seq1 = pF1KSDA1218.tfa, 2499 bp
seq2 = pF1KSDA1218/gi568815591r_105510529.tfa (gi568815591r:105510529_105976474), 465946 bp
>pF1KSDA1218 2499
>gi568815591r:105510529_105976474 (Chr7)
(complement)
1-97 (100001-100097) 100% ->
98-166 (100595-100663) 100% ==
271-494 (311186-311409) 100% ->
495-778 (333354-333637) 100% ->
779-861 (336906-336988) 100% ->
862-1118 (337866-338122) 100% ->
1119-1311 (352208-352400) 100% ->
1312-1433 (356154-356275) 100% ->
1434-2388 (361659-362613) 100% ->
2389-2463 (365872-365946) 100% ->
2464-2499 (368585-368620) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGACACTGGATCGCAAAGTGCCCAGTCCGGAGGCGTTTCTGGGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGACACTGGATCGCAAAGTGCCCAGTCCGGAGGCGTTTCTGGGCAA
50 . : . : . : . : . :
51 ACCCTGGTCCTCCTGGATCGACGCCGCCAAATTACACTGCTCCGACA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
100051 ACCCTGGTCCTCCTGGATCGACGCCGCCAAATTACACTGCTCCGACAGTA
100 . : . : . : . : . :
98 ATGTAGATTTAGAAGAGGCTGGAAAAGAGGGTGGAAAAAGCAGG
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ...CAGATGTAGATTTAGAAGAGGCTGGAAAAGAGGGTGGAAAAAGCAGG
150 . : . : .
142 GAGGTTATGAGGCTTAATAAAGAAG
|||||||||||||||||||||||||
100639 GAGGTTATGAGGCTTAATAAAGAAG
0 . : . : . : . : . :
271 GAGAGAAGACACGGTTCAATGTGTAGACCTTCTCCCTCTCCAGTGTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
311186 GAGAGAAGACACGGTTCAATGTGTAGACCTTCTCCCTCTCCAGTGTCTCC
50 . : . : . : . : . :
321 AGCCTCCAATCCCAGGACATCACTAGTACAGGTGAAAACAAAAGCCTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
311236 AGCCTCCAATCCCAGGACATCACTAGTACAGGTGAAAACAAAAGCCTGTC
100 . : . : . : . : . :
371 TCAGCGGCCATCACTCTGCCAGCAGCACCTCAAAGCCATTCAAAACGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
311286 TCAGCGGCCATCACTCTGCCAGCAGCACCTCAAAGCCATTCAAAACGCCC
150 . : . : . : . : . :
421 AAAGACAATCTACTTACCTCCAGCAGCAAACAGCACACAGTCTTTCCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
311336 AAAGACAATCTACTTACCTCCAGCAGCAAACAGCACACAGTCTTTCCTGC
200 . : . : . : . : . :
471 GAAAGGATCAAGGGATAAACCATG TGTTCCAGTTCCTGTAG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
311386 GAAAGGATCAAGGGATAAACCATGGTG...CAGTGTTCCAGTTCCTGTAG
250 . : . : . : . : . :
512 TCAGTTTAGAGAAAATTCCTAACCTAGTGAAGGCAGATGGTGCCAATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
333371 TCAGTTTAGAGAAAATTCCTAACCTAGTGAAGGCAGATGGTGCCAATGTC
300 . : . : . : . : . :
562 AAAATGAACTCCACAACCACTACTGCAGTTTCTGCCTCCTCCACCTCGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
333421 AAAATGAACTCCACAACCACTACTGCAGTTTCTGCCTCCTCCACCTCGTC
350 . : . : . : . : . :
612 CTCTGCCGTCTCCACCCCTCCTTTAATTAAGCCTGTCCTGATGTCCAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
333471 CTCTGCCGTCTCCACCCCTCCTTTAATTAAGCCTGTCCTGATGTCCAAGT
400 . : . : . : . : . :
662 CAGTGCCACCTTCACCAGAGAAGATCTTAAATGGCAAAGGAATTCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
333521 CAGTGCCACCTTCACCAGAGAAGATCTTAAATGGCAAAGGAATTCTGCCA
450 . : . : . : . : . :
712 ACCACCATAGACAAGAAACACCAAAATGGCACCAAAAACAGCAACAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
333571 ACCACCATAGACAAGAAACACCAAAATGGCACCAAAAACAGCAACAAGCC
500 . : . : . : . : . :
762 TTACAGGAGACTTTCAG AGAGAGAATTTGACCCAAATAAAC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
333621 TTACAGGAGACTTTCAGGTA...CAGAGAGAGAATTTGACCCAAATAAAC
550 . : . : . : . : . :
