seq1 = pF1KSDA0932.tfa, 3045 bp
seq2 = pF1KSDA0932/gi568815588r_96268091.tfa (gi568815588r:96268091_96613627), 345537 bp

>pF1KSDA0932 3045
>gi568815588r:96268091_96613627 (Chr10)

(complement)

1-175  (99943-100117)   100% ->
176-286  (133169-133279)   100% ->
287-364  (167460-167537)   100% ->
365-520  (180666-180821)   100% ->
521-638  (184880-184997)   100% ->
639-817  (190901-191079)   100% ->
818-923  (192567-192672)   100% ->
924-1048  (200312-200436)   100% ->
1049-1164  (203154-203269)   100% ->
1165-1267  (208294-208396)   100% ->
1268-1384  (216326-216442)   100% ->
1385-1530  (217608-217753)   99% ->
1531-1726  (218246-218441)   100% ->
1727-1852  (226550-226675)   100% ->
1853-2013  (227413-227573)   100% ->
2014-2194  (228861-229041)   100% ->
2195-2320  (234536-234661)   100% ->
2321-2448  (236809-236936)   100% ->
2449-2662  (239819-240032)   99% ->
2663-2913  (243313-243563)   100% ->
2914-3045  (245406-245537)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCGGGCGACTGCACTTGGGGCCCTGGTGTCACTGCTGCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99943 ATGCCCCGGGCGACTGCACTTGGGGCCCTGGTGTCACTGCTGCTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCTGCCTCGCGGCGCCGGGGGACTCGGGGAGCGCCCGGACGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99993 GCCGCTGCCTCGCGGCGCCGGGGGACTCGGGGAGCGCCCGGACGCCACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGACTACTCAGAGCTGGACGGCGAGGAGGGCACGGAGCAGCAGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100043 CAGACTACTCAGAGCTGGACGGCGAGGAGGGCACGGAGCAGCAGCTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATTACCACGACCCTTGCAAAGCCG         CTGTCTTTTGGGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100093 CATTACCACGACCCTTGCAAAGCCGGTA...CAGCTGTCTTTTGGGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTGCCTTAGATGAAGATGACTTGAAGCTGTTTCACATTGACAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133185 CATTGCCTTAGATGAAGATGACTTGAAGCTGTTTCACATTGACAAAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGACTGGACCAAGCAGACAGTGGGGGCAACAGGACACAGCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 133235 GAGACTGGACCAAGCAGACAGTGGGGGCAACAGGACACAGCACAGGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GTGGGCTTGAAGAGCAGGCATCTGAGAGCAGCCCAGACACCACAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133285 .TAGGTGGGCTTGAAGAGCAGGCATCTGAGAGCAGCCCAGACACCACAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGGACACTGGCACCAAGGAAGCTGGAAAGG         ATGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 167506 CATGGACACTGGCACCAAGGAAGCTGGAAAGGGTA...CAGATGGCCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGAATACCACACTCCTGCACAGCCCTGGGACCTTGCATGCCGCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180675 AGAATACCACACTCCTGCACAGCCCTGGGACCTTGCATGCCGCAGCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCTTCTCTCCCCGGGTCCGAAGAGCCACAACCTCAAGGACAGAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180725 ACCTTCTCTCCCCGGGTCCGAAGAGCCACAACCTCAAGGACAGAGAGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATGGCCTGGAGGAGTCATCCCCTACGTCATTGGAGGGAACTTCACTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 180775 ATGGCCTGGAGGAGTCATCCCCTACGTCATTGGAGGGAACTTCACTGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    521       GGAGCCAGAGGGCCATTTTTAAGCAGGCCATGAGACACTGGGAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180825 ...CAGGGAGCCAGAGGGCCATTTTTAAGCAGGCCATGAGACACTGGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGCACACCTGTGTGACCTTCATAGAAAGGACGGATGAGGAAAGCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184924 AAGCACACCTGTGTGACCTTCATAGAAAGGACGGATGAGGAAAGCTTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGTATTCAGTTACAGAACCTGTGG         CTGTTGCTCCTATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 184974 TGTATTCAGTTACAGAACCTGTGGGTA...CAGCTGTTGCTCCTATGTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GGCGCCGAGGAGGAGGCCCACAGGCCATATCCATTGGGAAGAACTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190918 GGCGCCGAGGAGGAGGCCCACAGGCCATATCCATTGGGAAGAACTGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGTTTGGCATTGTGGCTCACGAGCTGGGCCATGTGGTTGGGTTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190968 AAGTTTGGCATTGTGGCTCACGAGCTGGGCCATGTGGTTGGGTTTTGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAACACACCCGGCCAGACAGAGACCAACATGTCACCATCATCAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191018 TGAACACACCCGGCCAGACAGAGACCAACATGTCACCATCATCAGGGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACATCCAGCCAG         GTCAGGAGTATAATTTCTTAAAAATGGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 191068 ACATCCAGCCAGGTA...CAGGTCAGGAGTATAATTTCTTAAAAATGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GCTGGGGAAGTGAGCTCTCTGGGAGAGACATACGACTTTGACAGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192596 