seq1 = pF1KSDA0924.tfa, 1818 bp
seq2 = pF1KSDA0924/gi568815581r_49198416.tfa (gi568815581r:49198416_49417725), 219310 bp

>pF1KSDA0924 1818
>gi568815581r:49198416_49417725 (Chr17)

(complement)

1-900  (100001-100900)   100% ->
901-1048  (104881-105028)   100% ->
1049-1164  (105684-105799)   100% ->
1165-1309  (106270-106414)   100% ->
1310-1818  (118802-119310)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCACACAGCCAGTTCTTGTCAGGAGCTGGTTGAAAACTGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCACACAGCCAGTTCTTGTCAGGAGCTGGTTGAAAACTGTGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCATGTAGCAGGAATGGCACAAGAAGATAGCCGTCGTGGTCAAGTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCATGTAGCAGGAATGGCACAAGAAGATAGCCGTCGTGGTCAAGTGCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCCTTTTATCATGGTGCCAACCAAGAACTTGACCTGTCCACCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCCTTTTATCATGGTGCCAACCAAGAACTTGACCTGTCCACCAAAGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACAAAAGGGAATCAGGAAGTCCTTATTCTGTGTTAGTGGACACCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACAAAAGGGAATCAGGAAGTCCTTATTCTGTGTTAGTGGACACCAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCAAACCGCATCTCCATGAAACAGAAGAACAGCCATATTTCAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGCAAACCGCATCTCCATGAAACAGAAGAACAGCCATATTTCAGGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAGAGCAGTGTCTGACGTGCATGCTGTTAAGGAAGACCGGGAGAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAGAGCAGTGTCTGACGTGCATGCTGTTAAGGAAGACCGGGAGAATTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGACACAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGTCTCTTACAAAAGGGAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGACACAGAGGAGGAAGAGGAAGAAGTCTCTTACAAAAGGGAGCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATAGTGGAGGTAAACCTTAATAATCAAACATTAAATGTATCTAAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATAGTGGAGGTAAACCTTAATAATCAAACATTAAATGTATCTAAAGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAAGGGTGTCTCTTCTCAGTCCAAAGAGACTCCTGTTCTTAAGACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAAGGGTGTCTCTTCTCAGTCCAAAGAGACTCCTGTTCTTAAGACAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGTGAGGAGGAAGAGGAAGAGAGTGAGGAAGAGGCCACAGATGACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGTGAGGAGGAAGAGGAAGAGAGTGAGGAAGAGGCCACAGATGACAGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGACTATGGAGAGAATGAAAAGCAGAAGAAAAAGGAGAAGATAGTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGACTATGGAGAGAATGAAAAGCAGAAGAAAAAGGAGAAGATAGTAGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGTCAGCGTTACACAAAGGAGAACCAGGAGAGCTGCCTCTGTTGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGTCAGCGTTACACAAAGGAGAACCAGGAGAGCTGCCTCTGTTGCCGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTACCACTTCCCCTACTCCCAGAACTACAAGAGGTCGTAGGAAGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTACCACTTCCCCTACTCCCAGAACTACAAGAGGTCGTAGGAAGAGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGCCACCTAAGCGTAAGAAGCGGGCCACAAAGGAGCCCAAAGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAGCCACCTAAGCGTAAGAAGCGGGCCACAAAGGAGCCCAAAGCACCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCAGAAAGCTAAGTGTGAAGAGAAAGAGACTCTGACCTGTGAGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCAGAAAGCTAAGTGTGAAGAGAAAGAGACTCTGACCTGTGAGAAGTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCAGGGTATTTAACACTCGCTGGTACCTGGAGAAGCACATGAACGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCAGGGTATTTAACACTCGCTGGTACCTGGAGAAGCACATGAACGTTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCATAGGCGCATGCAGATTTGTGATAAATGTGGCAAGAAGTTTGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCATAGGCGCATGCAGATTTGTGATAAATGTGGCAAGAAGTTTGTCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAAGTGAGCTGTCCCTTCACCAGCAAACAGACTGTGAAAAAAACATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAAGTGAGCTGTCCCTTCACCAGCAAACAGACTGTGAAAAAAACATTCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901          