Result of SIM4 for
pF1KSDA0920
seq1 = pF1KSDA0920.tfa, 3309 bp
seq2 = pF1KSDA0920/gi568815589f_109680489.tfa (gi568815589f:109680489_110268494), 588006 bp
>pF1KSDA0920 3309
>gi568815589f:109680489_110268494 (Chr9)
1-45 (100001-100045) 100% ->
46-126 (187003-187083) 100% ->
127-257 (200063-200193) 100% ->
258-372 (243247-243361) 100% ->
373-394 (244573-244594) 100% ->
395-496 (251439-251540) 100% ->
497-582 (335466-335551) 100% ->
583-2995 (455639-458051) 100% ->
2996-3174 (475831-476009) 99% ->
3175-3213 (481606-481644) 100% ->
3214-3309 (487911-488006) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCAGAGGCGGAATTGCACAAGGAAAGGCTGCAAGCCATAGCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
100001 ATGGCAGAGGCGGAATTGCACAAGGAAAGGCTGCAAGCCATAGCAGTA..
50 . : . : . : . : . :
46 GAAAAAAGAAAGAGGCAGACTGAAATAGAAGGCAAGCGACAACAGC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 .AAGGAAAAAAGAAAGAGGCAGACTGAAATAGAAGGCAAGCGACAACAGC
100 . : . : . : . : . :
92 TTGACGAGCAGATACTTCTGCTGCAGCATTCCAAG TCCAAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
187049 TTGACGAGCAGATACTTCTGCTGCAGCATTCCAAGGTA...CAGTCCAAA
150 . : . : . : . : . :
133 GTGCTTCGGGAGAAATGGCTGCTGCAGGGCATACCCGCTGGAACTGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200069 GTGCTTCGGGAGAAATGGCTGCTGCAGGGCATACCCGCTGGAACTGCCGA
200 . : . : . : . : . :
183 AGAGGAGGAAGCCAGGAGGCGGCAGTCTGAAGAGGATGAGTTCAGAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
200119 AGAGGAGGAAGCCAGGAGGCGGCAGTCTGAAGAGGATGAGTTCAGAGTCA
250 . : . : . : . : . :
233 AGCAACTTGAAGATAACATTCAGAG GCTGGAGCAAGAAATA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
200169 AGCAACTTGAAGATAACATTCAGAGGTA...CAGGCTGGAGCAAGAAATA
300 . : . : . : . : . :
274 CAAACGCTAGAAAGTGAAGAGTCCCAGATATCTGCCAAAGAGCAAATCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
243263 CAAACGCTAGAAAGTGAAGAGTCCCAGATATCTGCCAAAGAGCAAATCAT
350 . : . : . : . : . :
324 CCTAGAGAAACTGAAGGAAACAGAAAAATCCTTCAAGGACTTTCAGAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
243313 CCTAGAGAAACTGAAGGAAACAGAAAAATCCTTCAAGGACTTTCAGAAGG
400 . : . : . : . : . :
373 GGTTTCTCCAGTACGGATGGAG ATGCAGTAAAT
>>...>>>||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
243363 TG...CAGGGTTTCTCCAGTACGGATGGAGGTA...CAGATGCAGTAAAT
450 . : . : . : . : . :
406 TACATTTCCTCCCAGCTTCCCGACCTGCCAATCCTCTGTTCACGAACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
251450 TACATTTCCTCCCAGCTTCCCGACCTGCCAATCCTCTGTTCACGAACAGC
500 . : . : . : . : . :
456 AGAACCATCACCTGGGCAGGACGGGACCAGCAGAGCGGCTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
251500 AGAACCATCACCTGGGCAGGACGGGACCAGCAGAGCGGCTGGTA...CAG
550 . : . : . : . : . :
