seq1 = pF1KSDA0848.tfa, 2931 bp
seq2 = pF1KSDA0848/gi568815595r_165087900.tfa (gi568815595r:165087900_165290830), 202931 bp

>pF1KSDA0848 2931
>gi568815595r:165087900_165290830 (Chr3)

(complement)

1-2931  (100001-102931)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACCTTCCATAGCTGAGATGCTTCACAGAGGAAGGATGTTGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAACCTTCCATAGCTGAGATGCTTCACAGAGGAAGGATGTTGTGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTCTTCTAAGCACAATTGCTCTAGGATGGACTACCCCGATTCCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATTCTTCTAAGCACAATTGCTCTAGGATGGACTACCCCGATTCCCCTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAGGACTCAGAGGAAATAGATGAGCCCTGTTTTGATCCATGCTACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGAGGACTCAGAGGAAATAGATGAGCCCTGTTTTGATCCATGCTACTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGTTAAAGAAAGCCTCTTTCATATACATTGTGACAGTAAAGGATTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAGTTAAAGAAAGCCTCTTTCATATACATTGTGACAGTAAAGGATTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAATATTAGTCAGATTACCGAGTTCTGGTCAAGACCTTTTAAACTGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAATATTAGTCAGATTACCGAGTTCTGGTCAAGACCTTTTAAACTGTATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCAGAGGAATTCTATGAGGAAATTATATACCAACAGTTTTCTTCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCAGAGGAATTCTATGAGGAAATTATATACCAACAGTTTTCTTCATTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATAATGCTGTGTCTATTAATCTTGGGAACAATGCATTGCAGGACATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATAATGCTGTGTCTATTAATCTTGGGAACAATGCATTGCAGGACATTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACTGGAGCTTTCAATGGTCTTAAGATTTTAAAGAGACTATATCTACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACTGGAGCTTTCAATGGTCTTAAGATTTTAAAGAGACTATATCTACATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAACAAACTAGATGTCTTCAGAAATGACACCTTCCTTGGCTTGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAACAAACTAGATGTCTTCAGAAATGACACCTTCCTTGGCTTGGAAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTAGAATATCTGCAGGCAGATTACAATGTCATTAAACGTATTGAGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTAGAATATCTGCAGGCAGATTACAATGTCATTAAACGTATTGAGAGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCATTTCGGAACCTAAGTAAATTGAGGGTTCTGATTTTAAATGATAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCATTTCGGAACCTAAGTAAATTGAGGGTTCTGATTTTAAATGATAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATCCCCATGCTTCCAACCAATTTATTTAAGGCTGTCTCTTTAACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATCCCCATGCTTCCAACCAATTTATTTAAGGCTGTCTCTTTAACCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGGACCTACGTGGAAATAGGTTAAAGGTTCTTTTTTACCGAGGAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGGACCTACGTGGAAATAGGTTAAAGGTTCTTTTTTACCGAGGAATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCACATTGGCAGAAGCCTGATGGAGCTCCAGCTGGAAGAAAACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCACATTGGCAGAAGCCTGATGGAGCTCCAGCTGGAAGAAAACCCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAACTGTACATGTGAAATTGTACAACTGAAGAGTTGGCTGGAACGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAACTGTACATGTGAAATTGTACAACTGAAGAGTTGGCTGGAACGCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTTATACTGCCCTGGTGGGAGACATTACCTGTGAGACCCCTTTCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTTATACTGCCCTGGTGGGAGACATTACCTGTGAGACCCCTTTCCACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCATGGAAAGGACCTACGAGAAATCAGGAAGACAGAACTCTGTCCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCATGGAAAGGACCTACGAGAAATCAGGAAGACAGAACTCTGTCCCTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTCTGACTCTGAGGTAGAGGCTAGTTTGGGAATTCCACATTCGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGTCTGACTCTGAGGTAGAGGCTAGTTTGGGAATTCCACATTCGTCATCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGTAAGGAGAATGCATGGCCAACTAAGCCTTCCTCAATGCTATCCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGTAAGGAGAATGCATGGCCAACTAAGCCTTCCTCAATGCTATCCTCTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCATTTTACTGCTTCTTCTGTCGAATACAAGTCCTCAAATAAACAGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCATTTTACTGCTTCTTCTGTCGAATACAAGTCCTCAAATAAACAGCCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCCCACCAAACAGCCTCGAACACCAAGGCCACCCTCCACCTCCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCCCACCAAACAGCCTCGAACACCAAGGCCACCCTCCACCTCCCAAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTATATCCTGGTCCAAACCAGCCTCCCATTGCTCCTTATCAGACCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTATATCCTGGTCCAAACCAGCCTCCCATTGCTCCTTATCAGACCAGACC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 