seq1 = pF1KSDA0831.tfa, 1137 bp
seq2 = pF1KSDA0831/gi568815584r_55269622.tfa (gi568815584r:55269622_55490980), 221359 bp

>pF1KSDA0831 1137
>gi568815584r:55269622_55490980 (Chr14)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-308  (104885-105122)   100% ->
309-538  (108790-109019)   100% ->
539-656  (110291-110408)   100% ->
657-747  (112907-112997)   100% ->
748-833  (113077-113162)   100% ->
834-1137  (121056-121359)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTGCAAGATGAGGATTGAACAGTTAAAACAAACAATATGTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTGCAAGATGAGGATTGAACAGTTAAAACAAACAATATGTAAAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAATGAAGAAATGGAGAAAA         ATTCTGAAGGCCTTCTCAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 AAATGAAGAAATGGAGAAAAGTA...TAGATTCTGAAGGCCTTCTCAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAAGGAAAAGAATCAGAAGCTTTACAGTCGAGCACAACGGCACCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104906 CCAAGGAAAAGAATCAGAAGCTTTACAGTCGAGCACAACGGCACCAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAAGGAGAAGATTCAGAGGCATAATCGCAAACTTGGTGACCTGGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104956 AAAAAGGAGAAGATTCAGAGGCATAATCGCAAACTTGGTGACCTGGTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAAAAGACCATTGACTTAAGAAGTCATTATGAGCGTCTGGCAAATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105006 AAAAAAGACCATTGACTTAAGAAGTCATTATGAGCGTCTGGCAAATCTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACGATCCCATATATTAGAGCTCACCTCTGTCATTTTTCCAATCGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105056 GACGATCCCATATATTAGAGCTCACCTCTGTCATTTTTCCAATCGAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTAAAGACGGGTGTGAG         AGACCCCGCAGATGTGTCTTCAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105106 GTAAAGACGGGTGTGAGGTA...TAGAGACCCCGCAGATGTGTCTTCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGTGACAGTGCCATGACCTCCAGCACTGTGAGCAAGCTTGCTGAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108814 GAGTGACAGTGCCATGACCTCCAGCACTGTGAGCAAGCTTGCTGAAGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGAGGACAACTTACCTCTCAGGACGATGGGTCTGTGACGATCACAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108864 GGAGGACAACTTACCTCTCAGGACGATGGGTCTGTGACGATCACAACGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACACCAGCATTAGCATTACAGGGCCTTGGATTAGCCTCCCTAACAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108914 GACACCAGCATTAGCATTACAGGGCCTTGGATTAGCCTCCCTAACAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACTACTCTGCCTACTACAGCTGGGTGGAGGAGAAGAAAACAACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108964 GGACTACTCTGCCTACTACAGCTGGGTGGAGGAGAAGAAAACAACCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGCCTG         ACATGGAGCAGAGTAACCCTGCCTACACCATCAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109014 GGCCTGGTG...CAGACATGGAGCAGAGTAACCCTGCCTACACCATCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTGCGCTGTGCTATGCAACTCAGCTGGTCAACATTCTGTCTCATATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110326 GCTGCGCTGTGCTATGCAACTCAGCTGGTCAACATTCTGTCTCATATACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGATGTAAATCTTCCCAAAAAGCTCTGCAACAG         TGAATTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110376 TGATGTAAATCTTCCCAAAAAGCTCTGCAACAGGCA...CAGTGAATTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTGGCGAAAATCTAAGCAAGCAGAAATTTACTCGAGCAGTGAAGAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112915 GTGGCGAAAATCTAAGCAAGCAGAAATTTACTCGAGCAGTGAAGAAACTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATGCAAATATTCTTTACCTTTGTTTTTCTCAG         CATGTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 112965 AATGCAAATATTCTTTACCTTTGTTTTTCTCAGGTA...TAGCATGTAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTTAGATCAATTACAACCACTGCATACCCTCAGGAATCTAATGTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113085 TTTAGATCAATTACAACCACTGCATACCCTCAGGAATCTAATGTACCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCAGTCCAAGCTCTGAACACCTAGGCAG         GTCAGGGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 113135 TCAGTCCAAGCTCTGAACACCTAGGCAGGTA...CAGGTCAGGGCCCTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAGTACGAGCAGACCTTGAGGAGTCCATGGAATTTGTGGATCCCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121069 GAAGTACGAGCAGACCTTGAGGAGTCCATGGAATTTGTGGATCCCGGAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGCTGGAGAATCAGATGAGAGCGGAGATGAGCGCGTCAGCGATGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121119 TGCTGGAGAATCAGATGAGAGCGGAGATGAGCGCGTCAGCGATGAAGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCGACCTGGGCACAGACTGGGAGAACTTGCCTAGTCCCCGGTTTTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121169 CCGACCTGGGCACAGACTGGGAGAACTTGCCTAGTCCCCGGTTTTGTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATCCCTTCCCAGTCTGTGGAAGTCTCCCAGAGTCAGAGCACCCAGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121219 ATCCCTTCCCAGTCTGTGGAAGTCTCCCAGAGTCAGAGCACCCAGGCGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCCACCCATCGCGAGCAGCAGTGCAGGTGGGATGATCTCCTCTGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121269 CCCACCCATCGCGAGCAGCAGTGCAGGTGGGATGATCTCCTCTGCAGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCTCGGTGACCTCCTGGTTTAAAGCTTACACTGGACACCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121319 CCTCGGTGACCTCCTGGTTTAAAGCTTACACTGGACACCGT