seq1 = pF1KSDA1344.tfa, 2475 bp
seq2 = pF1KSDA1344/gi568815584r_52332307.tfa (gi568815584r:52332307_52643557), 311251 bp

>pF1KSDA1344 2475
>gi568815584r:52332307_52643557 (Chr14)

(complement)

1-160  (100001-100160)   100% ->
161-243  (101105-101187)   100% ->
244-317  (105886-105959)   100% ->
318-392  (106765-106839)   100% ->
393-514  (124265-124386)   100% ->
515-605  (128588-128678)   98% ->
606-756  (132168-132318)   100% ->
757-923  (152553-152719)   100% ->
924-984  (153107-153167)   100% ->
985-1108  (155072-155195)   100% ->
1109-1252  (160593-160736)   100% ->
1253-1312  (161269-161328)   100% ->
1313-1481  (172878-173046)   99% ->
1482-1618  (173385-173521)   100% ->
1619-1703  (186384-186468)   100% ->
1704-1842  (188096-188234)   100% ->
1843-2003  (202834-202994)   99% ->
2004-2194  (204164-204354)   99% ->
2195-2475  (210971-211251)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTCCGGCTTCAATGTCTTTAGAGTTGGGATCTCTTTTGTCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTTCCGGCTTCAATGTCTTTAGAGTTGGGATCTCTTTTGTCATAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCATTTTTTACATGCCAACAGTAAACTCTTTACCAGAACTGAGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCATTTTTTACATGCCAACAGTAAACTCTTTACCAGAACTGAGTCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAATATTTTAGTACATTGCAACCAGGAAAAGCCTCTTTAGCTTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAATATTTTAGTACATTGCAACCAGGAAAAGCCTCTTTAGCTTATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTCAAGCTG         ATTCCCCAAGAACATCTGTATTTCTTGAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTCAAGCTGGTA...TAGATTCCCCAAGAACATCTGTATTTCTTGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTGAATGAGGCTGTTAGACCTCTGCAGGACTATGGAATTTCAGTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101136 ACTGAATGAGGCTGTTAGACCTCTGCAGGACTATGGAATTTCAGTTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AG         GTTAATTGTGTCAAAGAAGAAATATCAAGATACTGTGGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101186 AGGTA...AAGGTTAATTGTGTCAAAGAAGAAATATCAAGATACTGTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAAGAAAAGGATTTGATGAAAGCATATTTATTCAA         GGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105925 AAAGAAAAGGATTTGATGAAAGCATATTTATTCAAGTA...TAGGGGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATATTGCTCAGAGAATTCCCTACTGACACCTTGTTTGATGTGAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106771 CATATTGCTCAGAGAATTCCCTACTGACACCTTGTTTGATGTGAATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTGTCGCCCATGTTCTCTT         TGCTCTTCTTTTTAGTGAAGTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 106821 TTGTCGCCCATGTTCTCTTGTA...CAGTGCTCTTCTTTTTAGTGAAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAATATATTACCAACCTGGAAGACCTTCAGAACATAGAAAATGCTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124287 AAATATATTACCAACCTGGAAGACCTTCAGAACATAGAAAATGCTCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGGAAAAGCAAATATTATATTCTCATATGTAAGAGCCATTGGAATACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124337 AGGAAAAGCAAATATTATATTCTCATATGTAAGAGCCATTGGAATACCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515          AGCACAGAGCAGTCATGGAAGCCGGTTTTGTGTATGGGACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 124387 GTA...CAGAGCACAGAGCAGTCATGGAAGCCGCTTTTGTGTATGGGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACATACCAATTTGTCTTAACCACAGAAATTGCCCTTTTGGAAAGTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128629 ACATACCAATTTGTCTTAACCACAGAAATTGCCCTTTTGGAAAGTATTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606          CTCTGAGGATGTGGAATATGCACATCTCTACTTTTTTCATT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128679 GTA...TAGCTCTGAGGATGTGGAATATGCACATCTCTACTTTTTTCATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTAAACTAGTCTTGGACTTGACCCAGCAATGTAGAAGAACACTAATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132209 