GCTGGGGAAGTGAGCTCTCTGGGAGAGACATACGACTTTGACAGCATCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCACTACGCCCGGAACACCTTCTCAAG         AGGAGTTTTCTTAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 192646 GCACTACGCCCGGAACACCTTCTCAAGGTC...TAGAGGAGTTTTCTTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACACCATCCTTCCCCGTCAAGATGACAATGGCGTCAGGCCAACCATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200326 ACACCATCCTTCCCCGTCAAGATGACAATGGCGTCAGGCCAACCATTGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCGCGTGCGGCTCAGTCAGGGAGACATAGCTCAAGCCCGGAAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200376 CAGCGCGTGCGGCTCAGTCAGGGAGACATAGCTCAAGCCCGGAAGCTGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAATGCCCAG         CGTGTGGGGAGACCCTGCAGGACACAACGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 200426 CAAATGCCCAGGTA...CAGCGTGTGGGGAGACCCTGCAGGACACAACGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAAACTTTTCTGCACCTGGTTTCCCAAATGGGTACCCATCTTACTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203184 GAAACTTTTCTGCACCTGGTTTCCCAAATGGGTACCCATCTTACTCCCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGCGTCTGGAGGATCTCGGTCACCCCAGGGGAAAAG         ATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 203234 TGCGTCTGGAGGATCTCGGTCACCCCAGGGGAAAAGGTA...CAGATCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ATTAAACTTCACATCCATGGATTTGTTTAAAAGCCGACTGTGCTGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208299 ATTAAACTTCACATCCATGGATTTGTTTAAAAGCCGACTGTGCTGGTATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 ATTACGTGGAGGTCCGGGATGGTTACTGGAGAAAAGCCCCCCTTTTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 208349 ATTACGTGGAGGTCCGGGATGGTTACTGGAGAAAAGCCCCCCTTTTGGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1268        GCAGGTTTTGTGGCGATAAGATCCCGGAGCCCCTCGTCTCCAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208399 A...CAGGCAGGTTTTGTGGCGATAAGATCCCGGAGCCCCTCGTCTCCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGACAGCCGGCTCTGGGTGGAGTTCCGCAGCAGCAGCAACATCTTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216369 GGACAGCCGGCTCTGGGTGGAGTTCCGCAGCAGCAGCAACATCTTGGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGGGCTTCTTTGCAGCGTACGAAG         CTACCTGCGGGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 216419 AGGGCTTCTTTGCAGCGTACGAAGGTT...AAGCTACCTGCGGGGGAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ATGAACAAAGATGCCGGTCAGATTCAATCTCCCAACTATCCGGATGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217625 ATGAACAAAGATGCCGGTCAGATTCAATCTCCCAACTATCCGGATGACTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAGACCTTCCAAGGAATGTGTCTGGAGGATTATGGTTTCAGAGGGGTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 217675 CAGACCTTCCAAGGAATGTGTCTGGAGGATTACGGTTTCAGAGGGGTTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACGTGGGACTTACCTTCCAAGCTTTTGAG         ATTGAAAGGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 217725 ACGTGGGACTTACCTTCCAAGCTTTTGAGGTG...TAGATTGAAAGGCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GACAGCTGTGCATATGACTACCTGGAAGTCCGGGATGGCCCCACGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218258 GACAGCTGTGCATATGACTACCTGGAAGTCCGGGATGGCCCCACGGAAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GAGTGCCCTGATCGGCCACTTTTGTGGCTATGAGAAGCCGGAGGATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218308 GAGTGCCCTGATCGGCCACTTTTGTGGCTATGAGAAGCCGGAGGATGTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AATCGAGCTCCAACAGACTGTGGATGAAGTTTGTGTCCGATGGCTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218358 AATCGAGCTCCAACAGACTGTGGATGAAGTTTGTGTCCGATGGCTCTATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 AATAAAGCGGGCTTTGCAGCCAATTTTTTCAAGG         AGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 218408 AATAAAGCGGGCTTTGCAGCCAATTTTTTCAAGGGTA...CAGAGGTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TGAGTGTTCCTGGCCAGATCACGGCGGGTGCGAGCATCGCTGTGTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226557 TGAGTGTTCCTGGCCAGATCACGGCGGGTGCGAGCATCGCTGTGTGAACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CGCTGGGCAGCTACAAGTGTGCCTGTGACCCTGGCTACGAGCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226607 CGCTGGGCAGCTACAAGTGTGCCTGTGACCCTGGCTACGAGCTGGCCGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GATAAGAAGATGTGTGAAG         TGGCCTGTGGCGGTTTCATTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 226657 GATAAGAAGATGTGTGAAGGTT...CAGTGGCCTGTGGCGGTTTCATTAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CAAGCTGAATGGAACCATCACCAGCCCTGGGTGGCCGAAGGAGTATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227435 CAAGCTGAATGGAACCATCACCAGCCCTGGGTGGCCGAAGGAGTATCCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CAAACAAAAACTGTGTCTGGCAGGTGGTGGCCCCCGCTCAGTACCGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227485 