seq1 = pF1KSDA1092.tfa, 3381 bp
seq2 = pF1KSDA1092/gi568815595f_16785122.tfa (gi568815595f:16785122_17189909), 404788 bp

>pF1KSDA1092 3381
>gi568815595f:16785122_17189909 (Chr3)

1-327  (99919-100245)   100% ->
328-2814  (224553-227039)   100% ->
2815-3018  (229587-229790)   100% ->
3019-3094  (257753-257828)   100% ->
3095-3204  (282835-282944)   100% ->
3205-3381  (304612-304788)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGTGCGGCCGGGGGGGCGCCGCCGGCGGGGCCCTGCCCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99919 ATGGCGGAGTGCGGCCGGGGGGGCGCCGCCGGCGGGGCCCTGCCCACCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGGCCCGGCCCTCGGCGCCAAGGGCGCCCTGAAAGCCGGAGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99969 CCCGGGCCCGGCCCTCGGCGCCAAGGGCGCCCTGAAAGCCGGAGTGGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGCGGTGGCGGGGGAGGTCGCCTCGGCCACGGGCGGGCGCGCTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 AAGGCGGTGGCGGGGGAGGTCGCCTCGGCCACGGGCGGGCGCGCTATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGGCGGGGTTTCCAACGGAGACTGCAGCCTCGGCGTGTCCGGGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 AGCGGCGGGGTTTCCAACGGAGACTGCAGCCTCGGCGTGTCCGGGGACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCCGGGCTAGCCCTACCAGGGGACCCCGCGGCGTTGCGCTCGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 AGCCCGGGCTAGCCCTACCAGGGGACCCCGCGGCGTTGCGCTCGCCCCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCCCAGCGCGGTCGTCTGTACCCTCCCCCGGGAGAGCAAGCCGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100169 CCCCCAGCGCGGTCGTCTGTACCCTCCCCCGGGAGAGCAAGCCGGGCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCCCGCCGGAGCAGCATCATCAAG         GATGGTACAAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100219 CTGCCCCGCCGGAGCAGCATCATCAAGGTA...CAGGATGGTACAAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGAGGGAACGGAAAAAGACAGTCTCATTCAGCAGCATGCCAACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224567 GAAGAGGGAACGGAAAAAGACAGTCTCATTCAGCAGCATGCCAACAGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAAGATCAGCAGTGCAAGTGATTGTATTAATTCAATGGTTGAGGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224617 AGAAGATCAGCAGTGCAAGTGATTGTATTAATTCAATGGTTGAGGGTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAACTCAAAAAGGTTCGCTCCAACTCTAGAATTTATCATAGGTACTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224667 GAACTCAAAAAGGTTCGCTCCAACTCTAGAATTTATCATAGGTACTTTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTGGATGCTGACATGCAGAGCCTAAGGTGGGAGCCATCTAAGAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224717 ACTGGATGCTGACATGCAGAGCCTAAGGTGGGAGCCATCTAAGAAGGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGAGAAAGCCAAGATTGACATTAAATCCATCAAGGAAGTGAGAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224767 CTGAGAAAGCCAAGATTGACATTAAATCCATCAAGGAAGTGAGAACAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAAACACAGACATATTCCGCAGCAATGGCATTTCTGACCAGATATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224817 AAAAACACAGACATATTCCGCAGCAATGGCATTTCTGACCAGATATCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGATTGTGCGTTTTCCGTCATATATGGAGAGAATTATGAGTCACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224867 AGATTGTGCGTTTTCCGTCATATATGGAGAGAATTATGAGTCACTGGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGTTGCCAACTCCGCAGATGTTGCAAACATCTGGGTTACAGGACTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224917 TGGTTGCCAACTCCGCAGATGTTGCAAACATCTGGGTTACAGGACTGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TACCTAATTTCTTATGGAAAACATACACTTGATATGTTAGAAAGTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224967 TACCTAATTTCTTATGGAAAACATACACTTGATATGTTAGAAAGTAGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGATAACATGAGGACTTCTTGGGTTTCACAAATGTTTAGTGAAATTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225017 