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seq2 = pF1KSDA1099/gi568815596f_235394687.tfa (gi568815596f:235394687_236224119), 829433 bp

>pF1KSDA1099 2412
>gi568815596f:235394687_236224119 (Chr2)

1-163  (100001-100163)   100% ->
164-222  (314493-314551)   100% ->
223-310  (322871-322958)   100% ->
311-396  (346277-346362)   100% ->
397-538  (350012-350153)   100% ->
539-673  (355668-355802)   100% ->
674-801  (403073-403200)   100% ->
802-957  (404681-404836)   99% ->
958-1050  (412553-412645)   100% ->
1051-1155  (488659-488763)   100% ->
1156-1324  (514052-514220)   100% ->
1325-1486  (573776-573937)   100% ->
1487-1641  (641875-642029)   100% ->
1642-1732  (646065-646155)   100% ->
1733-1955  (654373-654595)   99% ->
1956-2211  (725506-725761)   100% ->
2212-2412  (729233-729433)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTACCAGCAGCAGCTGGCCAACTCGGCTGCCATCCGGGCCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTACCAGCAGCAGCTGGCCAACTCGGCTGCCATCCGGGCCGAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCGCTTCGAGTCGGTCCACCCCAACATCTACTCCATCTACGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGCGCTTCGAGTCGGTCCACCCCAACATCTACTCCATCTACGAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAGCGCGTGGAGGAGCCGGTGCTGCAGAACCAGATCCGGGAGCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGAGCGCGTGGAGGAGCCGGTGCTGCAGAACCAGATCCGGGAGCACGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGCCATCGAAG         ATGCCTTCGTGAACAGCCAGGAATGGAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCGCCATCGAAGGTG...CAGATGCCTTCGTGAACAGCCAGGAATGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGAGTCGATCTGTCCCGGAGCTCAAAGTG         GGAATTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 314521 GCTGAGTCGATCTGTCCCGGAGCTCAAAGTGGTG...CAGGGAATTGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTAACTTGGCCAGCGGCAAGTCTGCCCTGGTGCACCGGTACCTGACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 322881 GTAACTTGGCCAGCGGCAAGTCTGCCCTGGTGCACCGGTACCTGACGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACATATGTCCAGGAGGAGTCTCCGGAAG         GTGGCAGGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 322931 ACATATGTCCAGGAGGAGTCTCCGGAAGGTA...CAGGTGGCAGGTTCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAGAGATTGTCGTTGATGGACAGAGCTATCTGCTGCTGATCAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 346290 GAAAGAGATTGTCGTTGATGGACAGAGCTATCTGCTGCTGATCAGAGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGGGGGCCCCCCGGAGGCGCAG         TTTGCCATGTGGGTGGAC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 346340 AAGGGGGCCCCCCGGAGGCGCAGGTG...TAGTTTGCCATGTGGGTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTGTTATATTTGTCTTCAGCTTGGAGGATGAAATAAGTTTCCAGACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350030 GCTGTTATATTTGTCTTCAGCTTGGAGGATGAAATAAGTTTCCAGACCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTACCACTACTACAGTCGAATGGCCAACTATCGGAACACGAGCGAGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 350080 TTACCACTACTACAGTCGAATGGCCAACTATCGGAACACGAGCGAGATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTCTGGTTCTGGTGGGAACCCAGG         ATGCCATAAGTTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 350130 CTCTGGTTCTGGTGGGAACCCAGGGTG...CAGATGCCATAAGTTCTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACCCGAGGGTCATCGATGACGCCAGGGCGAGGAAGCTCTCCAACGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355685 AACCCGAGGGTCATCGATGACGCCAGGGCGAGGAAGCTCTCCAACGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAAACGGTGCACGTACTACGAGACGTGTGCTACATACGGGCTGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 355735 GAAACGGTGCACGTACTACGAGACGTGTGCTACATACGGGCTGAATGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAGGGTCTTCCAGGACG         TTGCCCAGAAGATTGTTGCCACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 355785 