GTAAACTAGTCTTGGACTTGACCCAGCAATGTAGAAGAACACTAATGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGCCATTGACTACACTGAACATTCACCTGTTTATTAAGACAATGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132259 CAGCCATTGACTACACTGAACATTCACCTGTTTATTAAGACAATGAAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACCTCTGTTG         ACTGAAGTTGCTGAAGATCCTCAACAAGTTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 132309 ACCTCTGTTGGTA...AAGACTGAAGTTGCTGAAGATCCTCAACAAGTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAACTGTCCATCTCCAACTGGGCTTACCACTGGTTTTTATTGTTAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152584 CAACTGTCCATCTCCAACTGGGCTTACCACTGGTTTTTATTGTTAGCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGGCTACTTATGAAGCTGATAGAAGAACTGCAGAATGGGTTGCTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152634 CAGGCTACTTATGAAGCTGATAGAAGAACTGCAGAATGGGTTGCTTGGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCTTCTGGGAAAAGCAGGAGTTCTACTCTTGTTAAG         GGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 152684 TCTTCTGGGAAAAGCAGGAGTTCTACTCTTGTTAAGGTA...AAGGGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTTTGGAAGTGAACATTCCTCAAGATGCTAATGTGGTCTTCAAAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153112 CTTTGGAAGTGAACATTCCTCAAGATGCTAATGTGGTCTTCAAAAGAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAGAG         GGAGTTCCAGTGGAATTTTTGGTATTACATGATGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153162 GAAGAGGTT...TAGGGAGTTCCAGTGGAATTTTTGGTATTACATGATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGATTTAATAATATCTCATGTGGAAAATAATATGCACATTGAGGAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155107 TGATTTAATAATATCTCATGTGGAAAATAATATGCACATTGAGGAAATAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AAGAAGATGAAGACAATGACATGGAAGGTCCAGATATAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 155157 AAGAAGATGAAGACAATGACATGGAAGGTCCAGATATAGGTA...TAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GTTCAGGATGATGAAGTGGCAGAAACTGTTTTCAGAGATAGGAAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160595 GTTCAGGATGATGAAGTGGCAGAAACTGTTTTCAGAGATAGGAAGAGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 ATTACCTTTGGAACTTACAGTGGAACTAACAGAAGAAACATTTAATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160645 ATTACCTTTGGAACTTACAGTGGAACTAACAGAAGAAACATTTAATGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGTGATGGCTTCTGACAGCATAGTACTCTTCTATGCTGGTT        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 160695 CAGTGATGGCTTCTGACAGCATAGTACTCTTCTATGCTGGTTGTG...TA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1253  GGCAAGCAGTATCCATGGCATTTTTGCAATCCTATATTGATGTGGCAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161268 GGGCAAGCAGTATCCATGGCATTTTTGCAATCCTATATTGATGTGGCAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TAAACTGAAAG         GCACATCTACTATGCTTCTTACTAGAATAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 161318 TAAACTGAAAGGTA...TAGGCACATCTACTATGCTTCTTACTAGAATAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 ACTGTGCAGATTGGTCTGATGTATGTACTAAGCAAAATGTTACTGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172908 ACTGTGCAGATTGGTCTGATGTATGTACTAAGCAAAATGTTACTGAATTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CCTATCATAAAGATGTACAAGAAAGGCGAGAACCCAGTATCTTATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172958 CCTATCATAAAGATGTACAAGAAAGGCGAGAACCCAGTATCTTATGCTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AATGTTAGGAACCAAAGATCTCCTAAAATTTATCCAGCT         CA
