seq1 = pF1KSDA0881.tfa, 3147 bp
seq2 = pF1KSDA0881/gi568815582f_29877773.tfa (gi568815582f:29877773_30091565), 213793 bp

>pF1KSDA0881 3147
>gi568815582f:29877773_30091565 (Chr16)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-204  (100317-100388)   100% ->
205-306  (100480-100581)   100% ->
307-352  (101027-101072)   100% ->
353-449  (101202-101298)   100% ->
450-563  (101423-101536)   100% ->
564-655  (101645-101736)   100% ->
656-749  (103889-103982)   100% ->
750-831  (104087-104168)   100% ->
832-999  (104962-105129)   100% ->
1000-1260  (105300-105560)   100% ->
1261-1422  (105731-105892)   99% ->
1423-1788  (107441-107806)   100% ->
1789-1992  (107886-108089)   100% ->
1993-2232  (108493-108732)   100% ->
2233-2445  (111821-112033)   100% ->
2446-2628  (113012-113194)   100% ->
2629-3147  (113275-113793)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAGCTGGGGGCCGGGCCGGGAGCCTGAAGGACCCAGATGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAGCTGGGGGCCGGGCCGGGAGCCTGAAGGACCCAGATGTGGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTTCTTCAAGGATGACCCAGAAAAGCTCTTCTCTGACCTCCGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTTCTTCAAGGATGACCCAGAAAAGCTCTTCTCTGACCTCCGGGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGCCATGGCAGCTTTGGAGCCGTATACTTT         GCCCGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 TTGGCCATGGCAGCTTTGGAGCCGTATACTTTGTG...TAGGCCCGGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCGGAATAGTGAGGTGGTGGCCATCAAGAAGATGTCCTACAGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100326 GTCCGGAATAGTGAGGTGGTGGCCATCAAGAAGATGTCCTACAGTGGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGTCCAATGAG         AAATGGCAAGACATCATCAAGGAGGTGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100376 GCAGTCCAATGAGGTG...TAGAAATGGCAAGACATCATCAAGGAGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGTTCTTACAGAAGCTCCGGCATCCCAACACCATTCAGTACCGGGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100508 GGTTCTTACAGAAGCTCCGGCATCCCAACACCATTCAGTACCGGGGCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACCTGAGGGAGCACACGGCTTGG         CTGGTAATGGAGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100558 TACCTGAGGGAGCACACGGCTTGGGTG...TAGCTGGTAATGGAGTATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTGGGCTCAGCTTCTGACCTTCTAGAAG         TGCACAAGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101044 CCTGGGCTCAGCTTCTGACCTTCTAGAAGGTA...CAGTGCACAAGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCCTTCAGGAGGTAGAGATCGCAGCTGTGACCCACGGGGCGCTTCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101214 CCCTTCAGGAGGTAGAGATCGCAGCTGTGACCCACGGGGCGCTTCAGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGCATATCTGCACTCCCACAACATGATCCATAG         GGATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101264 CTGGCATATCTGCACTCCCACAACATGATCCATAGGTA...CAGGGATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GAAGGCTGGAAACATCCTGCTGTCAGAGCCAGGGTTAGTGAAGCTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101429 GAAGGCTGGAAACATCCTGCTGTCAGAGCCAGGGTTAGTGAAGCTAGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACTTTGGTTCTGCGTCCATCATGGCACCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101479 ACTTTGGTTCTGCGTCCATCATGGCACCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCATACTG         GATGGCACCCGAGGTGATCCTGGCCATGGATGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101529 CCATACTGGTG...TAGGATGGCACCCGAGGTGATCCTGGCCATGGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GGGGCAGTACGATGGCAAAGTGGACGTCTGGTCCTTGGGGATAACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101678 