCCACCCACGCCACCCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106998 CTGCCAAGCCTCCAGCACTGAGGGCAGCGCCACCCACGCCACCCAGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TAGTGCTAG         GACCCCCAGTCATCGTGGTGCCCCCCAAGAAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107048 TAGTGCTAGGTG...CAGGACCCCCAGTCATCGTGGTGCCCCCCAAGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGCACAGTCAATGCCTCCCAGGATGTTTCATTGGCCTGCCATGCTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108665 AGCACAGTCAATGCCTCCCAGGATGTTTCATTGGCCTGCCATGCTGAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATACCCTGCTAACCTCACCTACAGCTGGTTCCAGGACAACATCAATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108715 ATACCCTGCTAACCTCACCTACAGCTGGTTCCAGGACAACATCAATGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCACATTAG         CCGCCTGCAGCCCCGGGTGCGGATCCTGGTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 108765 TCCACATTAGGTG...CAGCCGCCTGCAGCCCCGGGTGCGGATCCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GACGGGAGCCTGCGGCTGCTGGCCACCCAGCCTGATGATGCCGGCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108916 GACGGGAGCCTGCGGCTGCTGGCCACCCAGCCTGATGATGCCGGCTGCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACCTGTGTGCCCAGCAATGGCCTCCTGCATCCACCCTCAGCCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108966 CACCTGTGTGCCCAGCAATGGCCTCCTGCATCCACCCTCAGCCTCTGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCTCACTGTGCTCT         ACCCAGCCCAGGTGACAGCTATGCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109016 ACCTCACTGTGCTCTGTA...CAGACCCAGCCCAGGTGACAGCTATGCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCTGAGACACCCCTGCCCATAGGCATGCCGGGGGTGATCCGCTGCCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109149 CCTGAGACACCCCTGCCCATAGGCATGCCGGGGGTGATCCGCTGCCCGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCGTGCCAACCCCCCACTGCTCTTTGTCAGCTGGACCAAGGATGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109199 TCGTGCCAACCCCCCACTGCTCTTTGTCAGCTGGACCAAGGATGGAAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CCCTGCAGCTGGACAAG         TTCCCTGGCTGGTCCCAGGGCACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109249 CCCTGCAGCTGGACAAGGTA...CAGTTCCCTGGCTGGTCCCAGGGCACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAGGCTCACTGATCATCGCCCTGGGGAACGAGGATGCCCTGGGAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110827 GAAGGCTCACTGATCATCGCCCTGGGGAACGAGGATGCCCTGGGAGAATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTCCTGCACCCCCTACAACAGTCTTGGTACCGCCGGGCCCTCTCCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110877 CTCCTGCACCCCCTACAACAGTCTTGGTACCGCCGGGCCCTCTCCTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CCCGCGTGCTGCTCAAG         GCTCCCCCAGCTTTTATAGAGCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110927 CCCGCGTGCTGCTCAAGGTT...CAGGCTCCCCCAGCTTTTATAGAGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCCAAGGAAGAATATTTCCAAGAAGTAGGGCGGGAGCTGCTCATCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111551 CCCAAGGAAGAATATTTCCAAGAAGTAGGGCGGGAGCTGCTCATCCCCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTCCGCCCAAGGGGACCCTCCTCCTGTTGTCTCTTGGACCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111601 CTCCGCCCAAGGGGACCCTCCTCCTGTTGTCTCTTGGACCAAGGTA...T

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1363   GTGGGCCGGGGGCTGCAAGGCCAGGCCCAGGTGGACAGCAACAGCAGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111850 AGGTGGGCCGGGGGCTGCAAGGCCAGGCCCAGGTGGACAGCAACAGCAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CTCATCCTGCGACCATTGACCAAGGAGGCCCACGGGCACTGGGAATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111900 CTCATCCTGCGACCATTGACCAAGGAGGCCCACGGGCACTGGGAATGCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TGCCAGCAATGCTGTGGCCCGAGTGGCCACCTCCACGAACGTCTACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111950 TGCCAGCAATGCTGTGGCCCGAGTGGCCACCTCCACGAACGTCTACGTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGG         GCACTAGCCCTCATGTTGTCACCAATGTGTCCGTGGTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112000 TGGGTT...TAGGCACTAGCCCTCATGTTGTCACCAATGTGTCCGTGGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GCTTTGCCCAAGGGTGCCAATGTCTCCTGGGAGCCTGGCTTTGATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112232 