seq1 = pF1KSDA1279.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KSDA1279/gi568815588f_68888833.tfa (gi568815588f:68888833_69116413), 227581 bp

>pF1KSDA1279 1863
>gi568815588f:68888833_69116413 (Chr10)

1-426  (100001-100426)   99% ->
427-525  (111592-111690)   100% ->
526-605  (116214-116293)   100% ->
606-789  (116900-117083)   100% ->
790-874  (120009-120093)   100% ->
875-990  (122068-122183)   100% ->
991-1863  (126709-127581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAACGTTCCGTGGGCAGAGGTCTGCGAGAAATTCCAGGCGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAACGTTCCGTGGGCAGAGGTCTGCGAGAAATTCCAGGCGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCTGTCGCGGGTGGAACTGCATAAAAATCCGGAGAAGGAACCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCTGTCGCGGGTGGAACTGCATAAAAATCCGGAGAAGGAACCATACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCCAAATACAGCGCCCGGGCGCTACTGGAAGAGGTCAAGGCGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCCAAATACAGCGCCCGGGCGCTACTGGAAGAGGTCAAGGCGCTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCTGCGCCTGAGGACGAGGATGAGCGGCCTGAGGCCGAGGACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100151 GGCCCTGCGCCTGAGGACGAGGATGAGCGGCCTGAGGCCGAGGACGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGTGCCGGTGACCACGCCCTGGGGCTGCCGGCTGAGGTGGTGGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGTGCCGGTGACCACGCCCTGGGGCTGCCGGCTGAGGTGGTGGAGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGGCCCGTCGCCCAGCGAGCGGTGAGGCTGGCAGTCATCGAGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGGGCCCGTCGCCCAGCGAGCGGTGAGGCTGGCAGTCATCGAGTTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCGGGGTGAACCACATCGACACGGAGGAGCTGTCGGCGGGGGAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCGGGGTGAACCACATCGACACGGAGGAGCTGTCGGCGGGGGAGGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGGTGAAATGCCTGCGGCTGCTGCGCAGGTACCGGCTCTCGCACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGGTGAAATGCCTGCGGCTGCTGCGCAGGTACCGGCTCTCGCACGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCATCTCTCTCTGCATCCAGGCGCAG         AATAACCTGGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100401 GCATCTCTCTCTGCATCCAGGCGCAGGTG...CAGAATAACCTGGGTATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTGTGGTCTGAAAGAGAAGAAATTGAAACTGCACAGGCTTACCTAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111607 TTGTGGTCTGAAAGAGAAGAAATTGAAACTGCACAGGCTTACCTAGAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATCAGAAGCACTATATAATCAGTATATGAAAGAG         GTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111657 ATCAGAAGCACTATATAATCAGTATATGAAAGAGGTA...TAGGTTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GTCCTCCTCTTGATCCTACTGAGCGTTTTCTTCCTGAAGAAGAGAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116221 GTCCTCCTCTTGATCCTACTGAGCGTTTTCTTCCTGAAGAAGAGAAACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ACTGAACAAGAGAGATCAAAAAG         ATTTGAAAAGGTTTATAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 116271 ACTGAACAAGAGAGATCAAAAAGGTG...CAGATTTGAAAAGGTTTATAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCATAACCTATATTACCTAGCTCAAGTCTACCAGCATCTGGAAATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116918 TCATAACCTATATTACCTAGCTCAAGTCTACCAGCATCTGGAAATGTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAAGGCTGCTCACTATTGCCATAGTACACTAAAACGCCAGCTTGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116968 AGAAGGCTGCTCACTATTGCCATAGTACACTAAAACGCCAGCTTGAGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AATGCCTACCATCCTATAGAGTGGGCTATCAATGCTGCTACCTTGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117018 AATGCCTACCATCCTATAGAGTGGGCTATCAATGCTGCTACCTTGTCACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GTTTTACATCAATAAG         CTATGCTTTATGGAGGCCAGGCACT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117068 GTTTTACATCAATAAGGTA...TAGCTATGCTTTATGGAGGCCAGGCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GTTTATCAGCTGCTAATGTCATTTTTGGTCAAACTGGAAAGATCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120034 GTTTATCAGCTGCTAATGTCATTTTTGGTCAAACTGGAAAGATCTCAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACAGAAGACA         CTCCTGAAGCTGAAGGAGAAGTGCCAGAGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 120084 ACAGAAGACAGTA...TAGCTCCTGAAGCTGAAGGAGAAGTGCCAGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TTATCATCAAAGAAAGGGGGAAATAGCAAGGTGCTGGATCAAATACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122099 TTATCATCAAAGAAAGGGGGAAATAGCAAGGTGCTGGATCAAATACTGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGACTCTCATGCAGAATGCCCAACTCTCCATGCAG         GACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 122149 TGACTCTCATGCAGAATGCCCAACTCTCCATGCAGGTA...CAGGACAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATAGGAGAGCTTGATCTTGATAAACAGTCTGAACTTAGAGCTTTAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126715 ATAGGAGAGCTTGATCTTGATAAACAGTCTGAACTTAGAGCTTTAAGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AAAAGAACTAGATGAGGAGGAAAGCATTCGGAAAAAAGCTGTGCAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126765 AAAAGAACTAGATGAGGAGGAAAGCATTCGGAAAAAAGCTGTGCAGTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GAACCGGTGAACTGTGTGATGCCATCTCTGCAGTAGAAGAGAAAGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126815 GAACCGGTGAACTGTGTGATGCCATCTCTGCAGTAGAAGAGAAAGTGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TACTTGAGACCTTTAGATTTTGAAGAAGCCAGAGAACTTTTCTTATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126865 TACTTGAGACCTTTAGATTTTGAAGAAGCCAGAGAACTTTTCTTATTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCAGCACTATGTCTTTGAGGCAAAAGAGTTCTTTCAGATTGATGGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126915 TCAGCACTATGTCTTTGAGGCAAAAGAGTTCTTTCAGATTGATGGTTATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TCACTGACCATATTGAAGTTGTCCAAGACCACAGTGCTCTGTTTAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126965 TCACTGACCATATTGAAGTTGTCCAAGACCACAGTGCTCTGTTTAAGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CTTGCATTCTTTGAAACTGACATGGAGAGACGGTGCAAGATGCATAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127015 CTTGCATTCTTTGAAACTGACATGGAGAGACGGTGCAAGATGCATAAACG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CAGAATAGCCATGCTAGAGCCCCTAACTGTAGACCTGAATCCACAGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127065 CAGAATAGCCATGCTAGAGCCCCTAACTGTAGACCTGAATCCACAGTATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ATCTGTTGGTCAACAGACAGATCCAGTTTGAAATTGCACATGCTTACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127115 ATCTGTTGGTCAACAGACAGATCCAGTTTGAAATTGCACATGCTTACTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GATATGATGGATTTGAAGGTTGCCATTGCTGACAGGCTAAGGGATCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127165 GATATGATGGATTTGAAGGTTGCCATTGCTGACAGGCTAAGGGATCCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TTCACACATTGTAAAAAAAATAAATAATCTTAATAAGTCAGCACTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127215 TTCACACATTGTAAAAAAAATAAATAATCTTAATAAGTCAGCACTGAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ACTACCAGCTCTTCTTAGACTCCCTGAGAGACCCAAATAAAGTATTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127265 ACTACCAGCTCTTCTTAGACTCCCTGAGAGACCCAAATAAAGTATTCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GAGCATATAGGGGAAGATGTTCTTCGCCCTGCCATGTTAGCTAAGTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127315 GAGCATATAGGGGAAGATGTTCTTCGCCCTGCCATGTTAGCTAAGTTTCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 AGTTGCCCGTCTCTATGGCAAAATCATTACTGCAGATCCCAAGAAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127365 AGTTGCCCGTCTCTATGGCAAAATCATTACTGCAGATCCCAAGAAAGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TGGAAAATTTGGCAACATCATTGGAACATTACAAATTTATTGTTGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127415 TGGAAAATTTGGCAACATCATTGGAACATTACAAATTTATTGTTGATTAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TGTGAAAAGCATCCTGAGGCCGCCCAGGAAATAGAAGTTGAGCTAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127465 TGTGAAAAGCATCCTGAGGCCGCCCAGGAAATAGAAGTTGAGCTAGAACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TAGTAAAGAGATGGTTAGTCTTCTCCCAACAAAAATGGAGAGATTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127515 TAGTAAAGAGATGGTTAGTCTTCTCCCAACAAAAATGGAGAGATTCAGAA

   1900     .    :    .
   1847 CCAAGATGGCCCTGACT
        |||||||||||||||||
 127565 CCAAGATGGCCCTGACT