seq1 = pF1KSDA1267.tfa, 3315 bp
seq2 = pF1KSDA1267/gi568815581r_45931479.tfa (gi568815581r:45931479_46272143), 340665 bp

>pF1KSDA1267 3315
>gi568815581r:45931479_46272143 (Chr17)

(complement)

1-1289  (100001-101289)   100% ->
1290-1431  (177443-177584)   100% ->
1432-1533  (189602-189703)   100% ->
1534-1652  (204477-204595)   100% ->
1653-1848  (205412-205607)   100% ->
1849-2020  (221440-221611)   100% ->
2021-2203  (232260-232442)   100% ->
2204-2392  (232929-233117)   100% ->
2393-2541  (233458-233606)   100% ->
2542-2666  (237859-237983)   100% ->
2667-2724  (238684-238741)   100% ->
2725-2837  (238952-239064)   100% ->
2838-3090  (239845-240097)   99% ->
3091-3315  (240441-240665)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGATGGCGCCCGCTCTCACTGACGCAGCAGCTGAAGCACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCGATGGCGCCCGCTCTCACTGACGCAGCAGCTGAAGCACACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATCCGGTTCAAACTGGCTCCCCCATCCTCTACCTTGTCCCCTGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATCCGGTTCAAACTGGCTCCCCCATCCTCTACCTTGTCCCCTGGCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAAAATAACGGCAACGCCAACATCCTTATTGCTGCCAACGGAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAAAATAACGGCAACGCCAACATCCTTATTGCTGCCAACGGAACCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAAAAGCCATTGCTGCAGAGGATCCCAGCCTAGATTTCCGAAATAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAAAAGCCATTGCTGCAGAGGATCCCAGCCTAGATTTCCGAAATAATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TACCAAGGAAGACTTGGGAAAGCTGCAACCACTGGTGGCATCTTATCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TACCAAGGAAGACTTGGGAAAGCTGCAACCACTGGTGGCATCTTATCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTCTGATGTAACATCTGTTCCCTCAAAGGAGTCTTTGAAGTTGCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTCTGATGTAACATCTGTTCCCTCAAAGGAGTCTTTGAAGTTGCAAGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCTTCAGCAAGCAGACAGTCCTTAAATCTCATCCTCTCTTATCTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCTTCAGCAAGCAGACAGTCCTTAAATCTCATCCTCTCTTATCTCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGAACTCCGAGCTGAGCTGTTGGGGAGACAGCCAGTTTTGGAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGAACTCCGAGCTGAGCTGTTGGGGAGACAGCCAGTTTTGGAGTTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTAGAAAATCTTAGAACCATGAATACGAGTGGTCAGACAGCTCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTAGAAAATCTTAGAACCATGAATACGAGTGGTCAGACAGCTCTGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAAGCACCTGTAAATGGGTTGGCTAAGAAATTGACTAAAAGTTCAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAAGCACCTGTAAATGGGTTGGCTAAGAAATTGACTAAAAGTTCAACACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCTGATCATGACAATTCCACTTCCCTCAATGGGGGAAAACGGGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCTGATCATGACAATTCCACTTCCCTCAATGGGGGAAAACGGGCTCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTTCATCTGCTCTTCATGGGGGTGAAATGGGAGGATCTGAATCTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTTCATCTGCTCTTCATGGGGGTGAAATGGGAGGATCTGAATCTGGGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGAAGGGGGGTATGACCAATTGCACTCTTCCACATAGAAGCCTTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGAAGGGGGGTATGACCAATTGCACTCTTCCACATAGAAGCCTTGATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAACACACAACTTTGTATAGCAATAATAGCACTGCAAACAAATCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAACACACAACTTTGTATAGCAATAATAGCACTGCAAACAAATCCTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAATTCCATGGAACAGCCGGCACTTCAAGGAAGCAGTAGATTATCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAATTCCATGGAACAGCCGGCACTTCAAGGAAGCAGTAGATTATCACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTACAGACTCCAGCTCTAACTTGGGGGGTGTCAAATTGGAGGGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTACAGACTCCAGCTCTAACTTGGGGGGTGTCAAATTGGAGGGTAAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCTCCCCTGTCTTCCATTCTTTTCAGTGCTTTAGATTCTGACACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCTCCCCTGTCTTCCATTCTTTTCAGTGCTTTAGATTCTGACACAAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAACAGCTTTACTGCGGCGACAGGCTGACATTGAGAGCCGTGCCCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAACAGCTTTACTGCGGCGACAGGCTGACATTGAGAGCCGTGCCCGCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTACAAAAGCGCTTACAGGTTGTGCAAGCCAAGCAGGTTGAGAGGCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTACAAAAGCGCTTACAGGTTGTGCAAGCCAAGCAGGTTGAGAGGCATAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACAACATCAGCTGGGTGGATTTTTGGAGAAGACTTTGAGCAAACTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACAACATCAGCTGGGTGGATTTTTGGAGAAGACTTTGAGCAAACTGCCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACTTGGAATCCTTGAGACCACGGAGCCAGTTGATGCTGACTCGAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACTTGGAATCCTTGAGACCACGGAGCCAGTTGATGCTGACTCGAAAGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAGCTGCCTTGAGAAAAGCTGCCAGTGAGACCACCACTTCAGAGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAGCTGCCTTGAGAAAAGCTGCCAGTGAGACCACCACTTCAGAGGGACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TAGCAACTTTCTGAAAAGCAATTCAATTTCAGAAGAATTGGAGAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TAGCAACTTTCTGAAAAGCAATTCAATTTCAGAAGAATTGGAGAGATTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CAGCTAGTGGCATAGCCAACTTGAGGTGCAGTGAACAGGCATTTGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CAGCTAGTGGCATAGCCAACTTGAGGTGCAGTGAACAGGCATTTGATTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATGTCACTGACAGTAGTTCAGGAGGGGAGTCTGATATTGAAGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATGTCACTGACAGTAGTTCAGGAGGGGAGTCTGATATTGAAGAGGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACTGACCAGAGCTGATCCCGAGCAGCGTCATGTACCCCT         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101251 ACTGACCAGAGCTGATCCCGAGCAGCGTCATGTACCCCTGTG...TAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GACGCAGGTCAGAATGGAAATGGGCTGCAGACCGGGCAGCTATTGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177445 GACGCAGGTCAGAATGGAAATGGGCTGCAGACCGGGCAGCTATTGTCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CGCTGGAACTGGCTTCAGGCTCATGTTTCTGACTTGGAATATCGAATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177495 CGCTGGAACTGGCTTCAGGCTCATGTTTCTGACTTGGAATATCGAATTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TCAGCAAACAGACATTTACAAACAGATACGTGCTAATAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 177545 TCAGCAAACAGACATTTACAAACAGATACGTGCTAATAAGGTA...CAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GGTTGATAGTTCTTGGGGAGGTACCTCCCCCAGAGCATACAACAGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189603 GGTTGATAGTTCTTGGGGAGGTACCTCCCCCAGAGCATACAACAGACTTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 TTTCTTCCACTTAGTTCTGAGGTGAAGACAGATCATGGGACTGATAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189653 TTTCTTCCACTTAGTTCTGAGGTGAAGACAGATCATGGGACTGATAAATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 G         ATTGAGTCTGTTTCTCAGCCATTGGAAAACCATGGTGCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189703 GGTA...CAGATTGAGTCTGTTTCTCAGCCATTGGAAAACCATGGTGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CTATTATTGGTCATATTTCAGAGTCACTGTCTACCAAATCATGTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204517 CTATTATTGGTCATATTTCAGAGTCACTGTCTACCAAATCATGTGGAGCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CTCAGACCTGTCAATGGAGTTATTAACAC         TCTTCAGCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 204567 