seq1 = pF1KSDA1125.tfa, 3558 bp
seq2 = pF1KSDA1125/gi568815578r_47110764.tfa (gi568815578r:47110764_47410206), 299443 bp

>pF1KSDA1125 3558
>gi568815578r:47110764_47410206 (Chr20)

(complement)

1-25  (62327-62351)   100% ->
26-174  (100003-100151)   100% ->
175-393  (111260-111478)   100% ->
394-507  (115428-115541)   100% ->
508-600  (118319-118411)   100% ->
601-688  (119933-120020)   100% ->
689-744  (122923-122978)   100% ->
745-822  (126559-126636)   100% ->
823-938  (127990-128105)   100% ->
939-1420  (133412-133893)   100% ->
1421-1561  (147779-147919)   100% ->
1562-1714  (160768-160920)   100% ->
1715-2224  (163690-164199)   100% ->
2225-2605  (171069-171449)   100% ->
2606-2796  (173691-173881)   100% ->
2797-2877  (180401-180481)   100% ->
2878-2956  (182926-183004)   100% ->
2957-3196  (185651-185890)   100% ->
3197-3357  (188733-188893)   100% ->
3358-3424  (189883-189949)   100% ->
3425-3558  (199310-199443)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATATCTCTACTCGCTCCAAAG         ATCCTGGCTCTGCAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  62327 ATGGATATCTCTACTCGCTCCAAAGGTG...CAGATCCTGGCTCTGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAGAACAGCCCAGAAAAGAAAGTTCCCCAGCCCTCCACATTCTTCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 GAGAACAGCCCAGAAAAGAAAGTTCCCCAGCCCTCCACATTCTTCCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCACTCGCCGCAGGACACATCAACAAGCCCCATTAAAAAGAAAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 GCCACTCGCCGCAGGACACATCAACAAGCCCCATTAAAAAGAAAAAGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGGCTTACTGAACAGTAACAATAAGGAGCAG         TCAGAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100119 CCTGGCTTACTGAACAGTAACAATAAGGAGCAGGTA...CAGTCAGAACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGACATGGTCCGTTTTACTATATGAAGCAGCCACTCACCACAGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111268 AAGACATGGTCCGTTTTACTATATGAAGCAGCCACTCACCACAGACCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGATGTTGTACCGCAGGATGGACGGAATGATTTCTACTGCTGGGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111318 TTGATGTTGTACCGCAGGATGGACGGAATGATTTCTACTGCTGGGTTTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACCGGGAAGGCCAAGTCCTTTGCTGTGAGCTCTGTCCCCGGGTTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111368 CACCGGGAAGGCCAAGTCCTTTGCTGTGAGCTCTGTCCCCGGGTTTATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCTAAGTGTCTGAGACTGACATCGGAACCAGAGGGGGACTGGTTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111418 CGCTAAGTGTCTGAGACTGACATCGGAACCAGAGGGGGACTGGTTTTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGAATGTGAG         AAAATTACAGTAGCAGAATGCATCGAGACC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 111468 CTGAATGTGAGGTT...TAGAAAATTACAGTAGCAGAATGCATCGAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGAGTAAAGCCATGACAATGCTCACCATTGAACAGTTATCCTACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115458 CAGAGTAAAGCCATGACAATGCTCACCATTGAACAGTTATCCTACCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAAGTTTGCCATTCAGAAAATGAAACAGCCAGGG         ACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115508 CAAGTTTGCCATTCAGAAAATGAAACAGCCAGGGGTA...TAGACAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CATTCCAGAAGCCCGTTCCATTGGAACAGCACCCTGACTATGCGGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118326 CATTCCAGAAGCCCGTTCCATTGGAACAGCACCCTGACTATGCGGAATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCTTCCATCCAATGGACCTTTGTACATTGGAAAAG         AATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 118376 ATCTTCCATCCAATGGACCTTTGTACATTGGAAAAGGTT...CAGAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAAAAGAAAATGTATGGCTGCACAGAAGCCTTCCTGGCTGATGCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119938 GAAAAAGAAAATGTATGGCTGCACAGAAGCCTTCCTGGCTGATGCAAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGATTTTGCACAACTGCATCATTTATAATGGGG         GAAATCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 119988 GGATTTTGCACAACTGCATCATTTATAATGGGGGTG...TAGGAAATCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAATTGACGCAAATAGCGAAAGTAGTCATCAAAATCTGTGAACATGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 