TGTGTTTCCTGTAACAAATCGTTCAAGAAACTCTGGTCCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTA...CAGTGTGTTTCCTGTAACAAATCGTTCAAGAAACTCTGGTCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCATGAACATATCAAGATCGTCCATGGATATGCAGAAAAGAAATTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104922 TCATGAACATATCAAGATCGTCCATGGATATGCAGAAAAGAAATTTTCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTGAAATTTGTGAGAAGAAATTCTATACCATGGCTCATGTGCGGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104972 GTGAAATTTGTGAGAAGAAATTCTATACCATGGCTCATGTGCGGAAACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 ATGGTTG         CACACACAAAAGACATGCCATTTACATGCGAAAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105022 ATGGTTGGTA...CAGCACACACAAAAGACATGCCATTTACATGCGAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTGTGGAAAATCATTCAAACGCAGTATGTCACTCAAGGTGCACTCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105718 CTGTGGAAAATCATTCAAACGCAGTATGTCACTCAAGGTGCACTCCTTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGCATTCTGGAGAGAAGCCCTTTAGATGCGAG         AACTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105768 AGCATTCTGGAGAGAAGCCCTTTAGATGCGAGGTA...CAGAACTGTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAAAGGTTTCAGTACAAGTACCAGCTACGCTCCCACATGAGCATTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106279 GAAAGGTTTCAGTACAAGTACCAGCTACGCTCCCACATGAGCATTCATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGGGCACAAACAGTTCATGTGCCAGTGGTGTGGCAAGGATTTCAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106329 TGGGCACAAACAGTTCATGTGCCAGTGGTGTGGCAAGGATTTCAACATGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 AGCAGTACTTCGACGAACACATGAAAACACACACTG         GAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106379 AGCAGTACTTCGACGAACACATGAAAACACACACTGGTA...CAGGAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AAACCCTTTATCTGTGAAATCTGTGGCAAAAGCTTCACCAGCCGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118807 AAACCCTTTATCTGTGAAATCTGTGGCAAAAGCTTCACCAGCCGCCCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CATGAAGAGACACCGCAGAACTCACACAGGCGAGAAGCCCTATCCATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118857 CATGAAGAGACACCGCAGAACTCACACAGGCGAGAAGCCCTATCCATGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 ATGTGTGTGGCCAGCGGTTCCGCTTCTCGAACATGCTTAAGGCCCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118907 ATGTGTGTGGCCAGCGGTTCCGCTTCTCGAACATGCTTAAGGCCCACAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GAGAAGTGCTTTCGGGTGACCAGCCCCGTGAATGTGCCACCTGCTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118957 GAGAAGTGCTTTCGGGTGACCAGCCCCGTGAATGTGCCACCTGCTGTCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 GATCCCACTTACAACTTCCCCAGCCACCCCAGTTCCTTCTGTGGTGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119007 GATCCCACTTACAACTTCCCCAGCCACCCCAGTTCCTTCTGTGGTGAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CAGCCACAACCCCAACCCCTCCAATCAATATGAATCCTGTAAGCACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119057 CAGCCACAACCCCAACCCCTCCAATCAATATGAATCCTGTAAGCACTCTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 CCCCCTCGGCCCATCCCCCACCCCTTCTCACACCTGCACATCCACCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119107 CCCCCTCGGCCCATCCCCCACCCCTTCTCACACCTGCACATCCACCCACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 CCCTCACCACCCACACCACCTTCCCATCCCTCCAGTCCCTCACCTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119157 CCCTCACCACCCACACCACCTTCCCATCCCTCCAGTCCCTCACCTCCCGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 CACCTCCAGCTCTCTTTAAGAGTGAGCCTTTAAATCATAGAGGCCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119207 CACCTCCAGCTCTCTTTAAGAGTGAGCCTTTAAATCATAGAGGCCAGAGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GAGGACAACTTTCTGCGGCACCTGGCAGAGAAGAACAGTTCAGCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119257 GAGGACAACTTTCTGCGGCACCTGGCAGAGAAGAACAGTTCAGCACAGCA

   1850 
   1815 TCAT
        ||||
 119307 TCAT