AGATAACATGAGGACTTCTTGGGTTTCACAAATGTTTAGTGAAATTGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TAGATAACCTTGGACATATAACTCTGTGTAATGCTGTGCAATGTATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225067 TAGATAACCTTGGACATATAACTCTGTGTAATGCTGTGCAATGTATCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AACCTCAATCCTGGTTTAAAAACGAGCAAAATTGAGCTTAAGTTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225117 AACCTCAATCCTGGTTTAAAAACGAGCAAAATTGAGCTTAAGTTCAAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ATTGCATAAATCAAAGGACAAAGCTGGTACCGAGGTCACAAAGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225167 ATTGCATAAATCAAAGGACAAAGCTGGTACCGAGGTCACAAAGGAAGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTATTGAGGTTTTTCATGAGCTTTGTACTAGACCTGAAATTTATTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225217 TTATTGAGGTTTTTCATGAGCTTTGTACTAGACCTGAAATTTATTTCCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TTAGTTCAGTTTTCAAGCAATAAAGAATTCCTTGATACCAAGGACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225267 TTAGTTCAGTTTTCAAGCAATAAAGAATTCCTTGATACCAAGGACCTTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GATGTTTCTTGAGGCAGAACAGGGTGTGGCACATATAAATGAGGAAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225317 GATGTTTCTTGAGGCAGAACAGGGTGTGGCACATATAAATGAGGAAATAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCCTTGAAATTATTCACAAATATGAACCATCCAAAGAGGGTCAGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225367 GCCTTGAAATTATTCACAAATATGAACCATCCAAAGAGGGTCAGGAAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GGCTGGCTCTCCATAGACGGGTTCACTAATTACCTTATGTCACCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225417 GGCTGGCTCTCCATAGACGGGTTCACTAATTACCTTATGTCACCTGACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TTATATATTCGATCCAGAACATAAGAAGGTCTGTCAGGATATGAAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225467 TTATATATTCGATCCAGAACATAAGAAGGTCTGTCAGGATATGAAGCAAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CTCTGTCTCATTACTTTATAAACTCATCTCATAATACATACTTAATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225517 CTCTGTCTCATTACTTTATAAACTCATCTCATAATACATACTTAATAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GATCAGTTCCGAGGTCCCTCCGACATCACAGGATATATTCGAGCTCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225567 GATCAGTTCCGAGGTCCCTCCGACATCACAGGATATATTCGAGCTCTTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 AATGGGTTGCCGGAGTGTTGAATTAGATGTATGGGATGGGCCGGACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225617 AATGGGTTGCCGGAGTGTTGAATTAGATGTATGGGATGGGCCGGACAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AACCTGTAATTTACACAGGCCACACCATGACCTCTCAGATAGTTTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225667 AACCTGTAATTTACACAGGCCACACCATGACCTCTCAGATAGTTTTCCGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 AGTGTCATTGATATTATTAACAAGTATGCATTCTTTGCTTCAGAGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225717 AGTGTCATTGATATTATTAACAAGTATGCATTCTTTGCTTCAGAGTATCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 TCTTATCTTGTGTTTAGAAAACCACTGTTCCATTAAACAACAGAAGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225767 TCTTATCTTGTGTTTAGAAAACCACTGTTCCATTAAACAACAGAAGGTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 TGGTTCAGCACATGAAGAAACTTTTAGGAGACAAGCTCTATACAACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225817 TGGTTCAGCACATGAAGAAACTTTTAGGAGACAAGCTCTATACAACATCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 CCCAATGTTGAGGAATCTTATCTACCATCCCCAGATGTCCTGAAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225867 CCCAATGTTGAGGAATCTTATCTACCATCCCCAGATGTCCTGAAAGGGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 