Result of SIM4 for
pF1KSDA1263
seq1 = pF1KSDA1263.tfa, 2538 bp
seq2 = pF1KSDA1263/gi568815594r_161285750.tfa (gi568815594r:161285750_162211396), 925647 bp
>pF1KSDA1263 2538
>gi568815594r:161285750_162211396 (Chr4)
(complement)
1-127 (100001-100127) 100% ==
156-406 (290743-290993) 100% ->
407-603 (435323-435519) 100% ->
604-724 (451866-451986) 100% ->
725-891 (554903-555069) 100% ->
892-1012 (623822-623942) 100% ->
1013-1174 (668704-668865) 100% ->
1175-1309 (673097-673231) 100% ->
1310-1336 (700973-700999) 100% ->
1337-1455 (711263-711381) 100% ->
1456-1605 (730228-730377) 100% ->
1606-1713 (752078-752185) 100% ->
1714-1838 (756269-756393) 100% ->
1839-2538 (824948-825647) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTTTAAGTGCTGGTCAGTTGTCTTGGTTCTCGGATTCATTTTTCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTTTAAGTGCTGGTCAGTTGTCTTGGTTCTCGGATTCATTTTTCTGGA
50 . : . : . : . : . :
51 GTCGGAAGGAAGGCCAACCAAAGAAGGAGGATATGGCCTTAAATCCTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GTCGGAAGGAAGGCCAACCAAAGAAGGAGGATATGGCCTTAAATCCTATC
100 . : . : .
101 AGCCTCTAATGAGATTGCGACATAAGG
|||||||||||||||||||||||||||
100101 AGCCTCTAATGAGATTGCGACATAAGG
0 . : . : . : . : . :
156 AGGATTTATGATTCAGGATGGCCCTTTTGGATCTTGTGAAAATAAGTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290743 AGGATTTATGATTCAGGATGGCCCTTTTGGATCTTGTGAAAATAAGTACT
50 . : . : . : . : . :
206 GTGGTTTGGGAAGACACTGTGTTACCAGCAGAGAGACAGGGCAAGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290793 GTGGTTTGGGAAGACACTGTGTTACCAGCAGAGAGACAGGGCAAGCAGAA
100 . : . : . : . : . :
256 TGTGCCTGTATGGACCTTTGCAAACGTCACTACAAACCTGTGTGTGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290843 TGTGCCTGTATGGACCTTTGCAAACGTCACTACAAACCTGTGTGTGGATC
150 . : . : . : . : . :
306 TGACGGAGAATTCTATGAAAACCACTGTGAAGTGCACAGAGCTGCTTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290893 TGACGGAGAATTCTATGAAAACCACTGTGAAGTGCACAGAGCTGCTTGCC
200 . : . : . : . : . :
356 TGAAAAAACAAAAGATTACCATTGTTCACAATGAAGACTGCTTCTTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290943 TGAAAAAACAAAAGATTACCATTGTTCACAATGAAGACTGCTTCTTTAAA
250 . : . : . : . : . :
406 G GAGATAAGTGCAAGACTACTGAATACAGCAAGATGAAAAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290993 GGTA...CAGGAGATAAGTGCAAGACTACTGAATACAGCAAGATGAAAAA
300 . : . : . : . : . :
447 TATGCTATTAGATTTACAAAATCAAAAATATATTATGCAAGAAAATGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
435363 TATGCTATTAGATTTACAAAATCAAAAATATATTATGCAAGAAAATGAAA
350 . : . : . : . : . :
497 ATCCTAATGGCGACGACATATCTCGGAAGAAGCTATTGGTGGATCAAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
435413 ATCCTAATGGCGACGACATATCTCGGAAGAAGCTATTGGTGGATCAAATG
400 . : . : . : . : . :
547 TTTAAATATTTTGATGCAGACAGTAATGGACTTGTAGATATTAATGAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
435463 TTTAAATATTTTGATGCAGACAGTAATGGACTTGTAGATATTAATGAACT
450 . : . : . : . : . :
597 AACTCAG GTGATAAAACAGGAAGAACTTGGCAAGGATCTCT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
435513 AACTCAGGTA...TAGGTGATAAAACAGGAAGAACTTGGCAAGGATCTCT
500 . : . : . : . : . :
638 TTGATTGTACTTTGTATGTTCTATTGAAATATGATGATTTTAATGCTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
451900 TTGATTGTACTTTGTATGTTCTATTGAAATATGATGATTTTAATGCTGAC
550 . : . : . : . : . :
688 AAGCACCTGGCTCTTGAAGAATTTTATAGAGCATTCC AAGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
451950 AAGCACCTGGCTCTTGAAGAATTTTATAGAGCATTCCGTG...CAGAAGT
600 . : . : . : . : . :
729 GATCCAGTTGAGTCTGCCAGAAGATCAGAAACTAAGCATCACTGCAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