CAAACAAAAACTGTGTCTGGCAGGTGGTGGCCCCCGCTCAGTACCGGATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TCCCTTCAGTTTGAAGTGTTTGAACTGGAAGGCAATGAC         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 227535 TCCCTTCAGTTTGAAGTGTTTGAACTGGAAGGCAATGACGTA...CAGGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CTGTAAGTACGACTTTGTAGAGGTGCGCAGCGGCCTGTCCCCCGACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228863 CTGTAAGTACGACTTTGTAGAGGTGCGCAGCGGCCTGTCCCCCGACGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 AGCTGCACGGCAGGTTCTGCGGCTCTGAGACGCCGGAGGTCATCACCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228913 AGCTGCACGGCAGGTTCTGCGGCTCTGAGACGCCGGAGGTCATCACCTCG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 CAGAGCAACAACATGCGCGTGGAGTTCAAGTCCGACAACACCGTCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228963 CAGAGCAACAACATGCGCGTGGAGTTCAAGTCCGACAACACCGTCTCCAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GCGCGGCTTCAGGGCCCACTTCTTCTCAG         ATAAGGACGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 229013 GCGCGGCTTCAGGGCCCACTTCTTCTCAGGTA...CAGATAAGGACGAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GTGCCAAGGACAACGGCGGGTGTCAGCATGAGTGCGTCAACACCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234548 GTGCCAAGGACAACGGCGGGTGTCAGCATGAGTGCGTCAACACCTTCGGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AGCTACCTGTGCAGGTGCAGAAACGGCTACTGGCTCCACGAGAATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234598 AGCTACCTGTGCAGGTGCAGAAACGGCTACTGGCTCCACGAGAATGGGCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TGACTGCAAAGAGG         CTGGCTGTGCACACAAGATCAGCAGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 234648 TGACTGCAAAGAGGGTG...CAGCTGGCTGTGCACACAAGATCAGCAGTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TGGAGGGGACCCTGGCGAGCCCCAACTGGCCTGACAAATACCCCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236836 TGGAGGGGACCCTGGCGAGCCCCAACTGGCCTGACAAATACCCCAGCCGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 AGGGAGTGTACCTGGAACATCTCTTCGACTGCAGGCCACAGAGTGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236886 AGGGAGTGTACCTGGAACATCTCTTCGACTGCAGGCCACAGAGTGAAACT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 C         ACCTTTAATGAGTTTGAGATCGAGCAGCACCAGGAATGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236936 CGTG...CAGACCTTTAATGAGTTTGAGATCGAGCAGCACCAGGAATGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 CCTATGACCACCTGGAAATGTATGACGGGCCGGACAGCCTGGCTCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 239859 CCTATGACCACCTGGAAATGTATGACGGGCCGGACAGCCTGGCCCCCATT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 CTGGGCCGTTTCTGCGGCAGCAAGAAACCAGACCCCACGGTGGCTTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239909 CTGGGCCGTTTCTGCGGCAGCAAGAAACCAGACCCCACGGTGGCTTCCGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CAGCAGTATGTTTCTCAGGTTTTATTCGGATGCCTCAGTGCAGAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239959 CAGCAGTATGTTTCTCAGGTTTTATTCGGATGCCTCAGTGCAGAGGAAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 GCTTCCAGGCAGTGCACAGCACAG         AGTGCGGGGGCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 240009 GCTTCCAGGCAGTGCACAGCACAGGTA...CAGAGTGCGGGGGCAGGCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 AAGGCTGAAGTGCAGACCAAAGAGCTCTATTCCCACGCCCAGTTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243330 AAGGCTGAAGTGCAGACCAAAGAGCTCTATTCCCACGCCCAGTTTGGGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CAACAACTACCCGAGCGAGGCCCGCTGTGACTGGGTGATCGTGGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243380 CAACAACTACCCGAGCGAGGCCCGCTGTGACTGGGTGATCGTGGCAGAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 ACGGCTACGGCGTGGAGCTGACATTCCGGACCTTTGAGGTTGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243430 ACGGCTACGGCGTGGAGCTGACATTCCGGACCTTTGAGGTTGAGGAGGAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GCCGACTGCGGCTACGACTACATGGAAGCCTACGACGGCTACGACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 243480 GCCGACTGCGGCTACGACTACATGGAAGCCTACGACGGCTACGACAGCTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 AGCGCCCAGGCTCGGCCGCTTCTGTGGCTCTGGG         CCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 243530 AGCGCCCAGGCTCGGCCGCTTCTGTGGCTCTGGGGTA...CAGCCATTAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 AAGAAATCTACTCTGCAGGTGATTCCCTGATGATTCGATTCCGCACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245413 AAGAAATCTACTCTGCAGGTGATTCCCTGATGATTCGATTCCGCACAGAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 GACACCATCAACAAAAAAGGCTTTCATGCCCGATACACCAGCACCAAGTT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245463 GACACCATCAACAAGAAAGGCTTTCATGCCCGATACACCAGCACCAAGTT

   3200     .    :    .    :    .
   3021 CCAGGATGCCCTGCACATGAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||
 245513 CCAGGATGCCCTGCACATGAAGAAA