497 GAGTCGGGTGGGAGAATGTGCTGCTAAAGGAAGGTGAGTCAGCCTCGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
335466 GAGTCGGGTGGGAGAATGTGCTGCTAAAGGAAGGTGAGTCAGCCTCGAAC
600 . : . : . : . : . :
547 GCCACAGAAACATCCGGCCCAGACATGACTATCAAG AAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
335516 GCCACAGAAACATCCGGCCCAGACATGACTATCAAGGTA...CAGAAGCC
650 . : . : . : . : . :
588 TCCCCAGCTTTCTGAGGATGATATCTGGCTAAAAAGCGAGGGAGACAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455644 TCCCCAGCTTTCTGAGGATGATATCTGGCTAAAAAGCGAGGGAGACAACT
700 . : . : . : . : . :
638 ATAGTGCCACCCTCCTGGAGCCTGCTGCCAGCTCTCTTTCCCCAGATCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455694 ATAGTGCCACCCTCCTGGAGCCTGCTGCCAGCTCTCTTTCCCCAGATCAC
750 . : . : . : . : . :
688 AAAAACATGGAAATTGAGGTGTCTGTTGCAGAATGTAAAAGTGTTCCTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455744 AAAAACATGGAAATTGAGGTGTCTGTTGCAGAATGTAAAAGTGTTCCTGG
800 . : . : . : . : . :
738 AATCACCTCTACCCCACATCCCATGGACCATCCCTCCGCTTTCTATTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455794 AATCACCTCTACCCCACATCCCATGGACCATCCCTCCGCTTTCTATTCAC
850 . : . : . : . : . :
788 CCCCGCATAATGGCCTCCTTACTGATCACCACGAATCCCTGGATAATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455844 CCCCGCATAATGGCCTCCTTACTGATCACCACGAATCCCTGGATAATGAT
900 . : . : . : . : . :
838 GTTGCCAGAGAGATCCGCTATCTAGATGAGGTGCTAGAGGCCAACTGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455894 GTTGCCAGAGAGATCCGCTATCTAGATGAGGTGCTAGAGGCCAACTGCTG
950 . : . : . : . : . :
888 TGATTCTGCTGTGGATGGAACGTACAATGGAACATCCTCCCCAGAGCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455944 TGATTCTGCTGTGGATGGAACGTACAATGGAACATCCTCCCCAGAGCCTG
1000 . : . : . : . : . :
938 GTGCAGTGGTTCTGGTGGGCGGCCTAAGCCCCCCTGTCCACGAGGCGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
455994 GTGCAGTGGTTCTGGTGGGCGGCCTAAGCCCCCCTGTCCACGAGGCGACC
1050 . : . : . : . : . :
988 CAGCCAGAACCCACTGAAAGAACAGCTAGCCGGCAGGCACCTCCTCACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456044 CAGCCAGAACCCACTGAAAGAACAGCTAGCCGGCAGGCACCTCCTCACAT
1100 . : . : . : . : . :
1038 CGAGCTCAGTAATAGCAGCCCTGACCCCATGGCAGAGGCAGAAAGAACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456094 CGAGCTCAGTAATAGCAGCCCTGACCCCATGGCAGAGGCAGAAAGAACAA
1150 . : . : . : . : . :
1088 ATGGCCATTCCCCCAGCCAGCCTAGAGATGCGCTGGGGGACAGCCTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456144 ATGGCCATTCCCCCAGCCAGCCTAGAGATGCGCTGGGGGACAGCCTGCAG
1200 . : . : . : . : . :
1138 GTGCCTGTCAGCCCCAGCTCCACAACCAGCTCACGGTGTTCTTCCCGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456194 GTGCCTGTCAGCCCCAGCTCCACAACCAGCTCACGGTGTTCTTCCCGAGA
1250 . : . : . : . : . :
1188 TGGAGAGTTCACTCTCACCACACTGAAAAAGGAGGCCAAGTTTGAGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456244 TGGAGAGTTCACTCTCACCACACTGAAAAAGGAGGCCAAGTTTGAGCTGC
