seq1 = pF1KSDA0955.tfa, 1293 bp
seq2 = pF1KSDA0955/gi568815579r_48111713.tfa (gi568815579r:48111713_48334478), 222766 bp

>pF1KSDA0955 1293
>gi568815579r:48111713_48334478 (Chr19)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-227  (102669-102819)   100% ->
228-457  (103473-103702)   100% ->
458-717  (103782-104041)   100% ->
718-843  (112624-112749)   100% ->
844-985  (115467-115608)   100% ->
986-1030  (119095-119139)   100% ->
1031-1293  (122504-122766)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGACAGAGGCAGAGCCATTATTGTTCCGTGCTGTTCCTGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGACAGAGGCAGAGCCATTATTGTTCCGTGCTGTTCCTGAGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTATCTGGGGGGGACATTCCCAG         GAGACATTTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CAACTATCTGGGGGGGACATTCCCAGGTA...CAGGAGACATTTGCTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGAATCAAATAGTTTCCTCTTATGCTTCTAAAGTCTGTTTTGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102684 AAGAGAATCAAATAGTTTCCTCTTATGCTTCTAAAGTCTGTTTTGAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAAGATTATAAAAATCGTCAGTTTCTGGGGCCTGAAGGAAATGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102734 GAAGAAGATTATAAAAATCGTCAGTTTCTGGGGCCTGAAGGAAATGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTTGAGTTGATTGATAAGAGCACAAACAGATACAG         CGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102784 TGTTGAGTTGATTGATAAGAGCACAAACAGATACAGGTA...CAGCGTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTTCCCCACTGCTGGCTGGTATCTGTGGTCAGCCACAGGCCTCGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103478 GGTTCCCCACTGCTGGCTGGTATCTGTGGTCAGCCACAGGCCTCGGCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTAAGGGATGAGGTCACAGTGACGATTGCGTTTGGTTCCTGGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103528 CTGGTAAGGGATGAGGTCACAGTGACGATTGCGTTTGGTTCCTGGAGTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCACCTGGCCCTGGACCTGCAGCACCATGAACAGTGGCTGGTGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103578 GCACCTGGCCCTGGACCTGCAGCACCATGAACAGTGGCTGGTGGGCGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTGTTTGATGTCACTGCAGAGCCAGAGGAGGCTGTCGCCGAAATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103628 CCTTGTTTGATGTCACTGCAGAGCCAGAGGAGGCTGTCGCCGAAATCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCCCCCACTTCATCTCCCTCCAAG         GTGAGGTGGACGTCTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103678 CTCCCCCACTTCATCTCCCTCCAAGGTA...CAGGTGAGGTGGACGTCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGGTTTCTCGTTGCCCATTTTAAGAATGAAGGGATGGTCCTGGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103798 CTGGTTTCTCGTTGCCCATTTTAAGAATGAAGGGATGGTCCTGGAGCATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGCCCGGGTGGAGCCTTTCTATGCTGTCCTGGAAAGCCCCAGCTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103848 CAGCCCGGGTGGAGCCTTTCTATGCTGTCCTGGAAAGCCCCAGCTTCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGATGGGCATCCTGCTGCGGATCGCCAGTGGGACTCGCCTCTCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103898 CTGATGGGCATCCTGCTGCGGATCGCCAGTGGGACTCGCCTCTCCATCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATCACTTCCAACACATTGATCTATTATCACCCCCACCCCGAAGATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103948 CATCACTTCCAACACATTGATCTATTATCACCCCCACCCCGAAGATATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGTTCCACTTGTACCTTGTCCCCAGCGACGCCTTGCTAACAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103998 AGTTCCACTTGTACCTTGTCCCCAGCGACGCCTTGCTAACAAAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718    GCGATAGATGATGAGGAAGATCGCTTCCATGGTGTGCGCCTGCAGAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112621 TAGGCGATAGATGATGAGGAAGATCGCTTCCATGGTGTGCGCCTGCAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTCGCCCCCAATGGAACCCCTGAACTTTGGTTCCAGTTATATTGTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112671 TTCGCCCCCAATGGAACCCCTGAACTTTGGTTCCAGTTATATTGTGTCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ATTCTGCTAACCTGAAAGTAATGCCCAAG         GAGTTGAAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 112721 ATTCTGCTAACCTGAAAGTAATGCCCAAGGTT...TAGGAGTTGAAATTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TCCTACAGGAGCCCTGGAGAAATTCAGCACTTCTCAAAATTCTATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115479 TCCTACAGGAGCCCTGGAGAAATTCAGCACTTCTCAAAATTCTATGCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCAGATGAAGGAACCCATTCAACTTGAGATTACTGAAAAAAGACATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115529 GCAGATGAAGGAACCCATTCAACTTGAGATTACTGAAAAAAGACATGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTTTGGTGTGGGATACTGAGGTGAAGCCAG         TGGATCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115579 CTTTGGTGTGGGATACTGAGGTGAAGCCAGGTA...TAGTGGATCTCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTTGTAGCTGCATCAGCCCCTCCTCCTTTCTCAG         GTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119106 CTTGTAGCTGCATCAGCCCCTCCTCCTTTCTCAGGTA...CAGGTGCAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CTTTGTGAAGGAGAACCACCGGCAACTCCAAGCCAGGATGGGGGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122511 CTTTGTGAAGGAGAACCACCGGCAACTCCAAGCCAGGATGGGGGACCTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAGGGGTGCTCGATGATCTCCAGGACAATGAGGTTCTTACTGAGAATGAG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 122561 AAGGGGTGCTCGATGATCTCCAAGACAATGAGGTTCTTACTGAGAATGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AAGGAGCTGGTGGAGCAGGAAAAGACACGGCAGAGCAAGAATGAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122611 AAGGAGCTGGTGGAGCAGGAAAAGACACGGCAGAGCAAGAATGAGGCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GCTGAGCATGGTGGAGAAGAAAGGGGACCTGGCCCTGGACGTGCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122661 GCTGAGCATGGTGGAGAAGAAAGGGGACCTGGCCCTGGACGTGCTCTTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GAAGCATTAGTGAAAGGGACCCTTACCTCGTGTCCTATCTTAGACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122711 GAAGCATTAGTGAAAGGGACCCTTACCTCGTGTCCTATCTTAGACAGCAG

   1350     .
   1288 AATTTG
        ||||||
 122761 AATTTG