seq1 = pF1KSDA0854.tfa, 2511 bp
seq2 = pF1KSDA0854/gi568815590f_122851511.tfa (gi568815590f:122851511_123054021), 202511 bp

>pF1KSDA0854 2511
>gi568815590f:122851511_123054021 (Chr8)

1-2511  (100001-102511)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAGCAAACGAAAATCTACAACTCCATGCATGGTTCGGACATCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAGCAAACGAAAATCTACAACTCCATGCATGGTTCGGACATCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTAGTAGAACAAGATGTGCCCGAGGAAGTAGACAGGGCCAAAGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTAGTAGAACAAGATGTGCCCGAGGAAGTAGACAGGGCCAAAGAGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAATCGGCACACCACAGCCTGACGTGGCCAAGGACAGTTGGGCAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAATCGGCACACCACAGCCTGACGTGGCCAAGGACAGTTGGGCAGCAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTGAAAACTCTTCCAAAGAAAACGAAGTGATAGAGGTGAAATCTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTGAAAACTCTTCCAAAGAAAACGAAGTGATAGAGGTGAAATCTATGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAAGCCAGTCCAAAAAACTCCAAGGTGGTTATGAGTGCAAATACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAAGCCAGTCCAAAAAACTCCAAGGTGGTTATGAGTGCAAATACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTACTCCACGCAAAACCTGAACGAGTTCACGGAGCATGTCGACATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTACTCCACGCAAAACCTGAACGAGTTCACGGAGCATGTCGACATGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATCCCAACGTGATTCTCAACCCCCTCTACGTGTGTGCAGAATGTAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CATCCCAACGTGATTCTCAACCCCCTCTACGTGTGTGCAGAATGTAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACAACCAAAAAGTACGACTCCCTATCCGACCACAACTCCAAGTTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACAACCAAAAAGTACGACTCCCTATCCGACCACAACTCCAAGTTCCATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGGGGAGGCCAACTTCAAGCTGAAGTTAATTAAACGCAATAATCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGGGGAGGCCAACTTCAAGCTGAAGTTAATTAAACGCAATAATCAAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCTTGGAACAGTCCATCGAAACCACCAACCATGTCGTGTCCATCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCTTGGAACAGTCCATCGAAACCACCAACCATGTCGTGTCCATCACCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGTGGCCCTGGAACTGGTGACAGTGATTCTGGGATCTCGGTGAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGTGGCCCTGGAACTGGTGACAGTGATTCTGGGATCTCGGTGAGTAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCCCATCATGAAGCCTGGAAAACCAAAAGCGGATGCCAAGAAGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCCCATCATGAAGCCTGGAAAACCAAAAGCGGATGCCAAGAAGGTGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGAAGCCCGAGGAGATCACCCCCGAGAACCACGTGGAAGGGACCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGAAGCCCGAGGAGATCACCCCCGAGAACCACGTGGAAGGGACCGCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTGGTGACAGACACAGCTGAGATCCTCTCAAGACTCGGCGGGGTGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100651 CCTGGTGACAGACACAGCTGAGATCCTCTCGAGACTCGGCGGGGTGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCCAAGACACATTAGGACACGTCATGCCTTCTGTACAGCTGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCCAAGACACATTAGGACACGTCATGCCTTCTGTACAGCTGCCACCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATATCAACCTTGTGCCCAAGGTCCCTGTCCCACTAAATACTACCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATATCAACCTTGTGCCCAAGGTCCCTGTCCCACTAAATACTACCAAATA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAACTCTGCCCTGGATACAAATGCCACGATGATCAACTCTTTCAACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAACTCTGCCCTGGATACAAATGCCACGATGATCAACTCTTTCAACAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCCTTACCCGACCCAGGCTGAGTTGTCCTGGCTGACAGCTGCCTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCCTTACCCGACCCAGGCTGAGTTGTCCTGGCTGACAGCTGCCTCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACCCAGAGGAGCACATCAGAATCTGGTTTGCCACCCAGCGCTTAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACCCAGAGGAGCACATCAGAATCTGGTTTGCCACCCAGCGCTTAAAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGCATCAGCTGGTCCCCAGAAGAGGTGGAGGAGGCCCGGAAGAAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGCATCAGCTGGTCCCCAGAAGAGGTGGAGGAGGCCCGGAAGAAGATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCAACGGCACCATCCAGTCAGTACCCCCGACCATCACTGTGCTGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCAACGGCACCATCCAGTCAGTACCCCCGACCATCACTGTGCTGCCCGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGTTGGCCCCCACAAAGGTGACGCAGCCCATCCTCCAGACGGCTCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGTTGGCCCCCACAAAGGTGACGCAGCCCATCCTCCAGACGGCTCTACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GTGCCAGATCCTCGGCCAGACTAGCCTGGTGCTGACTCAGGTGACCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GTGCCAGATCCTCGGCCAGACTAGCCTGGTGCTGACTCAGGTGACCAGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGTCAACAACCGTCTCTTGCTCCCCCATCACACTTGCCGTGGCAGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGTCAACAACCGTCTCTTGCTCCCCCATCACACTTGCCGTGGCAGGAGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACTAACCATGGCCAGAAGAGACCCTTGGTGACTCCCCAAGCTGCCCCCGA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCAACCATGGCCAGAAGAGACCCTTGGTGACTCCCCAAGCTGCCCCCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 