seq1 = pF1KSDA0940.tfa, 2052 bp
seq2 = pF1KSDA0940/gi568815588r_91952215.tfa (gi568815588r:91952215_92340271), 388057 bp

>pF1KSDA0940 2052
>gi568815588r:91952215_92340271 (Chr10)

(complement)

1-1005  (99922-100926)   100% ->
1006-1096  (147636-147726)   100% ->
1097-1153  (159253-159309)   100% ->
1154-1321  (195160-195327)   100% ->
1322-1411  (197154-197243)   100% ->
1412-1530  (229078-229196)   100% ->
1531-1645  (248328-248442)   100% ->
1646-1827  (258771-258952)   100% ->
1828-2052  (287833-288057)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGATGATTTACTGATGGACAAAAGCAAAACCCAGCCCCAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99922 ATGCAGGATGATTTACTGATGGACAAAAGCAAAACCCAGCCCCAGCCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCCCCAACCTGAGTCCAGCGTATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99972 GCAGCAGCAGCGGCAGCAGCAGCAGCCCCAACCTGAGTCCAGCGTATCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGCCCCGTCCACGCCCCTCTCCTCAGAGACCCCCAAGCCGGAGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 AAGCCCCGTCCACGCCCCTCTCCTCAGAGACCCCCAAGCCGGAGGAAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGCAGTGCCGGCCCTCAGCCCAGCCGCTGCCCCCCCGGCCCCCAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100072 AGCGCAGTGCCGGCCCTCAGCCCAGCCGCTGCCCCCCCGGCCCCCAACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGACAAGATGCAGATGGAATCACCGCTCCTGCCAGGCTTGAGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100122 CCCGGACAAGATGCAGATGGAATCACCGCTCCTGCCAGGCTTGAGTTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCAGCCTCCTCAGCAGCCGCCGCCGCCTCAGGAGCCCGCGGCACCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100172 ATCAGCCTCCTCAGCAGCCGCCGCCGCCTCAGGAGCCCGCGGCACCGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGTCGCTGTCGCCGTCCTTCGGCAGCACCTGGTCCACGGGCACCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100222 GCGTCGCTGTCGCCGTCCTTCGGCAGCACCTGGTCCACGGGCACCACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCGGTAGAGGACAGCTTCTTCCAGGGGATCACCCCAGTCAACGGGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100272 CGCGGTAGAGGACAGCTTCTTCCAGGGGATCACCCCAGTCAACGGGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTCTTCCAGAACTTCCCGCACCATGTCAACCCAGTCTTCGGAGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100322 TGCTCTTCCAGAACTTCCCGCACCATGTCAACCCAGTCTTCGGAGGCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCTCCCCGCAGATCGGCCTGGCGCAGACCCAGCACCACCAGCAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100372 TTCTCCCCGCAGATCGGCCTGGCGCAGACCCAGCACCACCAGCAGCCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCGCCTGCGCCCGCGCCGCAGCCGGCACAGCCAGCGCAGCCACCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100422 GCCGCCTGCGCCCGCGCCGCAGCCGGCACAGCCAGCGCAGCCACCACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGCAGCCCCCGCAGCAGCGCCGCTCACCCGCCAGCCCCAGCCAGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100472 CGCAGCCCCCGCAGCAGCGCCGCTCACCCGCCAGCCCCAGCCAGGCGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TACGCGCAGAGGAGCGCCGCCGCGGCGTACGGCCACCAGCCCATCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100522 TACGCGCAGAGGAGCGCCGCCGCGGCGTACGGCCACCAGCCCATCATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGCAAGCCGTCCTCGTCTTCGGCGGTTGCAGCCGCTGCTGCCGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100572 CAGCAAGCCGTCCTCGTCTTCGGCGGTTGCAGCCGCTGCTGCCGCAGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCGCCTCGTCGGCCTCGTCCAGCTGGAACACGCACCAAAGCGTGAATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100622 CCGCCTCGTCGGCCTCGTCCAGCTGGAACACGCACCAAAGCGTGAATGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTGGAGCGCACCGTCCAACCCCTGGGGCGGCCTGCAGGCGGGCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100672 GCCTGGAGCGCACCGTCCAACCCCTGGGGCGGCCTGCAGGCGGGCCGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCCTCGCCGGGCGGTCGGTGTGGGCGTGGGTGTGGGTGTCGGGGTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100722 CCCTCGCCGGGCGGTCGGTGTGGGCGTGGGTGTGGGTGTCGGGGTGCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCCGCTCAACCCCATCTCGCCGCTCAAAAAGCCCTTCTCCAGCAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100772 CCCCGCTCAACCCCATCTCGCCGCTCAAAAAGCCCTTCTCCAGCAACGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCGCGCCGCCCAAGTTCCCTCGCGCGGCCCCTCTCACTTCCAAGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100822 ATCGCGCCGCCCAAGTTCCCTCGCGCGGCCCCTCTCACTTCCAAGTCCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GATGGAGGATAACGCTTTCCGGACCGATAATGGTAACAATCTGTTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100872 GATGGAGGATAACGCTTTCCGGACCGATAATGGTAACAATCTGTTGCCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTCAG         GACCGGAGTAGGCCCTATGATACTTTTAACTTGCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100922 TTCAGGTA...TAGGACCGGAGTAGGCCCTATGATACTTTTAACTTGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 TCGTTGGAGAACTCCTTAATGGATATGATAAGGACTGATCATGAACCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147672 TCGTTGGAGAACTCCTTAATGGATATGATAAGGACTGATCATGAACCTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAAAG         GACGCATGGGGATAAATTTCCATCATCCAGGAACAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147722 GAAAGGTA...TAGGACGCATGGGGATAAATTTCCATCATCCAGGAACAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATAATATTATGGCACTTAACA         GTCGATCTTCTCTCTTTCCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 159289 ATAATATTATGGCACTTAACAGTA...CAGGTCGATCTTCTCTCTTTCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TTTGAAGATGCCTTCCTGGATGATAGCCATGGTGATCAAGCCTTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195180 TTTGAAGATGCCTTCCTGGATGATAGCCATGGTGATCAAGCCTTGTCATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGGCTTAAGTTCTCCCACTCGCTGTCAAAATGGGGAACGAGTAGAACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195230 TGGCTTAAGTTCTCCCACTCGCTGTCAAAATGGGGAACGAGTAGAACGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ACTCTAGAAAGGTGTTTGTTGGAGGACTTCCTCCTGATATTGATGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 195280 ACTCTAGAAAGGTGTTTGTTGGAGGACTTCCTCCTGATATTGATGAAGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1322        ATGAGATCACTGCCAGCTTTCGCAGGTTTGGACCTCTCGTAGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195330 A...TAGATGAGATCACTGCCAGCTTTCGCAGGTTTGGACCTCTCGTAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AGACTGGCCTCACAAAGCTGAAAGCAAGTCTTATTTTCCTCCTAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 197197 AGACTGGCCTCACAAAGCTGAAAGCAAGTCTTATTTTCCTCCTAAAGGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1412       GCTATGCCTTTCTGCTGTTCCAAGAGGAAAGCTCAGTACAAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197247 ...AAGGCTATGCCTTTCTGCTGTTCCAAGAGGAAAGCTCAGTACAAGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TTGATAGATGCCTGCCTAGAAGAAGATGGGAAACTCTACCTGTGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229122 TTGATAGATGCCTGCCTAGAAGAAGATGGGAAACTCTACCTGTGTGTGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AAGCCCCACCATCAAGGACAAGCCA         GTGCAAATTCGACCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 229172 AAGCCCCACCATCAAGGACAAGCCAGTA...CAGGTGCAAATTCGACCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GGAACCTAAGTGACAGTGACTTTGTAATGGATGGTTCTCAGCCTTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248344 GGAACCTAAGTGACAGTGACTTTGTAATGGATGGTTCTCAGCCTTTGGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CCCAGAAAAACTATCTTTGTTGGGGGAGTTCCACGACCCCTTCGAGCTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 248394 CCCAGAAAAACTATCTTTGTTGGGGGAGTTCCACGACCCCTTCGAGCTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1646         TTGAACTGGCAATGATCATGGACCGTTTGTACGGTGGTGTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 248444 TG...CAGTTGAACTGGCAATGATCATGGACCGTTTGTACGGTGGTGTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 GCTATGCTGGCATTGATACGGACCCAGAGCTGAAGTACCCCAAAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258813 GCTATGCTGGCATTGATACGGACCCAGAGCTGAAGTACCCCAAAGGTGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGCCGCGTGGCATTCTCCAATCAGCAGAGTTACATTGCAGCCATCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 258863 GGCCGCGTGGCATTCTCCAATCAGCAGAGTTACATTGCAGCCATCAGCGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TCGTTTTGTGCAGCTTCAGCACAATGACATTGACAAACGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 258913 TCGTTTTGTGCAGCTTCAGCACAATGACATTGACAAACGGGTA...CAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TTGAAGTAAAGCCATATGTGCTGGATGATCAGATGTGTGATGAGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287834 TTGAAGTAAAGCCATATGTGCTGGATGATCAGATGTGTGATGAGTGCCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GGCACACGCTGTGGTGGGAAGTTTGCCCCGTTCTTCTGTGCCAACGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287884 GGCACACGCTGTGGTGGGAAGTTTGCCCCGTTCTTCTGTGCCAACGTCAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CTGTCTGCAGTATTACTGTGAATACTGCTGGGCGAGCATACATTCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287934 CTGTCTGCAGTATTACTGTGAATACTGCTGGGCGAGCATACATTCCCGAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 CCGGGCGGGAGTTCCACAAACCGCTGGTGAAGGAGGGAGGCGACCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287984 CCGGGCGGGAGTTCCACAAACCGCTGGTGAAGGAGGGAGGCGACCGCCCT

   2100     .    :    .    :
   2029 CGTCACGTCCCGTTCCGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||
 288034 CGTCACGTCCCGTTCCGCTGGAGC