CTCAGACCTGTCAATGGAGTTATTAACACGTA...TAGTCTTCAGCCTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CTTGGCAGACCACATTCCAGGTGACAGCTCTGATGCTGAGGAACAATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205424 CTTGGCAGACCACATTCCAGGTGACAGCTCTGATGCTGAGGAACAATTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 ATAAGAAGCAACGACTGAATCTCGTCTCTTCATCATCTGATGGCACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205474 ATAAGAAGCAACGACTGAATCTCGTCTCTTCATCATCTGATGGCACCTGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GTGGCAGCCCGGACACGTCCTGTACTGAGCTGTAAGAAGCGGAGGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205524 GTGGCAGCCCGGACACGTCCTGTACTGAGCTGTAAGAAGCGGAGGCTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 TCGACCCAACAGCATCGTTCCTCTTTCCAAGAAG         GTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 205574 TCGACCCAACAGCATCGTTCCTCTTTCCAAGAAGGTC...CAGGTTCACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1856 GGAACAGCACAATCCGCCCTGGCTGTGATGTGAATCCCTCCTGCGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221447 GGAACAGCACAATCCGCCCTGGCTGTGATGTGAATCCCTCCTGCGCACTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 TGTGGTTCAGGCAGCATCAACACCATGCCTCCCGAAATTCACTATGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221497 TGTGGTTCAGGCAGCATCAACACCATGCCTCCCGAAATTCACTATGAAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CCCTCTGTTGGAACGTCTTTCCCAGTTGGACTCTTGTGTTCATCCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221547 CCCTCTGTTGGAACGTCTTTCCCAGTTGGACTCTTGTGTTCATCCTGTTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 TAGCATTTCCAGATG         ATGTTCCCACAAGCCTGCATTTCCAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 221597 TAGCATTTCCAGATGGTA...CAGATGTTCCCACAAGCCTGCATTTCCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 AGCATGCTGAAATCTCAGTGGCAGAACAAGCCTTTTGACAAAATCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232286 AGCATGCTGAAATCTCAGTGGCAGAACAAGCCTTTTGACAAAATCAAACC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 TCCCAAAAAGTTATCGCTTAAGCACAGAGCACCCATGCCGGGCAGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232336 TCCCAAAAAGTTATCGCTTAAGCACAGAGCACCCATGCCGGGCAGTCTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2147 CAGATTCAGCTCGTAAGGACAGGCACAAATTGGTCAGCTCCTTCCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232386 CAGATTCAGCTCGTAAGGACAGGCACAAATTGGTCAGCTCCTTCCTAACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2197 ACAGCCA         AGCTGTCCCATCACCAAACCCGGCCTGACAGGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232436 ACAGCCAGTA...CAGAGCTGTCCCATCACCAAACCCGGCCTGACAGGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 CCACAGGCAGCACTTAGACGATGTGGGGGCCGTGCCCATGGTGGAGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232963 CCACAGGCAGCACTTAGACGATGTGGGGGCCGTGCCCATGGTGGAGCGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 TGACAGCGCCAAAAGCAGAGCGCTTGCTCAACCCACCACCACCCGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233013 TGACAGCGCCAAAAGCAGAGCGCTTGCTCAACCCACCACCACCCGTGCAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 GACCCAAACCACAGCAAAATGAGATTGCGAGACCATTCATCTGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233063 GACCCAAACCACAGCAAAATGAGATTGCGAGACCATTCATCTGAGAGAAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 TGAAG         TGTTGAAGCATCACACAGACATGAGCAGTTCGAGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233113 TGAAGGTA...CAGTGTTGAAGCATCACACAGACATGAGCAGTTCGAGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 ACTTGGCAGCCACCCACCATCCTCCACACAGTCCCTTGGTGCGACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233494 ACTTGGCAGCCACCCACCATCCTCCACACAGTCCCTTGGTGCGACAGCTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2479 