seq1 = pF1KSDA0849.tfa, 2859 bp
seq2 = pF1KSDA0849/gi568815582f_50649699.tfa (gi568815582f:50649699_50896505), 246807 bp

>pF1KSDA0849 2859
>gi568815582f:50649699_50896505 (Chr16)

1-504  (100001-100504)   100% ->
505-807  (101906-102208)   100% ->
808-913  (104621-104726)   100% ->
914-1012  (126481-126579)   100% ->
1013-1129  (128127-128243)   100% ->
1130-1509  (129967-130346)   100% ->
1510-1675  (131548-131713)   100% ->
1676-1817  (132627-132768)   100% ->
1818-1940  (134631-134753)   100% ->
1941-2032  (137157-137248)   100% ->
2033-2099  (138088-138154)   100% ->
2100-2232  (141860-141992)   100% ->
2233-2341  (142899-143007)   100% ->
2342-2460  (143848-143966)   100% ->
2461-2677  (144514-144730)   100% ->
2678-2859  (146626-146807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCAGGCTTATGGAGCCAAGAAAAAGTCACTTCACCCTACTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCAGGCTTATGGAGCCAAGAAAAAGTCACTTCACCCTACTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGCGGATTTTTTACTTGCTTCTTCAAGAATGCAGCGTTACAGACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGCGGATTTTTTACTTGCTTCTTCAAGAATGCAGCGTTACAGACAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAACACAAAAGCTCCTTAAAGTACCGAAGGGAAGTATAGGACAGTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAACACAAAAGCTCCTTAAAGTACCGAAGGGAAGTATAGGACAGTATATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAGATCGTTCTGTGGGGCATTCAAGGATTCCTTCTGCAAAAGGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAAGATCGTTCTGTGGGGCATTCAAGGATTCCTTCTGCAAAAGGCAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAATCAGATTGGATTAAAAATTCTAGAGCAACCTCATGCAGTTCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAATCAGATTGGATTAAAAATTCTAGAGCAACCTCATGCAGTTCTCTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGATGAAAAGGATGTTGTAGAGATAAATGAAAAGTTCACAGAGTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGATGAAAAGGATGTTGTAGAGATAAATGAAAAGTTCACAGAGTTACTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGCAATTACCAATTGTGAGGAGAGGTTCAGCCTGTTTAAAAACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGCAATTACCAATTGTGAGGAGAGGTTCAGCCTGTTTAAAAACAGAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGACTAAGTAAAGGCCTCCAAATAGACGTGGGCTGTCCTGTGAAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGACTAAGTAAAGGCCTCCAAATAGACGTGGGCTGTCCTGTGAAAGTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGAGATCTGGGGAAGAAAAATTTCCTGGAGTTGTACGCTTCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGAGATCTGGGGAAGAAAAATTTCCTGGAGTTGTACGCTTCAGAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCCTGTTAGCAGAGAGGACAGTCTCCGGAATATTCTTTGGAGTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCCTGTTAGCAGAGAGGACAGTCTCCGGAATATTCTTTGGAGTTGAATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTG         GAAGAAGGTCGTGGTCAAGGTTTCACTGACGGGGTGT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGTA...TAGGAAGAAGGTCGTGGTCAAGGTTTCACTGACGGGGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACCAAGGGAAACAGCTTTTTCAGTGTGATGAAGATTGTGGCGTGTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101943 ACCAAGGGAAACAGCTTTTTCAGTGTGATGAAGATTGTGGCGTGTTTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCATTGGACAAGCTAGAACTCATAGAAGATGATGACACTGCATTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101993 GCATTGGACAAGCTAGAACTCATAGAAGATGATGACACTGCATTGGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGATTACGCAGGTCCTGGGGACACAATGCAGGTCGAACTTCCTCCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102043 TGATTACGCAGGTCCTGGGGACACAATGCAGGTCGAACTTCCTCCTTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAATAAACTCCAGAGTTTCTTTGAAGGTTGGAGAAACAATAGAATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102093 AAATAAACTCCAGAGTTTCTTTGAAGGTTGGAGAAACAATAGAATCTGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACAGTTATATTCTGTGATGTTTTGCCAGGAAAAGAAAGCTTAGGATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102143 ACAGTTATATTCTGTGATGTTTTGCCAGGAAAAGAAAGCTTAGGATATTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGTTGGTGTGGACATG         GATAACCCTATTGGCAACTGGGATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102193 TGTTGGTGTGGACATGGTA...TAGGATAACCCTATTGGCAACTGGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GAAGATTTGATGGAGTGCAGCTTTGTAGTTTTGCGTGTGTTGAAAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104646 GAAGATTTGATGGAGTGCAGCTTTGTAGTTTTGCGTGTGTTGAAAGTACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATTCTATTGCACATCAATGATATCATCCCAG         AGAGTGTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104696 ATTCTATTGCACATCAATGATATCATCCCAGGTA...CAGAGAGTGTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCAGGAAAGGAGGCCTCCCAAACTTGCCTTTATGTCAAGAGGTGTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126491 GCAGGAAAGGAGGCCTCCCAAACTTGCCTTTATGTCAAGAGGTGTTGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACAAAGGTTCATCCAGTCATAATAAACCAAAGGCTACAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 126541 ACAAAGGTTCATCCAGTCATAATAAACCAAAGGCTACAGGTA...TAGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCTACCTCAGACCCTGGAAATAGAAACAGATCTGAATTATTTTATACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128129 TCTACCTCAGACCCTGGAAATAGAAACAGATCTGAATTATTTTATACCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AAATGGGTCTTCTGTTGACTCACAACCACAATCCAAATCAAAAAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128179 AAATGGGTCTTCTGTTGACTCACAACCACAATCCAAATCAAAAAATACAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGTACATTGATGAAG         TTGCAGAAGACCCTGCAAAATCTCTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 128229 GGTACATTGATGAAGGTA...TAGTTGCAGAAGACCCTGCAAAATCTCTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 ACAGAGATATCTACAGACTTTGACCGTTCTTCACCACCACTCCAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129993 ACAGAGATATCTACAGACTTTGACCGTTCTTCACCACCACTCCAGCCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCCTGTGAACTCACTGACCACCGAGAACAGATTCCACTCTTTACCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130043 TCCTGTGAACTCACTGACCACCGAGAACAGATTCCACTCTTTACCATTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GTCTCACCAAGATGCCCAATACCAATGGAAGTATTGGCCACAGTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130093 GTCTCACCAAGATGCCCAATACCAATGGAAGTATTGGCCACAGTCCACTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TCTCTGTCAGCCCAGTCTGTAATGGAAGAGCTAAACACTGCACCCGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130143 TCTCTGTCAGCCCAGTCTGTAATGGAAGAGCTAAACACTGCACCCGTCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AGAGAGTCCACCCTTGGCCATGCCTCCTGGGAACTCACATGGTCTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130193 AGAGAGTCCACCCTTGGCCATGCCTCCTGGGAACTCACATGGTCTAGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGGGCTCATTGGCTGAAGTTAAGGAGAACCCTCCTTTCTATGGGGTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130243 TGGGCTCATTGGCTGAAGTTAAGGAGAACCCTCCTTTCTATGGGGTAATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CGTTGGATCGGTCAGCCACCAGGACTGAATGAAGTGCTCGCTGGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130293 CGTTGGATCGGTCAGCCACCAGGACTGAATGAAGTGCTCGCTGGACTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 ACTG         GAAGATGAGTGTGCAGGCTGTACGGATGGAACCTTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130343 ACTGGTA...CAGGAAGATGAGTGTGCAGGCTGTACGGATGGAACCTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GAGGCACTCGGTATTTCACCTGTGCCCTGAAGAAGGCGCTGTTTGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131585 GAGGCACTCGGTATTTCACCTGTGCCCTGAAGAAGGCGCTGTTTGTGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTGAAGAGCTGCAGGCCTGACTCTAGGTTTGCATCATTGCAGCCGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131635 CTGAAGAGCTGCAGGCCTGACTCTAGGTTTGCATCATTGCAGCCGGTTTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CAATCAGATTGAGCGCTGTAACTCTTTAG         CATTTGGAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 131685 CAATCAGATTGAGCGCTGTAACTCTTTAGGTA...CAGCATTTGGAGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ACTTAAGTGAAGTAGTAGAAGAAAATACTCCACCAAAAATGGAAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132639 ACTTAAGTGAAGTAGTAGAAGAAAATACTCCACCAAAAATGGAAAAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GGCTTGGAGATAATGATTGGGAAGAAGAAAGGCATCCAGGGTCATTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132689 GGCTTGGAGATAATGATTGGGAAGAAGAAAGGCATCCAGGGTCATTACAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TTCTTGTTACTTAGACTCAACCTTATTCTG         CTTATTTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 132739 TTCTTGTTACTTAGACTCAACCTTATTCTGGTA...CAGCTTATTTGCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TTAGTTCTGTTCTGGACACTGTGTTACTTAGACCCAAAGAAAAGAACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134642 