seq1 = pF1KSDA0875.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KSDA0875/gi568815586r_117046090.tfa (gi568815586r:117046090_117290456), 244367 bp

>pF1KSDA0875 1863
>gi568815586r:117046090_117290456 (Chr12)

(complement)

1-239  (100001-100239)   100% ->
240-375  (101095-101230)   100% ->
376-470  (103886-103980)   100% ->
471-592  (112816-112937)   100% ->
593-739  (115660-115806)   100% ->
740-876  (116116-116252)   100% ->
877-1013  (117850-117986)   100% ->
1014-1193  (123380-123559)   100% ->
1194-1326  (124840-124972)   100% ->
1327-1517  (132394-132584)   100% ->
1518-1675  (134509-134666)   100% ->
1676-1863  (144180-144367)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCAGCAGTCGACAGCGCGATGGAGGTGGTGCCGGCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCAGCAGTCGACAGCGCGATGGAGGTGGTGCCGGCGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGAGGCCGCGCCGGAGGTAGCGGGCCTCAGCTGCCTCGTCAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGAGGCCGCGCCGGAGGTAGCGGGCCTCAGCTGCCTCGTCAACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGTGAGGTGCTGGAGTACATCCTGTGCTGCGGCTCGCTGACGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGTGAGGTGCTGGAGTACATCCTGTGCTGCGGCTCGCTGACGGCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACATCGGCCGTGTCTCCAGCACCTGCCGGCGGCTGCGCGAGCTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACATCGGCCGTGTCTCCAGCACCTGCCGGCGGCTGCGCGAGCTGTGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCAGCGGGAAGGTGTGGAAGGAGCAGTTCCGGGTGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100201 GAGCAGCGGGAAGGTGTGGAAGGAGCAGTTCCGGGTGAGGTG...TAGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCCTTCCCTTATGAAACACTACAGCCCCACCGACTACGTCAATTGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101097 GGCCTTCCCTTATGAAACACTACAGCCCCACCGACTACGTCAATTGGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAAGAGTATAAAGTTCGGCAAAAAGCTGGGTTAGAAGCGCGGAAGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101147 GAAGAGTATAAAGTTCGGCAAAAAGCTGGGTTAGAAGCGCGGAAGATTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGCCTCGTTCTCAAAGAGGTTCTTTTCAGAGCAC         GTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101197 AGCCTCGTTCTCAAAGAGGTTCTTTTCAGAGCACGTA...TAGGTTCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTAATGGCTTCAGTGACATTGAGAACCTTGAAGGACCAGAGATTTTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103893 GTAATGGCTTCAGTGACATTGAGAACCTTGAAGGACCAGAGATTTTTTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGGATGAACTGGTGTGTATCCTAAATATGGAAGGAAG         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103943 GAGGATGAACTGGTGTGTATCCTAAATATGGAAGGAAGGTA...CAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGCTTTGACCTGGAAATACTACGCAAAAAAAATTCTTTACTACCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112819 AGCTTTGACCTGGAAATACTACGCAAAAAAAATTCTTTACTACCTGCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AACAGAAGATCTTAAATAATCTTAAGGCCTTTCTTCAGCAGCCAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112869 AACAGAAGATCTTAAATAATCTTAAGGCCTTTCTTCAGCAGCCAGATGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TATGAGTCGTATCTTGAAG         GTGCTGTATATATTGACCAGTA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 112919 TATGAGTCGTATCTTGAAGGTG...CAGGTGCTGTATATATTGACCAGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTGCAATCCTCTCTCCGACATCAGCCTCAAAGACATCCAGGCCCAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115682 CTGCAATCCTCTCTCCGACATCAGCCTCAAAGACATCCAGGCCCAAATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACAGCATCGTGGAGCTTGTTTGCAAAACCCTTCGGGGCATAAACAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115732 ACAGCATCGTGGAGCTTGTTTGCAAAACCCTTCGGGGCATAAACAGTCGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACCCCAGCTTGGCCTTCAAGGCAG         GTGAATCATCCATGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115782 CACCCCAGCTTGGCCTTCAAGGCAGGTG...CAGGTGAATCATCCATGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AATGGAAATAGAACTCCAGAGCCAGGTGCTGGATGCCATGAACTATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116132 AATGGAAATAGAACTCCAGAGCCAGGTGCTGGATGCCATGAACTATGTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTTACGACCAACTGAAGTTCAAGGGGAATCGAATGGATTACTATAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116182 TTTACGACCAACTGAAGTTCAAGGGGAATCGAATGGATTACTATAATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTCAACTTATATATGCATCAG         GTTTTGATTCGCAGAACAGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 116232 CTCAACTTATATATGCATCAGGTA...TAGGTTTTGATTCGCAGAACAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AATCCCAATCAGCATGTCTCTGCTCTATTTGACAATTGCTCGGCAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117870 AATCCCAATCAGCATGTCTCTGCTCTATTTGACAATTGCTCGGCAGTTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAGTCCCACTGGAGCCTGTCAACTTCCCAAGTCACTTCTTATTAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117920 GAGTCCCACTGGAGCCTGTCAACTTCCCAAGTCACTTCTTATTAAGGTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TGCCAAGGCGCAGAAGG         GGCGACCCTGGACATCTTTGACTA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 117970 TGCCAAGGCGCAGAAGGGTG...TAGGGCGACCCTGGACATCTTTGACTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CATCTACATAGATGCTTTTGGGAAAGGCAAGCAGCTGACAGTGAAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123404 CATCTACATAGATGCTTTTGGGAAAGGCAAGCAGCTGACAGTGAAAGAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCGAGTACTTGATCGGCCAGCACGTGACTGCAGCACTGTATGGGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123454 GCGAGTACTTGATCGGCCAGCACGTGACTGCAGCACTGTATGGGGTGGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AATGTCAAGAAGGTGTTACAGAGAATGGTGGGAAACCTGTTAAGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123504 AATGTCAAGAAGGTGTTACAGAGAATGGTGGGAAACCTGTTAAGCCTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAAGCG         GGAAGGCATCGACCAGTCATACCAGCTCCTGAGAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123554 GAAGCGGTA...TAGGGAAGGCATCGACCAGTCATACCAGCTCCTGAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ACTCGCTGGATCTCTATCTGGCAATGTACCCGGACCAGGTGCAGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124875 ACTCGCTGGATCTCTATCTGGCAATGTACCCGGACCAGGTGCAGCTTCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTCCTCCAAGCCAGGCTTTACTTCCACCTGGGAATCTGGCCAGAGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 124925 CTCCTCCAAGCCAGGCTTTACTTCCACCTGGGAATCTGGCCAGAGAAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1327        GTGCTTGACATCCTCCAGCACATCCAAACCCTAGACCCGGGGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124975 A...AAGGTGCTTGACATCCTCCAGCACATCCAAACCCTAGACCCGGGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 AGCACGGGGCGGTGGGCTACCTGGTGCAGCACACTCTAGAGCACATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132437 AGCACGGGGCGGTGGGCTACCTGGTGCAGCACACTCTAGAGCACATTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CGCAAAAAGGAGGAGGTGGGCGTAGAGGTGAAGCTGCGCTCCGATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132487 CGCAAAAAGGAGGAGGTGGGCGTAGAGGTGAAGCTGCGCTCCGATGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCACAGAGATGTCTGCTACTCCATCGGGCTCATTATGAAGCATAAGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 132537 GCACAGAGATGTCTGCTACTCCATCGGGCTCATTATGAAGCATAAGAGGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1518        GTATGGCTATAACTGTGTGATCTACGGCTGGGACCCCACCTGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132587 G...TAGGTATGGCTATAACTGTGTGATCTACGGCTGGGACCCCACCTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ATGATGGGACACGAGTGGATCCGGAACATGAACGTCCACAGCCTGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134552 ATGATGGGACACGAGTGGATCCGGAACATGAACGTCCACAGCCTGCCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CGGCCACCACCAGCCTTTCTATAACGTGCTGGTGGAGGACGGCTCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134602 CGGCCACCACCAGCCTTTCTATAACGTGCTGGTGGAGGACGGCTCCTGTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GATACGCAGCCCAAG         AAAACTTGGAATATAACGTGGAGCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 134652 GATACGCAGCCCAAGGTA...CAGAAAACTTGGAATATAACGTGGAGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CAAGAAATCTCACACCCTGACGTGGGACGCTATTTCTCAGAGTTTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144206 CAAGAAATCTCACACCCTGACGTGGGACGCTATTTCTCAGAGTTTACTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CACTCACTACATCCCAAACGCAGAGCTGGAGATCCGGTATCCAGAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144256 CACTCACTACATCCCAAACGCAGAGCTGGAGATCCGGTATCCAGAAGATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGGAGTTTGTCTATGAAACGGTGCAGAATATTTACAGTGCAAAGAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144306 TGGAGTTTGTCTATGAAACGGTGCAGAATATTTACAGTGCAAAGAAAGAG

   1950     .    :
   1852 AACATAGATGAG
        ||||||||||||
 144356 AACATAGATGAG