seq1 = pF1KSDA0895.tfa, 1407 bp
seq2 = pF1KSDA0895/gi568815591r_36226763.tfa (gi568815591r:36226763_36457591), 230829 bp

>pF1KSDA0895 1407
>gi568815591r:36226763_36457591 (Chr7)

(complement)

1-25  (90652-90676)   100% ->
26-714  (100002-100690)   99% ->
715-847  (122414-122546)   100% ->
848-1153  (123431-123736)   100% ->
1154-1251  (126513-126610)   100% ->
1252-1407  (130674-130829)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGAGTCCATTCGCGTGACGG         AAAAGCTTCACTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
  90652 ATGCTGGAGTCCATTCGCGTGACGGGTG...CAGAAAAGCTTCACTGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGCAAGAACTTGCTAAGAAGTCTATTCTAAATGCAGAAGATTCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100018 TGAGCAAGAACTTGCTAAGAAGTCTATTCTAAATGCAGAAGATTCATTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATTGACAACAAAAGAAGCATTTCACATTTGTCCTCGGGAGTGCTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100068 TCATTGACAACAAAAGAAGCATTTCACATTTGTCCTCGGGAGTGCTAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACATTTTCACAACTGGAACCAGTAGTTACAATGTCCTACTACAGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100118 GACATTTTCACAACTGGAACCAGTAGTTACAATGTCCTACTACAGAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGAAAAAAAAGTATCATTCACAAAAACAGTCTTCCTCCACCTACTCCA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100168 GGAGGAAAAAAAGTATCATTCACAAAAACAGTCTTCCTCCACCTACTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAAGATGTAGAAAACCCAGCAAATCTCCTAACACTTCTCGTAGCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100218 AAAGATGTAGAAAACCCAGCAAATCTCCTAACACTTCTCGTAGCAAAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTCGCAGGATGAAAGCCCTGGTGCCTGTGACAAGCAGTGGTACTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100268 CCTCGCAGGATGAAAGCCCTGGTGCCTGTGACAAGCAGTGGTACTTGGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGCCTGGAGAGGCGGCCTGCTGTTTTTGTCACTAGTTCAGTGTCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100318 CTGCCTGGAGAGGCGGCCTGCTGTTTTTGTCACTAGTTCAGTGTCAAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGTAAAGTTTACACATGATATCTCTGTTACAGGGAATGGCATAGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100368 CTGTAAAGTTTACACATGATATCTCTGTTACAGGGAATGGCATAGTACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCACCTAAACCCAAAAGCAAGGTCAAGTGGTGCCATTTCTCCACTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100418 CCACCTAAACCCAAAAGCAAGGTCAAGTGGTGCCATTTCTCCACTCTTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAAGCCAAAGCCTCAGCTGTCTAGAAGCTTTGAAAAGGGAGATGACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 AAAGCCAAAGCCTCAGCTGTCTAGAAGCTTTGAAAAGGGAGATGACTTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGGGAAGAAATTTTGTATATTGACTGCTATAAAACCCACCAACTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100518 CTGGGAAGAAATTTTGTATATTGACTGCTATAAAACCCACCAACTTAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAGAAAAACTGAGATTCTTCAAATCTGACTATACCTACAATCCTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100568 AAAGAAAAACTGAGATTCTTCAAATCTGACTATACCTACAATCCTCAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAGTATGCCAATCCTGCTCTGCCAAGCGTATTAGCTAAGCATAGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100618 TGAGTATGCCAATCCTGCTCTGCCAAGCGTATTAGCTAAGCATAGCCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CATCTGACCGATTTCTTAAGCAG         ATTGTAGTTCATCTCACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100668 CATCTGACCGATTTCTTAAGCAGGTA...TAGATTGTAGTTCATCTCACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAGGACCTGCTTTCCCGAGCGTCAATGACAGTAGTAAATGGATGTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122432 GAGGACCTGCTTTCCCGAGCGTCAATGACAGTAGTAAATGGATGTCCGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCTGACTATCAATGTGTCCACTGCACGTGAGCATTGGCTGGAGGGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122482 TCTGACTATCAATGTGTCCACTGCACGTGAGCATTGGCTGGAGGGAATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGAGGCATGAAATAG         GTACACATTATTTTCGAGGTATTAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 122532 TGAGGCATGAAATAGGTA...TAGGTACACATTATTTTCGAGGTATTAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AACCTCCAGCAGCCATGGAACAGTTGGACTGGACGTAAAAAACATGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123457 AACCTCCAGCAGCCATGGAACAGTTGGACTGGACGTAAAAAACATGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AAAGCCAAATAATCCCACAGAGGAAGGACTAGCAAGCATTCACAGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123507 AAAGCCAAATAATCCCACAGAGGAAGGACTAGCAAGCATTCACAGTGTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGTTTAGAAAAGACCCTTTTTTATGGAGGGCTGCCCTCCTCTACTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123557 TGTTTAGAAAAGACCCTTTTTTATGGAGGGCTGCCCTCCTCTACTACACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GTTTATCAAGCCAGCCAAATGTCTTTTTGTGAACTCTTTAAAGATATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123607 GTTTATCAAGCCAGCCAAATGTCTTTTTGTGAACTCTTTAAAGATATTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CAGGTTTGTCAAGGACCCCAATACAAGATGGGATTATTGTGTACGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123657 CAGGTTTGTCAAGGACCCCAATACAAGATGGGATTATTGTGTACGGGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGAGGGGATGGACTGATACTTCCCAACCAG         GGTGTTTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123707 AGAGGGGATGGACTGATACTTCCCAACCAGGTG...CAGGGTGTTTTAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AAAGACCAGGTATACTTGGATGGAATTCTTCAAATCCTCCGATACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126524 AAAGACCAGGTATACTTGGATGGAATTCTTCAAATCCTCCGATACAGAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TACCATAGACTTCCATCTGCTGACTGCTCTCGGGAAG         GTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 126574 TACCATAGACTTCCATCTGCTGACTGCTCTCGGGAAGGTG...CAGGTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTTATGAAGATGTGGATCGCTTAAAAGGATTGGCAGTTACCGAAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130678 CTTATGAAGATGTGGATCGCTTAAAAGGATTGGCAGTTACCGAAAACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AGGGTCCCTCATTTCCTGCAGGACCATGGCCGATATATGGAACACTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130728 AGGGTCCCTCATTTCCTGCAGGACCATGGCCGATATATGGAACACTTAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GAAGATCATGGAAGTGAATGAACTGACTGACAGGGAACTGAAAGATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130778 GAAGATCATGGAAGTGAATGAACTGACTGACAGGGAACTGAAAGATCTTA

   1450 
   1406 TA
        ||
 130828 TA