AGAGGGTCTTCCAGGACGGTA...CAGTTGCCCAGAAGATTGTTGCCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGGAAGAAGCAGCAGCTGTCCATAGGACCCTGCAAGTCGCTACCTAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 403096 AGGAAGAAGCAGCAGCTGTCCATAGGACCCTGCAAGTCGCTACCTAATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TCCCAGCCATTCCTCCGTCTGTTCCGCGCAGGTGTCTGCCGTGCACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 403146 TCCCAGCCATTCCTCCGTCTGTTCCGCGCAGGTGTCTGCCGTGCACATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCAG         ACAAGTAATGGAGGTGGGAGTTTAAGCGACTATTCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 403196 GCCAGGTA...CAGACAAGTAATGGAGGTGGGAGTTTAAGCGACTATTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCCTCCGTTCCATCGACTCCCAGCATCAGCCAGAAGGAACTTCGGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 404717 TCCTCCGTTCCATCGACTCCCAGCACCAGCCAGAAGGAACTTCGGATCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGTTCCTCCCACTGCCAACACGCCCACGCCCGTTCGCAAGCAGTCTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 404767 TGTTCCTCCCACTGCCAACACGCCCACGCCCGTTCGCAAGCAGTCTAAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCCGGTCCAACCTGTTCACC         TCTCGGAAAGGGAGCGACCCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 404817 GCCGGTCCAACCTGTTCACCGTG...CAGTCTCGGAAAGGGAGCGACCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GACAAAGAGAAGAAAGGCCTGGAGAGTCGTGCGGACAGCATTGGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 412574 GACAAAGAGAAGAAAGGCCTGGAGAGTCGTGCGGACAGCATTGGGAGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCGAGCCATCCCAATTAAACAG         GGCATGCTGTTGAAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 412624 CCGAGCCATCCCAATTAAACAGGTG...TAGGGCATGCTGTTGAAGCGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTGGCAAATCGTTGAATAAAGAGTGGAAAAAGAAATATGTCACCCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 488678 GTGGCAAATCGTTGAATAAAGAGTGGAAAAAGAAATATGTCACCCTGTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GACAATGGCGTGCTGACCTATCATCCCAGTTTACAT         GATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 488728 GACAATGGCGTGCTGACCTATCATCCCAGTTTACATGTG...CAGGATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CATGCAGAATGTTCATGGTAAGGAGATTGACCTTCTGAGAACCACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514057 CATGCAGAATGTTCATGGTAAGGAGATTGACCTTCTGAGAACCACTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAGTCCCAGGGAAGAGGCCACCCCGAGCCACGTCAGCCTGCGCACCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514107 AAGTCCCAGGGAAGAGGCCACCCCGAGCCACGTCAGCCTGCGCACCCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCCAGCCCTAAAACCAATGGCCTATCCAAGGACATGAGCAGTTTACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 514157 TCCAGCCCTAAAACCAATGGCCTATCCAAGGACATGAGCAGTTTACACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTCACCCAATTCAG         ACACAGGGCTGGGTGACTCCGTATGCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 514207 CTCACCCAATTCAGGTA...CAGACACAGGGCTGGGTGACTCCGTATGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCAGCCCCAGTATCTCCAGCACCACCAGCCCCAAGCTCGACCCGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 573803 CCAGCCCCAGTATCTCCAGCACCACCAGCCCCAAGCTCGACCCGCCCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TCCCCTCACGCCAACAGAAAGAAGCACCGAAGGAAGAAAAGCACTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 573853 TCCCCTCACGCCAACAGAAAGAAGCACCGAAGGAAGAAAAGCACTAGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CTTCAAAGCCGACGGCCTGTCCGGCACTGCTGAAG         AACAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 573903 CTTCAAAGCCGACGGCCTGTCCGGCACTGCTGAAGGTA...CAGAACAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAGAAAATTTTGAGTTTATCATTGTGTCCCTCACTGGCCAAACATGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 641881 