seq1 = pF1KSDA1098.tfa, 1479 bp
seq2 = pF1KSDA1098/gi568815590r_27187553.tfa (gi568815590r:27187553_27411235), 223683 bp

>pF1KSDA1098 1479
>gi568815590r:27187553_27411235 (Chr8)

(complement)

1-435  (100001-100435)   100% ->
436-531  (112677-112772)   100% ->
532-762  (116926-117156)   100% ->
763-785  (121058-121080)   100% ->
786-904  (121956-122074)   100% ->
905-1479  (123109-123683)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGAGTCCCGACGTGTCCCCCGGGCCTTCCCGCTCCTTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGAGTCCCGACGTGTCCCCCGGGCCTTCCCGCTCCTTCAAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTTGCTCTGCGCCGTCTGCTACGACCCCTTCCGCGACGCAGTCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGTTGCTCTGCGCCGTCTGCTACGACCCCTTCCGCGACGCAGTCACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCGCTGCGGCCACAACTTCTGCCGCGGGTGCGTGAGCCGCTGCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCGCTGCGGCCACAACTTCTGCCGCGGGTGCGTGAGCCGCTGCTGGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCAGGTGTCGCCCACCTGCCCAGTGTGCAAAGACCGCGCGTCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCAGGTGTCGCCCACCTGCCCAGTGTGCAAAGACCGCGCGTCACCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACCTGCGCACCAACCACACCCTCAACAACCTGGTGGAGAAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACCTGCGCACCAACCACACCCTCAACAACCTGGTGGAGAAGCTGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGAGGAGGCCGAGGGCGCGCGCTGGACCAGCTACCGCTTCTCGCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGAGGAGGCCGAGGGCGCGCGCTGGACCAGCTACCGCTTCTCGCGTGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCCGCCTGCACCGCGGACAGCTCAGCCTCTTCTGCCTCGAGGACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCCGCCTGCACCGCGGACAGCTCAGCCTCTTCTGCCTCGAGGACAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGCTGTGCTGCTCCTGCCAGGCCGACCCCCGACACCAGGGGCACCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGCTGTGCTGCTCCTGCCAGGCCGACCCCCGACACCAGGGGCACCGCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCAGCCGGTGAAGGACACTGCCCACGACTTTCGG         GCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100401 TGCAGCCGGTGAAGGACACTGCCCACGACTTTCGGGTA...CAGGCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCAGGAACATGGAGCATGCACTGCGGGAGAAGGCCAAGGCCTTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112683 TGCAGGAACATGGAGCATGCACTGCGGGAGAAGGCCAAGGCCTTCTGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATGCGGCGCTCCTATGAGGCCATCGCCAAGCACAATCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112733 CATGCGGCGCTCCTATGAGGCCATCGCCAAGCACAATCAGGTG...TAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGAGGCTGCATGGCTGGAAGGCCGGATCCGGCAGGAGTTTGATAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116927 TGGAGGCTGCATGGCTGGAAGGCCGGATCCGGCAGGAGTTTGATAAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CGCGAGTTCTTGAGAGTGGAGGAGCAGGCCATTCTGGATGCCATGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116977 CGCGAGTTCTTGAGAGTGGAGGAGCAGGCCATTCTGGATGCCATGGCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGAGACAAGGCAGAAGCAACTTCTGGCCGACGAGAAGATGAAGCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117027 GGAGACAAGGCAGAAGCAACTTCTGGCCGACGAGAAGATGAAGCAGCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CAGAGGAGACGGAGGTGCTGGCACATGAGATCGAGCGGCTGCAGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117077 CAGAGGAGACGGAGGTGCTGGCACATGAGATCGAGCGGCTGCAGATGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATGAAGGAGGACGACGTTTCTTTTCTCATG         AAACACAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 117127 ATGAAGGAGGACGACGTTTCTTTTCTCATGGTA...CAGAAACACAAGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCGAAAACGCCG         ACTCTTCTGCACCATGGAGCCAGAGCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 121069 CCGAAAACGCCGGTA...CAGACTCTTCTGCACCATGGAGCCAGAGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TCCAGCCCGGCATGCTTATCGATGTCTGCAAGTACCTGGGCTCCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121985 TCCAGCCCGGCATGCTTATCGATGTCTGCAAGTACCTGGGCTCCCTGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TACCGCGTCTGGAAGAAGATGCTTGCATCTGTGGAATCTG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 122035 TACCGCGTCTGGAAGAAGATGCTTGCATCTGTGGAATCTGGTG...CAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACCCTTCAGCTTTGACCCCAACACCGCAGCTGGCTGGCTCTCCGTGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123110 ACCCTTCAGCTTTGACCCCAACACCGCAGCTGGCTGGCTCTCCGTGTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACGACCTCACCAGCGTCACCAACCATGGCTACCGCGTGCAGGTGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123160 ACGACCTCACCAGCGTCACCAACCATGGCTACCGCGTGCAGGTGGAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CCGGAACGCTTCTCCTCGGCGCCCTGCCTGCTGGGCTCCCGTGTCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123210 CCGGAACGCTTCTCCTCGGCGCCCTGCCTGCTGGGCTCCCGTGTCTTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACAGGGCTCGCACGCCTGGGAGGTGGCCCTTGGGGGGCTGCAGAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123260 ACAGGGCTCGCACGCCTGGGAGGTGGCCCTTGGGGGGCTGCAGAGCTGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GGGTGGGCGTGGTACGTGTGCGCCAGGACTCGGGCGCTGAGGGCCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123310 GGGTGGGCGTGGTACGTGTGCGCCAGGACTCGGGCGCTGAGGGCCACTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CACAGCTGCTACCACGACACACGCTCGGGCTTCTGGTATGTCTGCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123360 CACAGCTGCTACCACGACACACGCTCGGGCTTCTGGTATGTCTGCCGCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCAGGGCGTGGAGGGGGACCACTGCGTGACCTCGGACCCAGCCACGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123410 GCAGGGCGTGGAGGGGGACCACTGCGTGACCTCGGACCCAGCCACGTCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CCCTGGTCCTGGCCATCCCACGCCGCCTGCGTGTGGAGCTGGAGTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123460 CCCTGGTCCTGGCCATCCCACGCCGCCTGCGTGTGGAGCTGGAGTGTGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GAGGGCGAGCTGTCTTTCTATGACGCGGAGCGCCACTGCCACCTGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123510 GAGGGCGAGCTGTCTTTCTATGACGCGGAGCGCCACTGCCACCTGTACAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTTCCACGCCCGCTTTGGGGAGGTTCGCCCCTACTTCTACCTGGGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123560 CTTCCACGCCCGCTTTGGGGAGGTTCGCCCCTACTTCTACCTGGGGGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CACGGGGCGCCGGGCCTCCAGAGCCTTTGCGCATCTGCCCCTTGCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123610 CACGGGGCGCCGGGCCTCCAGAGCCTTTGCGCATCTGCCCCTTGCACATC

   1500     .    :    .    :
   1456 AGTGTCAAGGAAGAACTGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||
 123660 AGTGTCAAGGAAGAACTGGATGGC