seq1 = pF1KSDA1089.tfa, 3048 bp
seq2 = pF1KSDA1089/gi568815597r_156150590.tfa (gi568815597r:156150590_156382662), 232073 bp
>pF1KSDA1089 3048
>gi568815597r:156150590_156382662 (Chr1)
(complement)
1-74 (99983-100056) 100% ->
75-173 (103629-103727) 100% ->
174-297 (104615-104738) 100% ->
298-454 (105422-105578) 100% ->
455-544 (107977-108066) 100% ->
545-634 (109213-109302) 100% ->
635-713 (110265-110343) 100% ->
714-839 (114248-114373) 100% ->
840-908 (114480-114548) 100% ->
909-1117 (114985-115193) 100% ->
1118-1255 (115985-116122) 100% ->
1256-1855 (116283-116882) 100% ->
1856-2031 (119093-119268) 100% ->
2032-2107 (121255-121330) 100% ->
2108-2283 (122037-122212) 100% ->
2284-2442 (123500-123658) 100% ->
2443-2502 (129155-129214) 100% ->
2503-2662 (129585-129744) 100% ->
2663-2753 (130159-130249) 100% ->
2754-2828 (131186-131260) 100% ->
2829-2967 (131667-131805) 100% ->
2968-3048 (131993-132073) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGCCAAGGCCCCCCCACAGGGGAGAGCAGCGAGCCCGAAGCAAAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99983 ATGAGCCAAGGCCCCCCCACAGGGGAGAGCAGCGAGCCCGAAGCAAAAGT
50 . : . : . : . : . :
51 CCTCCACACTAAGCGGCTTTACCG GGCTGTGGTGGAGGCTG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
100033 CCTCCACACTAAGCGGCTTTACCGGTG...CAGGGCTGTGGTGGAGGCTG
100 . : . : . : . : . :
92 TGCATCGACTTGACCTCATCCTTTGCAACAAAACTGCTTATCAAGAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103646 TGCATCGACTTGACCTCATCCTTTGCAACAAAACTGCTTATCAAGAAGTA
150 . : . : . : . : . :
142 TTCAAACCAGAAAACATTAGCCTGAGGAACAA GCTGCGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
103696 TTCAAACCAGAAAACATTAGCCTGAGGAACAAGTA...CAGGCTGCGTGA
200 . : . : . : . : . :
183 GCTCTGCGTCAAGCTTATGTTCCTGCACCCAGTGGACTATGGGAGAAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104624 GCTCTGCGTCAAGCTTATGTTCCTGCACCCAGTGGACTATGGGAGAAAGG
250 . : . : . : . : . :
233 CTGAGGAGCTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAGCTTATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104674 CTGAGGAGCTGCTGTGGAGAAAGGTATACTATGAAGTTATCCAGCTTATC
300 . : . : . : . : . :
283 AAGACTAACAAAAAG CACATCCACAGCCGGAGCACTTTGGA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
104724 AAGACTAACAAAAAGGTA...TAGCACATCCACAGCCGGAGCACTTTGGA
350 . : . : . : . : . :
324 ATGTGCCTACAGGACGCACCTGGTTGCTGGTATTGGCTTCTACCAGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105448 ATGTGCCTACAGGACGCACCTGGTTGCTGGTATTGGCTTCTACCAGCATC
400 . : . : . : . : . :
374 TCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTGCAGTGCTGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105498 TCCTTCTCTATATCCAGTCCCACTACCAGCTGGAACTGCAGTGCTGCATC
450 . : . : . : . : . :
424 GACTGGACCCATGTCACTGACCCCCTCATAG GATGCAAGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
105548 GACTGGACCCATGTCACTGACCCCCTCATAGGTC...TAGGATGCAAGAA
500 . : . : . : . : . :