554907 GATCCAGTTGAGTCTGCCAGAAGATCAGAAACTAAGCATCACTGCAGCAA
650 . : . : . : . : . :
779 CTGTGGGACAAAGTGCTGTTCTGAGCTGTGCCATTCAAGGAACCCTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
554957 CTGTGGGACAAAGTGCTGTTCTGAGCTGTGCCATTCAAGGAACCCTGAGA
700 . : . : . : . : . :
829 CCTCCCATTATCTGGAAAAGGAACAATATTATTCTAAATAATTTAGATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
555007 CCTCCCATTATCTGGAAAAGGAACAATATTATTCTAAATAATTTAGATTT
750 . : . : . : . : . :
879 GGAAGACATCAAT GACTTTGGAGATGATGGGTCCTTGTATA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
555057 GGAAGACATCAATGTG...TAGGACTTTGGAGATGATGGGTCCTTGTATA
800 . : . : . : . : . :
920 TTACTAAGGTTACCACAACTCACGTTGGCAATTACACCTGCTATGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
623850 TTACTAAGGTTACCACAACTCACGTTGGCAATTACACCTGCTATGCAGAT
850 . : . : . : . : . :
970 GGCTATGAACAAGTCTATCAGACTCACATCTTCCAAGTGAATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
623900 GGCTATGAACAAGTCTATCAGACTCACATCTTCCAAGTGAATGGTA...T
900 . : . : . : . : . :
1013 TTCCTCCAGTCATCCGGGTGTATCCAGAGAGTCAGGCTAGAGAGCCTG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
668702 AGTTCCTCCAGTCATCCGGGTGTATCCAGAGAGTCAGGCTAGAGAGCCTG
950 . : . : . : . : . :
1061 GGGTAACTGCCAGTCTTAGGTGCCATGCAGAGGGCATACCAAAGCCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
668752 GGGTAACTGCCAGTCTTAGGTGCCATGCAGAGGGCATACCAAAGCCTCAG
1000 . : . : . : . : . :
1111 CTTGGCTGGTTGAAGAATGGAATTGATATTACACCAAAGCTTTCCAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
668802 CTTGGCTGGTTGAAGAATGGAATTGATATTACACCAAAGCTTTCCAAACA
1050 . : . : . : . : . :
1161 ACTCACGCTTCAAG CAAATGGCAGTGAGGTTCACATAAGCA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
668852 ACTCACGCTTCAAGGTG...CAGCAAATGGCAGTGAGGTTCACATAAGCA
1100 . : . : . : . : . :
1202 ATGTGCGCTATGAAGATACTGGAGCATACACTTGTATCGCAAAGAATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
673124 ATGTGCGCTATGAAGATACTGGAGCATACACTTGTATCGCAAAGAATGAA
1150 . : . : . : . : . :
1252 GCAGGAGTGGATGAAGACATCTCTTCTCTTTTTGTGGAAGACTCTGCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
673174 GCAGGAGTGGATGAAGACATCTCTTCTCTTTTTGTGGAAGACTCTGCTAG
1200 . : . : . : . : . :
1302 AAAGACCC TAGCTAACATATTATGGAGAGAAGAAG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||>>>...
673224 AAAGACCCGTA...CAGTAGCTAACATATTATGGAGAGAAGAAGGTA...
1250 . : . : . : . : . :
1337 GTCTGGGAATTGGGAACATGTTCTATGTTTTTTATGAAGATGGAATC
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
711260 AAGGTCTGGGAATTGGGAACATGTTCTATGTTTTTTATGAAGATGGAATC
1300 . : . : . : . : . :
1384 AAAGTGATACAACCCATAGAATGTGAATTTCAGAGGCACATTAAGCCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
711310 AAAGTGATACAACCCATAGAATGTGAATTTCAGAGGCACATTAAGCCTAG
1350 . : . : . : . : . :
1434 TGAAAAGCTCCTTGGATTTCAG GATGAAGTCTGTCCCAAAG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
711360 TGAAAAGCTCCTTGGATTTCAGGCA...CAGGATGAAGTCTGTCCCAAAG
1400 . : . : . : . : . :
1475 CTGAGGGAGATGAAGTTCAGAGGTGTGTGTGGGCATCAGCTGTTAATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
730247 CTGAGGGAGATGAAGTTCAGAGGTGTGTGTGGGCATCAGCTGTTAATGTC
1450 . : . : . : . : . :
1525 AAAGACAAGTTCATTTATGTTGCACAGCCAACTTTGGACAGAGTCCTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
730297 AAAGACAAGTTCATTTATGTTGCACAGCCAACTTTGGACAGAGTCCTTAT
1500 . : . : . : . : . :
1575 TGTTGATGTGCAGTCCCAAAAAGTTGTTCAG GCAGTGAGCA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
730347 TGTTGATGTGCAGTCCCAAAAAGTTGTTCAGGTA...TAGGCAGTGAGCA
1550 . : . : . : . : . :