AATACTAATTAAAGCAAAGAAGCTGTCCTCAAATTGCTCTGGGGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225917 AATACTAATTAAAGCAAAGAAGCTGTCCTCAAATTGCTCTGGGGTAGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 GAGATGTTACTGACGAAGATGAAGGAGCAGAAATGTCTCAGAGGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225967 GAGATGTTACTGACGAAGATGAAGGAGCAGAAATGTCTCAGAGGATGGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 AAAGAGAACATGGAGCAACCCAATAATGTGCCTGTGAAGCGATTTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226017 AAAGAGAACATGGAGCAACCCAATAATGTGCCTGTGAAGCGATTTCAGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 TTGTAAAGAACTGTCTGAACTGGTCAGCATCTGCAAATCAGTTCAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226067 TTGTAAAGAACTGTCTGAACTGGTCAGCATCTGCAAATCAGTTCAGTTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 AAGAATTTCAGGTGTCGTTTCAGGTTCAGAAGTACTGGGAAGTCTGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226117 AAGAATTTCAGGTGTCGTTTCAGGTTCAGAAGTACTGGGAAGTCTGTTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 TTTAATGAAGTGCTTGCCAGCAAGTACGCCAATGAAAATCCAGGGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226167 TTTAATGAAGTGCTTGCCAGCAAGTACGCCAATGAAAATCCAGGGGACTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 TGTAAATTACAACAAACGTTTTCTTGCTAGGGTTTTTCCCAGTCCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226217 TGTAAATTACAACAAACGTTTTCTTGCTAGGGTTTTTCCCAGTCCAATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 GAATTGATTCCAGTAACATGAATCCTCAAGATTTTTGGAAATGTGGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226267 GAATTGATTCCAGTAACATGAATCCTCAAGATTTTTGGAAATGTGGTTGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 CAAATTGTAGCCATGAACTTTCAGACACCAGGACTGATGATGGACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226317 CAAATTGTAGCCATGAACTTTCAGACACCAGGACTGATGATGGACCTGAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 TATTGGCTGGTTTAGGCAGAACGGAAACTGTGGCTATGTCCTCCGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226367 TATTGGCTGGTTTAGGCAGAACGGAAACTGTGGCTATGTCCTCCGGCCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 CCATCATGAGGGAGGAGGTCTCCTTCTTCAGCGCCAATACAAAAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226417 CCATCATGAGGGAGGAGGTCTCCTTCTTCAGCGCCAATACAAAAGACTCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 GTCCCAGGGGTCTCACCTCAACTTCTTCACATTAAAATCATCAGTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226467 GTCCCAGGGGTCTCACCTCAACTTCTTCACATTAAAATCATCAGTGGGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 GAACTTTCCCAAGCCCAAAGGATCAGGTGCCAAAGGTGATGTGGTAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226517 GAACTTTCCCAAGCCCAAAGGATCAGGTGCCAAAGGTGATGTGGTAGATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 CTTATGTCTATGTTGAAATCCATGGAATCCCTGCTGATTGTGCAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226567 CTTATGTCTATGTTGAAATCCATGGAATCCCTGCTGATTGTGCAGAACAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 AGGACAAAAACAGTGCACCAGAATGGAGACGCTCCCATTTTTGATGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226617 AGGACAAAAACAGTGCACCAGAATGGAGACGCTCCCATTTTTGATGAAAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 CTTTGAATTTCAAATCAACCTGCCTGAACTGGCCATGGTGCGCTTTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226667 CTTTGAATTTCAAATCAACCTGCCTGAACTGGCCATGGTGCGCTTTGTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 TGCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAATTCATCGGCCAGTACACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226717 TGCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAATTCATCGGCCAGTACACAATT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 