122931 AAATTGACGCAAATAGCGAAAGTAGTCATCAAAATCTGTGAACATGAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745        ATGAATGAAATCGAAGTATGTCCAGAATGTTATCTAGCTGCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122981 A...CAGATGAATGAAATCGAAGTATGTCCAGAATGTTATCTAGCTGCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GCCAAAAACGAGATAACTGGTTTTGTGAGCCTTGT         AGCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126602 GCCAAAAACGAGATAACTGGTTTTGTGAGCCTTGTGTA...TAGAGCAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCACATCCTTTGGTCTGGGCCAAACTGAAGGGGTTTCCATTCTGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127996 CCACATCCTTTGGTCTGGGCCAAACTGAAGGGGTTTCCATTCTGGCCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AAAAGCTCTAAGGGATAAAGACGGGCAGGTCGATGCCCGATTCTTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128046 AAAAGCTCTAAGGGATAAAGACGGGCAGGTCGATGCCCGATTCTTTGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AACATGACAG         GGCCTGGGTTCCAATAAATAATTGCTACCTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 128096 AACATGACAGGTG...TAGGGCCTGGGTTCCAATAAATAATTGCTACCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ATGTCTAAAGAAATTCCTTTTTCTGTGAAAAAGACTAAGAGCATCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133443 ATGTCTAAAGAAATTCCTTTTTCTGTGAAAAAGACTAAGAGCATCTTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CAGTGCCATGCAAGAGATGGAGGTTTACGTGGAGAACATCCGCAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133493 CAGTGCCATGCAAGAGATGGAGGTTTACGTGGAGAACATCCGCAGGAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TTGGGGTTTTTAATTACTCTCCATTTAGGACACCCTACACACCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133543 TTGGGGTTTTTAATTACTCTCCATTTAGGACACCCTACACACCCAACAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CAGTATCAAATGCTGCTCGATCCCACCAACCCCAGCGCCGGCACTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133593 CAGTATCAAATGCTGCTCGATCCCACCAACCCCAGCGCCGGCACTGCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GATAGACAAGCAGGAGAAGGTCAAGCTCAACTTTGACATGACGGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133643 GATAGACAAGCAGGAGAAGGTCAAGCTCAACTTTGACATGACGGCATCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCAAGATCCTGATGAGCAAGCCTGTGCTGAGTGGGGGCACAGGCCGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133693 CCAAGATCCTGATGAGCAAGCCTGTGCTGAGTGGGGGCACAGGCCGCCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ATTTCCTTGTCGGATATGCCGCGCTCCCCCATGAGCACAAACTCTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133743 ATTTCCTTGTCGGATATGCCGCGCTCCCCCATGAGCACAAACTCTTCTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCACACGGGCTCCGACGTGGAGCAGGATGCTGAGAAGAAGGCCACGTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133793 GCACACGGGCTCCGACGTGGAGCAGGATGCTGAGAAGAAGGCCACGTCGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCCACTTCAGTGCGAGCGAGGAGTCCATGGACTTCCTGGATAAGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133843 GCCACTTCAGTGCGAGCGAGGAGTCCATGGACTTCCTGGATAAGAGCACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 G         CTTCACCAGCCTCCACCAAGACGGGACAAGCAGGGAGTTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133893 GGTC...CAGCTTCACCAGCCTCCACCAAGACGGGACAAGCAGGGAGTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ATCCGGCAGCCCAAAGCCCTTCTCTCCTCAACTGTCAGCTCCTATCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147819 ATCCGGCAGCCCAAAGCCCTTCTCTCCTCAACTGTCAGCTCCTATCACGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CGAAAACGGACAAAACCTCCACCACCGGCAGCATCCTGAATCTTAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147869 CGAAAACGGACAAAACCTCCACCACCGGCAGCATCCTGAATCTTAACCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 G         ATCGAAGCAAAGCTGAGATGGATTTGAAGGAGCTGAGCGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147919 GGTC...CAGATCGAAGCAAAGCTGAGATGGATTTGAAGGAGCTGAGCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GTCGGTCCAGCAACAGTCCACCCCTGTTCCTCTCATCTCTCCCAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160808 GTCGGTCCAGCAACAGTCCACCCCTGTTCCTCTCATCTCTCCCAAGCGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AGATTCGTAGCAGGTTCCAGCTGAATCTTGACAAGACCATAGAGAGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160858 