GCTTTGCCCAAGGGTGCCAATGTCTCCTGGGAGCCTGGCTTTGATGGTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTATCTGCAGAGATTCAGTGTCTGGTACACCCCACT         GGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112282 TTATCTGCAGAGATTCAGTGTCTGGTACACCCCACTGTG...CAGGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGCGTCCTGACCGAATGCACCATGACTGGGTGTCCTTGGCAGTGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112593 AGCGTCCTGACCGAATGCACCATGACTGGGTGTCCTTGGCAGTGCCTGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GGGGCTGCTCACCTCCTAGTGCCAGGGCTGCAGCCCCACACCCAGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112643 GGGGCTGCTCACCTCCTAGTGCCAGGGCTGCAGCCCCACACCCAGTACCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GTTCAGCGTGCTAGCTCAGAACAAGCTGGGGAGTGGTCCCTTCAGCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112693 GTTCAGCGTGCTAGCTCAGAACAAGCTGGGGAGTGGTCCCTTCAGCGAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 TCGTCTTGTCTGCTCCGGAAG         GGCTTCCTACCACGCCAGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 112743 TCGTCTTGTCTGCTCCGGAAGGTG...CAGGGCTTCCTACCACGCCAGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GCACCCGGGCTTCCCCCAACAGAGATACCGCCTCCCCTGTCCCCTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113036 GCACCCGGGCTTCCCCCAACAGAGATACCGCCTCCCCTGTCCCCTCCGCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGGTCTGGTGGCAGTGAGGACACCCCGGGGGGTACTCCTGCATTGGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113086 GGGTCTGGTGGCAGTGAGGACACCCCGGGGGGTACTCCTGCATTGGGATC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCCCAGAGCTGGTCCCTAAGAGACTGGATGGCTACGTCTTGGAAGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113136 CCCCAGAGCTGGTCCCTAAGAGACTGGATGGCTACGTCTTGGAAGGCCGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CAAGGCTCCCAGGGCTGGGAGGTGCTGGACCCGGCTGTGGCAGGCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113186 CAAGGCTCCCAGGGCTGGGAGGTGCTGGACCCGGCTGTGGCAGGCACAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 AACAGAGCTGCTGGTGCCAGGCCTCATCAAG         GATGTTCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113236 AACAGAGCTGCTGGTGCCAGGCCTCATCAAGGTA...CAGGATGTTCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ACGAGTTCCGCCTCGTGGCCTTCGCGGGCAGCTTCGTCAGCGACCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113490 ACGAGTTCCGCCTCGTGGCCTTCGCGGGCAGCTTCGTCAGCGACCCCAGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 AACACGGCCAACGTCTCCACTTCCG         GTCTGGAGGTCTACCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113540 AACACGGCCAACGTCTCCACTTCCGGTG...TAGGTCTGGAGGTCTACCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TTCGCGCACGCAGCTGCCGGGCCTCCTGCCTCAGCCCGTGCTGGCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113657 TTCGCGCACGCAGCTGCCGGGCCTCCTGCCTCAGCCCGTGCTGGCCGGCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TGGTGGGCGGAGTCTGCTTTCTGGGAGTGGCCGTCCTTGTGAGCATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113707 TGGTGGGCGGAGTCTGCTTTCTGGGAGTGGCCGTCCTTGTGAGCATCCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GCCGGCTGCCTCCTGAACCGGCGCAGGGCTGCCCGCCGCCGCCGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113757 GCCGGCTGCCTCCTGAACCGGCGCAGGGCTGCCCGCCGCCGCCGCAAGCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CCTCCGCCAAG         ATCCACCTCTTATCTTCTCTCCGACCGGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 113807 CCTCCGCCAAGGTA...CAGATCCACCTCTTATCTTCTCTCCGACCGGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AGTCAGCTGCACC         CTCTGCTCTGGGCTCAGGCAGTCCTGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114092 AGTCAGCTGCACCGTA...CAGCTCTGCTCTGGGCTCAGGCAGTCCTGAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AGCGTGGCGAAGCTGAAGCTCCAGGGATCCCCAGTCCCCAGCCTGCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114465 AGCGTGGCGAAGCTGAAGCTCCAGGGATCCCCAGTCCCCAGCCTGCGCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 GAGTCTGCTCTGGGGGGATCCTGCCGGAACTCCCAGCCCCCACCCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114515 GAGTCTGCTCTGGGGGGATCCTGCCGGAACTCCCAGCCCCCACCCGGATC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 CTCCATCTAGCCGGGGACCCTTACCTCTGGAGCCCATTTGCCGGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114565 