seq1 = pF1KSDA0927.tfa, 2847 bp
seq2 = pF1KSDA0927/gi568815576f_26069670.tfa (gi568815576f:26069670_26477776), 408107 bp

>pF1KSDA0927 2847
>gi568815576f:26069670_26477776 (Chr22)

1-94  (100001-100094)   100% ->
95-835  (222737-223477)   99% ->
836-969  (224623-224756)   100% ->
970-1162  (227219-227411)   100% ->
1163-1348  (229315-229500)   100% ->
1349-1514  (236310-236475)   99% ->
1515-1681  (241001-241167)   100% ->
1682-1876  (242099-242293)   100% ->
1877-2015  (244095-244233)   100% ->
2016-2212  (270767-270963)   100% ->
2213-2407  (278050-278244)   100% ->
2408-2602  (295703-295897)   100% ->
2603-2717  (305906-306020)   100% ->
2718-2820  (308004-308106)   100% ->
2821-2847  (310597-310623)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCGGCCCGGCCGCCCGCCGCGGGACTCCGCGGGATCTCGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCGGCCCGGCCGCCCGCCGCGGGACTCCGCGGGATCTCGCTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCGCTCTGCTCCTGGGGAGCCCGGCGGCAGCGCTGGAGCGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 CCTCGCTCTGCTCCTGGGGAGCCCGGCGGCAGCGCTGGAGCGAGGTA...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95    ATGCTCTTCCCGAGGGAGATGCTAGCCCTTTGGGTCCTTACCTCCTG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222734 AAGATGCTCTTCCCGAGGGAGATGCTAGCCCTTTGGGTCCTTACCTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCTCAGGAGCCCCGGAGAGAGGCAGTCCTGGCAAAGAGCACCCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222784 CCCTCAGGAGCCCCGGAGAGAGGCAGTCCTGGCAAAGAGCACCCTGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGAGTGGTAACAGCGCCCCCCAGTTCCTCACAGTCGGCGGAAGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222834 GAGAGTGGTAACAGCGCCCCCCAGTTCCTCACAGTCGGCGGAAGTGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGAGCTGGTGCTGGATGGGACCGCACCCTCTGCACATCACGACATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222884 GCGAGCTGGTGCTGGATGGGACCGCACCCTCTGCACATCACGACATCCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCCCTGTCACCGCTGCTTCCAGAGGAGGCCCGCCCCAAGCACGCCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222934 GCCCTGTCACCGCTGCTTCCAGAGGAGGCCCGCCCCAAGCACGCCTTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCCAAGAAGAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGGTGAACTCTGCCAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222984 CCCCAAGAAGAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGGTGAACTCTGCCAGGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCTGAGGCCCAAGGCCACCTCCGCAGCCACTGTCCAAAGGGCAGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223034 AGCTGAGGCCCAAGGCCACCTCCGCAGCCACTGTCCAAAGGGCAGGGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGCCAGCGTCCCAGGGCCTAGATCTCCTCTCCTCCTCCACGGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223084 CAGCCAGCGTCCCAGGGCCTAGATCTCCTCTCCTCCTCCACGGAGAAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGCCCACCGGGGGACCCGGACCCCATCGTGGCCTCCGAGGAGGCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223134 TGGCCCACCGGGGGACCCGGACCCCATCGTGGCCTCCGAGGAGGCATCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAGTGCCCCTTTGGCTGGATCGAAAGGAGAGTGCGGTCCCTACAACACCC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 223184 AAGTGCCCCTTTGGCTGGACCGAAAGGAGAGTGCGGTCCCTACAACACCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCACCCCTGCAAATCTCCCCCTTCACTTCGCAGCCCTATGTGGCCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223234 GCACCCCTGCAAATCTCCCCCTTCACTTCGCAGCCCTATGTGGCCCACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACTCCCCCAGAGGCCAGAACCCGGGGAGCCTGGGCCTGACATGGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223284 ACTCCCCCAGAGGCCAGAACCCGGGGAGCCTGGGCCTGACATGGCCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGGCCCCCCAGGAGGACACCAGCCCCATGGCCCTGATGGACAAAGGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223334 AGGCCCCCCAGGAGGACACCAGCCCCATGGCCCTGATGGACAAAGGTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AATGAGCTGACTGGGTCAGCCTCAGAGGAGAGCCAGGAGACCACTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223384 AATGAGCTGACTGGGTCAGCCTCAGAGGAGAGCCAGGAGACCACTACCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CACCATTATCACCACCACGGTCATCACCACCGAGCAAGCACCAG      
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||>>>...