AGATTCGTAGCAGGTTCCAGCTGAATCTTGACAAGACCATAGAGAGTTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 AAAGCACAATTAG         GCATAAATGAAATCTCGGAAGATGTCTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 160908 AAAGCACAATTAGGTA...TAGGCATAAATGAAATCTCGGAAGATGTCTA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TACGGCCGTAGAGCACAGCGATTCGGAGGATTCTGAGAAGTCAGATAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163718 TACGGCCGTAGAGCACAGCGATTCGGAGGATTCTGAGAAGTCAGATAGTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GCGATAGTGAGTATATCAGTGATGATGAGCAGAAGTCTAAGAACGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163768 GCGATAGTGAGTATATCAGTGATGATGAGCAGAAGTCTAAGAACGAGCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 GAAGACACAGAGGACAAAGAAGGTTGTCAGATGGACAAAGAGCCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163818 GAAGACACAGAGGACAAAGAAGGTTGTCAGATGGACAAAGAGCCATCTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGTTAAAAAAAAGCCCAAGCCTACAAACCCAGTGGAGATTAAAGAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163868 TGTTAAAAAAAAGCCCAAGCCTACAAACCCAGTGGAGATTAAAGAGGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TGAAAAGCACGTCACCAGCCAGCGAGAAGGCAGACCCTGGAGCAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163918 TGAAAAGCACGTCACCAGCCAGCGAGAAGGCAGACCCTGGAGCAGTCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GACAAGGCCAGCCCTGAGCCTGAGAAGGACTTTTCCGAAAAGGCAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163968 GACAAGGCCAGCCCTGAGCCTGAGAAGGACTTTTCCGAAAAGGCAAAACC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TTCACCTCACCCCATAAAGGATAAACTGAAGGGAAAAGATGAGACGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164018 TTCACCTCACCCCATAAAGGATAAACTGAAGGGAAAAGATGAGACGGATT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CCCCAACAGTCCATTTGGGCCTGGACTCTGATTCAGAGAGCGAACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164068 CCCCAACAGTCCATTTGGGCCTGGACTCTGATTCAGAGAGCGAACTTGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 ATAGATTTAGGAGAAGACCATTCTGGGCGGGAGGGTCGAAAAAATAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164118 ATAGATTTAGGAGAAGACCATTCTGGGCGGGAGGGTCGAAAAAATAAGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 GGAACCCAAAGAACCATCTCCCAAACAGGATG         TTGTAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 164168 GGAACCCAAAGAACCATCTCCCAAACAGGATGGTA...TAGTTGTAGGTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 AAACTCCACCATCCACGACGGTGGGCAGCCATTCTCCCCCGGAAACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171078 AAACTCCACCATCCACGACGGTGGGCAGCCATTCTCCCCCGGAAACACCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 GTGCTCACCCGCTCTTCCGCCCAAACTTCCGCGGCTGGCGCCACAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171128 GTGCTCACCCGCTCTTCCGCCCAAACTTCCGCGGCTGGCGCCACAGCCAC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 CACCAGCACGTCCTCCACGGTCACCGTCACGGCCCCGGCCCCCGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171178 CACCAGCACGTCCTCCACGGTCACCGTCACGGCCCCGGCCCCCGCCGCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 CAGGAAGCCCAGTGAAAAAGCAGAGGCCGCTTTTACCGAAGGAGACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171228 CAGGAAGCCCAGTGAAAAAGCAGAGGCCGCTTTTACCGAAGGAGACTGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CCGGCCGTGCAGCGGGTCGTGTGGAACTCATCAAGTAAGTTTCAAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171278 CCGGCCGTGCAGCGGGTCGTGTGGAACTCATCAAGTAAGTTTCAAACGTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 CTCCCAAAAGTGGCACATGCAGAAGATGCAGCGTCAGCAGCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171328 CTCCCAAAAGTGGCACATGCAGAAGATGCAGCGTCAGCAGCAGCAGCAGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 AGCAGCAAAACCAGCAGCAGCAGCCTCAGTCTTCCCAGGGGACGAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171378 AGCAGCAAAACCAGCAGCAGCAGCCTCAGTCTTCCCAGGGGACGAGATAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 CAGACCAGACAGGCTGTGAAAG         CTGTCCAGCAGAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 171428 CAGACCAGACAGGCTGTGAAAGGTA...TAGCTGTCCAGCAGAAGGAGAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 