ACCAATCCCCATTATATGCCCCACTGGGTGTACCTGTAATTTGCACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 ACCAATCCCCATTATATGCCCCACTGGGTGTACCTGTAATTTGCACATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ATGACCTTGGCTTGACTGTCAACTGCAAAGAGCGAGGATTTAATAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ATGACCTTGGCTTGACTGTCAACTGCAAAGAGCGAGGATTTAATAACATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TCTGAACTTCTTCCAAGGCCCTTGAATGCCAAGAAACTGTATCTGAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TCTGAACTTCTTCCAAGGCCCTTGAATGCCAAGAAACTGTATCTGAGTAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CAATCTGATTCAGAAAATATACCGTTCTGATTTTTGGAATTTTTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CAATCTGATTCAGAAAATATACCGTTCTGATTTTTGGAATTTTTCTTCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGGATCTCTTGCATCTGGGGAACAATCGTATTTCCTATGTCCAAGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TGGATCTCTTGCATCTGGGGAACAATCGTATTTCCTATGTCCAAGATGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCTTTATCAACTTGCCCAACTTAAAGAGCCTCTTCCTTAATGGCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCCTTTATCAACTTGCCCAACTTAAAGAGCCTCTTCCTTAATGGCAACGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TATAGAGAAGCTGACACCAGGCATGTTCCGAGGCCTACAGAGTTTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TATAGAGAAGCTGACACCAGGCATGTTCCGAGGCCTACAGAGTTTGCACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACTTGTACTTTGAGTTCAATGTCATCCGGGAAATCCAGCCTGCAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 ACTTGTACTTTGAGTTCAATGTCATCCGGGAAATCCAGCCTGCAGCCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGCCTCATGCCCAACTTGAAGCTGCTATTCCTCAATAATAACTTACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGCCTCATGCCCAACTTGAAGCTGCTATTCCTCAATAATAACTTACTGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GACTCTGCCAACAGACGCCTTTGCTGGCACATCCCTGGCCCGGCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GACTCTGCCAACAGACGCCTTTGCTGGCACATCCCTGGCCCGGCTCAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TGAGGAAGAACTACTTCCTCTATCTTCCCGTGGCTGGTGTCCTGGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TGAGGAAGAACTACTTCCTCTATCTTCCCGTGGCTGGTGTCCTGGAACAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TTGAATGCCATTGTCCAGATAGACCTCAATGAGAATCCTTGGGACTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TTGAATGCCATTGTCCAGATAGACCTCAATGAGAATCCTTGGGACTGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CTGTGACCTGGTCCCCTTTAAACAGTGGATCGAAACCATCAGCTCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CTGTGACCTGGTCCCCTTTAAACAGTGGATCGAAACCATCAGCTCAGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 GTGTGGTTGGTGATGTGCTTTGCAGGAGCCCTGAGAACCTCACGCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GTGTGGTTGGTGATGTGCTTTGCAGGAGCCCTGAGAACCTCACGCACCGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GATGTGCGCACTATTGAGCTGGAAGTTCTTTGCCCAGAGATGCTGCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GATGTGCGCACTATTGAGCTGGAAGTTCTTTGCCCAGAGATGCTGCACGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TGCACCAGCTGGAGAATCCCCAGCCCAGCCTGGAGATTCTCACCTTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TGCACCAGCTGGAGAATCCCCAGCCCAGCCTGGAGATTCTCACCTTATTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 GGGCACCAACCAGTGCATCACCTTATGAGTTTTCTCCTCCTGGGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 GGGCACCAACCAGTGCATCACCTTATGAGTTTTCTCCTCCTGGGGGCCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 