 223434 CACCATTATCACCACCACGGTCATCACCACCGAGCAGGCACCAGGTA...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836    CTCTCTGCAGTGTGAGCTTCTCCAATCCTGAGGGGTACATTGACTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224620 CAGCTCTCTGCAGTGTGAGCTTCTCCAATCCTGAGGGGTACATTGACTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 AGCGACTACCCACTGCTGCCCCTCAACAACTTTCTGGAGTGCACATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224670 AGCGACTACCCACTGCTGCCCCTCAACAACTTTCTGGAGTGCACATACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CGTGACAGTCTACACTGGCTATGGGGTGGAGCTCCAG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 224720 CGTGACAGTCTACACTGGCTATGGGGTGGAGCTCCAGGTA...CAGGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGAGTGTGAACCTGTCCGATGGGGAACTGCTCTCCATCCGCGGGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227223 AGAGTGTGAACCTGTCCGATGGGGAACTGCTCTCCATCCGCGGGGTGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGCCCTACCCTGACCGTCCTGGCCAACCAGACACTCCTGGTGGAGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227273 GGCCCTACCCTGACCGTCCTGGCCAACCAGACACTCCTGGTGGAGGGGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGTAATCCGAAGCCCCACCAACACCATCTCCGTCTACTTCCGGACCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 227323 GGTAATCCGAAGCCCCACCAACACCATCTCCGTCTACTTCCGGACCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGGACGACGGCCTTGGGACCTTCCAGCTTCACTACCAGG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 227373 AGGACGACGGCCTTGGGACCTTCCAGCTTCACTACCAGGGTA...CAGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTCATGCTGAGCTGCAACTTTCCCCGCCGGCCTGACTCTGGGGATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229317 TTCATGCTGAGCTGCAACTTTCCCCGCCGGCCTGACTCTGGGGATGTCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGTGATGGACCTGCACTCAGGTGGGGTGGCCCACTTTCACTGCCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229367 GGTGATGGACCTGCACTCAGGTGGGGTGGCCCACTTTCACTGCCACCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GCTATGAGCTCCAGGGCGCTAAGATGCTGACATGCATCAATGCCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229417 GCTATGAGCTCCAGGGCGCTAAGATGCTGACATGCATCAATGCCTCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CCGCACTGGAGCAGCCAGGAGCCCATCTGCTCAG         CTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 229467 CCGCACTGGAGCAGCCAGGAGCCCATCTGCTCAGGTA...CAGCTCCTTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TGGAGGGGCAGTGCACAATGCCACCATCGGCCGCGTCCTCTCCCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236317 TGGAGGGGCAGTGCACAATGCCACCATCGGCCGCGTCCTCTCCCCAAGTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACCCTGAAAACACCAATGGGAGCCAATTCTGCATCTGGACGATTGAAGCT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236367 ACCCTGAAAACACAAATGGGAGCCAATTCTGCATCTGGACGATTGAAGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCAGAGGGCCAGAAGCTGCACCTGCACTTTGAGAGGCTGTTGCTGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236417 CCAGAGGGCCAGAAGCTGCACCTGCACTTTGAGAGGCTGTTGCTGCATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CAAGGACAG         GATGACGGTTCACAGCGGGCAGACCAACAAGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 236467 CAAGGACAGGTA...CAGGATGACGGTTCACAGCGGGCAGACCAACAAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CAGCTCTTCTCTACGACTCCCTTCAAACCGAGAGTGTCCCTTTTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241033 CAGCTCTTCTCTACGACTCCCTTCAAACCGAGAGTGTCCCTTTTGAGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTGCTGAGCGAAGGCAACACCATCCGCATCGAGTTCACGTCCGACCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241083 CTGCTGAGCGAAGGCAACACCATCCGCATCGAGTTCACGTCCGACCAGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CCGGGCGGCCTCCACCTTCAACATCCGATTTGAAG         CGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 241133 CCGGGCGGCCTCCACCTTCAACATCCGATTTGAAGGTG...CAGCGTTTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AGAAAGGCCACTGCTATGAGCCCTACATCCAGAATGGGAACTTCACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242105 AGAAAGGCCACTGCTATGAGCCCTACATCCAGAATGGGAACTTCACTACA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TCCGACCCGACCTATAACATTGGGACTATAGTGGAGTTCACCTGCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242155 TCCGACCCGACCTATAACATTGGGACTATAGTGGAGTTCACCTGCGACCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CGGCCACTCCCTGGAGCAGGGCCCGGCCATCATCGAATGCATCAATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242205 CGGCCACTCCCTGGAGCAGGGCCCGGCCATCATCGAATGCATCAATGTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 