Result of SIM4 for pF1KSDA0899

seq1 = pF1KSDA0899.tfa, 2817 bp
seq2 = pF1KSDA0899/gi568815587f_826022.tfa (gi568815587f:826022_1110622), 284601 bp

>pF1KSDA0899 2817
>gi568815587f:826022_1110622 (Chr11)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-136  (133416-133484)   100% ->
137-279  (144148-144290)   100% ->
280-473  (146041-146234)   100% ->
474-603  (151074-151203)   100% ->
604-705  (155177-155278)   100% ->
706-814  (158624-158732)   100% ->
815-962  (159414-159561)   99% ->
963-1137  (160764-160936)   98% ->
1138-1269  (162537-162668)   100% ->
1270-1452  (166482-166664)   100% ->
1453-1550  (167263-167360)   100% ->
1551-1782  (167733-167964)   100% ->
1783-1956  (168051-168224)   100% ->
1957-2123  (174411-174577)   100% ->
2124-2206  (177701-177783)   100% ->
2207-2298  (180507-180598)   98% ->
2299-2420  (181993-182114)   100% ->
2421-2537  (183079-183195)   100% ->
2538-2607  (183307-183376)   100% ->
2608-2742  (183662-183796)   100% ->
2743-2817  (184527-184601)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGGGACGGGATGCGGGGCCTGGCGGTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGCCGTGTCCAAGGGGGACGGGATGCGGGGCCTGGCGGTCTTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGGATATCCGCAACT         GTAAAAGTAAAGAAGCAGAAATAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGGATATCCGCAACTGTG...TAGGTAAAAGTAAAGAAGCAGAAATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAGGATAAACAAGGAACTGGCAAATATCAGATCAAAATTTAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 133440 AAAGGATAAACAAGGAACTGGCAAATATCAGATCAAAATTTAAAGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    137     GTGACAAGGCTCTTGATGGCTATAGTAAAAAAAAGTACGTCTGCAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133490 .TAGGTGACAAGGCTCTTGATGGCTATAGTAAAAAAAAGTACGTCTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTGCTCTTCATCTTTCTCCTTGGTCATGACATTGACTTTGGACACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144194 GTTGCTCTTCATCTTTCTCCTTGGTCATGACATTGACTTTGGACACATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGCTGTGAACCTGCTGAGTTCAAACAGATACACGGAAAAGCAGATC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 144244 AGGCTGTGAACCTGCTGAGTTCAAACAGATACACGGAAAAGCAGATCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280       GGCTACCTTTTCATCTCTGTGTTGGTGAACTCAAACAGTGAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144294 ...CAGGGCTACCTTTTCATCTCTGTGTTGGTGAACTCAAACAGTGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATCCGCCTGATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146085 GATCCGCCTGATCAACAACGCCATCAAGAATGACCTGGCCAGCCGCAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCACCTTCATGGGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAGCGTGGGCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146135 CCACCTTCATGGGCCTGGCCCTGCACTGCATCGCCAGCGTGGGCAGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGATGGCCGAGGCCTTCGCCGGGGAGATCCCTAAGGTCCTCGTAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146185 GAGATGGCCGAGGCCTTCGCCGGGGAGATCCCTAAGGTCCTCGTAGCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474          AGACACTATGGACAGCGTGAAGCAGAGCGCGGCCCTGTGCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146235 GTA...CAGAGACACTATGGACAGCGTGAAGCAGAGCGCGGCCCTGTGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTGCGCCTGTACAGGACGTCCCCCGATCTTGTCCCCATGGGCGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151115 TGCTGCGCCTGTACAGGACGTCCCCCGATCTTGTCCCCATGGGCGACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACATCCCGAGTGGTGCACCTGCTCAATGACCAGCACTTG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 151165 ACATCCCGAGTGGTGCACCTGCTCAATGACCAGCACTTGGTA...CAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGGTAACTGCAGCCACAAGTCTGATCACCACTTTAGCACAGAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155179 TGTGGTAACTGCAGCCACAAGTCTGATCACCACTTTAGCACAGAAGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAGAAGAGTTTAAAACCTCCGTGTCTCTGGCTGTCTCTAGGCTAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155229 CAGAAGAGTTTAAAACCTCCGTGTCTCTGGCTGTCTCTAGGCTAAGCAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          ATCGTGACGTCTGCATCCACAGATCTCCAGGATTACACTTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155279 GTA...CAGATCGTGACGTCTGCATCCACAGATCTCCAGGATTACACTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTATTTTGTCCCGGCTCCCTGGCTGTCTGTCAAACTGCTGAGACTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158665 CTATTTTGTCCCGGCTCCCTGGCTGTCTGTCAAACTGCTGAGACTGCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGTGCTACCCACCCCCAG         ACCCTGCAGTGCGAGGCCGCCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 158715 AGTGCTACCCACCCCCAGGTA...AAGACCCTGCAGTGCGAGGCCGCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACTGAGTGCCTGGAGACCATCCTGAACAAAGCCCAAGAACCGCCCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159437 ACTGAGTGCCTGGAGACCATCCTGAACAAAGCCCAAGAACCGCCCAAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAAGAAGGTCCAGCACTCCAACGCGAAGAATGCCGTGCTTTTCGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 159487 GAAGAAGGTCCAGCACTCCAACGCGAAGAATGCCGTGCTCTTCGAGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCAGCTTAATCATTCACCATGACAG         TGAGCCGAACCTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 159537 TCAGCTTAATCATTCACCATGACAGGTG...CAGTGAGCCGAACCTGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GTCCGTGCCTGCAACCAGTTGGGCCAGTTTCTGCAGCACCGCGAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160780 GTCCGTGCCTGCAACCAGTTGGGCCAGTTTCTGCAGCACCGCGAGACCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160830 CCTGCGCTACCTGGCCCTGGAGAGCATGTGCACGCTGGCCAGCTCTGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCTCCCATGAGGCTGTCAAGACGCACATCGAGACGGTCATCAACGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160880 TCTCCCATGAGGCTGTCAAGACGCACATCGAGACGGTCATCAACGCCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGACTGAG         CGGGACGTGAGCGTGCGGCAGCGGGCCGTGGA
        ||| |-||->>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 160930 AAGGC GA GTG...GAGCGGGACGTGAGCGTGCGGCAGCGGGCCGTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCTCCTCTACGCCATGTGCGACCGCAGCAACGCCCCACAGATCGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162569 CCTCCTCTACGCCATGTGCGACCGCAGCAACGCCCCACAGATCGTGGCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGATGCTGAGCTATCTGGAGACAGCTGACTACTCCATCCGAGAAGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162619 AGATGCTGAGCTATCTGGAGACAGCTGACTACTCCATCCGAGAAGAGATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270          GTGCTGAAGGTCGCCATCCTGGCTGAGAAGTACGCGGTGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162669 GTG...CAGGTGCTGAAGGTCGCCATCCTGGCTGAGAAGTACGCGGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTACACCTGGTATGTGGATACCATCTTGAACTTGATCCGAATTGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166523 CTACACCTGGTATGTGGATACCATCTTGAACTTGATCCGAATTGCTGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 ATTACGTGAGTGAAGAGGTGTGGTACCGAGTCATTCAGATCGTCATCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166573 ATTACGTGAGTGAAGAGGTGTGGTACCGAGTCATTCAGATCGTCATCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CGGGACGACGTGCAGGGCTACGCGGCCAAGACTGTGTTCGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 166623 CGGGACGACGTGCAGGGCTACGCGGCCAAGACTGTGTTCGAGGTA...CA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1453  GCTCTTCAGGCTCCCGCGTGCCACGAGAACCTGGTCAAAGTGGGCGGCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167262 GGCTCTTCAGGCTCCCGCGTGCCACGAGAACCTGGTCAAAGTGGGCGGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACATCCTGGGGGAGTTTGGAAACTTGATAGCTGGAGACCCGAGATCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 167312 ACATCCTGGGGGAGTTTGGAAACTTGATAGCTGGAGACCCGAGATCCAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551         CCCGCTGATCCAGTTCCACCTGCTGCACTCCAAGTTCCACCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167362 TG...CAGCCCGCTGATCCAGTTCCACCTGCTGCACTCCAAGTTCCACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GTGCAGCGTCCCCACCCGCGCGCTGCTCCTGTCCACCTACATCAAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167775 GTGCAGCGTCCCCACCCGCGCGCTGCTCCTGTCCACCTACATCAAGTTCG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGAACCTCTTCCCGGAGGTGAAGCCCACCATCCAGGACGTGCTGCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167825 TGAACCTCTTCCCGGAGGTGAAGCCCACCATCCAGGACGTGCTGCGCAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GACAGCCAGCTCAGGAACGCAGACGTGGAGCTGCAGCAGCGTGCTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167875 GACAGCCAGCTCAGGAACGCAGACGTGGAGCTGCAGCAGCGTGCTGTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GTACCTGCGGCTCAGCACCGTGGCCAGCACCGACATTCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 167925 GTACCTGCGGCTCAGCACCGTGGCCAGCACCGACATTCTGGTA...AAGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CGACCGTGCTGGAGGAGATGCCCCCATTCCCGGAGCGGGAGTCCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168052 