seq1 = pF1KSDA1056.tfa, 2586 bp
seq2 = pF1KSDA1056/gi568815584r_23432568.tfa (gi568815584r:23432568_23635325), 202758 bp

>pF1KSDA1056 2586
>gi568815584r:23432568_23635325 (Chr14)

(complement)

1-2041  (100001-102041)   99% ->
2042-2552  (102242-102752)   100% <-
2553-2586  (104879-104914)   91%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCCTTAACTCAGCCTCTACCACTGGTACCACCCCCTCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCCTTAACTCAGCCTCTACCACTGGTACCACCCCCTCCCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACAATGCCCCGTCCCTGCCTTCGGACACCTTCTCCTCCAGCACCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCACAATGCCCCGTCCCTGCCTTCGGACACCTTCTCCTCCAGCACCCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGATCCTGTCACCAAAGATCCCCCTGCTGCCTCCTCCACCTCTGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGATCCTGTCACCAAAGATCCCCCTGCTGCCTCCTCCACCTCTGAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGAGGTCCTCAGAGCCAGGGGGACAGCTCCTGGAGTCGGGCTGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGAGGTCCTCAGAGCCAGGGGGACAGCTCCTGGAGTCGGGCTGTGGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCCCACCAAAGGAGATTGGGGAGCCCCAGGAAGGGCCTGACTGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCCCACCAAAGGAGATTGGGGAGCCCCAGGAAGGGCCTGACTGTGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTCCCACCAAATGACCCAGGGGTGGAAAAGGACAAGGAGCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCCCACCAAATGACCCAGGGGTGGAAAAGGACAAGGAGCAGGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAGAAGAAGGGCTCCCTCCCATGGACCTAAGCAACCACTTATTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAGAAGAAGGGCTCCCTCCCATGGACCTAAGCAACCACTTATTCTTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCTGGAGGTGAGGCCTACCTAGTGGCCAAGCTGTCCCTGCCAGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCTGGAGGTGAGGCCTACCTAGTGGCCAAGCTGTCCCTGCCAGGTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGAACTCCTGTTACCAAAGGGCTTCCCCTGGGGTGAGGCGGGCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGAACTCCTGTTACCAAAGGGCTTCCCCTGGGGTGAGGCGGGCATCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAGAGCCCAGTCTGCCCTTCCTTGCCTACCCACCCCCCTCACACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAGAGCCCAGTCTGCCCTTCCTTGCCTACCCACCCCCCTCACACCTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCCTTCACATCCAACATGGCTTTGACCCAATCCAAGGCTTTAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCCTTCACATCCAACATGGCTTTGACCCAATCCAAGGCTTTAGCTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGACCAAATTCTGTCCCATGATACCTCAGCACCATCTCCGGCTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGACCAAATTCTGTCCCATGATACCTCAGCACCATCTCCGGCTGCCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGAAAGGCATGGAGCTTTCTGGAGCTACCAGCTGGCTCCAAATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGAAAGGCATGGAGCTTTCTGGAGCTACCAGCTGGCTCCAAATCCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGAGATCCCAAAGATGGCCCCATGGGGAACAGCGGGGGCAACCACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGAGATCCCAAAGATGGCCCCATGGGGAACAGCGGGGGCAACCACGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGTCTTCTGGCTCTGCCTTCTGTGCCGCCTGGGTTTCAGCAAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGTCTTCTGGCTCTGCCTTCTGTGCCGCCTGGGTTTCAGCAAGCCCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTTTATGGATCACACACAGTCTCATGGGGTGAAGCTAACCCCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCTTTATGGATCACACACAGTCTCATGGGGTGAAGCTAACCCCTGCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATATCAGGGCCTGTCAGGTAGCCCAGCTGTACTCCAGGAGGGAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATATCAGGGCCTGTCAGGTAGCCCAGCTGTACTCCAGGAGGGAGATGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTGCAAGGCCCTCATAAGCTTTCTGGAGCCAAAACTCCCTGCTCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTGCAAGGCCCTCATAAGCTTTCTGGAGCCAAAACTCCCTGCTCGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCTTCTGACATACCCCTTGACAACAGCAGCACAGTGAACATGGAGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCTTCTGACATACCCCTTGACAACAGCAGCACAGTGAACATGGAGGCGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTGGCCCAGACAGAGGATGGCCCCCCTGAGGCAGAAGTCCAGGCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTGGCCCAGACAGAGGATGGCCCCCCTGAGGCAGAAGTCCAGGCCCTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCCTCCTGGATGAAGAAGTTATGGCCCTCAGCCCACCCTCTCCACCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCCTCCTGGATGAAGAAGTTATGGCCCTCAGCCCACCCTCTCCACCCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCACCTGGGACCCCAGCCCAACCCAAGCCAAAGAATCGCCAGTAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCACCTGGGACCCCAGCCCAACCCAAGCCAAAGAATCGCCAGTAGCAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGGCGAGGCAGGGCCAGATTGGTTCCCTGAGGGGCAAGAAGAGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AGGCGAGGCAGGGCCAGATTGGTTCCCTGAGGGGCAAGAAGAGGATGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGCTCTGCCCCCCACTCAACCAAAGCTCACCCACCTCCAAGGAGGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGCTCTGCCCCCCACTCAACCAAAGCTCACCCACCTCCAAGGAGGGGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTCTCCCTGCCCCAGTGGGCTCCCCCGAAGACCCCAGTGACCCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACTCTCCCTGCCCCAGTGGGCTCCCCCGAAGACCCCAGTGACCCACCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCCCTATCGCCTAGCTGATGACTACACCCCAGCCCCTGCAGCCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCCCTATCGCCTAGCTGATGACTACACCCCAGCCCCTGCAGCCTTCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCCTCAGCCTGTCCAGCCACATGTCCCTGCTCCACTCACGCAACTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCCTCAGCCTGTCCAGCCACATGTCCCTGCTCCACTCACGCAACTCCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAGACACTCAAGTGTCCCAAGTGCAACTGGCACTACAAGTACCAGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAGACACTCAAGTGTCCCAAGTGCAACTGGCACTACAAGTACCAGCAGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCTGGATGTGCACATGCAAGAGAAGCACCCTGAGAGCAACAGTCACTGCA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CCTGGATGTGCACATGCGAGAGAAGCACCCTGAGAGCAACAGTCACTGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCTACTGCAGTGCTGGGGGCGCCCACCCCCGCCTTGCTCGTGGAGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GCTACTGCAGTGCTGGGGGCGCCCACCCCCGCCTTGCTCGTGGAGAGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TACAACTGTGGCTACAAACCCTACCGCTGTGACGTCTGCAACTACTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 TACAACTGTGGCTACAAACCCTACCGCTGTGACGTCTGCAACTACTCTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 AACCACCAAAGGCAACCTCAGCATCCATATGCAGTCTGACAAGCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 AACCACCAAAGGCAACCTCAGCATCCATATGCAGTCTGACAAGCACCTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCAACCTACAGGGCTTCCAGGCGGGCCCTGGTGGGCAGGGAAGTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 101601 CCAACCTACAGGGCTTCCAGGCGGGCCCTGGTGGGCAGGGAAGTCCACCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAGGCATCACTCCCACCCTCCGCGGGAGACAAAGAGCCTAAGACCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAGGCATCACTCCCACCCTCCGCGGGAGACAAAGAGCCTAAGACCAAATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ATCCTGGCAGTGCAAGGTGTGCAGCTACGAGACAAACATCTCCCGTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 