GGGACCCATACTGGAATGACACAGAGCCCCTGTGCAGAG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 242255 GGGACCCATACTGGAATGACACAGAGCCCCTGTGCAGAGGTG...CAGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 ATGTGTGGTGGGGAGCTCTCTGCTGTGGCTGGGGTGGTATTGTCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244097 ATGTGTGGTGGGGAGCTCTCTGCTGTGGCTGGGGTGGTATTGTCCCCAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 CTGGCCCGAGCCCTACGTGGAAGGTGAAGATTGTATCTGGAAGATCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244147 CTGGCCCGAGCCCTACGTGGAAGGTGAAGATTGTATCTGGAAGATCCACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 TGGGAGAAGAGAAACGGATCTTCTTAGATATCCAGTT         CCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 244197 TGGGAGAAGAGAAACGGATCTTCTTAGATATCCAGTTGTG...AAGCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 AATCTGAGCAACAGTGACATCTTGACCATCTACGATGGCGACGAGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 270771 AATCTGAGCAACAGTGACATCTTGACCATCTACGATGGCGACGAGGTCAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 GCCCCACATCTTGGGGCAGTACCTTGGGAACAGTGGCCCCCAGAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 270821 GCCCCACATCTTGGGGCAGTACCTTGGGAACAGTGGCCCCCAGAAACTGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 ACTCCTCCACGCCAGACTTAACCATCCAGTTCCATTCGGACCCTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 270871 ACTCCTCCACGCCAGACTTAACCATCCAGTTCCATTCGGACCCTGCTGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 CTCATCTTTGGAAAGGGCCAGGGATTTATCATGAACTACATAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 270921 CTCATCTTTGGAAAGGGCCAGGGATTTATCATGAACTACATAGGTA...A

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2213   AGGTATCAAGGAATGACTCCTGCTCGGATTTACCCGAGATCCAGAATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278048 AGAGGTATCAAGGAATGACTCCTGCTCGGATTTACCCGAGATCCAGAATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 GCTGGAAAACCACTTCTCACACGGAGTTGGTGCGGGGAGCCAGAATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278098 GCTGGAAAACCACTTCTCACACGGAGTTGGTGCGGGGAGCCAGAATCACC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 TACCAGTGTGACCCCGGCTATGACATCGTGGGGAGTGACACCCTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278148 TACCAGTGTGACCCCGGCTATGACATCGTGGGGAGTGACACCCTCACCTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2361 CCAGTGGGACCTCAGCTGGAGCAGCGACCCCCCATTTTGTGAGAAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 278198 CCAGTGGGACCTCAGCTGGAGCAGCGACCCCCCATTTTGTGAGAAAAGTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2408       CGGAGGAGTCCCTGGCATGTGACAACCCAGGGCTGCCTGAAAAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 278248 ...CAGCGGAGGAGTCCCTGGCATGTGACAACCCAGGGCTGCCTGAAAAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 GGATACCAAATCCTGTACAAGCGACTCTACCTGCCAGGAGAGTCCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295747 GGATACCAAATCCTGTACAAGCGACTCTACCTGCCAGGAGAGTCCCTCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 CTTCATGTGCTACGAAGGCTTTGAGCTCATGGGTGAAGTGACCATCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295797 CTTCATGTGCTACGAAGGCTTTGAGCTCATGGGTGAAGTGACCATCCGCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 GCATCCTGGGACAGCCATCCCACTGGAACGGGCCCCTGCCCGTGTGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295847 GCATCCTGGGACAGCCATCCCACTGGAACGGGCCCCTGCCCGTGTGTAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 G         TAGCAGAAGCGGCAGCAGAGACGTCGCTGGAAGGGGGGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 295897 GGTA...CAGTAGCAGAAGCGGCAGCAGAGACGTCGCTGGAAGGGGGGAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643 CATGGCCCTGGCTATCTTCATCCCGGTCCTCATCATCTCCTTACTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 305946 CATGGCCCTGGCTATCTTCATCCCGGTCCTCATCATCTCCTTACTGCTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2693 GAGGAGCCTACATTTACATCACAAG         ATGTCGCTACTATTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 305996 GAGGAGCCTACATTTACATCACAAGGTA...CAGATGTCGCTACTATTCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2734 AACCTCCGCCTGCCTCTGATGTACTCCCACCCCTACAGCCAGATCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 308020 AACCTCCGCCTGCCTCTGATGTACTCCCACCCCTACAGCCAGATCACCGT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2784 GGAAACCGAGTTTGACAACCCCATTTACGAGACAGGG         GAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 308070 GGAAACCGAGTTTGACAACCCCATTTACGAGACAGGGGTG...CAGGAAA

   2950     .    :    .    :
   2825 CCAGAGAGTATGAGGTTTCTATC
        |||||||||||||||||||||||
 310601 CCAGAGAGTATGAGGTTTCTATC