465 GCCAGTGTCTGCCTCAGGGAAGGAGATGGATTGGGCACAGATGGCATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107987 GCCAGTGTCTGCCTCAGGGAAGGAGATGGATTGGGCACAGATGGCATGTC
550 . : . : . : . : . :
515 ACCGATGTCTGGTGTATCTGGGGGATTTGT CCCGATATCAG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
108037 ACCGATGTCTGGTGTATCTGGGGGATTTGTGTA...CAGCCCGATATCAG
600 . : . : . : . : . :
556 AATGAATTAGCTGGCGTAGATACCGAGCTGCTAGCCGAGAGATTTTACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109224 AATGAATTAGCTGGCGTAGATACCGAGCTGCTAGCCGAGAGATTTTACTA
650 . : . : . : . : . :
606 CCAAGCCCTGTCAGTAGCTCCTCAGATTG GAATGCCCTTCA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
109274 CCAAGCCCTGTCAGTAGCTCCTCAGATTGGTA...TAGGAATGCCCTTCA
700 . : . : . : . : . :
647 ATCAGCTGGGCACCCTGGCAGGCAGCAAGTACTATAATGTGGAAGCCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110277 ATCAGCTGGGCACCCTGGCAGGCAGCAAGTACTATAATGTGGAAGCCATG
750 . : . : . : . : . :
697 TATTGCTACCTGCGCTG CATCCAGTCAGAAGTGTCCTTTGA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
110327 TATTGCTACCTGCGCTGGTG...CAGCATCCAGTCAGAAGTGTCCTTTGA
800 . : . : . : . : . :
738 GGGAGCCTATGGGAACCTCAAGCGGCTGTATGACAAGGCAGCCAAAATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114272 GGGAGCCTATGGGAACCTCAAGCGGCTGTATGACAAGGCAGCCAAAATGT
850 . : . : . : . : . :
788 ACCACCAACTGAAGAAGTGTGAGACTCGGAAACTGTCTCCTGGCAAAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114322 ACCACCAACTGAAGAAGTGTGAGACTCGGAAACTGTCTCCTGGCAAAAAG
900 . : . : . : . : . :
838 CG ATGTAAAGACATTAAAAGGTTGCTAGTGAACTTTATGTA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114372 CGGTG...CAGATGTAAAGACATTAAAAGGTTGCTAGTGAACTTTATGTA
950 . : . : . : . : . :
879 TCTGCAAAGCCTCCTACAGCCCAAAAGCAG CTCCGTGGACT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
114519 TCTGCAAAGCCTCCTACAGCCCAAAAGCAGGTG...TAGCTCCGTGGACT
1000 . : . : . : . : . :
920 CAGAGCTGACCTCACTTTGCCAGTCAGTCCTGGAGGACTTCAACCTCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114996 CAGAGCTGACCTCACTTTGCCAGTCAGTCCTGGAGGACTTCAACCTCTGC
1050 . : . : . : . : . :
970 CTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTCAGCCTGGCCAGTGAGGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115046 CTCTTCTACCTGCCCTCCTCACCCAACCTCAGCCTGGCCAGTGAGGATGA
1100 . : . : . : . : . :
1020 GGAGGAGTATGAGAGTGGATATGCTTTCCTCCCGGACCTTCTCATCTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115096 GGAGGAGTATGAGAGTGGATATGCTTTCCTCCCGGACCTTCTCATCTTTC
1150 . : . : . : . : . :
1070 AAATGGTCATCATCTGCCTTATGTGTGTGCACAGCTTGGAGAGAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
115146 AAATGGTCATCATCTGCCTTATGTGTGTGCACAGCTTGGAGAGAGCAGGT
1200 . : . : . : . : . :
1118 GATCCAAGCAGTACAGTGCAGCCATTGCCTTCACCCTGGCCCT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
115196 A...CAGGATCCAAGCAGTACAGTGCAGCCATTGCCTTCACCCTGGCCCT
1250 . : . : . : . : . :
1161 CTTTTCCCACCTCGTCAATCATGTCAACATACGGCTGCAGGCTGAGCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116028 CTTTTCCCACCTCGTCAATCATGTCAACATACGGCTGCAGGCTGAGCTGG
1300 . : . : . : . : . :
