seq1 = pF1KSDA0941.tfa, 1536 bp
seq2 = pF1KSDA0941/gi568815588r_117909001.tfa (gi568815588r:117909001_118146163), 237163 bp

>pF1KSDA0941 1536
>gi568815588r:117909001_118146163 (Chr10)

(complement)

1-353  (100001-100353)   100% ->
354-796  (105599-106041)   100% ->
797-1265  (106724-107192)   100% ->
1266-1311  (131054-131099)   100% ->
1312-1536  (136939-137163)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCTGTCCGAGCAAGCCCAAAAGTGGTTTCCAACCCACGTGCAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCTGAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACAGTGCTCCAAGCCAAAGATCTGAAGCCAAAAGGCAAAAGTGGTACCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGACACATACACTATAATTCAGCTGGGCAAGGAAAAGTACTCCACCTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAGCTGAGAAAACCCTTGAGCCAGTTTGGAAGGAGGAGGCCTCTTTCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTACCTGGATTGCTAATTCAGGGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTACCTGGATTGCTAATTCAGGGAAGTCCAGAGAAATACATTCTTTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTATAGTTATGCACAGGTCCCTGGTGGGTCTGGATAAATTTTTAGGGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGCAATCAATCTCAATGACATCTTTGAGGACAAACAAAGAAGGAAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGA         GTGGTTTAGATTAGAATCCAAACAAGGAAAACGAATCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGAGTA...AAGGTGGTTTAGATTAGAATCCAAACAAGGAAAACGAATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105637 AAAACAGGGGTGAGATAAAGGTCAATATTCAGTTTATGAGGAACAATATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCGCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105687 ACCGCAAGTATGTTTGACTTATCAATGAAGGACAAAACCAGATCTCCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGGTAGAAAAAATGATGGAACATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105737 TGCAAAGTTAAAAGATAAGATGAAGGGTAGAAAAAATGATGGAACATTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105787 CTGATACGTCTTCTGCAATCATTCCAAGTACTCACATGCCCGATGCCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105837 AGTGAATTTTCAAGTGGTGAAATACAGATGAAATCCAAACCAAAAAAGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTCTCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105887 TTTTCTCTTGGGTCCTCAGCGACTCTCGTCAGCGCATTCAATGTCTGATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105937 TATCTGGGTCCCATATGTCTTCTGAGAAACTGAAGGCTGGCACCATAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105987 CAAACACATCTTCTCGGACACCAGTTAGATTCCTTTGGAACAGTTCCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AAGTG         GAAGTCTCAAATCTCCACACAGAAGAACATTAAGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106037 AAGTGGTA...TAGGAAGTCTCAAATCTCCACACAGAAGAACATTAAGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106760 TTGATACTTCTAAAATGAACCAACCTGACAGCATTGTGGATGAAGGTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTGTGTTTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106810 TTGTGTTTCGGAAGACAAAATGACCCATTTACAAATGTGACTGCTTCATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 ACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAAGAAAAATCCATTTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106860 ACCCCAAAAATTTGCAACACTGCCAAGGAAGAAAAATCCATTTGAAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106910 GCAGCGAAACATGGGACAGCAGCATGAATTTATTTTCAAAACCAATTGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ATAAGAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106960 ATAAGAAAAGAAAATAAAAGAGAGAAAAGGGAGAAAGTTAGCCTGTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGAAGATCTGATAAACTTAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107010 AAGAGTGACTGGAAAAAAAGATAGCAGAAGATCTGATAAACTTAACAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107060 GGGGATCTGATAGCCCTTGTGACTTGAAATCACCTAATGCATTTAGTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AATCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107110 AATCGCCAGGACTATTTTGATTATGAGTCAACCAATCCATTTACAGCAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCATCTTCAAG         TTTTCATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107160 ATTCAGGGCTTCAAATATAATGCCATCTTCAAGGTA...TAGTTTTCATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGAGTCCAACAAGCAATGAAGACCTCAGGAAAATCCCG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 131062 TGAGTCCAACAAGCAATGAAGACCTCAGGAAAATCCCGGTA...TAGGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGCAACCCCTTTGATGCCACTGCAGGGTATCGTAGTCTGACCTATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136942 AGCAACCCCTTTGATGCCACTGCAGGGTATCGTAGTCTGACCTATGAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GGTTCTACAGGAGCTGGTGAAACACAAAGAACTCCTTAGGAGGAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136992 GGTTCTACAGGAGCTGGTGAAACACAAAGAACTCCTTAGGAGGAAAGACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 CCCACATCCGGGAACTCGAGGACTACATCGACAACCTCCTTGTAAGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137042 CCCACATCCGGGAACTCGAGGACTACATCGACAACCTCCTTGTAAGGGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 ATGGAAGAAACGCCCAGTATTCTCAGAGTGCCATATGAACCATCCAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 137092 ATGGAAGAAACGCCCAGTATTCTCAGAGTGCCGTATGAACCATCCAGGAA

   1550     .    :    .    :
   1515 AGCTGGCAAATTCTCTAACAGT
        ||||||||||||||||||||||
 137142 AGCTGGCAAATTCTCTAACAGT