1300 . : . : . : . : . :
1238 GTGCCTTCCATGAGGACAAGAAGCCCTCCAAGCTCTTTGAGGATGACGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456294 GTGCCTTCCATGAGGACAAGAAGCCCTCCAAGCTCTTTGAGGATGACGAG
1350 . : . : . : . : . :
1288 CATGAGAAAGAACAATACTGCATTAGAAAAGTGAGGCCTTCAGAGGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456344 CATGAGAAAGAACAATACTGCATTAGAAAAGTGAGGCCTTCAGAGGAGAT
1400 . : . : . : . : . :
1338 GCTGGAGCTGGAAAAGGAGAGGAGAGAGCTCATCCGCAGCCAGGCCGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456394 GCTGGAGCTGGAAAAGGAGAGGAGAGAGCTCATCCGCAGCCAGGCCGTCA
1450 . : . : . : . : . :
1388 AGAAGAATCCTGGCATTGCAGCAAAATGGTGGAATCCCCCGCAGGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456444 AGAAGAATCCTGGCATTGCAGCAAAATGGTGGAATCCCCCGCAGGAAAAA
1500 . : . : . : . : . :
1438 ACCATCGAGGAGCAGCTGGACGAGGAACATCTGGAGTCGCACAAAAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456494 ACCATCGAGGAGCAGCTGGACGAGGAACATCTGGAGTCGCACAAAAAGTA
1550 . : . : . : . : . :
1488 CAAGGAGCGCAAAGAGAGAAGGGCACAGCAGGAACAGTTGCTGCTGCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456544 CAAGGAGCGCAAAGAGAGAAGGGCACAGCAGGAACAGTTGCTGCTGCAGA
1600 . : . : . : . : . :
1538 AGCAGTTACAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCCCATCGCAGCTCTGCACAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456594 AGCAGTTACAGCAGCAGCAGCAGCAGCCCCCATCGCAGCTCTGCACAGCC
1650 . : . : . : . : . :
1588 CCTGCCTCTTCTCATGAACGCGCAAGCATGATTGACAAAGCAAAGGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456644 CCTGCCTCTTCTCATGAACGCGCAAGCATGATTGACAAAGCAAAGGAGGA
1700 . : . : . : . : . :
1638 CATTGTCACAGAGCAGATAGATTTCTCTGCTGCTCGCAAACAATTTCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456694 CATTGTCACAGAGCAGATAGATTTCTCTGCTGCTCGCAAACAATTTCAGC
1750 . : . : . : . : . :
1688 TGATGGAGAATTCCAGGCAAGCGGTGGCCAAGGGCCAGAGTACACCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456744 TGATGGAGAATTCCAGGCAAGCGGTGGCCAAGGGCCAGAGTACACCCAGG
1800 . : . : . : . : . :
1738 CTGTTCTCCATCAAGCCTTTCTACAGGCCTCTGGGGTCAGTCAACTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456794 CTGTTCTCCATCAAGCCTTTCTACAGGCCTCTGGGGTCAGTCAACTCAGA
1850 . : . : . : . : . :
1788 CAAGCCACTGACTAATCCGAGACCACCTTCTGTCGGGGGACCTCCAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456844 CAAGCCACTGACTAATCCGAGACCACCTTCTGTCGGGGGACCTCCAGAAG
1900 . : . : . : . : . :
1838 ACAGTGGTGCCTCAGCCGCCAAGGGACAGAAATCCCCCGGTGCCCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456894 ACAGTGGTGCCTCAGCCGCCAAGGGACAGAAATCCCCCGGTGCCCTGGAG
1950 . : . : . : . : . :
1888 ACCCCATCGGCAGCAGGAAGCCAGGGCAACACAGCCTCTCAGGGGAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456944 ACCCCATCGGCAGCAGGAAGCCAGGGCAACACAGCCTCTCAGGGGAAGGA