CACACAGAGCCCATCCACGTCCACCATCACCCTGGTGACCAGCACACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173710 CACACAGAGCCCATCCACGTCCACCATCACCCTGGTGACCAGCACACAGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 CATCGCCCCTGGTCACCAGCTCGGGGTCCATGAGCACCCTTGTGTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173760 CATCGCCCCTGGTCACCAGCTCGGGGTCCATGAGCACCCTTGTGTCCTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 GTCAACGCTGACCTGCCCATCGCCACTGCCTCAGCTGATGTCGCCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173810 GTCAACGCTGACCTGCCCATCGCCACTGCCTCAGCTGATGTCGCCGCTGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 TATTGCCAAGTACACTAGCAAA         ATGATGGATGCAATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 173860 TATTGCCAAGTACACTAGCAAAGTG...CAGATGATGGATGCAATAAAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 GAACAATGACAGAAATATACAACGATCTTTCTAAAAACACTACTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180420 GAACAATGACAGAAATATACAACGATCTTTCTAAAAACACTACTGGAAGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 ACAATAGCTGAG         ATTCGCAGGCTGAGGATCGAGATAGAGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 180470 ACAATAGCTGAGGTC...CAGATTCGCAGGCTGAGGATCGAGATAGAGAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2907 GCTCCAGTGGCTGCACCAGCAAGAGCTCTCCGAAATGAAACACAACTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182955 GCTCCAGTGGCTGCACCAGCAAGAGCTCTCCGAAATGAAACACAACTTAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2957          AGCTGACCATGGCGGAGATGCGGCAGAGCCTGGAGCAGGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183005 GTA...CAGAGCTGACCATGGCGGAGATGCGGCAGAGCCTGGAGCAGGAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 CGGGACCGGCTCATCGCCGAGGTGAAGAAGCAGCTGGAGTTGGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185692 CGGGACCGGCTCATCGCCGAGGTGAAGAAGCAGCTGGAGTTGGAGAAGCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 GCAGGCGGTGGATGAGACCAAGAAGAAGCAGTGGTGCGCCAACTGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185742 GCAGGCGGTGGATGAGACCAAGAAGAAGCAGTGGTGCGCCAACTGCAAGA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 AGGAGGCCATCTTTTACTGCTGTTGGAACACCAGCTACTGTGACTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185792 AGGAGGCCATCTTTTACTGCTGTTGGAACACCAGCTACTGTGACTACCCC

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3148 TGCCAGCAAGCCCACTGGCCTGAGCACATGAAGTCCTGCACCCAGTCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 185842 TGCCAGCAAGCCCACTGGCCTGAGCACATGAAGTCCTGCACCCAGTCAGG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3197         CTACTGCTCCTCAGCAGGAAGCGGATGCTGAGGTGAACACAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185892 TA...CAGCTACTGCTCCTCAGCAGGAAGCGGATGCTGAGGTGAACACAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3239 AAACACTAAATAAGTCCTCCCAGGGGAGCTCCTCGAGCACACAATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188775 AAACACTAAATAAGTCCTCCCAGGGGAGCTCCTCGAGCACACAATCAGCA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3289 CCTTCAGAAACGGCCAGCGCCTCCAAAGAGAAGGAGACGTCAGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188825 CCTTCAGAAACGGCCAGCGCCTCCAAAGAGAAGGAGACGTCAGCTGAGAA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3339 AAGCAAGGAGAGTGGCTCG         ACCCTTGACCTTTCTGGCTCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 188875 AAGCAAGGAGAGTGGCTCGGTG...TAGACCCTTGACCTTTCTGGCTCCA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3380 GAGAGACGCCCTCCTCCATTCTCTTAGGCTCCAACCAAGGCTCTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 189905 GAGAGACGCCCTCCTCCATTCTCTTAGGCTCCAACCAAGGCTCTGGTA..

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3425     ACCATTCCCGGAGTAATAAATCCAGTTGGAGCAGCAGTGATGAGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189955 .CAGACCATTCCCGGAGTAATAAATCCAGTTGGAGCAGCAGTGATGAGAA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3471 GAGGGGATCGACACGTTCCGATCACAACACCAGTACCAGCACGAAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199356 GAGGGGATCGACACGTTCCGATCACAACACCAGTACCAGCACGAAGAGCC

   3700     .    :    .    :    .    :    .
   3521 TCCTCCCGAAAGAGTCTCGGCTGGACACCTTCTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199406 TCCTCCCGAAAGAGTCTCGGCTGGACACCTTCTGGGAC