CCCTTTGAATGTTTACAGACGGGCTACCGCCATGTCCCCCTGCAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226767 CCCTTTGAATGTTTACAGACGGGCTACCGCCATGTCCCCCTGCAGTCCTT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2592 AACTGGAGAGGTCCTTGCACATGCTTCTTTATTTGTCCACGTGGCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226817 AACTGGAGAGGTCCTTGCACATGCTTCTTTATTTGTCCACGTGGCTATTA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2642 CTAACCGAAGAGGAGGAGGAAAGCCTCATAAAAGGGGCCTTTCTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226867 CTAACCGAAGAGGAGGAGGAAAGCCTCATAAAAGGGGCCTTTCTGTGAGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2692 AAAGGGAAGAAATCCAGGGAATATGCATCTTTGAGAACACTGTGGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226917 AAAGGGAAGAAATCCAGGGAATATGCATCTTTGAGAACACTGTGGATTAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2742 AACCGTGGATGAGGTATTCAAGAATGCCCAGCCCCCTATACGGGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226967 AACCGTGGATGAGGTATTCAAGAATGCCCAGCCCCCTATACGGGATGCCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2792 CAGATCTGAGAGAAAACATGCAG         AATGCGGTGGTGTCATTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 227017 CAGATCTGAGAGAAAACATGCAGGTG...CAGAATGCGGTGGTGTCATTC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2833 AAGGAGCTGTGTGGCCTCTCCTCTGTGGCCAATCTCATGCAGTGCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229605 AAGGAGCTGTGTGGCCTCTCCTCTGTGGCCAATCTCATGCAGTGCATGTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2883 GGCGGTGTCTCCCCGCTTTCTGGGGCCCGATAACACACCCCTAGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229655 GGCGGTGTCTCCCCGCTTTCTGGGGCCCGATAACACACCCCTAGTGGTCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2933 TAAATCTCAGCGAGCAGTACCCCACAATGGAGCTGCAGGGAATTGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229705 TAAATCTCAGCGAGCAGTACCCCACAATGGAGCTGCAGGGAATTGTGCCG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2983 GAGGTTCTGAAGAAGATCGTAACAACTTATGACATG         ATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 229755 GAGGTTCTGAAGAAGATCGTAACAACTTATGACATGGTG...CAGATGAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3024 TCAGTCCCTCAAGGCGTTGATTGAAAATGCAGATGCTGTATATGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 257758 TCAGTCCCTCAAGGCGTTGATTGAAAATGCAGATGCTGTATATGAAAAGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3074 TCGTACATTGTCAGAAGGCAG         CCATGGAATTCCATGAACAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 257808 TCGTACATTGTCAGAAGGCAGGTA...CAGCCATGGAATTCCATGAACAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3115 TTGCACAGCATAGGCACCAAGGAAGGTTTGAAGGAAAGAAAACTACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282855 TTGCACAGCATAGGCACCAAGGAAGGTTTGAAGGAAAGAAAACTACAAAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3165 AGCAGTGGAGAGCTTTACCTGGAATATTACCATCTTAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 282905 AGCAGTGGAGAGCTTTACCTGGAATATTACCATCTTAAAGGTA...TAGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3206 GACAAGCAGATCTTTTGAAATATGCTAAGAATGAGACATTGGAGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304613 GACAAGCAGATCTTTTGAAATATGCTAAGAATGAGACATTGGAGAACCTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3256 AAACAAATCCATTTTGCTGCTGTTTCATGTGGACTGAATAAACCAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304663 AAACAAATCCATTTTGCTGCTGTTTCATGTGGACTGAATAAACCAGGCAC

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3306 CGAAAATGCTGATGTCCAGAAGCCACGCCGGAGCTTGGAAGTCATACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 304713 CGAAAATGCTGATGTCCAGAAGCCACGCCGGAGCTTGGAAGTCATACCCG

   3400     .    :    .    :    .
   3356 AAAAAGCAAACGATGAAACTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 304763 AAAAAGCAAACGATGAAACTGGAGAA