seq1 = pF1KSDA0961.tfa, 1557 bp
seq2 = pF1KSDA0961/gi568815579r_37534984.tfa (gi568815579r:37534984_37744736), 209753 bp

>pF1KSDA0961 1557
>gi568815579r:37534984_37744736 (Chr19)

(complement)

10-136  (100001-100127)   100% ->
137-235  (101374-101472)   100% ->
236-1557  (108432-109753)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     10 GATTTGGTGATGTTCAGAGATGTGGCTGTAGACTTTTCTCAGGAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 GATTTGGTGATGTTCAGAGATGTGGCTGTAGACTTTTCTCAGGAAGAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     60 GGAATGCCTGAACTCATATCAGAGGAATTTGTACAGAGATGTGATATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAATGCCTGAACTCATATCAGAGGAATTTGTACAGAGATGTGATATTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    110 AGAACTATAGCAACTTGGTGTCACTGG         CAGGATGTTCTATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 AGAACTATAGCAACTTGGTGTCACTGGGTA...AAGCAGGATGTTCTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTAAGCCAGATGTGATCACCCTATTGGAACAAGGGAAAGAGCCCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101388 TCTAAGCCAGATGTGATCACCCTATTGGAACAAGGGAAAGAGCCCTGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTTGTGAGGGATGAGAAAAGAAGATGGACTCTAG         ATTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101438 GGTTGTGAGGGATGAGAAAAGAAGATGGACTCTAGGTA...CAGATTTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATCCAGATATGACACTAAAAAGTTATTTCAAGGAAAGGATATTTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108438 AATCCAGATATGACACTAAAAAGTTATTTCAAGGAAAGGATATTTATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGAACTTATCTCAGTGGAAGGTAATGGAAAGAATTAAAAGCTGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108488 ATGAACTTATCTCAGTGGAAGGTAATGGAAAGAATTAAAAGCTGTGGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAAGAACAAGAAAGTCCTCATGAGGTGTGTTTCAGGCAAGTGACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108538 TGAAGAACAAGAAAGTCCTCATGAGGTGTGTTTCAGGCAAGTGACAAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCACCTCTGAAAAAATGCCTACTTACAGAAAACTCACATCTCTTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108588 CCACCTCTGAAAAAATGCCTACTTACAGAAAACTCACATCTCTTCCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TATCAGAAAAGTCATAACAGAGAGAAACCCTACGAATGTGGGGAATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108638 TATCAGAAAAGTCATAACAGAGAGAAACCCTACGAATGTGGGGAATGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAAGGCTTTTAGAGTACGACAACAACTTACTTTCCATCAAAGAATTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108688 GAAGGCTTTTAGAGTACGACAACAACTTACTTTCCATCAAAGAATTCATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108738 CTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTGGAAAAGCCTTTAGACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TGTGCCCACCTCAGTCGACATCAGAGAATTCATACTTCTGACAAACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108788 TGTGCCCACCTCAGTCGACATCAGAGAATTCATACTTCTGACAAACTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAATGTAAAAAATGTGGAAAGATCTTCACATGTGGCTCAGACCTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108838 TGAATGTAAAAAATGTGGAAAGATCTTCACATGTGGCTCAGACCTTCGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TACATCAGAGAATTCATATTGGTGAGAAGCCGTATGAATGTAAAGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108888 TACATCAGAGAATTCATATTGGTGAGAAGCCGTATGAATGTAAAGAATGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGGAAAGCCTTTAGAGTTAGAGGACAACTTAATCTCCATCAAAGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108938 GGGAAAGCCTTTAGAGTTAGAGGACAACTTAATCTCCATCAAAGGATTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CACGGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108988 CACGGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAGGCCTTTAGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGTATGCACACCTTACTCGACATCAGAGACTGAACATTGCTGAGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109038 AGTATGCACACCTTACTCGACATCAGAGACTGAACATTGCTGAGAAGTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TATGAGTGTAAGGAATGTGGTCAGGCCTTTCTGTGTAGTACAGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109088 TATGAGTGTAAGGAATGTGGTCAGGCCTTTCTGTGTAGTACAGGCCTTCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ACTACATCACAAACTTCATACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109138 ACTACATCACAAACTTCATACTGGAGAAAAACCCTATGAATGTAAGGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTGGAAAGGCCTTTAGAGTGCGGCAGCAACTTACTCTCCATCAGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109188 GTGGAAAGGCCTTTAGAGTGCGGCAGCAACTTACTCTCCATCAGAGAATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACACTGGTGAGAAGCCTTATGATTGTAAGGAATGTGGGAAGACTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109238 CACACTGGTGAGAAGCCTTATGATTGTAAGGAATGTGGGAAGACTTTCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TCGTGGCTATCATCTAACTCTCCATCAGAGAATACATACTGGTGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109288 TCGTGGCTATCATCTAACTCTCCATCAGAGAATACATACTGGTGAAAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCTATGAATGTAAGGAATGTCAGAAGTTCTTTCGTCGTTACTCAGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109338 CCTATGAATGTAAGGAATGTCAGAAGTTCTTTCGTCGTTACTCAGAACTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATTTCACATCAGGGTATTCACATTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109388 ATTTCACATCAGGGTATTCACATTGGAGAGAAACCTTATGAATGTAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 ATGTGGGAAGGCATTTAGGCTGTTCTCACAGCTTACTCAACATCAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109438 ATGTGGGAAGGCATTTAGGCTGTTCTCACAGCTTACTCAACATCAGAGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TTCATTTTGGTGAGAAACCCTTTAAGTGTAAGGAATGTGAGAAGACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 TTCATTTTGGTGAGAAACCCTTTAAGTGTAAGGAATGTGAGAAGACTTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGACTGCTTTCACAACTTACCCAACATCAAAGTATTCATACTGGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 AGACTGCTTTCACAACTTACCCAACATCAAAGTATTCATACTGGTGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GCCCTATGACTGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTTAGACTTCATTCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109588 GCCCTATGACTGTAAGGAATGTGGAAAGGCCTTTAGACTTCATTCATCAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TGATTCAACATCAGAGAATTCATTCTGGTGAGAAACCATACAAATGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109638 TGATTCAACATCAGAGAATTCATTCTGGTGAGAAACCATACAAATGTAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GAATGTAAAAAGGCATTTAGACAACATTCACATCTTACTTACCATCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109688 GAATGTAAAAAGGCATTTAGACAACATTCACATCTTACTTACCATCAGCG

   1550     .    :    .
   1542 AATTCATAATGTAACT
        ||||||||||||||||
 109738 AATTCATAATGTAACT