1211 AAGAGGGCGAGAATCCCGTCCCGGCATTCCAGAGTGATGGCACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
116078 AAGAGGGCGAGAATCCCGTCCCGGCATTCCAGAGTGATGGCACAGGTG..
1350 . : . : . : . : . :
1256 ATGAACCAGAGTCCAAGGAACCTGTGGAGAAAGAGGAGGAGCCAGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116128 .CAGATGAACCAGAGTCCAAGGAACCTGTGGAGAAAGAGGAGGAGCCAGA
1400 . : . : . : . : . :
1302 TCCTGAGCCTCCTCCTGTAACACCCCAAGTGGGTGAGGGCAGAAAGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116329 TCCTGAGCCTCCTCCTGTAACACCCCAAGTGGGTGAGGGCAGAAAGAGCC
1450 . : . : . : . : . :
1352 GTAAGTTCTCTCGCCTCTCCTGTCTCCGCCGTCGCCGCCACCCACCCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116379 GTAAGTTCTCTCGCCTCTCCTGTCTCCGCCGTCGCCGCCACCCACCCAAA
1500 . : . : . : . : . :
1402 GTTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAAGGCTTTGAATCGGACTCAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116429 GTTGGTGATGACAGTGACCTGAGTGAAGGCTTTGAATCGGACTCAAGCCA
1550 . : . : . : . : . :
1452 TGACTCAGCCCGGGCCAGTGAGGGCTCAGACAGTGGCTCTGACAAGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116479 TGACTCAGCCCGGGCCAGTGAGGGCTCAGACAGTGGCTCTGACAAGAGTC
1600 . : . : . : . : . :
1502 TTGAAGGTGGGGGAACGGCCTTTGATGCTGAAACAGACTCGGAAATGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116529 TTGAAGGTGGGGGAACGGCCTTTGATGCTGAAACAGACTCGGAAATGAAT
1650 . : . : . : . : . :
1552 AGCCAGGAGTCCCGATCAGACTTGGAAGATATGGAGGAAGAGGAGGGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116579 AGCCAGGAGTCCCGATCAGACTTGGAAGATATGGAGGAAGAGGAGGGGAC
1700 . : . : . : . : . :
1602 ACGGTCACCAACCCTGGAGCCCCCTCGGGGCAGATCAGAGGCTCCCGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116629 ACGGTCACCAACCCTGGAGCCCCCTCGGGGCAGATCAGAGGCTCCCGATT
1750 . : . : . : . : . :
1652 CCCTCAATGGCCCACTGGGCCCCAGTGAGGCTAGCATTGCCAGCAATCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116679 CCCTCAATGGCCCACTGGGCCCCAGTGAGGCTAGCATTGCCAGCAATCTA
1800 . : . : . : . : . :
1702 CAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACTAAGCGCTGCTTCCGACTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116729 CAAGCCATGTCCACCCAGATGTTCCAGACTAAGCGCTGCTTCCGACTGGC
1850 . : . : . : . : . :
1752 CCCCACCTTTAGCAACCTGCTCCTCCAGCCCACCACCAACCCTCATACCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116779 CCCCACCTTTAGCAACCTGCTCCTCCAGCCCACCACCAACCCTCATACCT
1900 . : . : . : . : . :
1802 CGGCCAGCCACAGGCCTTGCGTCAATGGGGATGTAGACAAGCCTTCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116829 CGGCCAGCCACAGGCCTTGCGTCAATGGGGATGTAGACAAGCCTTCAGAG
1950 . : . : . : . : . :
1852 CCAG CCTCTGAGGAGGGCTCTGAGTCGGAGGGGAGTGAGTC
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116879 CCAGGTA...CAGCCTCTGAGGAGGGCTCTGAGTCGGAGGGGAGTGAGTC
2000 . : . : . : . : . :
1893 CAGTGGACGCTCCTGTCGGAATGAGCGCAGCATCCAGGAGAAGCTTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119130 CAGTGGACGCTCCTGTCGGAATGAGCGCAGCATCCAGGAGAAGCTTCAGG
2050 . : . : . : . : . :
1943 TCCTGATGGCCGAAGGTCTGCTTCCTGCTGTGAAAGTCTTCCTGGACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119180 TCCTGATGGCCGAAGGTCTGCTTCCTGCTGTGAAAGTCTTCCTGGACTGG
2100 . : . : . : . : . :
1993 CTTCGGACCAACCCCGACCTCATCATCGTGTGTGCGCAG AG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
119230 CTTCGGACCAACCCCGACCTCATCATCGTGTGTGCGCAGGTG...CAGAG
2150 . : . : . : . : . :
2034 CTCTCAAAGTCTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTTGCTGAATCTGTTGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121257 CTCTCAAAGTCTGTGGAACCGCCTGTCTGTGTTGCTGAATCTGTTGCCTG
2200 . : . : . : . : . :
2084 CTGCTGGTGAACTCCAGGAGTCTG GCCTGGCCTTGTGTCCT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
121307 CTGCTGGTGAACTCCAGGAGTCTGGTG...CAGGCCTGGCCTTGTGTCCT
2250 . : . : . : . : . :