2000 . : . : . : . : . :
1938 AGGGCCCTACAGCGAGCCTTCTAAACGTGGGCCCTTATCTAAACTGTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456994 AGGGCCCTACAGCGAGCCTTCTAAACGTGGGCCCTTATCTAAACTGTGGG
2050 . : . : . : . : . :
1988 CTGAGGATGGAGAATTTACGAGCGCCCGGGCTGTCCTCACTGTGGTCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457044 CTGAGGATGGAGAATTTACGAGCGCCCGGGCTGTCCTCACTGTGGTCAAG
2100 . : . : . : . : . :
2038 GATGATGACCATGGGATTTTGGATCAGTTCTCAAGATCTGTCAATGTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457094 GATGATGACCATGGGATTTTGGATCAGTTCTCAAGATCTGTCAATGTCTC
2150 . : . : . : . : . :
2088 CTTGACCCAAGAGGAGCTTGACTCTGGTCTGGACGAATTGTCGGTGAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457144 CTTGACCCAAGAGGAGCTTGACTCTGGTCTGGACGAATTGTCGGTGAGGT
2200 . : . : . : . : . :
2138 CTCAGGATACCACAGTCCTGGAGACCCTATCCAATGATTTCAGCATGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457194 CTCAGGATACCACAGTCCTGGAGACCCTATCCAATGATTTCAGCATGGAC
2250 . : . : . : . : . :
2188 AACATCAGTGACAGCGGGGCATCCAATGAGACAACCAATGCCCTCCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457244 AACATCAGTGACAGCGGGGCATCCAATGAGACAACCAATGCCCTCCAGGA
2300 . : . : . : . : . :
2238 AAATTCACTGGCTGATTTTTCTCTGCCCCAGACACCACAAACTGACAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457294 AAATTCACTGGCTGATTTTTCTCTGCCCCAGACACCACAAACTGACAACC
2350 . : . : . : . : . :
2288 CCTCAGAGGGCCGAGGAGAAGGCGTCTCCAAGTCATTTAGTGATCATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457344 CCTCAGAGGGCCGAGGAGAAGGCGTCTCCAAGTCATTTAGTGATCATGGT
2400 . : . : . : . : . :
2338 TTCTATTCCCCTTCCTCCACGCTGGGGGACTCTCCGTTGGTTGATGACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457394 TTCTATTCCCCTTCCTCCACGCTGGGGGACTCTCCGTTGGTTGATGACCC
2450 . : . : . : . : . :
2388 CTTGGAGTATCAGGCTGGCCTCCTGGTGCAGAATGCCATTCAACAAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457444 CTTGGAGTATCAGGCTGGCCTCCTGGTGCAGAATGCCATTCAACAAGCCA
2500 . : . : . : . : . :
2438 TAGCCGAGCAGGTGGATAAAGCTGTGTCCAAAACCAGCAGGGATGGAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457494 TAGCCGAGCAGGTGGATAAAGCTGTGTCCAAAACCAGCAGGGATGGAGCA
2550 . : . : . : . : . :
2488 GAGCAACAGGGACCTGAAGCGACTGTAGAGGAAGCTGAAGCTGCGGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457544 GAGCAACAGGGACCTGAAGCGACTGTAGAGGAAGCTGAAGCTGCGGCTTT
2600 . : . : . : . : . :
2538 CGGCTCAGAAAAGCCTCAGAGCATGTTTGAGCCACCTCAGGTGTCTTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457594 CGGCTCAGAAAAGCCTCAGAGCATGTTTGAGCCACCTCAGGTGTCTTCTC
2650 . : . : . : . : . :
2588 CTGTTCAAGAGAAAAGGGATGTATTACCAAAGATTCTGCCTGCTGAAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457644 CTGTTCAAGAGAAAAGGGATGTATTACCAAAGATTCTGCCTGCTGAAGAC