TTAGTTCTGTTCTGGACACTGTGTTACTTAGACCCAAAGAAAAGAACGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GTAGAATATTATAGTGAAACCCAAGAGCTACTGAGGACAGAAATTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134692 GTAGAATATTATAGTGAAACCCAAGAGCTACTGAGGACAGAAATTGTTAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 TCCTCTGAGAAT         ATATGGATATGTGTGTGCCACAAAAATTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 134742 TCCTCTGAGAATGTA...TAGATATGGATATGTGTGTGCCACAAAAATTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 TGAAACTGAGGAAAATACTTGAAAAGGTGGAGGCTGCATCAGGATTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137186 TGAAACTGAGGAAAATACTTGAAAAGGTGGAGGCTGCATCAGGATTTACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TCTGAAGAAAAAG         ATCCTGAGGAATTCTTGAATATTCTGTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 137236 TCTGAAGAAAAAGGTG...TAGATCCTGAGGAATTCTTGAATATTCTGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 TCATCATATTTTAAGGGTAGAACCTTTGCTAAAAATAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 138116 TCATCATATTTTAAGGGTAGAACCTTTGCTAAAAATAAGGTA...TAGAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CAGCAGGTCAAAAGGTACAAGATTGTTACTTCTATCAAATTTTTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141862 CAGCAGGTCAAAAGGTACAAGATTGTTACTTCTATCAAATTTTTATGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 AAAAATGAGAAAGTTGGCGTTCCCACAATTCAGCAGTTGTTAGAATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141912 AAAAATGAGAAAGTTGGCGTTCCCACAATTCAGCAGTTGTTAGAATGGTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 TTTTATCAACAGTAACCTGAAATTTGCAGAG         GCACCATCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141962 TTTTATCAACAGTAACCTGAAATTTGCAGAGGTT...TAGGCACCATCAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 GTCTGATTATTCAGATGCCTCGATTTGGAAAAGACTTTAAACTATTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142909 GTCTGATTATTCAGATGCCTCGATTTGGAAAAGACTTTAAACTATTTAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 AAAATTTTTCCTTCTCTGGAATTAAATATAACAGATTTACTTGAAGACA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 142959 AAAATTTTTCCTTCTCTGGAATTAAATATAACAGATTTACTTGAAGACAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2342         CTCCCAGACAGTGCCGGATATGTGGAGGGCTTGCAATGTATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143009 TA...CAGCTCCCAGACAGTGCCGGATATGTGGAGGGCTTGCAATGTATG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 AGTGTAGAGAATGCTACGACGATCCGGACATCTCAGCTGGAAAAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143890 AGTGTAGAGAATGCTACGACGATCCGGACATCTCAGCTGGAAAAATCAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CAGTTTTGTAAAACCTGCAACACTCAA         GTCCACCTTCATCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 143940 CAGTTTTGTAAAACCTGCAACACTCAAGTG...TAGGTCCACCTTCATCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 GAAGAGGCTGAATCATAAATATAACCCAGTGTCACTTCCCAAAGACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144528 GAAGAGGCTGAATCATAAATATAACCCAGTGTCACTTCCCAAAGACTTAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 CCGACTGGGACTGGAGACACGGCTGCATCCCTTGCCAGAATATGGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144578 CCGACTGGGACTGGAGACACGGCTGCATCCCTTGCCAGAATATGGAGTTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 TTTGCTGTTCTCTGCATAGAAACAAGCCACTATGTTGCTTTTGTGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144628 TTTGCTGTTCTCTGCATAGAAACAAGCCACTATGTTGCTTTTGTGAAGTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 TGGGAAGGACGATTCTGCCTGGCTCTTCTTTGACAGCATGGCCGATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144678 TGGGAAGGACGATTCTGCCTGGCTCTTCTTTGACAGCATGGCCGATCGGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 ATG         GTGGTCAGAATGGCTTCAACATTCCTCAAGTCACCCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144728 ATGGTA...TAGGTGGTCAGAATGGCTTCAACATTCCTCAAGTCACCCCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2716 TGCCCAGAAGTAGGAGAGTACTTGAAGATGTCTCTGGAAGACCTGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146664 TGCCCAGAAGTAGGAGAGTACTTGAAGATGTCTCTGGAAGACCTGCATTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2766 CTTGGACTCCAGGAGAATCCAAGGCTGTGCACGAAGACTGCTTTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146714 CTTGGACTCCAGGAGAATCCAAGGCTGTGCACGAAGACTGCTTTGTGATG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :
   2816 CATATATGTGCATGTACCAGAGTCCAACAATGAGTTTGTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146764 CATATATGTGCATGTACCAGAGTCCAACAATGAGTTTGTACAAA