803 ACTGTGGAGTATTGGATCCCGAGACAAAGAAACCTTGCACAAGATCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
336930 ACTGTGGAGTATTGGATCCCGAGACAAAGAAACCTTGCACAAGATCCCTC
600 . : . : . : . : . :
853 ACCTGCAAG ACACATTCGCTAAGCCATCGGAGGGCAGTCCC
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
336980 ACCTGCAAGGTA...TAGACACATTCGCTAAGCCATCGGAGGGCAGTCCC
650 . : . : . : . : . :
894 AGGCCGGAAAAAGCAATTTGACCTCCTCCTGGCAGAACACAAAGCAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
337898 AGGCCGGAAAAAGCAATTTGACCTCCTCCTGGCAGAACACAAAGCAAAGT
700 . : . : . : . : . :
944 CCCGGGAAAAAGAAGTTAAAGATAAAGAGCATCTCCTGACTTCCACGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
337948 CCCGGGAAAAAGAAGTTAAAGATAAAGAGCATCTCCTGACTTCCACGAGG
750 . : . : . : . : . :
994 GAAATACTTCCAAGCCAATCCGGGCCGGCACAGGATTCTCTGCTAGGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
337998 GAAATACTTCCAAGCCAATCCGGGCCGGCACAGGATTCTCTGCTAGGGTC
800 . : . : . : . : . :
1044 TTCAGGGAGCTCTGGGCCAGAACCAAAAGTTGCATCCCCTGCAAAATCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
338048 TTCAGGGAGCTCTGGGCCAGAACCAAAAGTTGCATCCCCTGCAAAATCCA
850 . : . : . : . : . :
1094 GACCACCCAACTCTGTACTTCCTAG ACCATCATCTGCAAAT
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
338098 GACCACCCAACTCTGTACTTCCTAGGTA...TAGACCATCATCTGCAAAT
900 . : . : . : . : . :
1135 AGCATAAGCAGCAGCACATCTTCAAATCATAGCGGCCACACTCCAGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352224 AGCATAAGCAGCAGCACATCTTCAAATCATAGCGGCCACACTCCAGAGCC
950 . : . : . : . : . :
1185 CCCACTCCCACCGGTTGGAGGTGACCTCGCCAGCCGACTGTCCAGTGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352274 CCCACTCCCACCGGTTGGAGGTGACCTCGCCAGCCGACTGTCCAGTGATG
1000 . : . : . : . : . :
1235 AAGGGGAGATGGACGGAGCCGACGAATCCGAGAAGCTAGACTGTCAGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
352324 AAGGGGAGATGGACGGAGCCGACGAATCCGAGAAGCTAGACTGTCAGTTC
1050 . : . : . : . : . :
1285 TCCACGCACCACCCCAGACCTCTGGCG TTTTGCTCATTTGG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
352374 TCCACGCACCACCCCAGACCTCTGGCGGTA...CAGTTTTGCTCATTTGG
1100 . : . : . : . : . :
1326 GAGTCGCCTCATGGGACGAGGGTACTATGTGTTTGATAGAAGATGGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
356168 GAGTCGCCTCATGGGACGAGGGTACTATGTGTTTGATAGAAGATGGGATC
1150 . : . : . : . : . :
1376 GTTTTCGATTCGCACTAAACTCCATGGTAGAAAAACACCTGAATTCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
356218 GTTTTCGATTCGCACTAAACTCCATGGTAGAAAAACACCTGAATTCACAG
1200 . : . : . : . : . :
1426 ATGTGGAA GAAGATCCCTCCTGCGGCAGATAGCCCCCTGCC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
356268 ATGTGGAAGTA...TAGGAAGATCCCTCCTGCGGCAGATAGCCCCCTGCC
1250 . : . : . : . : . :
1467 CTCGCCAGCAGCCCACATCACCACCCCCGTTCCAGCATCCGTTTTGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361692 CTCGCCAGCAGCCCACATCACCACCCCCGTTCCAGCATCCGTTTTGCAGC
1300 . : . : . : . : . :
1517 CTTTCAGCAACCCCAGTGCTGTGTATCTTCCTTCAGCTCCCATCAGCTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361742 CTTTCAGCAACCCCAGTGCTGTGTATCTTCCTTCAGCTCCCATCAGCTCG
1350 . : . : . : . : . :
1567 AGGCTCACCTCTTCTTACATAATGACATCAGCCATGCTCTCAAACGCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361792 AGGCTCACCTCTTCTTACATAATGACATCAGCCATGCTCTCAAACGCAGC
1400 . : . : . : . : . :
1617 TTTCGTGACATCGCCGGACCCGAGCGCCCTCATGTCCCACACCACAGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361842 TTTCGTGACATCGCCGGACCCGAGCGCCCTCATGTCCCACACCACAGCTT
