seq1 = pF1KSDA1087.tfa, 2763 bp
seq2 = pF1KSDA1087/gi568815579r_47330092.tfa (gi568815579r:47330092_47566403), 236312 bp

>pF1KSDA1087 2763
>gi568815579r:47330092_47566403 (Chr19)

(complement)

1-675  (100001-100675)   100% ->
676-1340  (108810-109474)   100% ->
1341-1763  (118173-118595)   100% ->
1764-1867  (124964-125067)   100% ->
1868-1885  (125218-125235)   100% ->
1886-2010  (128431-128555)   100% ->
2011-2110  (128843-128942)   100% ->
2111-2389  (133959-134237)   100% ->
2390-2763  (135939-136312)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCCCTGGCCTTGGTGGGGGTCACACTCCTCCTGGCGGCTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCCCTGGCCTTGGTGGGGGTCACACTCCTCCTGGCGGCTCCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCTCCGGGGCAGCCACCCCAACCCCCTCCCTGCCGCCTCCCCCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCTCCGGGGCAGCCACCCCAACCCCCTCCCTGCCGCCTCCCCCGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGACAGCGACACCAGCACAGGGGGCTGCCAGGGGTCCTACCGCTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGACAGCGACACCAGCACAGGGGGCTGCCAGGGGTCCTACCGCTGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGGGGTGCTGCTGCCCGTGTGGGAGCCCGACGACCCGTCGCTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGGGGTGCTGCTGCCCGTGTGGGAGCCCGACGACCCGTCGCTGGGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAGGCGGCACGGGCAGTGGTGTACTTTGTGGCCATGGTCTACATGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGGCGGCACGGGCAGTGGTGTACTTTGTGGCCATGGTCTACATGTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGGAGTGTCCATCATCGCCGACCGTTTCATGGCGGCCATCGAGGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGGAGTGTCCATCATCGCCGACCGTTTCATGGCGGCCATCGAGGTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGTCAAAAGAGAAGGAGATCACCATCACCAAGGCCAACGGTGAGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGTCAAAAGAGAAGGAGATCACCATCACCAAGGCCAACGGTGAGACCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTGGGCACCGTTCGCATCTGGAATGAGACGGTGTCCAACCTCACGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTGGGCACCGTTCGCATCTGGAATGAGACGGTGTCCAACCTCACGCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCCTGGGCTCCTCCGCACCTGAGATCCTGCTGTCAGTCATCGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCCTGGGCTCCTCCGCACCTGAGATCCTGCTGTCAGTCATCGAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCGGCCACAACTTCCAGGCGGGTGAGCTGGGCCCAGGCACCATCGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCGGCCACAACTTCCAGGCGGGTGAGCTGGGCCCAGGCACCATCGTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCGCTGCCTTCAACATGTTTGTGGTCATCGCCGTGTGCATCTACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGCGCTGCCTTCAACATGTTTGTGGTCATCGCCGTGTGCATCTACGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCCAGCCGGCGAGAGCCGCAAGATCAAGCACCTGAGAGTCTTCTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCCAGCCGGCGAGAGCCGCAAGATCAAGCACCTGAGAGTCTTCTTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTGCCTCTTGGAGCATCTTCGCCTATGTCTGGCTTTATCTCATCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTGCCTCTTGGAGCATCTTCGCCTATGTCTGGCTTTATCTCATCCTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTTTTTTCCCCCGGTGTGGTCCAG         GTGTGGGAGGCGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100651 TGTTTTTTCCCCCGGTGTGGTCCAGGTG...CAGGTGTGGGAGGCGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGACCCTGGTCTTCTTCCCGGTGTGCGTGGTATTCGCCTGGATGGCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108826 TGACCCTGGTCTTCTTCCCGGTGTGCGTGGTATTCGCCTGGATGGCCGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AAGCGGCTGCTCTTCTACAAGTACGTGTACAAGCGCTACCGCACCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108876 AAGCGGCTGCTCTTCTACAAGTACGTGTACAAGCGCTACCGCACCGACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACGCAGCGGCATCATCATAGGCGCCGAGGGCGACCCCCCGAAGAGCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108926 ACGCAGCGGCATCATCATAGGCGCCGAGGGCGACCCCCCGAAGAGCATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGCTGGACGGCACGTTCGTGGGCGCCGAGGCCCCAGGTGAGCTGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108976 