seq1 = pF1KSDA0997.tfa, 1932 bp
seq2 = pF1KSDA0997/gi568815584f_64421505.tfa (gi568815584f:64421505_64623402), 201898 bp

>pF1KSDA0997 1932
>gi568815584f:64421505_64623402 (Chr14)

1-1898  (100001-101898)   99% ->
1899-1932  (110357-110390)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAAGCCCAGCCACAGCAGCTATGTCCTTCAGCAGCTAAACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAAGCCCAGCCACAGCAGCTATGTCCTTCAGCAGCTAAACAACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGAGAATGGGGTTTTCTCTGTGACTGCTGTATTGCAATTGATGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGAGAATGGGGTTTTCTCTGTGACTGCTGTATTGCAATTGATGACATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTTCAAGCACACAAGGCAGTTCTAGCTGCCTGTAGCTCCTATTTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTTCAAGCACACAAGGCAGTTCTAGCTGCCTGTAGCTCCTATTTTAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGTTTTTCATGAACCATCAGCATAGTACTGCACAACTGAATCTCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGTTTTTCATGAACCATCAGCATAGTACTGCACAACTGAATCTCAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGAAAATTAGTGCAGAATGTTTTGATCTCATTTTGCAGTTTATGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGAAAATTAGTGCAGAATGTTTTGATCTCATTTTGCAGTTTATGTATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGGAAAAATTATGACAGCTCCCTCCAGTTTTGAGCAGTTTAAAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGGAAAAATTATGACAGCTCCCTCCAGTTTTGAGCAGTTTAAAGTGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGAACTACCTACAGCTATACAATGTTCCTGACTGTTTAGAAGACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGAACTACCTACAGCTATACAATGTTCCTGACTGTTTAGAAGACATCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATGCAGATTGTTCTAGTTCAAAATGTTCCTCTTCTGCTTCCAGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATGCAGATTGTTCTAGTTCAAAATGTTCCTCTTCTGCTTCCAGCAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAACAGCAAAATGATATTTGGGGTAAGAATGTATGAAGATACTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAACAGCAAAATGATATTTGGGGTAAGAATGTATGAAGATACTGTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGAAATGGCAATGAAGCCAACAGGTGGTGTGCAGAGCCAAGTTCAACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGAAATGGCAATGAAGCCAACAGGTGGTGTGCAGAGCCAAGTTCAACGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAATACACCACATAATAGAGAGGCTGATGAAGAGTCTTTACAATTAGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAATACACCACATAATAGAGAGGCTGATGAAGAGTCTTTACAATTAGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTTTCCTGAGCCACTATTTGATGTATGTAAAAAAAGTTCCGTGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTTTCCTGAGCCACTATTTGATGTATGTAAAAAAAGTTCCGTGTCCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTATCTAATCCAAAAGAACGTGTGTCAAGACGCTTTGGGCGGAGTTTTAC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTATCTACTCCAAAAGAACGTGTGTCAAGACGCTTTGGGCGGAGTTTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGTGATAGCTGTGGATTTGGCTTTAGCTGTGAAAAATTATTAGATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGTGATAGCTGTGGATTTGGCTTTAGCTGTGAAAAATTATTAGATGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGTGCTAACCTGTACTAACAGACATTTATACCAAAACACAAGATCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGTGCTAACCTGTACTAACAGACATTTATACCAAAACACAAGATCTTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CATAGAATAGTAGATATTAGAGATGGAAAAGACAGTAACATCAAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CATAGAATAGTAGATATTAGAGATGGAAAAGACAGTAACATCAAAGCTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATTTGGTGAAAAAGATTCTTCCAAAACATTTTCTGCACAGACGGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATTTGGTGAAAAAGATTCTTCCAAAACATTTTCTGCACAGACGGACAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAGAGGAGACACAAGCCAGGCTGCTGATGATTCAGCTTCAACCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACAGAGGAGACACAAGCCAGGCTGCTGATGATTCAGCTTCAACCACTGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCAGAAAAAGTAGCACAGTGGAGTCTGAAATAGCAAGCGAAGAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCAGAAAAAGTAGCACAGTGGAGTCTGAAATAGCAAGCGAAGAGAAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAGAGCTGCTGAGAGGAAAAGGATTATTATTAAGATGGAGCCAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAGAGCTGCTGAGAGGAAAAGGATTATTATTAAGATGGAGCCAGAAGATA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTCCTACAGATGAACTGAAAGACTTTAACATTATTAAAGTTACTGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTCCTACAGATGAACTGAAAGACTTTAACATTATTAAAGTTACTGATAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GACTGTAATGAATCCACTGACAATGATGAATTAGAAGATGAACCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GACTGTAATGAATCCACTGACAATGATGAATTAGAAGATGAACCTGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCCATTTTATAGATACTATGTTGAAGAAGATGTCAGCATAAAAAAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCCATTTTATAGATACTATGTTGAAGAAGATGTCAGCATAAAAAAAAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTAGGAAAACTCTAAAACCTCGAATGTCAGTAAGTGCTGATGAAAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTAGGAAAACTCTAAAACCTCGAATGTCAGTAAGTGCTGATGAAAGAGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGTTTAGAGAATATGAGGCCCCCTAACAACAGCAGTCCAGTACAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGTTTAGAGAATATGAGGCCCCCTAACAACAGCAGTCCAGTACAAGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGCTGAAAATGCATCTTGTGAGCTGTGTGGACTTACAATAACCGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGCTGAAAATGCATCTTGTGAGCTGTGTGGACTTACAATAACCGAGGAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCTGTCATCTCATTACTTAGCCAAACACATTGAAAATATCTGTGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACCTGTCATCTCATTACTTAGCCAAACACATTGAAAATATCTGTGCATGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGTAAATGTGGACAAATACTTGTAAAGGGTAGGCAGCTTCAGGAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGTAAATGTGGACAAATACTTGTAAAGGGTAGGCAGCTTCAGGAACATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCAACGATGTGGCGAGCCCCAAGATCTGACCATGAATGGGTTAGGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TCAACGATGTGGCGAGCCCCAAGATCTGACCATGAATGGGTTAGGAAATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CTGAGGAGAAAATGGACTTGGAAGAGAATCCTGATGAGCAGTCCGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CTGAGGAGAAAATGGACTTGGAAGAGAATCCTGATGAGCAGTCCGAAATA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGAGATATGTTTGTTGAAATGCTGGATGATTTTAGGGACAATCATTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGAGATATGTTTGTTGAAATGCTGGATGATTTTAGGGACAATCATTACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GATAAACAGTATCCAAAAAAAGCAGTTATTTAAACATTCTGCCTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GATAAACAGTATCCAAAAAAAGCAGTTATTTAAACATTCTGCCTGCCCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TTCGATGTCCTAATTGTGGCCAGCGTTTTGAAACTGAAAATCTAGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TTCGATGTCCTAATTGTGGCCAGCGTTTTGAAACTGAAAATCTAGTGGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 GAACATATGTCTAGCTGCTTAGATCAAGATATGTTTAAGAGTGCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 GAACATATGTCTAGCTGCTTAGATCAAGATATGTTTAAGAGTGCCATCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GGAAGAAAATGAAAGAGATCACAGACGAAAGCATTTTTGTAATCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GGAAGAAAATGAAAGAGATCACAGACGAAAGCATTTTTGTAATCTGTGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GAAAAGGATTTTATCAGCGGTGTCACTTAAGAGAACACTATACTGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GAAAAGGATTTTATCAGCGGTGTCACTTAAGAGAACACTATACTGTTCAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACTAAGGAAAAACAGTTTGTTTGTCAAACATGTGGAAAGCAGTTTTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACTAAGGAAAAACAGTTTGTTTGTCAAACATGTGGAAAGCAGTTTTTAAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGAGCGTCAGTTGCGACTGCACAATGATATGCACAAAGGCATGGCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101851 AGAGCGTCAGTTGCGACTGCACAATGATATGCACAAAGGCATGGCCAGGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :
   1899        TGGTGAAATAGGGCCTTCTAAACCTGTGGAGAAG
        >...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 A...CAGTGGTGAAATAGGGCCTTCTAAACCTGTGGAGAAG