CTCCATCTAGCCGGGGACCCTTACCTCTGGAGCCCATTTGCCGGGGCCCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GACGGGCGCTTTGTGATGGGGCCCACTGTGGCGGCCCCCCAGGAAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114615 GACGGGCGCTTTGTGATGGGGCCCACTGTGGCGGCCCCCCAGGAAAGGTC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AGGCCGGGAGCAGGCAGAACCTCGGACTCCAGCCCAGCGTCTGGCCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114665 AGGCCGGGAGCAGGCAGAACCTCGGACTCCAGCCCAGCGTCTGGCCCGGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CCTTTGACTGTAGCAGCAGCAGCCCCAGTGGGGCACCCCAGCCCCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114715 CCTTTGACTGTAGCAGCAGCAGCCCCAGTGGGGCACCCCAGCCCCTCTGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 ATTGAAGACATCAGCCCTGTGGCACCCCCTCCAGCAGCCCCACCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114765 ATTGAAGACATCAGCCCTGTGGCACCCCCTCCAGCAGCCCCACCCAGTCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 CTTGCCAGGTCCTGGACCCCTGCTCCAGTACCTGAGCCTGCCCTTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114815 CTTGCCAGGTCCTGGACCCCTGCTCCAGTACCTGAGCCTGCCCTTCTTCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 GAGAGATGAATGTGGATGGGGACTGGCCCCCGCTTGAGGAGCCCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114865 GAGAGATGAATGTGGATGGGGACTGGCCCCCGCTTGAGGAGCCCAGCCCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 GCTGCACCCCCAGATTACATGGATACCCGGCGCTGTCCCACCTCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114915 GCTGCACCCCCAGATTACATGGATACCCGGCGCTGTCCCACCTCATCTTT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 CCTTCGTTCTCCAGAAACCCCTCCTGTATCCCCCAGGGAATCACTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114965 CCTTCGTTCTCCAGAAACCCCTCCTGTATCCCCCAGGGAATCACTTCCTG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 GGGCTGTGGTAGGGGCTGGGGCCACTGCAGAGCCCCCTTACACAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115015 GGGCTGTGGTAGGGGCTGGGGCCACTGCAGAGCCCCCTTACACAGCCCTG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 GCTGACTGGACACTGAGGGAGCGGCTGCTGCCAGGCCTTCTCCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115065 GCTGACTGGACACTGAGGGAGCGGCTGCTGCCAGGCCTTCTCCCTGCTGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 CCCTCGAGGCAGCCTCACCAGCCAGAGCAGTGGGCGAGGCAGCGCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115115 CCCTCGAGGCAGCCTCACCAGCCAGAGCAGTGGGCGAGGCAGCGCTTCGT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 TCCTGCGGCCCCCCTCCACAGCCCCCTCTGCAGGAGGCAGCTACCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115165 TCCTGCGGCCCCCCTCCACAGCCCCCTCTGCAGGAGGCAGCTACCTCAGC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 CCTGCTCCAGGAGACACCAGCAGCTGGGCCAGTGGCCCTGAGAGATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115215 CCTGCTCCAGGAGACACCAGCAGCTGGGCCAGTGGCCCTGAGAGATGGCC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3198 CCGAAGGGAGCATGTGGTGACAGTCAGCAAGAG         GAGGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 115265 CCGAAGGGAGCATGTGGTGACAGTCAGCAAGAGGTG...CAGGAGGAACA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 CATCTGTGGACGAGAACTATGAGTGGGACTCAGAATTCCCTGGGGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115576 CATCTGTGGACGAGAACTATGAGTGGGACTCAGAATTCCCTGGGGACATG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 GAATTGCTGGAGACTTTGCACCTGGGCTTGGCCAGCTCCCGGCTCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115626 GAATTGCTGGAGACTTTGCACCTGGGCTTGGCCAGCTCCCGGCTCAGACC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 TGAAGCTGAGCCAGAGCTAG         GTGTGAAGACTCCAGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115676 TGAAGCTGAGCCAGAGCTAGGTG...CAGGTGTGAAGACTCCAGAGGAGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 GCTGCCTCCTGAACACTGCCCATGTTACTGGCCCTGAGGCCCGCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115950 GCTGCCTCCTGAACACTGCCCATGTTACTGGCCCTGAGGCCCGCTGTGCT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3430 GCCCTTCGGGAGGAATTCCTGGCCTTCCGCCGCCGCCGAGATGCTACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116000 GCCCTTCGGGAGGAATTCCTGGCCTTCCGCCGCCGCCGAGATGCTACTAG

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3480 GGCTCGGCTACCAGCCTATCGACAGCCAGTCCCCCACCCCGAACAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116050 GGCTCGGCTACCAGCCTATCGACAGCCAGTCCCCCACCCCGAACAGGCCA

   3700     .
   3530 CTCTGCTG
        ||||||||
 116100 CTCTGCTG