AGCTGGACGGCACGTTCGTGGGCGCCGAGGCCCCAGGTGAGCTGGGCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGGGCCCGGGCCCCGCCGAGGCGCGCGAGCTGGACGCCAGCCGCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109026 CTGGGCCCGGGCCCCGCCGAGGCGCGCGAGCTGGACGCCAGCCGCCGCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGTCATCCAGATCCTCAAGGACCTCAAGCAGAAGCACCCGGACAAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109076 GGTCATCCAGATCCTCAAGGACCTCAAGCAGAAGCACCCGGACAAGGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGGAGCAGCTGGTGGGCATCGCCAACTACTACGCGCTGCTGCACCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109126 TGGAGCAGCTGGTGGGCATCGCCAACTACTACGCGCTGCTGCACCAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AAGAGCCGCGCCTTCTACCGCATCCAGGCCACGCGGCTGATGACCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109176 AAGAGCCGCGCCTTCTACCGCATCCAGGCCACGCGGCTGATGACCGGCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CGGGAACGTGCTGCGCAGACACGCGGCGGACGCCTCGCGCAGGGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109226 CGGGAACGTGCTGCGCAGACACGCGGCGGACGCCTCGCGCAGGGCGGCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CGGCCGAGGGCGCGGGCGAGGACGAAGACGACGGCGCCAGCCGCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109276 CGGCCGAGGGCGCGGGCGAGGACGAAGACGACGGCGCCAGCCGCATCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TTCGAGCCTAGCCTCTACCACTGCCTGGAGAACTGCGGCTCCGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109326 TTCGAGCCTAGCCTCTACCACTGCCTGGAGAACTGCGGCTCCGTGCTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GTCCGTCACGTGCCAGGGCGGCGAGGGCAACAGCACCTTCTACGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109376 GTCCGTCACGTGCCAGGGCGGCGAGGGCAACAGCACCTTCTACGTGGACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ACCGCACTGAGGACGGCTCTGCCAAGGCGGGCTCCGACTACGAGTACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109426 ACCGCACTGAGGACGGCTCTGCCAAGGCGGGCTCCGACTACGAGTACAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1341         CGAGGGCACGCTGGTGTTCAAACCAGGCGAGACGCAGAAGGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109476 TG...CAGCGAGGGCACGCTGGTGTTCAAACCAGGCGAGACGCAGAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GCTGCGCATCGGCATCATCGACGACGACATCTTCGAGGAGGACGAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118215 GCTGCGCATCGGCATCATCGACGACGACATCTTCGAGGAGGACGAGCATT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 TCTTCGTGCGGCTGCTGAACCTGCGCGTGGGCGACGCGCAGGGCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118265 TCTTCGTGCGGCTGCTGAACCTGCGCGTGGGCGACGCGCAGGGCATGTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 GAGCCGGACGGCGGCGGGCGGCCCAAGGGGCGGCTGGTGGCGCCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118315 GAGCCGGACGGCGGCGGGCGGCCCAAGGGGCGGCTGGTGGCGCCGCTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GGCCACCGTCACCATCCTGGACGACGACCACGCAGGCATCTTCTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118365 GGCCACCGTCACCATCCTGGACGACGACCACGCAGGCATCTTCTCCTTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 AGGACCGCCTGCTGCACGTGAGCGAGTGCATGGGCACCGTGGACGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118415 AGGACCGCCTGCTGCACGTGAGCGAGTGCATGGGCACCGTGGACGTGCGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GTCGTGCGCAGCTCGGGCGCGCGCGGCACCGTGCGCCTTCCCTACCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118465 GTCGTGCGCAGCTCGGGCGCGCGCGGCACCGTGCGCCTTCCCTACCGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GGTGGACGGCACGGCGCGCGGCGGCGGCGTGCACTACGAGGACGCGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118515 GGTGGACGGCACGGCGCGCGGCGGCGGCGTGCACTACGAGGACGCGTGCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 GAGAGCTGGAGTTTGGCGACGACGAGACCAT         GAAAACTCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 118565 GAGAGCTGGAGTTTGGCGACGACGAGACCATGTG...CAGGAAAACTCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CAGGTGAAGATAGTTGATGACGAGGAATATGAGAAAAAGGATAATTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124974 CAGGTGAAGATAGTTGATGACGAGGAATATGAGAAAAAGGATAATTTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 CATTGAGCTGGGCCAGCCCCAGTGGCTTAAGCGAGGGATTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 125024 CATTGAGCTGGGCCAGCCCCAGTGGCTTAAGCGAGGGATTTCAGGTG...

