seq1 = pF1KSDA1094.tfa, 1614 bp
seq2 = pF1KSDA1094/gi568815589r_128845690.tfa (gi568815589r:128845690_129047303), 201614 bp

>pF1KSDA1094 1614
>gi568815589r:128845690_129047303 (Chr9)

(complement)

1-1614  (100001-101614)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCGAGAGTGCCCATCTCCGGCCCCGGGGCCTGGGGCTCCGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCGAGAGTGCCCATCTCCGGCCCCGGGGCCTGGGGCTCCGCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGATCGGTGCTGGCAGAGGCGGCAGTAGTGTTTGCAGTGGTGCTGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGATCGGTGCTGGCAGAGGCGGCAGTAGTGTTTGCAGTGGTGCTGAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCACGCAACCGTATGGGACCGATACTCGTGGTGCGCCGTGGCCCTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCACGCAACCGTATGGGACCGATACTCGTGGTGCGCCGTGGCCCTCGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCAGGCGTTCTACGTCCAATACAAGTGGGACCGGCTGCTACAGCAGGG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCAGGCCTTCTACGTCCAATACAAGTGGGACCGGCTGCTACAGCAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGCGCCGTCTTCCAGTTCCGAATGTCCGCAAACAGTGGCCTATTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGCGCCGTCTTCCAGTTCCGAATGTCCGCAAACAGTGGCCTATTGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTCCATGGTCATGCCTTTGCTTGGACTAGTCATGAAGGAGCGGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTCCATGGTCATGCCTTTGCTTGGACTAGTCATGAAGGAGCGGTGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTGCTGGGAACCCGTTCTTTGAGCGTTTTGGCATTGTGGTGGCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTGCTGGGAACCCGTTCTTTGAGCGTTTTGGCATTGTGGTGGCAGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCATGGCAGTGGCCCTCTTCTCATCAGTGTTGGCGCTCGGCATCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCATGGCAGTGGCCCTCTTCTCATCAGTGTTGGCGCTCGGCATCACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCCAGTGCCAACCAACACTTGTGTCATCTTGGGCTTGGCTGGAGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCCAGTGCCAACCAACACTTGTGTCATCTTGGGCTTGGCTGGAGGTGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCATTTATATCATGAAGCACTCGTTGAGCGTGGGGGAGGTGATCGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCATTTATATCATGAAGCACTCGTTGAGCGTGGGGGAGGTGATCGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGGAAGTCCTTCTGATCTTCGTTTATCTCAACATGATCCTGCTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGGAAGTCCTTCTGATCTTCGTTTATCTCAACATGATCCTGCTGTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGCCCCGCTGCTTCACCCCTGGTGAGGCACTGCTGGTATTGGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGCCCCGCTGCTTCACCCCTGGTGAGGCACTGCTGGTATTGGGTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTAGCTTTGTCCTCAACCAGCTCATCAAGCGCTCTCTGACACTGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTAGCTTTGTCCTCAACCAGCTCATCAAGCGCTCTCTGACACTGGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAGTCAGGGGGACCCAGTGGACTTCTTCCTGCTGGTGGTGGTAGTAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAGTCAGGGGGACCCAGTGGACTTCTTCCTGCTGGTGGTGGTAGTAGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGTACTCATGGGCATTTTCTTCAGCACTCTGTTTGTCTTCATGGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGTACTCATGGGCATTTTCTTCAGCACTCTGTTTGTCTTCATGGACTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCACCTGGGCCTCCTCCATCTTCTTCCACCTCATGACCTGTGTGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCACCTGGGCCTCCTCCATCTTCTTCCACCTCATGACCTGTGTGCTGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTTGGTGTGGTCCTACCCTGGCTGCACCGGCTCATCCGCAGGAATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTTGGTGTGGTCCTACCCTGGCTGCACCGGCTCATCCGCAGGAATCCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTCTGGCTTCTTCAGTTTCTCTTCCAGACAGACACCCGCATCTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTCTGGCTTCTTCAGTTTCTCTTCCAGACAGACACCCGCATCTACCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTAGCCTATTGGTCTCTGCTGGCCACCTTGGCCTGCCTGGTGGTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTAGCCTATTGGTCTCTGCTGGCCACCTTGGCCTGCCTGGTGGTGCTGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCAGAATGCCAAGCGGTCATCTTCCGAGTCCAAGAAGCACCAGGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCAGAATGCCAAGCGGTCATCTTCCGAGTCCAAGAAGCACCAGGCCCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCATCGCCCGAAAGTATTTCCACCTCATTGTGGTAGCCACCTACATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCATCGCCCGAAAGTATTTCCACCTCATTGTGGTAGCCACCTACATCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGTATCATCTTTGACCGGCCACTGCTCTATGTAGCCGCCACTGTATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGTATCATCTTTGACCGGCCACTGCTCTATGTAGCCGCCACTGTATGCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCGGTCTTCATCTTCCTGGAGTATGTGCGCTACTTCCGCATCAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCGGTCTTCATCTTCCTGGAGTATGTGCGCTACTTCCGCATCAAGCCTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGGTCACACTCTACGGAGCTTCCTGTCCCTTTTTCTGGATGAACGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGGTCACACTCTACGGAGCTTCCTGTCCCTTTTTCTGGATGAACGAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AGTGGACCACTCATTCTGACACACATCTACCTGCTCCTGGGCATGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AGTGGACCACTCATTCTGACACACATCTACCTGCTCCTGGGCATGTCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCCCATCTGGCTGATCCCCAGACCCTGCACACAGAAGGGTAGCCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCCCATCTGGCTGATCCCCAGACCCTGCACACAGAAGGGTAGCCTGGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GAGCCAGGGCCCTCGTCCCCTATGCCGGTGTCCTGGCTGTGGGTGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GAGCCAGGGCCCTCGTCCCCTATGCCGGTGTCCTGGCTGTGGGTGTGGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GATACTGTGGCCTCCATCTTCGGTAGCACCATGGGGGAGATCCGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GATACTGTGGCCTCCATCTTCGGTAGCACCATGGGGGAGATCCGCTGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TGGAACCAAAAAGACTTTTGAGGGGACCATGACATCTATATTTGCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TGGAACCAAAAAGACTTTTGAGGGGACCATGACATCTATATTTGCGCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCATTTCTGTAGCTCTGATCTTAATCTTTGACAGTGGAGTGGACCTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCATTTCTGTAGCTCTGATCTTAATCTTTGACAGTGGAGTGGACCTAAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TACAGTTATGCTTGGATTTTGGGGTCCATCAGCACTGTGTCCCTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TACAGTTATGCTTGGATTTTGGGGTCCATCAGCACTGTGTCCCTCCTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AGCATACACTACACAGATAGACAATCTCCTTCTGCCTCTCTACCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AGCATACACTACACAGATAGACAATCTCCTTCTGCCTCTCTACCTCCTGA

   1600     .    :
   1601 TATTGCTGATGGCC
        ||||||||||||||
 101601 TATTGCTGATGGCC