1616 CAGACCCTGTCCCAGTTAAATTACACTATGACAAATCACATGATCAGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
752088 CAGACCCTGTCCCAGTTAAATTACACTATGACAAATCACATGATCAGGTC
1600 . : . : . : . : . :
1666 TGGGTGCTAAGCTGGGGTACCTTGGAGAAGACATCACCAACACTACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
752138 TGGGTGCTAAGCTGGGGTACCTTGGAGAAGACATCACCAACACTACAGGT
1650 . : . : . : . : . :
1714 GTAATTACCCTGGCCAGTGGGAATGTGCCTCACCACACGATCC
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
752188 A...TAGGTAATTACCCTGGCCAGTGGGAATGTGCCTCACCACACGATCC
1700 . : . : . : . : . :
1757 ACACCCAACCAGTGGGAAAGCAATTTGACAGAGTGGATGATTTTTTCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
756312 ACACCCAACCAGTGGGAAAGCAATTTGACAGAGTGGATGATTTTTTCATT
1750 . : . : . : . : . :
1807 CCCACCACAACACTCATTATCACCCATATGAG GTTTGGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
756362 CCCACCACAACACTCATTATCACCCATATGAGGTA...CAGGTTTGGATT
1800 . : . : . : . : . :
1848 TATTCTTCATAAAGATGAAGCTGCACTACAAAAAATTGATCTTGAAACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
824957 TATTCTTCATAAAGATGAAGCTGCACTACAAAAAATTGATCTTGAAACCA
1850 . : . : . : . : . :
1898 TGTCATACATCAAGACAATTAACTTGAAGGACTATAAGTGCGTTCCTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825007 TGTCATACATCAAGACAATTAACTTGAAGGACTATAAGTGCGTTCCTCAG
1900 . : . : . : . : . :
1948 TCATTGGCATATACACACTTGGGAGGCTACTACTTCATTGGCTGCAAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825057 TCATTGGCATATACACACTTGGGAGGCTACTACTTCATTGGCTGCAAACC
1950 . : . : . : . : . :
1998 TGACAGCACCGGAGCAGTTTCCCCACAGGTCATGGTGGACGGTGTAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825107 TGACAGCACCGGAGCAGTTTCCCCACAGGTCATGGTGGACGGTGTAACTG
2000 . : . : . : . : . :
2048 ACTCAGTCATTGGGTTCAATAGTGATGTGACGGGCACTCCATATGTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825157 ACTCAGTCATTGGGTTCAATAGTGATGTGACGGGCACTCCATATGTCTCT
2050 . : . : . : . : . :
2098 CCAGATGGCCACTACCTTGTCAGCATTAATGATGTGAAAGGTCTTGTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825207 CCAGATGGCCACTACCTTGTCAGCATTAATGATGTGAAAGGTCTTGTAAG
2100 . : . : . : . : . :
2148 GGTTCAGTACATTACCATCAGAGGAGAAATACAGGAGGCTTTTGATATTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825257 GGTTCAGTACATTACCATCAGAGGAGAAATACAGGAGGCTTTTGATATTT
2150 . : . : . : . : . :
2198 ACACAAATCTGCACATATCTGATCTGGCATTTCAACCATCCTTTACTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825307 ACACAAATCTGCACATATCTGATCTGGCATTTCAACCATCCTTTACTGAA
2200 . : . : . : . : . :
2248 GCCCACCAATATAACATCTACGGTAGTTCAAGCACACAAACTGATGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825357 GCCCACCAATATAACATCTACGGTAGTTCAAGCACACAAACTGATGTGCT
2250 . : . : . : . : . :
2298 CTTTGTGGAGCTCTCTTCTGGGAAGGTCAAGATGATAAAGAGTCTCAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825407 CTTTGTGGAGCTCTCTTCTGGGAAGGTCAAGATGATAAAGAGTCTCAAGG
2300 . : . : . : . : . :
2348 AACCACTCAAGGCAGAAGAATGGCCTTGGAACCGGAAAAACAGGCAAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825457 AACCACTCAAGGCAGAAGAATGGCCTTGGAACCGGAAAAACAGGCAAATC
2350 . : . : . : . : . :
2398 CAGGACAGTGGCTTGTTTGGTCAATACCTGATGACACCTTCCAAGGACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825507 CAGGACAGTGGCTTGTTTGGTCAATACCTGATGACACCTTCCAAGGACTC
2400 . : . : . : . : . :
2448 TCTCTTCATCCTAGATGGACGACTCAATAAATTAAACTGTGAGATCACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825557 TCTCTTCATCCTAGATGGACGACTCAATAAATTAAACTGTGAGATCACTG
2450 . : . : . : . :
2498 AAGTTGAAAAAGGAAATACAGTCATTTGGGTTGGAGATGCC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
825607 AAGTTGAAAAAGGAAATACAGTCATTTGGGTTGGAGATGCC