GGGGCAGTACGATGGCAAAGTGGACGTCTGGTCCTTGGGGATAACCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCGAGCTGG         CTGAACGGAAACCACCGCTCTTTAACATGAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 TCGAGCTGGGTA...TAGCTGAACGGAAACCACCGCTCTTTAACATGAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCGATGAGTGCCTTATACCACATTGCACAGAACGAATCCCCCGTGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103921 GCGATGAGTGCCTTATACCACATTGCACAGAACGAATCCCCCGTGCTCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GTCAGGACACTG         GTCTGAGTACTTCCGGAATTTTGTCGACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103971 GTCAGGACACTGGTG...CAGGTCTGAGTACTTCCGGAATTTTGTCGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCTGTCTTCAGAAAATCCCTCAAGACAGACCAACCTCAGAGGTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104116 CCTGTCTTCAGAAAATCCCTCAAGACAGACCAACCTCAGAGGTTCTCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAG         CACCGCTTTGTGCTCCGGGAGCGGCCACCCACAGTCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104166 AAGGTG...CAGCACCGCTTTGTGCTCCGGGAGCGGCCACCCACAGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CATGGACCTGATCCAGAGGACCAAGGATGCCGTGCGGGAGCTGGACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105000 CATGGACCTGATCCAGAGGACCAAGGATGCCGTGCGGGAGCTGGACAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCAGTACCGCAAGATGAAGAAGATCCTGTTCCAAGAGGCACCCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105050 TGCAGTACCGCAAGATGAAGAAGATCCTGTTCCAAGAGGCACCCAACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCTGGTGCCGAGGCCCCAGAGGAGGAAGAG         GAGGCCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105100 CCTGGTGCCGAGGCCCCAGAGGAGGAAGAGGTG...CAGGAGGCCGAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CTACATGCACCGGGCCGGGACTCTGACCAGCCTCGAGAGTAGCCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105311 CTACATGCACCGGGCCGGGACTCTGACCAGCCTCGAGAGTAGCCACTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGCCCAGCATGTCCATCAGCGCCTCCAGCCAGAGCAGCTCCGTCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105361 TGCCCAGCATGTCCATCAGCGCCTCCAGCCAGAGCAGCTCCGTCAACAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTAGCAGATGCCTCAGACAACGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105411 CTAGCAGATGCCTCAGACAACGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGAGGAGGAGGAAGAAGGCCCTGAAGCCCGGGAGATGGCCATGATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105461 GGAGGAGGAGGAAGAAGGCCCTGAAGCCCGGGAGATGGCCATGATGCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGGGGGAGCACACAGTCACCTCTCACAGCTCCATTATCCACCGGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105511 AGGGGGAGCACACAGTCACCTCTCACAGCTCCATTATCCACCGGCTGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261          GGCTCTGACAACCTATATGATGACCCCTACCAGCCAGAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105561 GTA...TAGGGCTCTGACAACCTATATGATGACCCCTACCAGCCAGAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AACCCCCAGCCCTCTCCAGCCGCCTGCAGCCCCAGCTCCCACTTCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105772 AACCCCCAGCCCTCTCCAGCCGCCTGCAGCCCCAGCTCCCACTTCCACCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCTCTTCTGCCCGCCGCCGGGCCTACTGCCGTAACCGAGACCACTTTGCC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105822 CCTCTTCCGCCCGCCGCCGGGCCTACTGCCGTAACCGAGACCACTTTGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACCATCCGAACCGCCTCCCTG         GTCAGCCGTCAGATCCAGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105872 ACCATCCGAACCGCCTCCCTGGTG...CAGGTCAGCCGTCAGATCCAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GCATGAGCAGGACTCTGCGCTGCGGGAGCAGCTGAGCGGCTATAAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107461 