1450 . : . : . : . : . :
1667 TCCCTCATGTGGCCGCAACCCTCAGCATCATGGACTCAACCTTCAAGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361892 TCCCTCATGTGGCCGCAACCCTCAGCATCATGGACTCAACCTTCAAGGCC
1500 . : . : . : . : . :
1717 CCATCCGCCGTGTCCCCGATACCAGCCGTCATCCCTTCCCCATCCCACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361942 CCATCCGCCGTGTCCCCGATACCAGCCGTCATCCCTTCCCCATCCCACAA
1550 . : . : . : . : . :
1767 GCCATCCAAAACCAAAACCAGCAAATCCTCAAAAGTCAAAGACCTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361992 GCCATCCAAAACCAAAACCAGCAAATCCTCAAAAGTCAAAGACCTGTCCA
1600 . : . : . : . : . :
1817 CCCGTAGCGACGAGTCTCCAAGTAACAAAAAAAGGAAGCCACAGTCTTCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362042 CCCGTAGCGACGAGTCTCCAAGTAACAAAAAAAGGAAGCCACAGTCTTCG
1650 . : . : . : . : . :
1867 ACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTTGCAGACATCCCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362092 ACTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTTGCAGACATCCCTCTC
1700 . : . : . : . : . :
1917 GTCTCCACTGTCAGGGCCTCACAAAAAGAACTGTGTTTTGAATGCCAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362142 GTCTCCACTGTCAGGGCCTCACAAAAAGAACTGTGTTTTGAATGCCAGTT
1750 . : . : . : . : . :
1967 CTGCTTTGAACTCCTATCAGGCGGCCCCTCCCTATAACAGCCTGTCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362192 CTGCTTTGAACTCCTATCAGGCGGCCCCTCCCTATAACAGCCTGTCTGTG
1800 . : . : . : . : . :
2017 CACAACTCAAACAATGGGGTGAGCCCACTCAGTGCCAAACTGGAGCCCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362242 CACAACTCAAACAATGGGGTGAGCCCACTCAGTGCCAAACTGGAGCCCTC
1850 . : . : . : . : . :
2067 AGGACGGACCTCGCTGCCCGGCGGCCCCGCGGACATAGTGAGACAGGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362292 AGGACGGACCTCGCTGCCCGGCGGCCCCGCGGACATAGTGAGACAGGTGG
1900 . : . : . : . : . :
2117 GCGCGGTGGGAGGCAGCAGTGACTCCTGTCCCCTCTCTGTGCCCTCCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362342 GCGCGGTGGGAGGCAGCAGTGACTCCTGTCCCCTCTCTGTGCCCTCCCTT
1950 . : . : . : . : . :
2167 GCGCTCCACGCAGGGGACCTCTCTCTGGCCTCACACAATGCTGTGTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362392 GCGCTCCACGCAGGGGACCTCTCTCTGGCCTCACACAATGCTGTGTCTTC
2000 . : . : . : . : . :
2217 TCTGCCCCTCTCTTTTGACAAATCAGAAGGAAAAAAGCGTAAGAACTCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362442 TCTGCCCCTCTCTTTTGACAAATCAGAAGGAAAAAAGCGTAAGAACTCGA
2050 . : . : . : . : . :
2267 GTTCTAGTAGCAAAGCCTGTAAAATCACTAAAATGCCTGGTATGAATAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362492 GTTCTAGTAGCAAAGCCTGTAAAATCACTAAAATGCCTGGTATGAATAGC
2100 . : . : . : . : . :
2317 GTTCACAAAAAGAACCCGCCCAGCCTTCTCGCACCGGTGCCCGATCCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
362542 GTTCACAAAAAGAACCCGCCCAGCCTTCTCGCACCGGTGCCCGATCCCGT
2150 . : . : . : . : . :
2367 TAACAGCACCTCCTCTCGGCAG GTTGGGAAAAATAGCAGCC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
362592 TAACAGCACCTCCTCTCGGCAGGTA...CAGGTTGGGAAAAATAGCAGCC
2200 . : . : . : . : . :
2408 TAGCTTTGTCACAATCCAGTCCTTCAAGTATATCCAGCCCAGGACACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
365891 TAGCTTTGTCACAATCCAGTCCTTCAAGTATATCCAGCCCAGGACACAGC
2250 . : . : . : . : . :
2458 CGACAG AACACAAACAGAACGGGCAGGATAAGGACTCTTCC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
365941 CGACAGGTA...AAGAACACAAACAGAACGGGCAGGATAAGGACTCTTCC
2300
2499 A
|
368620 A