seq1 = pF1KSDA1051.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KSDA1051/gi568815591f_94564609.tfa (gi568815591f:94564609_94765590), 200982 bp

>pF1KSDA1051 1071
>gi568815591f:94564609_94765590 (Chr7)

1-1071  (100001-101071)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCAGATTCATCTTCCGGGCAGACACACCCTGTTCGTCCGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCAGATTCATCTTCCGGGCAGACACACCCTGTTCGTCCGAGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCGATTCTGGTGCTTCTGGCAACTTCATTGATCACGAATATGTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCGATTCTGGTGCTTCTGGCAACTTCATTGATCACGAATATGTTGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAATGGAATTCCTCTAAGAATCAAGGACTGGCCAATACTTGTGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAATGGAATTCCTCTAAGAATCAAGGACTGGCCAATACTTGTGGAAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTGATGGGCGCCCCATAGCATCGGGCCCAGTTGTCCACGAAACTCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTGATGGGCGCCCCATAGCATCGGGCCCAGTTGTCCACGAAACTCACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGATAGTTGACCTGGGAGATCACCGAGAGGTGCTGTCATTTGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGATAGTTGACCTGGGAGATCACCGAGAGGTGCTGTCATTTGATGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCAGTCTCCATTCTTCCCTGTCGTCCTAGGGGTTCGCTGGCTGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCAGTCTCCATTCTTCCCTGTCGTCCTAGGGGTTCGCTGGCTGAGCACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATGATCCCAATATCACATGGAGCACTCGATCTATCGTCTTTGATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATGATCCCAATATCACATGGAGCACTCGATCTATCGTCTTTGATTCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATACTGCCGCTACCACTGCCGGATGTATTCTCCAATACCACCATCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATACTGCCGCTACCACTGCCGGATGTATTCTCCAATACCACCATCGCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CACCACCAGCACCACAACCGCCACTCTATTATCCAGTAGATGGATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CACCACCAGCACCACAACCGCCACTCTATTATCCAGTAGATGGATACAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTTTACCAACCAGTGAGGTATTACTATGTCCAGAATGTGTACACTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTTTACCAACCAGTGAGGTATTACTATGTCCAGAATGTGTACACTCCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGATGAGCACGTCTACCCAGATCACCGCCTGGTTGACCCTCACATAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGATGAGCACGTCTACCCAGATCACCGCCTGGTTGACCCTCACATAGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATACCTGGAGCACACAGTATTCCCAGTGGACATGTGTATTCACTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATACCTGGAGCACACAGTATTCCCAGTGGACATGTGTATTCACTGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAACCTGAAATGGCAGCTCTTCGAGATTTTGTGGCAAGAAATGTAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAACCTGAAATGGCAGCTCTTCGAGATTTTGTGGCAAGAAATGTAAAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGGCTAATTACTCCAACGATTGCACCTAATGGAGCCCAAGTTCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGGCTAATTACTCCAACGATTGCACCTAATGGAGCCCAAGTTCTCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAAGAGGGGGTGGAAACTGCAAGTTTCTTATGATTGCCGAGCTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAAGAGGGGGTGGAAACTGCAAGTTTCTTATGATTGCCGAGCTCCAAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATTTTACTATCCAGAATCAGTATCCTCGCCTATCTATTCCAAATTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATTTTACTATCCAGAATCAGTATCCTCGCCTATCTATTCCAAATTTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGACCAAGCACACCTGGCAACGTACACTGAATTCGTACCTCAAATACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGACCAAGCACACCTGGCAACGTACACTGAATTCGTACCTCAAATACCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GATACCAAACATACCCCACATATGCCGCGTACCCGACCTACCCAGTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GATACCAAACATACCCCACATATGCCGCGTACCCGACCTACCCAGTAGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCGCCTGGTACCCAGTGGGACGAGACGGACAAGGAAGATCACTATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCGCCTGGTACCCAGTGGGACGAGACGGACAAGGAAGATCACTATATGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACCTGTGATGATCACTTGGAATCCACACTGGTACCGCCAGCCTCCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACCTGTGATGATCACTTGGAATCCACACTGGTACCGCCAGCCTCCGGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CACAGTACCCGCCGCCACAGCCGCCGCCTCCACCACCACCACCGCCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CACAGTACCCGCCGCCACAGCCGCCGCCTCCACCACCACCACCGCCGCCG

   1050     .    :    .    :
   1051 CCTCCATCTTACAGTACCCTG
        |||||||||||||||||||||
 101051 CCTCCATCTTACAGTACCCTG