GTGCCACTTTCTGTGTTAATTCTCAGCCTGCTGGTTCTGTTTTTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GTGCCACTTTCTGTGTTAATTCTCAGCCTGCTGGTTCTGTTTTTCTCAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 AGTCTTTGTTGCTGCAGGCCTCTTTGCCTACGTGCTCCGAAGGCGTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 AGTCTTTGTTGCTGCAGGCCTCTTTGCCTACGTGCTCCGAAGGCGTCGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 AGAAGCTGCCCTTCAGAAGCAAGCGGCAGGAAGGTGTGGACCTTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 AGAAGCTGCCCTTCAGAAGCAAGCGGCAGGAAGGTGTGGACCTTACTGGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 ATCCAAATGCAATGCCACAGGCTGTTTGAGGATGGTGGAGGTGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 ATCCAAATGCAATGCCACAGGCTGTTTGAGGATGGTGGAGGTGGTGGTGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 CGGAAGTGGGGGTGGTGGTCGACCAACTCTTTCCTCTCCAGAGAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 CGGAAGTGGGGGTGGTGGTCGACCAACTCTTTCCTCTCCAGAGAAGGCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CTCCCGTGGGTCATGTGTATGAGTACATCCCCCACCCGGTTACCCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 CTCCCGTGGGTCATGTGTATGAGTACATCCCCCACCCGGTTACCCAAATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 TGCAACAACCCCATCTACAAGCCTCGTGAGGAGGAGGAGGTGGCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102251 TGCAACAACCCCATCTACAAGCCTCGTGAGGAGGAGGAGGTGGCTGTTTC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 ATCAGCCCAAGAAGCAGGGAGTGCAGAACGTGGGGGTCCAGGGACACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 ATCAGCCCAAGAAGCAGGGAGTGCAGAACGTGGGGGTCCAGGGACACAAC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2351 CACCGGGAATGGGTGAGGCTCTCCTAGGAAGTGAGCAGTTTGCTGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 CACCGGGAATGGGTGAGGCTCTCCTAGGAAGTGAGCAGTTTGCTGAGACA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2401 CCCAAGGAGAACCATAGTAACTACCGGACCTTGCTGGAAAAAGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102401 CCCAAGGAGAACCATAGTAACTACCGGACCTTGCTGGAAAAAGAGAAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2451 GTGGGCCCTAGCAGTGTCCAGCTCCCAGCTTAACACCATAGTGACGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102451 GTGGGCCCTAGCAGTGTCCAGCTCCCAGCTTAACACCATAGTGACGGTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2501 ATCACCATCACCCTCACCACCCAGCAGTTGGTGGGGTTTCAGGAGTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102501 ATCACCATCACCCTCACCACCCAGCAGTTGGTGGGGTTTCAGGAGTAGTT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2551 GGGGGAACTGGGGGAGACTTGGCAGGGTTCCGCCACCATGAGAAAAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102551 GGGGGAACTGGGGGAGACTTGGCAGGGTTCCGCCACCATGAGAAAAATGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2601 TGGGGTGGTGCTGTTTCCTCCTGGGGGAGGCTGTGGTAGTGGCAGTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102601 TGGGGTGGTGCTGTTTCCTCCTGGGGGAGGCTGTGGTAGTGGCAGTATGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2651 TACTAGATCGAGAGAGGCCACAGCCTGCCCCCTGCACAGTGGGATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102651 TACTAGATCGAGAGAGGCCACAGCCTGCCCCCTGCACAGTGGGATTTGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2701 GACTGTCTCTATGGAACAGTGCCCAAATTAAAGGAACTGCACGTGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102701 GACTGTCTCTATGGAACAGTGCCCAAATTAAAGGAACTGCACGTGCACCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2751 TCCTGGCATGCAATACCCAGACTTACAGCAGGATGCCAGGCTCAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102751 TCCTGGCATGCAATACCCAGACTTACAGCAGGATGCCAGGCTCAAAGAAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2801 CCCTTCTCTTCTCGGCTGAAAAGGGCTTCACAGACCACCAAACCCAAAAA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 102801 CCCTTCTCTTCTCGGCTGGAAAGGGCTTCACAGACCACCAAACCCAAAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2851 AGTGATTACCTCGAGTTAAGGGCCAAACTTCAAACCAAGCCGGATTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102851 AGTGATTACCTCGAGTTAAGGGCCAAACTTCAAACCAAGCCGGATTACCT

   2900     .    :    .    :    .    :
   2901 CGAAGTCCTGGAGAAGACAACATACAGGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 102901 CGAAGTCCTGGAGAAGACAACATACAGGTTC