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 173008 AATGTTAGGAACCGAAGATCTCCTAAAATTTATCCAGCTGTA...CAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ACAGGATTTCATATCCAGTGAATATAACATCGATCCAAGAAGCAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173387 ACAGGATTTCATATCCAGTGAATATAACATCGATCCAAGAAGCAGAAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TATTTAAGTGGGGAATTATATAAAGACCTCATCTTGTATTCTAGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173437 TATTTAAGTGGGGAATTATATAAAGACCTCATCTTGTATTCTAGTGTGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 AGTATTGGGACTATTTAGTCCAACCATGAAAACAG         CAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 173487 AGTATTGGGACTATTTAGTCCAACCATGAAAACAGGTA...TAGCAAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AAGATTTTAGTGAAGCAGGAAACTACCTAAAAGGATATGTTATCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186390 AAGATTTTAGTGAAGCAGGAAACTACCTAAAAGGATATGTTATCACTGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 ATTTATTCTGAAGAAGATGTTTTGCTACT         GTCAACCAAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 186440 ATTTATTCTGAAGAAGATGTTTTGCTACTGTA...TAGGTCAACCAAATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TGCTGCAAGTCTTCCAGCCCTGCTGCTTGCCAGACACACAGAAGGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188108 TGCTGCAAGTCTTCCAGCCCTGCTGCTTGCCAGACACACAGAAGGCAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TAGAGAGCATCCCACTAGCTAGCACACATGCACAAGACATAGTTCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188158 TAGAGAGCATCCCACTAGCTAGCACACATGCACAAGACATAGTTCAAATA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 ATAACAGATGCACTACTGGAAATGTTT         CCGGAAATCACTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 188208 ATAACAGATGCACTACTGGAAATGTTTGTG...CAGCCGGAAATCACTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 GGAAAATCTTCCCAGTTATTTCAGACTTCAGAAACCATTATTGATTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202848 GGAAAATCTTCCCAGTTATTTCAGACTTCAGAAACCATTATTGATTTTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 TCAGTGATGGCACTGTAAATCCTCAATATAAAAAAGCAATATTGACACTG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 202898 TCAGTGATGGCACTGTAAATCCTCAGTATAAAAAAGCAATATTGACACTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GTAAAGCAGAAATACTTGGATTCATTTACTCCATGCTGGTTAAATCT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 202948 GTAAAGCAGAAATACTTGGATTCATTTACTCCATGCTGGTTAAATCTGTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2004       AAAGAATACTCCAGTGGGGAGAGGAATCTTGCGGGCATATTTTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 202998 ...CAGAAAGAATACTCCAGTGGGGAGAGGAATCTTGAGGGCATATTTTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 ATCCTCTGCCTCCCCTTCCTCTTCTTGTTTTGGTGAATCTGCATTCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204208 ATCCTCTGCCTCCCCTTCCTCTTCTTGTTTTGGTGAATCTGCATTCAGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GGCCAAGTATTTGCATTTCCTTCAGACCAGGCTATAATTGAAGAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204258 GGCCAAGTATTTGCATTTCCTTCAGACCAGGCTATAATTGAAGAAAACCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 TGTATTGTGGCTGAAGAAATTAGAAGCAGGACTAGAAAATCATATCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 204308 TGTATTGTGGCTGAAGAAATTAGAAGCAGGACTAGAAAATCATATCAGTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2195       CAATTTTACCTGCTCAAGAATGGAAACCTCCTCTTCCAGCTTAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204358 ...CAGCAATTTTACCTGCTCAAGAATGGAAACCTCCTCTTCCAGCTTAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GATTTTCTAAGTATGATAGATGCCGCAACATCTCAACGTGGCACTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211015 GATTTTCTAAGTATGATAGATGCCGCAACATCTCAACGTGGCACTAGGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 AGTTCCCAAGTGTATGAAAGAAACAGATGTGCAGGAGAATGATAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211065 AGTTCCCAAGTGTATGAAAGAAACAGATGTGCAGGAGAATGATAAGGAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AACATGAAGATAAATCGGCAGTCAGAAAAGAACCGATTGAAACTCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211115 AACATGAAGATAAATCGGCAGTCAGAAAAGAACCGATTGAAACTCTGAGA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 ATAAAGCATTGGAATAGAAGTAATTGGTTTAAAGAAGCAGAAAAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211165 ATAAAGCATTGGAATAGAAGTAATTGGTTTAAAGAAGCAGAAAAATCATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .
   2439 TAGACGTGATAAAGAGTTAGGATGCTCAAAAGTGAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211215 TAGACGTGATAAAGAGTTAGGATGCTCAAAAGTGAAC