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1868    CTCTGCTACTCAATCAAG         GGGATGGGGACAGGAAGCTA
        >>>||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 125215 CAGCTCTGCTACTCAATCAAGGTG...CAGGGGATGGGGACAGGAAGCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1906 ACAGCCGAGGAGGAGGAGGCTCGGAGGATAGCAGAGATGGGCAAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128451 ACAGCCGAGGAGGAGGAGGCTCGGAGGATAGCAGAGATGGGCAAGCCAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 TCTTGGGGAGAACTGCCGGCTGGAGGTCATCATCGAGGAGTCATATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128501 TCTTGGGGAGAACTGCCGGCTGGAGGTCATCATCGAGGAGTCATATGATT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 TTAAG         AACACGGTGGATAAACTCATCAAGAAAACGAACTTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128551 TTAAGGTG...CAGAACACGGTGGATAAACTCATCAAGAAAACGAACTTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 GCCTTGGTAATTGGGACCCATTCATGGAGGGAGCAGTTTTTAGAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128879 GCCTTGGTAATTGGGACCCATTCATGGAGGGAGCAGTTTTTAGAGGCAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 TACGGTGAGCGCAG         GGGACGAGGAGGAGGAGGAGGACGGGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128929 TACGGTGAGCGCAGGTA...CAGGGGACGAGGAGGAGGAGGAGGACGGGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 CCCGGGAGGAGCGGCTGCCGTCGTGCTTTGACTACGTGATGCACTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133986 CCCGGGAGGAGCGGCTGCCGTCGTGCTTTGACTACGTGATGCACTTCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 ACGGTGTTCTGGAAGGTGCTCTTCGCCTGTGTGCCCCCCACCGAGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134036 ACGGTGTTCTGGAAGGTGCTCTTCGCCTGTGTGCCCCCCACCGAGTACTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2238 CCACGGCTGGGCCTGCTTTGGTGTCTCCATCCTGGTCATCGGCCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134086 CCACGGCTGGGCCTGCTTTGGTGTCTCCATCCTGGTCATCGGCCTGCTCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2288 CCGCCCTCATTGGGGACCTCGCCTCCCACTTCGGCTGCACCGTTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134136 CCGCCCTCATTGGGGACCTCGCCTCCCACTTCGGCTGCACCGTTGGCCTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2338 AAGGACTCTGTCAATGCTGTTGTCTTCGTTGCCCTGGGCACCTCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134186 AAGGACTCTGTCAATGCTGTTGTCTTCGTTGCCCTGGGCACCTCCATCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2388 TG         ACACGTTCGCCAGCAAGGTGGCGGCGCTGCAGGACCAGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134236 TGGTA...CAGACACGTTCGCCAGCAAGGTGGCGGCGCTGCAGGACCAGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2429 GCGCCGACGCGTCCATCGGCAACGTGACCGGCTCCAACGCGGTGAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135978 GCGCCGACGCGTCCATCGGCAACGTGACCGGCTCCAACGCGGTGAACGTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2479 TTCCTTGGCCTGGGCGTCGCCTGGTCTGTGGCCGCCGTGTACTGGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136028 TTCCTTGGCCTGGGCGTCGCCTGGTCTGTGGCCGCCGTGTACTGGGCGGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2529 GCAGGGCCGCCCCTTCGAGGTGCGCACTGGCACGCTGGCCTTCTCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136078 GCAGGGCCGCCCCTTCGAGGTGCGCACTGGCACGCTGGCCTTCTCCGTCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2579 CGCTCTTCACCGTCTTCGCCTTCGTGGGCATTGCCGTGCTGCTGTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136128 CGCTCTTCACCGTCTTCGCCTTCGTGGGCATTGCCGTGCTGCTGTACCGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2629 CGCCGGCCGCACATCGGCGGCGAGCTGGGCGGCCCGCGCGGACCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136178 CGCCGGCCGCACATCGGCGGCGAGCTGGGCGGCCCGCGCGGACCCAAGCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2679 CGCCACCACCGCGCTCTTCCTGGGCCTCTGGCTCCTGTACATCCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136228 CGCCACCACCGCGCTCTTCCTGGGCCTCTGGCTCCTGTACATCCTCTTCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .
   2729 CCAGCCTGGAGGCGTACTGCCACATCCGGGGCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136278 CCAGCCTGGAGGCGTACTGCCACATCCGGGGCTTC