seq1 = pF1KSDA0798.tfa, 1956 bp
seq2 = pF1KSDA0798/gi568815579r_51933723.tfa (gi568815579r:51933723_52141609), 207887 bp

>pF1KSDA0798 1956
>gi568815579r:51933723_52141609 (Chr19)

(complement)

13-142  (100001-100130)   100% ->
143-238  (101027-101122)   100% ->
239-1956  (106170-107887)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 CAGGAATTGCTGACACTGGAGGATGTTACTGTGGAGTTCACCTGGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGAATTGCTGACACTGGAGGATGTTACTGTGGAGTTCACCTGGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     63 GTGGCAGCTCCTGGGCCCTTTTCAGAAGGATTTGTACCGGGATGTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGGCAGCTCCTGGGCCCTTTTCAGAAGGATTTGTACCGGGATGTGATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    113 TGGAGATCTACAGCAACCTGCTATCAATGG         GTTATCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100101 TGGAGATCTACAGCAACCTGCTATCAATGGGTG...CAGGTTATCAAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 AGCAAACCAGATGCACTCTCCAAGTTGGAACGAGGAGAAGAACCATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101038 AGCAAACCAGATGCACTCTCCAAGTTGGAACGAGGAGAAGAACCATGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    204 AATGGAAGATGAAAGGCACAGTCGAATCTGTCCAG         AAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101088 AATGGAAGATGAAAGGCACAGTCGAATCTGTCCAGGTA...TAGAAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 ACGAAGTTGATGATCATCTGCAGGATCACTTGGAAAATCAAAGGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106176 ACGAAGTTGATGATCATCTGCAGGATCACTTGGAAAATCAAAGGATGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 AAGAGTGTGGAACAATACCATGAACATAATGCATTTGGAAATACTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106226 AAGAGTGTGGAACAATACCATGAACATAATGCATTTGGAAATACTGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 TCAAACCAAAAGCCTTTGTCTTTTCAGGGAAAATCATGATACATTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106276 TCAAACCAAAAGCCTTTGTCTTTTCAGGGAAAATCATGATACATTTGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395 TATATATAAAAACTTTGAAATCAAATTTAAGTTTAGTCAACCAGAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106326 TATATATAAAAACTTTGAAATCAAATTTAAGTTTAGTCAACCAGAACAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    445 AGCTGTGAAATTAACAACTCTACTAAATTTAGTGGAGATGGGAAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106376 AGCTGTGAAATTAACAACTCTACTAAATTTAGTGGAGATGGGAAATCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    495 TCTTCATGGTAACTATGAAGAACTTTATTCTGCAGCTAAATTCTCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106426 TCTTCATGGTAACTATGAAGAACTTTATTCTGCAGCTAAATTCTCTGTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    545 GTACAAAAGCCAATAGCACTAAATCCCAAGTCAGTAAGCATCAGAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106476 GTACAAAAGCCAATAGCACTAAATCCCAAGTCAGTAAGCATCAGAGAACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595 CATGAAATAGAAAAAAACCACGTATGCAGTGAATGTGGGAAAGCGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106526 CATGAAATAGAAAAAAACCACGTATGCAGTGAATGTGGGAAAGCGTTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    645 CAAGAAGTCTCAGCTCACTGATCATGAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106576 CAAGAAGTCTCAGCTCACTGATCATGAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695 CTTATGGATGTACTTTGTGTGCAAAAGTGTTCTCCAGAAAGTCCAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106626 CTTATGGATGTACTTTGTGTGCAAAAGTGTTCTCCAGAAAGTCCAGGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745 AATGAACATCAAAGAATTCATAAAAGAGAGAAATCTTTTATATGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106676 AATGAACATCAAAGAATTCATAAAAGAGAGAAATCTTTTATATGCAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    795 ATGTGGAAAAGTCTTCACTATGAAGAGCCGTCTGATTGAACATCAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106726 ATGTGGAAAAGTCTTCACTATGAAGAGCCGTCTGATTGAACATCAGCGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    845 CTCATACTGGAGAGAAACCCTACATATGCAATGAATGTGGAAAAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106776 CTCATACTGGAGAGAAACCCTACATATGCAATGAATGTGGAAAAGGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    895 CCAGGCAAGCGTAATCTCATTGTACATCAGCGAAATCATACTGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106826 CCAGGCAAGCGTAATCTCATTGTACATCAGCGAAATCATACTGGAGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    