ACCCAAGCGTCCACACATCGCTCAGGTGCCAGAGCCCCCACCCAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 ACCCAAGCGTCCACACATCGCTCAGGTGCCAGAGCCCCCACCCAAGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCAACCCCCCGCTCACACCAGCCAGTGACCGCAAGAAGACAAAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCAACCCCCCGCTCACACCAGCCAGTGACCGCAAGAAGACAAAGGAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATAGCACATCTCAAGGCCAGCTTTCTCCAGAGCCAGTTCCCTGACGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATAGCACATCTCAAGGCCAGCTTTCTCCAGAGCCAGTTCCCTGACGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CGAGGTTTACCGGCTCATCGAGGTGACTGGCCTTGCCAGGAGCGAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CGAGGTTTACCGGCTCATCGAGGTGACTGGCCTTGCCAGGAGCGAGATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGAAGTGGTTCAGTGACCACCGATATCGGTGTCAAAGGGGCATCGTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGAAGTGGTTCAGTGACCACCGATATCGGTGTCAAAGGGGCATCGTCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATCACCAGCGAATCCCTTGCCAAAGACCAGTTGGCCATCGCGGCCTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATCACCAGCGAATCCCTTGCCAAAGACCAGTTGGCCATCGCGGCCTCCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ACACGGTCGCACGTATCATGCGTACCCAGACTTTGCCCCCCAGAAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 ACACGGTCGCACGTATCATGCGTACCCAGACTTTGCCCCCCAGAAGTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AAGAGAAAACACAGGGTCAGGTTAAAATCTTGGAAGACAGCTTTTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AAGAGAAAACACAGGGTCAGGTTAAAATCTTGGAAGACAGCTTTTTGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AGTTCTTTTCCTACCCAAGCAGAACTGGATCGGCTAAGGGTGGAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AGTTCTTTTCCTACCCAAGCAGAACTGGATCGGCTAAGGGTGGAGACCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GCTGAGCAGGAGAGAGATCGACTCCTGGTTCTCGGAGAGGCGGAAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GCTGAGCAGGAGAGAGATCGACTCCTGGTTCTCGGAGAGGCGGAAGCTTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GAGACAGCATGGAACAAGCTGTCTTGGATTCCATGGGGTCTGGCAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GAGACAGCATGGAACAAGCTGTCTTGGATTCCATGGGGTCTGGCAAAAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GGCCAAGATGTGGGAGCCCCCAATGGTGCTCTGTCTCGACTCGACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GGCCAAGATGTGGGAGCCCCCAATGGTGCTCTGTCTCGACTCGACCAGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 CTCCGGTGCCCAGTTAACAAGTTCTCTGCCCAGCCCTTCGCCAGCAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 CTCCGGTGCCCAGTTAACAAGTTCTCTGCCCAGCCCTTCGCCAGCAATTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 CAAAAAGTCAAGAACAGGTTCATCTCCTGAGGAGCACGTTTGCAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CAAAAAGTCAAGAACAGGTTCATCTCCTGAGGAGCACGTTTGCAAGAACC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CAGTGGCCTACTCCCCAGGAGTACGACCAGTTAGCGGCCAAGACTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CAGTGGCCTACTCCCCAGGAGTACGACCAGTTAGCGGCCAAGACTGGCCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GGTCCGAACTGAGATTGTGCGTTGGTTCAAGGAGAACAGATGCTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GGTCCGAACTGAGATTGTGCGTTGGTTCAAGGAGAACAGATGCTTGCTGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AAACGGGAACCGTGAAGTGGATGGAGCAGTACCAGCACCAGCCCATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AAACGGGAACCGTGAAGTGGATGGAGCAGTACCAGCACCAGCCCATGGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 GATGATCACGGCTACGATGCCGTAGCAAGGAAAGCAACAAAACCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 GATGATCACGGCTACGATGCCGTAGCAAGGAAAGCAACAAAACCCATGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CGAGAGCCCAAAGAACGGGGGTGATGTGGTTCCACAATATTACAAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CGAGAGCCCAAAGAACGGGGGTGATGTGGTTCCACAATATTACAAGGACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CCAAAAAGCTCTGCGAAGAGGACTTGGAGAAGTTGGTGACCAGGGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CCAAAAAGCTCTGCGAAGAGGACTTGGAGAAGTTGGTGACCAGGGTAAAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GTAGGCAGCGAGCCAGCAAAAGACTGTTTGCCAGCAAAGCCCTCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 GTAGGCAGCGAGCCAGCAAAAGACTGTTTGCCAGCAAAGCCCTCAGAGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 CACCTCAGACCGGTCAGAGGGCAGCAGCCGGGACGGCCAGGGTAGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CACCTCAGACCGGTCAGAGGGCAGCAGCCGGGACGGCCAGGGTAGCGACG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 AGAACGAGGAGTCGAGCGTTGTGGATTACGTGGAGGTGACGGTCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 AGAACGAGGAGTCGAGCGTTGTGGATTACGTGGAGGTGACGGTCGGGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 GAGGATGCGATCTCAGATAGATCAGATAGCTGGAGTCAGGCTGCGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 GAGGATGCGATCTCAGATAGATCAGATAGCTGGAGTCAGGCTGCGGCAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 AGGTGTGTCGGAACTGGCTGAATCAGACTCCGACTGCGTCCCTGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 AGGTGTGTCGGAACTGGCTGAATCAGACTCCGACTGCGTCCCTGCAGAGG

   2500     .    :
   2501 CTGGCCAGGCC
        |||||||||||
 102501 CTGGCCAGGCC