seq1 = pF1KSDA0845.tfa, 3078 bp
seq2 = pF1KSDA0845/gi568815576f_29380263.tfa (gi568815576f:29380263_29590700), 210438 bp

>pF1KSDA0845 3078
>gi568815576f:29380263_29590700 (Chr22)

1-883  (100001-100883)   100% ->
884-1083  (103113-103312)   100% ->
1084-1208  (105461-105585)   100% ->
1209-1545  (108587-108923)   100% ==
1648-1809  (108924-109085)   93% ->
1810-1856  (109128-109174)   93% ->
1857-3078  (109236-110438)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGCTTCGGCGGCGCGGACGCGCTGCTGGGCGCCCCGTTCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGCTTCGGCGGCGCGGACGCGCTGCTGGGCGCCCCGTTCGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCATGGCGGCGGCAGCCTCCACTACGCGCTAGCCCGAAAGGGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCATGGCGGCGGCAGCCTCCACTACGCGCTAGCCCGAAAGGGTGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCGGGACGCGCTCCGCCGCTGGCTCCTCCAGCGGCTTCCACTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGCGGGACGCGCTCCGCCGCTGGCTCCTCCAGCGGCTTCCACTCGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACACGGACGTCCGTGAGCTCCGTGTCCGCCTCGCCCAGCCGCTTCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACACGGACGTCCGTGAGCTCCGTGTCCGCCTCGCCCAGCCGCTTCCGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCAGGCGCCGCCTCAAGCACCGACTCGCTGGACACGCTGAGCAACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCAGGCGCCGCCTCAAGCACCGACTCGCTGGACACGCTGAGCAACGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGAGGGCTGCATGGTGGCGGTGGCCACCTCACGCAGTGAGAAGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGAGGGCTGCATGGTGGCGGTGGCCACCTCACGCAGTGAGAAGGAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCAGGCGCTGAACGACCGCTTCGCCGGGTACATCGACAAGGTGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCAGGCGCTGAACGACCGCTTCGCCGGGTACATCGACAAGGTGCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGAGGCGCACAACCGCAGCCTGGAGGGCGAGGCTGCGGCGCTGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGAGGCGCACAACCGCAGCCTGGAGGGCGAGGCTGCGGCGCTGCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCAGCAGGCGGGCCGCTCCGCTATGGGCGAGCTGTACGAGCGCGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCAGCAGGCGGGCCGCTCCGCTATGGGCGAGCTGTACGAGCGCGAGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCGAGATGCGCGGCGCGGTGCTGCGCCTGGGCGCGGCGCGCGGTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCGAGATGCGCGGCGCGGTGCTGCGCCTGGGCGCGGCGCGCGGTCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACGCCTGGAGCAGGAGCACCTGCTCGAGGACATCGCGCACGTGCGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACGCCTGGAGCAGGAGCACCTGCTCGAGGACATCGCGCACGTGCGCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTAGACGACGAGGCCCGGCAGCGAGAGGAGGCCGAGGCGGCGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTAGACGACGAGGCCCGGCAGCGAGAGGAGGCCGAGGCGGCGGCCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGCTGGCGCGCTTCGCGCAGGAGGCCGAGGCGGCGCGCGTGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGCTGGCGCGCTTCGCGCAGGAGGCCGAGGCGGCGCGCGTGGACCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGAAGGCGCAGGCGCTGCAGGAGGAGTGCGGCTACCTGCGGCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAGAAGGCGCAGGCGCTGCAGGAGGAGTGCGGCTACCTGCGGCGCCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCAGGAAGAGGTGGGCGAGCTGCTCGGCCAGATCCAGGGCTCCGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCAGGAAGAGGTGGGCGAGCTGCTCGGCCAGATCCAGGGCTCCGGCGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCGCAGGCGCAGATGCAGGCCGAGACGCGCGACGCCCTGAAGTGCGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCGCAGGCGCAGATGCAGGCCGAGACGCGCGACGCCCTGAAGTGCGACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACGTCGGCGCTGCGCGAGATTCGCGCGCAGCTTGAAGGCCACGCGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACGTCGGCGCTGCGCGAGATTCGCGCGCAGCTTGAAGGCCACGCGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAGCACGCTGCAGTCCGAGGAGTGGTTCCGAG         TGAGGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100851 AGAGCACGCTGCAGTCCGAGGAGTGGTTCCGAGGTA...CAGTGAGGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GACCGACTGTCGGAGGCAGCCAAGGTGAACACAGACGCTATGCGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103121 GACCGACTGTCGGAGGCAGCCAAGGTGAACACAGACGCTATGCGCTCAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCAGGAGGAGATAACTGAGTACCGGCGTCAGCTGCAGGCCAGGACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103171 GCAGGAGGAGATAACTGAGTACCGGCGTCAGCTGCAGGCCAGGACCACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 AGCTGGAGGCACTGAAAAGCACCAAGGACTCACTGGAGAGGCAGCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103221 AGCTGGAGGCACTGAAAAGCACCAAGGACTCACTGGAGAGGCAGCGCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAGCTGGAGGACCGTCATCAGGCCGACATTGCCTCCTACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103271 GAGCTGGAGGACCGTCATCAGGCCGACATTGCCTCCTACCAGGTG...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1084  GAAGCCATTCAGCAGCTGGACGCTGAGCTGAGGAACACCAAGTGGGAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105460 GGAAGCCATTCAGCAGCTGGACGCTGAGCTGAGGAACACCAAGTGGGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TGGCCGCCCAGCTGCGAGAATACCAGGACCTGCTCAATGTCAAGATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105510 TGGCCGCCCAGCTGCGAGAATACCAGGACCTGCTCAATGTCAAGATGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTGGATATAGAGATAGCCGCTTACAG         AAAACTCCTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105560 CTGGATATAGAGATAGCCGCTTACAGGTG...CAGAAAACTCCTGGAAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGAAGAGTGTCGGATTGGCTTTGGCCCAATTCCTTTCTCGCTTCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108602 TGAAGAGTGTCGGATTGGCTTTGGCCCAATTCCTTTCTCGCTTCCAGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GACTCCCCAAAATTCCCTCTGTGTCCACTCACATAAAGGTGAAAAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108652 GACTCCCCAAAATTCCCTCTGTGTCCACTCACATAAAGGTGAAAAGCGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 GAGAAGATCAAAGTGGTGGAGAAGTCTGAGAAAGAAACTGTGATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108702 GAGAAGATCAAAGTGGTGGAGAAGTCTGAGAAAGAAACTGTGATTGTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GGAACAGACAGAGGAGACCCAAGTGACTGAAGAAGTGACTGAAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108752 GGAACAGACAGAGGAGACCCAAGTGACTGAAGAAGTGACTGAAGAAGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AGAAAGAGGCCAAAGAGGAGGAGGGCAAGGAGGAAGAAGGGGGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108802 AGAAAGAGGCCAAAGAGGAGGAGGGCAAGGAGGAAGAAGGGGGTGAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAGGAGGCAGAAGGGGGAGAAGAAGAAACAAAGTCTCCCCCAGCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108852 GAGGAGGCAGAAGGGGGAGAAGAAGAAACAAAGTCTCCCCCAGCAGAAGA

   1550     .    :    .    :
   1524 GGCTGCATCCCCAGAGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||
 108902 GGCTGCATCCCCAGAGAAGGAA

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GCCAAGTCTCCAGCAAAGGAAGAGGCAAAGTCACCGCCTGAGGCCAAGTC
        |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 108924 GCCAAGTCACCAGTAAAGGAAGAGGCAAAGTCACCGGCTGAGGCCAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 CCCAGAGAAGGAGGAAGCAAAATCTCCAGCTGAGGTCAAGTCCCCCGAGA
        |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||
 108974 CCCAGAGAAGGAGGAAGCAAAATCCCCAGCCGAAGTCAAGTCCCCTGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 AGGCCAAGTCCCCAGCAAAGGAAGAGGCAAAGTCACCGGCTGAGGCCAAG
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 109024 AGGCCAAGTCTCCAGCAAAGGAAGAGGCAAAGTCACCGCCTGAGGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 TCTCCAGAGAAG         GCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAA
        || |||||||||>>>...>>>|||||||||||||  |||||||| |||||
 109074 TCCCCAGAGAAGGAG...AAGGCCAAGTCCCCAGCAAAGGAAGAGGCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 GTCACCGGCTGAGGCCAA         GTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>-||||||||||||||||||||||
 109157 GTCACCGGCTGAGGCCAAGTC...AAG TCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 AATCTCCAGCTGAGGTCAAGTCCCCGGAAAAGGCCAAGTCTCCAACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109258 AATCTCCAGCTGAGGTCAAGTCCCCGGAAAAGGCCAAGTCTCCAACGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 GAGGAAGCAAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTC
        |||||||---------|-----|----|||||||||||||||||||||||
 109308 GAGGAAG         C     A    AAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 CCCAGAGAAGGAAGAGGCCAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109340 CCCAGAGAAGGAAGAGGCCAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 AGGCAGAAGCAAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109390 AGGCAGAAGCAAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGCAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 GCAAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109440 GCAAAGTCCCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 CCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGTCCCCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109490 CCCTGAGAAGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGTCCCCTGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2180 AGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGACCCCCGAGAAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109540 AGGCCAAGTCCCCAGTGAAGGAAGAAGCAAAGACCCCCGAGAAGGCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2230 TCCCCAGTGAAGGAAGAAGCCAAGTCCCCAGAGAAGGCCAAGTCCCCAGA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 109590 TCCCCAGTGAAGGAAGAAGCTAAGTCCCCAGAGAAGGCCAAGTCCCCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2280 GAAGGCCAAGACTCTTGATGTGAAGTCTCCAGAAGCCAAGACTCCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109640 GAAGGCCAAGACTCTTGATGTGAAGTCTCCAGAAGCCAAGACTCCAGCGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AGGAGGAAGCAAGGTCCCCTGCAGACAAATTCCCTGAAAAGGCCAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109690 AGGAGGAAGCAAGGTCCCCTGCAGACAAATTCCCTGAAAAGGCCAAAAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 CCTGTCAAGGAGGAGGTCAAGTCCCCAGAGAAGGCGAAATCTCCCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109740 CCTGTCAAGGAGGAGGTCAAGTCCCCAGAGAAGGCGAAATCTCCCCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 GGAGGATGCCAAGGCCCCTGAGAAGGAGATCCCAAAAAAGGAAGAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109790 GGAGGATGCCAAGGCCCCTGAGAAGGAGATCCCAAAAAAGGAAGAGGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 AGTCCCCAGTGAAGGAGGAGGAGAAGCCCCAGGAGGTGAAAGTCAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109840 AGTCCCCAGTGAAGGAGGAGGAGAAGCCCCAGGAGGTGAAAGTCAAAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CCCCCAAAGAAGGCAGAGGAAGAGAAAGCCCCTGCCACACCAAAAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109890 CCCCCAAAGAAGGCAGAGGAAGAGAAAGCCCCTGCCACACCAAAAACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GGAGAAGAAGGACAGCAAGAAAGAGGAGGCACCCAAGAAGGAGGCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109940 GGAGAAGAAGGACAGCAAGAAAGAGGAGGCACCCAAGAAGGAGGCTCCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2630 AGCCCAAGGTGGAGGAGAAGAAGGAACCTGCTGTCGAAAAGCCCAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109990 AGCCCAAGGTGGAGGAGAAGAAGGAACCTGCTGTCGAAAAGCCCAAAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 TCCAAAGTTGAAGCCAAGAAGGAAGAGGCTGAAGATAAGAAAAAAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110040 TCCAAAGTTGAAGCCAAGAAGGAAGAGGCTGAAGATAAGAAAAAAGTCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CACCCCAGAGAAGGAGGCTCCTGCCAAGGTGGAGGTGAAGGAAGACGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110090 CACCCCAGAGAAGGAGGCTCCTGCCAAGGTGGAGGTGAAGGAAGACGCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 AACCCAAAGAAAAGACAGAGGTGGCCAAGAAGGAACCAGATGATGCCAAG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 110140 AACCCAAAGAAAAGACAGAGGTAGCCAAGAAGGAACCAGATGATGCCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GCCAAGGAACCCAGCAAACCAGCAGAGAAGAAGGAGGCAGCACCGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110190 GCCAAGGAACCCAGCAAACCAGCAGAGAAGAAGGAGGCAGCACCGGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 AAAAGACACCAAGGAGGAGAAGGCCAAGAAGCCTGAGGAGAAACCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110240 AAAAGACACCAAGGAGGAGAAGGCCAAGAAGCCTGAGGAGAAACCCAAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 CAGAGGCCAAAGCCAAGGAAGATGACAAGACCCTCTCAAAAGAGCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110290 CAGAGGCCAAAGCCAAGGAAGATGACAAGACCCTCTCAAAAGAGCCTAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 AAGCCTAAGGCAGAAAAGGCTGAAAAATCCTCCAGCACAGACCAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110340 AAGCCTAAGGCAGAAAAGGCTGAAAAATCCTCCAGCACAGACCAAAAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3030 CAGCAAGCCTCCAGAGAAGGCCACAGAAGACAAGGCCGCCAAGGGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110390 CAGCAAGCCTCCAGAGAAGGCCACAGAAGACAAGGCCGCCAAGGGGAAG