2700 . : . : . : . : . :
2638 AGGGCGCTCAGGGAAAGGGGGCCCCCCCAGCCACTGCCAGCTGTGCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457694 AGGGCGCTCAGGGAAAGGGGGCCCCCCCAGCCACTGCCAGCTGTGCAGCC
2750 . : . : . : . : . :
2688 CAGTGGCCCGATTAACATGGAGGAGACCAGGCCCGAAGGAAGCTATTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457744 CAGTGGCCCGATTAACATGGAGGAGACCAGGCCCGAAGGAAGCTATTTCA
2800 . : . : . : . : . :
2738 GCAAGTACTCGGAGGCAGCTGAGCTGAGAAGCACAGCCTCCCTCCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457794 GCAAGTACTCGGAGGCAGCTGAGCTGAGAAGCACAGCCTCCCTCCTGGCC
2850 . : . : . : . : . :
2788 ACTCAAGAATCTGACGTGATGGTTGGGCCTTTCAAGCTGAGGTCCAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457844 ACTCAAGAATCTGACGTGATGGTTGGGCCTTTCAAGCTGAGGTCCAGGAA
2900 . : . : . : . : . :
2838 ACAGCGGACTTTGTCCATGATTGAGGAAGAGATCCGAGCAGCTCAGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457894 ACAGCGGACTTTGTCCATGATTGAGGAAGAGATCCGAGCAGCTCAGGAAA
2950 . : . : . : . : . :
2888 GGGAAGAGGAGCTGAAGAGGCAGAGACAAGTCTTGCAGAGTACGCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457944 GGGAAGAGGAGCTGAAGAGGCAGAGACAAGTCTTGCAGAGTACGCAGAGC
3000 . : . : . : . : . :
2938 CCCAGGACAAAGAATGCCCCATCACTGCCCTCCAGAACATGCTACAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
457994 CCCAGGACAAAGAATGCCCCATCACTGCCCTCCAGAACATGCTACAAAAC
3050 . : . : . : . : . :
2988 TGCTCCAG GGAAAATAGAGAAAGTCAAACCTCCTCCATCCC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
458044 TGCTCCAGGTA...CAGGGAAAATAGAGAAAGTCAAACCTCCTCCATCCC
3100 . : . : . : . : . :
3029 CCACCACTGAAGGCCCCAGCCTGCAGCCTGACTTAGCCCCTGAAGAGGCT
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
475864 CCACCACTGAAGGCCCCAGCTTGCAGCCTGACTTAGCCCCTGAAGAGGCT
3150 . : . : . : . : . :
3079 GCCGGAACCCAGCGGCCCAAGAATCTGATGCAGACCCTCATGGAAGACTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
475914 GCCGGAACCCAGCGGCCCAAGAATCTGATGCAGACCCTCATGGAAGACTA
3200 . : . : . : . : . :
3129 TGAGACACACAAATCTAAAAGGCGCGAGAGAATGGATGATAGTAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
475964 TGAGACACACAAATCTAAAAGGCGCGAGAGAATGGATGATAGTAGTGTA.
3250 . : . : . : . : . :
3175 TACACTTCTAAGTTACTGTCTTGCAAGGTGACTTCCGAG
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
476014 ..CAGTACACTTCTAAGTTACTGTCTTGCAAGGTGACTTCCGAGGTA...
3300 . : . : . : . : . :
3214 GTCCTCGAGGCCACACGGGTTAATCGAAGAAAGAGCGCACTGGCTTT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
487908 CAGGTCCTCGAGGCCACACGGGTTAATCGAAGAAAGAGCGCACTGGCTTT
3350 . : . : . : . : .
3261 GCGCTGGGAAGCAGGGATCTATGCCAACCAGGAGGAAGAAGACAACGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
487958 GCGCTGGGAAGCAGGGATCTATGCCAACCAGGAGGAAGAAGACAACGAA