ATCCTGGCAGTGCAAGGTGTGCAGCTACGAGACAAACATCTCCCGTAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TGCGCATCCATATGACCTCTGAGAAGCACATGCAGAATGTCCTAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TGCGCATCCATATGACCTCTGAGAAGCACATGCAGAATGTCCTAATGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CACCAGGGGCTGCCGCTGGGCCTGCCACCTGGATTGATGGGGCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CACCAGGGGCTGCCGCTGGGCCTGCCACCTGGATTGATGGGGCCAGGCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TCCTCCCCCACCAGGGGCTACCCCCACTAGCCCCCCTGAACTCTTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TCCTCCCCCACCAGGGGCTACCCCCACTAGCCCCCCTGAACTCTTCCAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ACTTTGGGCCCCAGGCCCTAGGGCAGCCTCAGACTCCCTTGGCTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ACTTTGGGCCCCAGGCCCTAGGGCAGCCTCAGACTCCCTTGGCTGGCCCG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GGGCTGAGGCCAGACAAGCCCCTGGAAGCCCAGCTACTTCTCAATGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GGGCTGAGGCCAGACAAGCCCCTGGAAGCCCAGCTACTTCTCAATGGTTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CCACCACGTAGGAGCACCTGCCCGCAAGTTCCCCACATCCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102001 CCACCACGTAGGAGCACCTGCCCGCAAGTTCCCCACATCCGGTA...TAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 CCCCTGGAAGCCTATCCCCTGATGCCCACCTGCCTCCAAGTCAGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102242 CCCCTGGAAGCCTATCCCCTGATGCCCACCTGCCTCCAAGTCAGCTCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2092 GGTTCCTCATCTGACAGCCTGCCCACCTCACCACCCCCAGACGACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102292 GGTTCCTCATCTGACAGCCTGCCCACCTCACCACCCCCAGACGACAGCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2142 GTCCCTGAAGGTGTTCCGCTGCCTAGTGTGCCAGGCCTTCAGCACAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102342 GTCCCTGAAGGTGTTCCGCTGCCTAGTGTGCCAGGCCTTCAGCACAGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2192 GCCTGGAGCTGCTGCTCTACCACTGCAGCATAGGCCGGAGCCTCCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102392 GCCTGGAGCTGCTGCTCTACCACTGCAGCATAGGCCGGAGCCTCCCGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2242 GCTGAATGGAAGGAGGTGGCTGGTGACACCCACCGCTGCAAGCTTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102442 GCTGAATGGAAGGAGGTGGCTGGTGACACCCACCGCTGCAAGCTTTGCTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2292 CTATGGCACCCAGCTCAAGGCCAACTTCCAACTCCACCTCAAGACTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 CTATGGCACCCAGCTCAAGGCCAACTTCCAACTCCACCTCAAGACTGACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342 AACATGCTCAGAAGTACCAGCTGGCAGCCCACCTGCGGGAGGGGGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102542 AACATGCTCAGAAGTACCAGCTGGCAGCCCACCTGCGGGAGGGGGGTGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 GCCATGGGCACCCCTTCCCCAGCATCCCTGGGAGATGGGGCTCCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 GCCATGGGCACCCCTTCCCCAGCATCCCTGGGAGATGGGGCTCCTTATGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 GTCTGTCTCCCCACTACACCTGCGCTGCAACATCTGTGACTTTGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102642 GTCTGTCTCCCCACTACACCTGCGCTGCAACATCTGTGACTTTGAGTCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 ACAGCAAGGAGAAGATGCAGCTGCATGCCAGGGGTGCAGCCCACGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102692 ACAGCAAGGAGAAGATGCAGCTGCATGCCAGGGGTGCAGCCCACGAAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 AACAGCCAAAT           CTATAAAAGGACAGAAACTGGACTCTTA
        |||||||||||<<<...<<<--|||||||||||||| |||||||||||||
 102742 AACAGCCAAATCTA...GACTTCTATAAAAGGACAGGAACTGGACTCTTA

   2600     .
   2581 ATAAAA
        ||||||
 104909 ATAAAA