AAGAAAATTTTGAGTTTATCATTGTGTCCCTCACTGGCCAAACATGGCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TTTGAAGCCACGACGTATGAGGAGCGGGACGCCTGGGTCCAAGCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 641931 TTTGAAGCCACGACGTATGAGGAGCGGGACGCCTGGGTCCAAGCCATCGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAGCCAGATCCTGGCCAGCCTGCAGTCGTGCGAGAGCAGCAAGAACAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 641981 GAGCCAGATCCTGGCCAGCCTGCAGTCGTGCGAGAGCAGCAAGAACAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642         TCCCGGCTGACGAGCCAGAGCGAGGCCATGGCCCTGCAGTCG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 642031 TG...CAGTCCCGGCTGACGAGCCAGAGCGAGGCCATGGCCCTGCAGTCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ATCCGGAACATGCGCGGGAACTCCCACTGTGTGGACTGCGAGACCCAGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 646107 ATCCGGAACATGCGCGGGAACTCCCACTGTGTGGACTGCGAGACCCAGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733         ATCCCAACTGGGCCAGTTTGAACTTGGGAGCCCTCATGTGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 646157 TA...TAGATCCCAACTGGGCCAGTTTGAACTTGGGAGCCCTCATGTGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCGAATGCTCAGGGATCCACCGGAATCTTGGCACCCACCTTTCCCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 654415 TCGAATGCTCAGGGATCCACCGGAATCTTGGCACCCACCTTTCCCGAGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CGATCTCTGGACCTGGATGACTGGCCAATCGAGCTCATCAAGGTGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 654465 CGATCTCTGGACCTGGATGACTGGCCAGTCGAGCTCATCAAGGTGATGTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 ATCCATCGGGAACGAGCTAGCCAACAGCGTCTGGGAAGAGAGCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 654515 ATCCATCGGGAACGAGCTAGCCAACAGCGTCTGGGAAGAGAGCAGCCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GGCGGACGAAACCATCGGTAGACTCCACAAG         GGAAGAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 654565 GGCGGACGAAACCATCGGTAGACTCCACAAGGTA...CAGGGAAGAGAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GAACGGTGGATCCGTGCCAAGTACGAGCAGAAGCTCTTCCTGGCCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 725516 GAACGGTGGATCCGTGCCAAGTACGAGCAGAAGCTCTTCCTGGCCCCGCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GCCCTGCACGGAGCTGTCCCTGGGCCAGCACCTGCTGCGGGCCACCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 725566 GCCCTGCACGGAGCTGTCCCTGGGCCAGCACCTGCTGCGGGCCACCGCCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ACGAGGACCTGCGGACGGCCATCCTGCTGCTGGCACACGGCTCCCGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 725616 ACGAGGACCTGCGGACGGCCATCCTGCTGCTGGCACACGGCTCCCGGGAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GAGGTGAACGAGACCTGCGGGGAGGGAGACGGCCGCACGGCGCTGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 725666 GAGGTGAACGAGACCTGCGGGGAGGGAGACGGCCGCACGGCGCTGCATCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GGCCTGCCGCAAGGGGAATGTGGTCCTGGCGCAGCTCCTGATCTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 725716 GGCCTGCCGCAAGGGGAATGTGGTCCTGGCGCAGCTCCTGATCTGGGTA.

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212      TACGGAGTGGACGTCACGGCCCGAGATGCCCACGGGAACACAGCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 725766 ..CAGTACGGAGTGGACGTCACGGCCCGAGATGCCCACGGGAACACAGCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 CTGGCCTACGCCCGGCAGGCCTCCAGCCAGGAGTGCATCGACGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 729278 CTGGCCTACGCCCGGCAGGCCTCCAGCCAGGAGTGCATCGACGTGCTGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GCAGTACGGCTGCCCCGACGAGCGCTTCGTGCTCATGGCCACCCCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 729328 GCAGTACGGCTGCCCCGACGAGCGCTTCGTGCTCATGGCCACCCCTAACC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 TGTCCAGGAGAAACAATAACCGGAACAACAGCAGTGGGAGGGTGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 729378 TGTCCAGGAGAAACAATAACCGGAACAACAGCAGTGGGAGGGTGCCCACC

   2550     .
   2407 ATCATC
        ||||||
 729428 ATCATC