945 ATCCTATATATGTAGTGAATGTGGAAAAGGCTTCACTGGGAAGAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106876 ATCCTATATATGTAGTGAATGTGGAAAAGGCTTCACTGGGAAGAGCATGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    995 TTATTATACATCAGCGAACTCATACAGGAGAGAAGCCCTACATCTGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106926 TTATTATACATCAGCGAACTCATACAGGAGAGAAGCCCTACATCTGTAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1045 GAATGTGGGAAAGGCTTCACCACAAAACACTATGTCATCATACATCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106976 GAATGTGGGAAAGGCTTCACCACAAAACACTATGTCATCATACATCAACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1095 AAATCATACAGGAGAGAAACCATATATATGCAATGAATGTGGGAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107026 AAATCATACAGGAGAGAAACCATATATATGCAATGAATGTGGGAAAGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1145 TCACCATGAAGAGCCGTATGATCGAACATCAACGAACTCATACAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107076 TCACCATGAAGAGCCGTATGATCGAACATCAACGAACTCATACAGGAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1195 AAACCCTACATATGCAGTGAATGTGGAAAAGGCTTTCCCAGGAAGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107126 AAACCCTACATATGCAGTGAATGTGGAAAAGGCTTTCCCAGGAAGAGTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1245 TCTTATTGTACATCAGAGAAATCATACAGTAGAGAAGTCATATCTATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107176 TCTTATTGTACATCAGAGAAATCATACAGTAGAGAAGTCATATCTATGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1295 GTGAATGTGGAAAAGGTTTTACTGTGAAAAGCATGCTCATCATACATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107226 GTGAATGTGGAAAAGGTTTTACTGTGAAAAGCATGCTCATCATACATCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1345 CGAACTCATACAGGAGAGAAGCCCTACACATGCAGTGAATGTGGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107276 CGAACTCATACAGGAGAGAAGCCCTACACATGCAGTGAATGTGGGAAAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1395 CTTCCCCTTGAAGAGTCGGCTGATTGTACATCAGCGAACTCATACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107326 CTTCCCCTTGAAGAGTCGGCTGATTGTACATCAGCGAACTCATACTGGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1445 AGAAACCTTACAGGTGCAGTGAATGTGGGAAAGGTTTCATTGTGAATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107376 AGAAACCTTACAGGTGCAGTGAATGTGGGAAAGGTTTCATTGTGAATAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1495 GGACTGATGTTACATCAGCGAACTCATACTGGAGAGAAACCGTACATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107426 GGACTGATGTTACATCAGCGAACTCATACTGGAGAGAAACCGTACATATG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1545 CAATGAATGTGGAAAAGGTTTTGCCTTTAAGAGCAATCTTGTTGTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107476 CAATGAATGTGGAAAAGGTTTTGCCTTTAAGAGCAATCTTGTTGTACACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1595 AGCGAACTCATACTGGAGAGAAACCCTTTATGTGCAGTGAATGTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107526 AGCGAACTCATACTGGAGAGAAACCCTTTATGTGCAGTGAATGTGGAAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1645 GGCTTCACCATGAAACGCTATCTCATTGTACATCAGCAAATTCATACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107576 GGCTTCACCATGAAACGCTATCTCATTGTACATCAGCAAATTCATACAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1695 AGAGAAATCTTGTATATGTAGTGAATGTGGAAGAGGCTTTGCCAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107626 AGAGAAATCTTGTATATGTAGTGAATGTGGAAGAGGCTTTGCCAAGGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1745 CAGAGCTTGCTTTACATAAGCAAGTTCATACTGGAGAAAAACCTTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107676 CAGAGCTTGCTTTACATAAGCAAGTTCATACTGGAGAAAAACCTTATGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1795 TGTAATGAATGTGGTAAAGGCTTCACTATGAAGAGCCGTCTAATTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107726 TGTAATGAATGTGGTAAAGGCTTCACTATGAAGAGCCGTCTAATTGTTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1845 TCAACGAACTCATACAGGAGAGAAACCCTTTGTATGCAGTGAATGTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107776 TCAACGAACTCATACAGGAGAGAAACCCTTTGTATGCAGTGAATGTAGAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1895 AAGCCTTCTCCTCAAAGAGAAATCTCATTGTACATCAGCGAACTCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107826 AAGCCTTCTCCTCAAAGAGAAATCTCATTGTACATCAGCGAACTCATAAT

   1950     .    :
   1945 GGAAACAAACCC
        ||||||||||||
 107876 GGAAACAAACCC