GCATGAGCAGGACTCTGCGCTGCGGGAGCAGCTGAGCGGCTATAAGCGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGCGACGACAGCACCAGAAGCAGCTGCTGGCCCTGGAGTCACGGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107511 TGCGACGACAGCACCAGAAGCAGCTGCTGGCCCTGGAGTCACGGCTGAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GGTGAACGGGAGGAGCACAGTGCACGGCTGCAGCGGGAGCTTGAGGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107561 GGTGAACGGGAGGAGCACAGTGCACGGCTGCAGCGGGAGCTTGAGGCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCGGGCTGGCTTTGGGGCAGAGGCAGAAAAGCTGGCCCGGCGGCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107611 GCGGGCTGGCTTTGGGGCAGAGGCAGAAAAGCTGGCCCGGCGGCACCAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CCATAGGTGAGAAGGAGGCACGAGCTGCCCAGGCCGAGGAGCGGAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107661 CCATAGGTGAGAAGGAGGCACGAGCTGCCCAGGCCGAGGAGCGGAAGTTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CAGCAGCACATCCTTGGGCAGCAGAAGAAGGAGCTGGCTGCCCTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107711 CAGCAGCACATCCTTGGGCAGCAGAAGAAGGAGCTGGCTGCCCTGCTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GGCACAGAAGCGGACCTACAAACTTCGCAAGGAACAGCTGAAGGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107761 GGCACAGAAGCGGACCTACAAACTTCGCAAGGAACAGCTGAAGGAGGTG.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789      GAGCTCCAGGAGAACCCCAGCACTCCCAAGCGGGAGAAGGCCGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107811 ..CAGGAGCTCCAGGAGAACCCCAGCACTCCCAAGCGGGAGAAGGCCGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TGGCTGCTGCGGCAGAAGGAGCAGCTCCAGCAGTGCCAGGCGGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107931 TGGCTGCTGCGGCAGAAGGAGCAGCTCCAGCAGTGCCAGGCGGAGGAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AGCAGGGCTGCTGCGGCGGCAGCGCCAGTACTTTGAGCTGCAGTGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107981 AGCAGGGCTGCTGCGGCGGCAGCGCCAGTACTTTGAGCTGCAGTGTCGCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 AGTACAAGCGCAAGATGTTGCTGGCTCGGCACAGCCTGGACCAGGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108031 AGTACAAGCGCAAGATGTTGCTGGCTCGGCACAGCCTGGACCAGGACCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CTGCGGGAG         GACCTGAACAAGAAGCAGACCCAGAAGGACTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108081 CTGCGGGAGGTA...CAGGACCTGAACAAGAAGCAGACCCAGAAGGACTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 GGAGTGTGCACTGCTGCTTCGGCAGCACGAGGCCACGCGGGAGCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108525 GGAGTGTGCACTGCTGCTTCGGCAGCACGAGGCCACGCGGGAGCTGGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TGCGGCAGCTCCAGGCCGTGCAGCGCACGCGGGCTGAGCTCACCCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108575 TGCGGCAGCTCCAGGCCGTGCAGCGCACGCGGGCTGAGCTCACCCGCCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CAGCACCAGACGGAGCTGGGCAACCAGCTGGAGTACAACAAGCGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108625 CAGCACCAGACGGAGCTGGGCAACCAGCTGGAGTACAACAAGCGGCGTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GCAAGAGTTGCGGCAGAAGCATGCGGCCCAGGTTCGCCAGCAGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108675 GCAAGAGTTGCGGCAGAAGCATGCGGCCCAGGTTCGCCAGCAGCCCAAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 GCCTCAAA         TCTAAGGAGCTGCAGATCAAGAAGCAGTTCCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108725 GCCTCAAAGTA...TAGTCTAAGGAGCTGCAGATCAAGAAGCAGTTCCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GAGACGTGTAAGATCCAGACTCGGCAGTACAAGGCTCTGCGAGCACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111854 