CGACCGTGCTGGAGGAGATGCCCCCATTCCCGGAGCGGGAGTCCTCCATC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTGGCAAAGCTCAAGAAGAAGAAGGGCCCCAGCACGGTGACAGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168102 TTGGCAAAGCTCAAGAAGAAGAAGGGCCCCAGCACGGTGACAGACCTGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 GGACACCAAGCGGGACAGGAGTGTGGACGTGAACGGGGGTCCTGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168152 GGACACCAAGCGGGACAGGAGTGTGGACGTGAACGGGGGTCCTGAGCCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CCCCAGCCAGTACCAGCGCCGTG         TCTACGCCTTCTCCGTCG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 168202 CCCCAGCCAGTACCAGCGCCGTGGTG...CAGTCTACGCCTTCTCCGTCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GCAGACCTGCTGGGTCTCGGGGCTGCCCCCCCTGCCCCCGCGGGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174429 GCAGACCTGCTGGGTCTCGGGGCTGCCCCCCCTGCCCCCGCGGGCCCCCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 ACCCTCCTCCGGCGGCAGCGGGCTGCTCGTGGACGTGTTCTCAGACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174479 ACCCTCCTCCGGCGGCAGCGGGCTGCTCGTGGACGTGTTCTCAGACTCGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCTCTGTGGTCGCGCCTCTCGCTCCTGGCTCCGAAGACAACTTTGCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 174529 CCTCTGTGGTCGCGCCTCTCGCTCCTGGCTCCGAAGACAACTTTGCCAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2124         GTTTGTTTGTAAAAACAATGGTGTGTTGTTTGAAAACCAGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174579 TA...TAGGTTTGTTTGTAAAAACAATGGTGTGTTGTTTGAAAACCAGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GCTTCAAATTGGACTTAAGTCTGAATTTCGGCAGAATTTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 177743 GCTTCAAATTGGACTTAAGTCTGAATTTCGGCAGAATTTAGGTA...TAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GTCGGATGTTTATCTTTTATGGTAATAAGACCTCCACGCAGTTCCTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180507 GTCGGATGTTTATCTTTTATGGTAATAAGACCTCCACGCAGTTCCTAAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 TTTACCCCAACACTAATCTGTTCAGACGACCTTCAGCCTAAC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>
 180557 TTTACCCCAACACTAATCTGTTCAGACGACCTTCAGCCTAATATC...CA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2299  CTGAACCTGCAGACCAAGCCCGTGGACCCGACCGTGGAGGGGGGCGCGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181992 CCTGAACCTGCAGACCAAGCCCGTGGACCCGACCGTGGAGGGGGGCGCGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 AGGTGCAGCAGGTGGTCAACATAGAGTGCGTGTCCGACTTCACGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182042 AGGTGCAGCAGGTGGTCAACATAGAGTGCGTGTCCGACTTCACGGAGGCG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CCAGTCCTCAACATTCAGTTCAG         GTATGGGGGCACCTTCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 182092 CCAGTCCTCAACATTCAGTTCAGGTA...CAGGTATGGGGGCACCTTCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 GAACGTGTCTGTGCAGCTGCCCATCACTCTCAACAAATTCTTCCAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183097 GAACGTGTCTGTGCAGCTGCCCATCACTCTCAACAAATTCTTCCAGCCGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 CAGAAATGGCTTCTCAGGATTTCTTTCAACGTTGGAAGCAGTTGAGCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 183147 CAGAAATGGCTTCTCAGGATTTCTTTCAACGTTGGAAGCAGTTGAGCAAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2538         TCCACAGCAGGAAGTGCAGAACATCTTCAAAGCAAAGCACCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183197 TG...CAGTCCACAGCAGGAAGTGCAGAACATCTTCAAAGCAAAGCACCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 AATGGACACAGAAGTCACCAAAGCCAAG         ATCATTGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 183349 AATGGACACAGAAGTCACCAAAGCCAAGGTA...CAGATCATTGGATTTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 GTTCTGCACTTCTTGAAGAAGTTGATCCTAATCCTGCGAATTTCGTGGGA
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 183675 GTTCTGCACTTCTTGAAGAAGTTGATCCTAATCCTGCGAATTTCGTGGGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GCTGGAATCATCCACACGAAAACCACCCAGATTGGATGCCTGCTGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183725 GCTGGAATCATCCACACGAAAACCACCCAGATTGGATGCCTGCTGCGCTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GGAGCCGAACCTGCAAGCCCAG         ATGTACCGGCTCACGCTGC
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 183775 GGAGCCGAACCTGCAAGCCCAGGTC...CAGATGTACCGGCTCACGCTGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 GCACAAGTAAGGAAGCCGTTTCTCAGAGATTATGTGAATTGCTCTCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184546 GCACAAGTAAGGAAGCCGTTTCTCAGAGATTATGTGAATTGCTCTCAGCG

   3000     .
   2812 CAGTTT
        ||||||
 184596 CAGTTT

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