2125 GAGGTCCAAGATCTTCTTGAAGGTTGTGAACTGCCTGACCTCCCCTCTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122054 GAGGTCCAAGATCTTCTTGAAGGTTGTGAACTGCCTGACCTCCCCTCTAG
2300 . : . : . : . : . :
2175 CCTTCTGCTCCCAGAGGACATGGCTCTTCGTAACCTGCCCCCGCTCCGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122104 CCTTCTGCTCCCAGAGGACATGGCTCTTCGTAACCTGCCCCCGCTCCGAG
2350 . : . : . : . : . :
2225 CTGCCCACAGACGCTTTAACTTTGACACGGATCGGCCCCTGCTCAGCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122154 CTGCCCACAGACGCTTTAACTTTGACACGGATCGGCCCCTGCTCAGCACC
2400 . : . : . : . : . :
2275 TTAGAGGAG TCAGTGGTGCGCATCTGCTGCATCCGCAGCTT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
122204 TTAGAGGAGGTA...CAGTCAGTGGTGCGCATCTGCTGCATCCGCAGCTT
2450 . : . : . : . : . :
2316 TGGTCATTTCATCGCCCGCCTGCAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAACCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123532 TGGTCATTTCATCGCCCGCCTGCAAGGCAGCATCCTGCAGTTCAACCCAG
2500 . : . : . : . : . :
2366 AGGTTGGCATCTTCGTCAGCATTGCCCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123582 AGGTTGGCATCTTCGTCAGCATTGCCCAGTCTGAGCAGGAGAGCCTGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2416 CAGCAGGCCCAGGCACAGTTCCGAATG GCACAGGAGGAAGC
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
123632 CAGCAGGCCCAGGCACAGTTCCGAATGGTG...TAGGCACAGGAGGAAGC
2600 . : . : . : . : . :
2457 TCGTCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGACTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
129169 TCGTCGGAACAGGCTCATGAGAGACATGGCTCAGCTACGACTTCAGGTA.
2650 . : . : . : . : . :
2503 CTCGAAGTGTCTCAGCTGGAGGGCAGCCTGCAGCAGCCCAAGGCC
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129219 ..CAGCTCGAAGTGTCTCAGCTGGAGGGCAGCCTGCAGCAGCCCAAGGCC
2700 . : . : . : . : . :
2548 CAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCGTCCCTGACACCCAGGCCCTCTGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129630 CAGTCAGCCATGTCTCCCTACCTCGTCCCTGACACCCAGGCCCTCTGCCA
2750 . : . : . : . : . :
2598 CCATCTCCCTGTCATCCGCCAACTGGCCACCAGTGGCCGCTTCATTGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
129680 CCATCTCCCTGTCATCCGCCAACTGGCCACCAGTGGCCGCTTCATTGTCA
2800 . : . : . : . : . :
2648 TCATCCCAAGGACAG TGATCGATGGCCTGGATTTGCTGAAG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
129730 TCATCCCAAGGACAGGTA...CAGTGATCGATGGCCTGGATTTGCTGAAG
2850 . : . : . : . : . :
2689 AAGGAACACCCAGGGGCCCGGGATGGGATTCGGTACCTGGAGGCAGAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130185 AAGGAACACCCAGGGGCCCGGGATGGGATTCGGTACCTGGAGGCAGAGTT
2900 . : . : . : . : . :
2739 TAAAAAAGGAAACAG GTACATTCGCTGCCAGAAAGAGGTGG
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
130235 TAAAAAAGGAAACAGGTG...CAGGTACATTCGCTGCCAGAAAGAGGTGG
2950 . : . : . : . : . :
2780 GAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAGCTGAAGAGGCAGGATGCAGATGCCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
131212 GAAAGAGCTTTGAGCGGCATAAGCTGAAGAGGCAGGATGCAGATGCCTGG
3000 . : . : . : . : . :
2829 GACTCTCTATAAGATCCTAGACAGCTGCAAACAGCTGACTCT
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131262 TA...CAGGACTCTCTATAAGATCCTAGACAGCTGCAAACAGCTGACTCT
3050 . : . : . : . : . :
2871 GGCCCAGGGGGCAGGTGAGGAGGATCCGAGTGGCATGGTGACCATCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131709 GGCCCAGGGGGCAGGTGAGGAGGATCCGAGTGGCATGGTGACCATCATCA
3100 . : . : . : . : . :
2921 CAGGCCTTCCACTGGACAACCCCAGCGTGCTTTCAGGCCCCATGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
131759 CAGGCCTTCCACTGGACAACCCCAGCGTGCTTTCAGGCCCCATGCAGGTG
3150 . : . : . : . : . :
2968 GCAGCCCTGCAGGCCGCTGCCCACGCCAGTGTGGACATCAAGAA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131809 ...CAGGCAGCCCTGCAGGCCGCTGCCCACGCCAGTGTGGACATCAAGAA
3200 . : . : . : .
3012 TGTTCTGGACTTCTACAAGCAGTGGAAGGAAATTGGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132037 TGTTCTGGACTTCTACAAGCAGTGGAAGGAAATTGGT