GAGACGTGTAAGATCCAGACTCGGCAGTACAAGGCTCTGCGAGCACACTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GCTGGAGACCACGCCCAAAGCTCAGCACAAGAGCCTCCTTAAGCGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111904 GCTGGAGACCACGCCCAAAGCTCAGCACAAGAGCCTCCTTAAGCGGCTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGGAAGAGCAGACCCGCAAGCTGGCGATCTTGGCGGAGCAGTATGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111954 AGGAAGAGCAGACCCGCAAGCTGGCGATCTTGGCGGAGCAGTATGACCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 TCCATCTCAGAGATGCTCAGCTCACAGGCG         CTGCGGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112004 TCCATCTCAGAGATGCTCAGCTCACAGGCGGTG...CAGCTGCGGCTTGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TGAGACCCAGGAGGCAGAGTTCCAGGCCCTTCGGCAGCAGCTTCAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113023 TGAGACCCAGGAGGCAGAGTTCCAGGCCCTTCGGCAGCAGCTTCAACAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 AGCTGGAGCTGCTCAACGCTTACCAGAGCAAGATCAAGATCCGCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113073 AGCTGGAGCTGCTCAACGCTTACCAGAGCAAGATCAAGATCCGCACAGAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 AGCCAGCACGAGAGGGAGCTGCGGGAGCTGGAGCAGAGGGTCGCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113123 AGCCAGCACGAGAGGGAGCTGCGGGAGCTGGAGCAGAGGGTCGCGCTGCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCGGGCACTGCTGGAGCAGCGG         GTGGAAGAGGAGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 113173 GCGGGCACTGCTGGAGCAGCGGGTA...CAGGTGGAAGAGGAGCTGCTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CCCTGCAGACAGGACGCTCCGAGCGAATCCGCAGTCTGCTTGAGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113294 CCCTGCAGACAGGACGCTCCGAGCGAATCCGCAGTCTGCTTGAGCGGCAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GCCCGTGAGATCGAGGCCTTCGATGCGGAAAGCATGAGGCTGGGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113344 GCCCGTGAGATCGAGGCCTTCGATGCGGAAAGCATGAGGCTGGGCTTCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 CAGCATGGCTCTGGGGGGCATCCCGGCTGAAGCTGCTGCCCAGGGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113394 CAGCATGGCTCTGGGGGGCATCCCGGCTGAAGCTGCTGCCCAGGGCTATC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 CTGCTCCACCCCCTGCCCCAGCCTGGCCCTCCCGTCCCGTTCCCCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113444 CTGCTCCACCCCCTGCCCCAGCCTGGCCCTCCCGTCCCGTTCCCCGTTCT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 GGGGCACACTGGAGCCATGGCCCTCCTCCACCAGGCATGCCCCCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113494 GGGGCACACTGGAGCCATGGCCCTCCTCCACCAGGCATGCCCCCTCCAGC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2898 CTGGCGTCAGCCGTCTCTGCTGGCTCCCCCAGGCCCCCCAAACTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113544 CTGGCGTCAGCCGTCTCTGCTGGCTCCCCCAGGCCCCCCAAACTGGCTGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2948 GGCCCCCCACACAAAGTGGGACACCCCGTGGCGGAGCCCTGCTGCTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113594 GGCCCCCCACACAAAGTGGGACACCCCGTGGCGGAGCCCTGCTGCTGCTA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2998 AGAAACAGCCCCCAGCCCCTGCGGCGGGCAGCCTCGGGGGGCAGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113644 AGAAACAGCCCCCAGCCCCTGCGGCGGGCAGCCTCGGGGGGCAGTGGCAG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3048 TGAGAATGTGGGCCCCCCTGCTGCCGCGGTGCCCGGGCCCCTGAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113694 TGAGAATGTGGGCCCCCCTGCTGCCGCGGTGCCCGGGCCCCTGAGCCGCA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3098 GCACCAGTGTCGCTTCCCACATCCTCAATGGTTCTTCCCACTTCTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113744 GCACCAGTGTCGCTTCCCACATCCTCAATGGTTCTTCCCACTTCTATTCC