TCCACCTCCTCAGATTCCCCTGCACCCGCCAGCTCTAGCTCACAGGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233544 TCCACCTCCTCAGATTCCCCTGCACCCGCCAGCTCTAGCTCACAGGTTAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2529 AGCCAGCACATCG         CAGCAGCCAGTAAGGAGGAGAAGGGGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 233594 AGCCAGCACATCGGTA...CAGCAGCAGCCAGTAAGGAGGAGAAGGGGAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 AGAGCTCATTTGATATTAACAACATTGTCATCCCAATGTCTGTTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237887 AGAGCTCATTTGATATTAACAACATTGTCATCCCAATGTCTGTTGCTGCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 ACAACTCGCGTAGAGAAACTGCAATACAAGGAAATCCTTACGCCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 237937 ACAACTCGCGTAGAGAAACTGCAATACAAGGAAATCCTTACGCCCAGGTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2667       CTGGCGGGAGGTTGATCTTCAGTCTCTGAAGGGGAGTCCTGATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237987 ...CAGCTGGCGGGAGGTTGATCTTCAGTCTCTGAAGGGGAGTCCTGATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2711 AGGAGAATGAAGAG         ATTGAGGACCTATCCGACGCAGCCTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 238728 AGGAGAATGAAGAGGTA...CAGATTGAGGACCTATCCGACGCAGCCTTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 GCCGCCCTGCATGCCAAATGTGAGGAGATGGAGAGGGCACGGTGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238979 GCCGCCCTGCATGCCAAATGTGAGGAGATGGAGAGGGCACGGTGGCTGTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 GACCACGAGTGTGCCACCCCAGCGGCGGGGCAGCAG         GTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 239029 GACCACGAGTGTGCCACCCCAGCGGCGGGGCAGCAGGTG...CAGGTCCT

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2843 ACAGGTCATCAGACGGCCGGACAACCCCCCAGCTGGGCAGTGCCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239850 ACAGGTCATCAGACGGCCGGACAACCCCCCAGCTGGGCAGTGCCAACCCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2893 TCCACCCCCCAGCCTGCCTCCCCTGATGTCAGCAGTAGCCACTCTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239900 TCCACCCCCCAGCCTGCCTCCCCTGATGTCAGCAGTAGCCACTCTTTGTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2943 AGAATACTCCCATGGTCAGTCCCCTAGGAGCCCCATTAGCCCGGAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239950 AGAATACTCCCATGGTCAGTCCCCTAGGAGCCCCATTAGCCCGGAACTGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2993 ACTCAGCACCCCTCACCCCTGTGGCTCGGGACACTCTGCGACACTTAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 240000 ACTCAGCACCCCTCACCCCTGTGGCTCGGGACACTCCGCGACACTTAGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3043 AGTGAGGATACCCGTTGTTCCACACCAGAGCTGGGGCTGGATGAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 240050 AGTGAGGATACCCGTTGTTCCACACCAGAGCTGGGGCTGGATGAACAGGT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3091        TCTGTCCAGCCCTGGGAGCGGCGGACCTTCCCCCTGGCGCACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240100 A...CAGTCTGTCCAGCCCTGGGAGCGGCGGACCTTCCCCCTGGCGCACA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3134 GTCCCCAGGCGGAGTGTGAGGACCAGCTGGATGCACAGGAGCGAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240484 GTCCCCAGGCGGAGTGTGAGGACCAGCTGGATGCACAGGAGCGAGCAGCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3184 CGCTGCACTCGACGCACCTCAGGCAGCAAGACTGGCCGGGAGACAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240534 CGCTGCACTCGACGCACCTCAGGCAGCAAGACTGGCCGGGAGACAGAGGC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3234 AGCGCCCACCTCGCCTCCCATTGTCCCCCTCAAGAGTCGGCATCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240584 AGCGCCCACCTCGCCTCCCATTGTCCCCCTCAAGAGTCGGCATCTGGTGG

   3400     .    :    .    :    .    :
   3284 CAGCAGCCACAGCTCAGCGCCCGACTCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 240634 CAGCAGCCACAGCTCAGCGCCCGACTCACAGA