seq1 = pF1KSDA1349.tfa, 2217 bp
seq2 = pF1KSDA1349/gi568815581r_16522291.tfa (gi568815581r:16522291_16724507), 202217 bp

>pF1KSDA1349 2217
>gi568815581r:16522291_16724507 (Chr17)

(complement)

1-2217  (100001-102217)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCAAACCTGCAACCAAGAATGCTACACGAACAAAGGCTATTTC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCAAACCTGCAACCAAGAAGGCTACACGAACAAAGGCTATTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAAGATTTATCACAGGAGGCCATACTAGAGAAACTTACAGAGAATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAAGATTTATCACAGGAGGCCATACTAGAGAAACTTACAGAGAATGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGGGATTCCAGAATGGAAGGGTTATGGAAATGGAATGATAGGATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTGGGATTCCAGAATGGAAGGGTTATGGAAATGGAATGATAGGATATTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGATTACAAAATAATCAGGAGAATCATTTGAGTCAAAGAATAATTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGATTACAAAATAATCAGGAGAATCATTTGAGTCAAAGAATAATTCCACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGAAGACTCCCACTAGTCAAAGAGGCTTTAGATTTGAATCTATTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGAAGACTCCCACTAGTCAAAGAGGCTTTAGATTTGAATCTATTCTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCCAGAACCAGGCATTGCCACAGAAGAGCTTCACAGCAGATGCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCCAGAACCAGGCATTGCCACAGAAGAGCTTCACAGCAGATGCCAAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAGAGGAAAATTTCACAGAGAATTTAAATTTGATTACAGATACCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAGAGGAAAATTTCACAGAGAATTTAAATTTGATTACAGATACCCATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGGAAGATAATTTGCAAGGAGATGAAAGGCAGCAAAGCCATAAGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGGAAGATAATTTGCAAGGAGATGAAAGGCAGCAAAGCCATAAGGCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTTCAGAACTAACTTTGGGGAAAAAATCCAATAATAAGGAAAAACCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTTCAGAACTAACTTTGGGGAAAAAATCCAATAATAAGGAAAAACCCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAATGTAGTACATGCGAAAAGGCCTTTCATTATAGATCATTGCTCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAATGTAGTACATGCGAAAAGGCCTTTCATTATAGATCATTGCTCATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACATCAAAGAACTCATACTAAAGAAAAACCTTATGAATGTAATGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACATCAAAGAACTCATACTAAAGAAAAACCTTATGAATGTAATGAATGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAAAACATTCAGCCAGCCTTCATATCTCAGTCAGCACAAAAAAATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAAAACATTCAGCCAGCCTTCATATCTCAGTCAGCACAAAAAAATCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCATTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCTTCATCACTTATGGTACATCAGAGAATTCACACTAAAGAGAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCTTCATCACTTATGGTACATCAGAGAATTCACACTAAAGAGAAACCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATCAGTGTAATGTGTGTGGGAAATCTTTTAGCCAGTGTGCCCGTCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATCAGTGTAATGTGTGTGGGAAATCTTTTAGCCAGTGTGCCCGTCTTAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGCACCAGAGAATTCAAACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAGTGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGCACCAGAGAATTCAAACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAGTGAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGGAAAGCTTTTAGTGATAAATCAAAACTTGCAAGACATCAGGAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGGGAAAGCTTTTAGTGATAAATCAAAACTTGCAAGACATCAGGAAACTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAATGGTGAGAAACCCTACAAATGTGATGATTGTGGGAAAGCCTTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACAATGGTGAGAAACCCTACAAATGTGATGATTGTGGGAAAGCCTTTAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACAAGTCATATCTTAGTGTACATCAGAAGACCCACACTGAAGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACAAGTCATATCTTAGTGTACATCAGAAGACCCACACTGAAGAGAAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ATATCAGTGCAACGAGTGTGGGAAGTCTTTTAAGAATACCACAATTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ATATCAGTGCAACGAGTGTGGGAAGTCTTTTAAGAATACCACAATTTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGTGCATCAGAGGATTCATACTGGAGAGAAACCTTTTAGATGTAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGTGCATCAGAGGATTCATACTGGAGAGAAACCTTTTAGATGTAACGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TGTGGAAAAGCCTATAGAAGTAATTCAAGCCTTATCGTACATATAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TGTGGAAAAGCCTATAGAAGTAATTCAAGCCTTATCGTACATATAAGAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCACACTGGGGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCACACTGGGGAAAAACCCTATGAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACCGCATCGCAAATTTCACAGAACATCAGCGAATTCACACAGGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACCGCATCGCAAATTTCACAGAACATCAGCGAATTCACACAGGAGAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCATTAATTATTCATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCCTATAAATGTAATGAATGTGGGAAAGCATTCATTAATTATTCATGCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TACTGTACACCACAGAATGCATACAGGAGAGAAACCTTATAAATGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TACTGTACACCACAGAATGCATACAGGAGAGAAACCTTATAAATGTACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AATGTGGAAAGGCCTTCATGCGTTCTTCTTCTCTAATTATACATCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AATGTGGAAAGGCCTTCATGCGTTCTTCTTCTCTAATTATACATCAGCGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATTCATACTGAAGAGAAACCTTATCTGTGCAATGAATGTGGGGAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATTCATACTGAAGAGAAACCTTATCTGTGCAATGAATGTGGGGAGTCTTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAGAATAAAATCACACTTAACTGTACATCAGAGAATTCACACTGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAGAATAAAATCACACTTAACTGTACATCAGAGAATTCACACTGGAGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AACCATATAAATGTACTGACTGCGAGAGGGCATTCACCAAAATGGTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AACCATATAAATGTACTGACTGCGAGAGGGCATTCACCAAAATGGTAAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CTCAAGGAGCATCAGAAAATTCATACTGGAGTGAAACCCTATAAATGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CTCAAGGAGCATCAGAAAATTCATACTGGAGTGAAACCCTATAAATGTTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TGACTGTGGAAAGTCCTTTAGGACTAAATCATACCTTATTGTACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TGACTGTGGAAAGTCCTTTAGGACTAAATCATACCTTATTGTACATCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GGACCCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTAATGAATGTGAGAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GGACCCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTAATGAATGTGAGAAAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTCACTAATACATCACAGCTTACCGTGCACCAACGAAGGCATACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTCACTAATACATCACAGCTTACCGTGCACCAACGAAGGCATACTGGAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GAAGCCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAGGTTTTCACAAGTAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GAAGCCCTATAAATGCAATGAATGTGGAAAGGTTTTCACAAGTAACTCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GCTTTAATACACATCAAAGAACACATACTGGAGAGAAACCATTTAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GCTTTAATACACATCAAAGAACACATACTGGAGAGAAACCATTTAAATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AATGACTGTGGGAAAGCATTTAGCCAGATGGTACATGTCACAGAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AATGACTGTGGGAAAGCATTTAGCCAGATGGTACATGTCACAGAACATCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GAAAATCCATAGTGGAGAGAAGCCCTATAAGTGTGATGTCTGTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GAAAATCCATAGTGGAGAGAAGCCCTATAAGTGTGATGTCTGTGGAAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CCTTCAGGAGGGGTTCTTACCTTACAGTGCATTGGAGAACACACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CCTTCAGGAGGGGTTCTTACCTTACAGTGCATTGGAGAACACACACTGGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GAAAAACCCTACACCTGTAAGGAATGTGGAAAGGGTTGTATTACTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GAAAAACCCTACACCTGTAAGGAATGTGGAAAGGGTTGTATTACTCTATC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 ACAGCTAACCCTACATCAGAGAATTCATACTGGGGAGAGGCCCTATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 ACAGCTAACCCTACATCAGAGAATTCATACTGGGGAGAGGCCCTATAAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 GTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTCAGAACTAACTCAGACTTTACTGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 GTGAAGAATGTGGAAAAGCCTTCAGAACTAACTCAGACTTTACTGTACAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 TTGAGGATGCATACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 TTGAGGATGCATACTGGAGAAAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 AGCCTTCAGGAGTAGTTCGAGCCTTACTGTACATCAAAGAATACATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 AGCCTTCAGGAGTAGTTCGAGCCTTACTGTACATCAAAGAATACATCAAA

   2200     .    :    .
   2201 GAGAAACTCAGTTAATA
        |||||||||||||||||
 102201 GAGAAACTCAGTTAATA