seq1 = pF1KSDA0780.tfa, 3141 bp
seq2 = pF1KSDA0780/gi568815589f_6692989.tfa (gi568815589f:6692989_7270037), 577049 bp

>pF1KSDA0780 3141
>gi568815589f:6692989_7270037 (Chr9)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-320  (112611-112786)   100% ->
321-435  (121643-121757)   100% ->
436-629  (156519-156712)   100% ->
630-679  (187024-187073)   100% ->
680-783  (194972-195075)   100% ->
784-921  (200107-200244)   100% ->
922-1115  (287937-288130)   100% ->
1116-1354  (291178-291416)   100% ->
1355-1677  (293356-293678)   99% ->
1678-1786  (297428-297536)   100% ->
1787-1968  (318710-318891)   100% ->
1969-2182  (320800-321013)   100% ->
2183-2259  (322865-322941)   100% ->
2260-2315  (353874-353929)   100% ->
2316-2424  (356104-356212)   100% ->
2425-2610  (410697-410882)   99% ->
2611-2781  (435078-435248)   100% ->
2782-2901  (472250-472369)   100% ->
2902-3141  (476810-477049)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTGGCCGAGGTGGAAAGTCCTCTGAACCCCAGCTGTAAGATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTGGCCGAGGTGGAAAGTCCTCTGAACCCCAGCTGTAAGATAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTTCAGACCCTCCATGGAGGAGTTCCGGGAGTTCAACAAATACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTTCAGACCCTCCATGGAGGAGTTCCGGGAGTTCAACAAATACCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATACATGGAGTCTAAAGGAGCCCATCGTGCGGGTCTTGCAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 CATACATGGAGTCTAAAGGAGCCCATCGTGCGGGTCTTGCAAAGGTG...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    GTGATTCCTCCTAAGGAGTGGAAGCCAAGACAGTGCTATGATGACAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112608 TAGGTGATTCCTCCTAAGGAGTGGAAGCCAAGACAGTGCTATGATGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATAATTTGCTCATTCCAGCACCAATTCAGCAGATGGTCACAGGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112658 TGATAATTTGCTCATTCCAGCACCAATTCAGCAGATGGTCACAGGGCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGACTGTTCACTCAGTACAACATCCAGAAAAAAGCGATGACTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112708 CAGGACTGTTCACTCAGTACAACATCCAGAAAAAAGCGATGACTGTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGTTCAGGCAGCTGGCCAACAGTGGCAA         ATATTGTACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 112758 GAGTTCAGGCAGCTGGCCAACAGTGGCAAGTG...CAGATATTGTACTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAGATACTTGGATTACGAAGATTTGGAGCGCAAGTACTGGAAGAACTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121655 AAGATACTTGGATTACGAAGATTTGGAGCGCAAGTACTGGAAGAACTTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTTTTGTGGCACCTATCTATGGTGCAGATATTAATGGGAGCATATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121705 CTTTTGTGGCACCTATCTATGGTGCAGATATTAATGGGAGCATATATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAG         GGTGTGGATGAATGGAACATAGCTCGCCTCAATACAGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121755 GAGGTA...CAGGGTGTGGATGAATGGAACATAGCTCGCCTCAATACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTGGATGTGGTTGAAGAAGAGTGTGGCATTTCTATTGAGGGTGTAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156557 CTTGGATGTGGTTGAAGAAGAGTGTGGCATTTCTATTGAGGGTGTAAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCCATATCTCTATTTTGGCATGTGGAAGACCACGTTTGCATGGCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156607 CCCCATATCTCTATTTTGGCATGTGGAAGACCACGTTTGCATGGCACACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGACATGGACCTCTATAGCATTAATTATCTCCACTTTGGAGAGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156657 GAAGACATGGACCTCTATAGCATTAATTATCTCCACTTTGGAGAGCCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTCTTG         GTATGCTATACCTCCGGAGCATGGAAAACGACTTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156707 GTCTTGGCA...TAGGTATGCTATACCTCCGGAGCATGGAAAACGACTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAGACTAGCTCAAG         GTTTTTTCCCAAGCAGCTCCCAAGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 187059 AAAGACTAGCTCAAGGTA...TAGGTTTTTTCCCAAGCAGCTCCCAAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGTGATGCATTTCTTCGCCACAAGATGACATTGATTTCTCCATCAGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194998 TGTGATGCATTTCTTCGCCACAAGATGACATTGATTTCTCCATCAGTATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGAAATATGGTATTCCCTTTGACAAG         ATAACCCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 195048 GAAGAAATATGGTATTCCCTTTGACAAGGTA...CAGATAACCCAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CTGGAGAATTCATGATCACTTTCCCATATGGCTACCATGCTGGTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200120 CTGGAGAATTCATGATCACTTTCCCATATGGCTACCATGCTGGTTTTAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CATGGTTTCAACTGTGCAGAATCTACAAATTTTGCTACTGTCAGATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200170 CATGGTTTCAACTGTGCAGAATCTACAAATTTTGCTACTGTCAGATGGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TGACTATGGAAAAGTTGCCAAATTG         TGCACTTGCAGGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 200220 TGACTATGGAAAAGTTGCCAAATTGGTA...CAGTGCACTTGCAGGAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACATGGTGAAGATTTCAATGGATATCTTTGTGAGGAAATTTCAGCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 287953 ACATGGTGAAGATTTCAATGGATATCTTTGTGAGGAAATTTCAGCCAGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGATATCAGCTTTGGAAACAAGGAAAGGATATATACACCATTGATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288003 AGATATCAGCTTTGGAAACAAGGAAAGGATATATACACCATTGATCACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAAGCCTACTCCAGCATCCACCCCTGAAGTAAAAGCATGGCTGCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 288053 GAAGCCTACTCCAGCATCCACCCCTGAAGTAAAAGCATGGCTGCAGAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGAGGAAAGTAAGAAAAGCATCCCGAAG         CTTCCAGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 288103 GGAGGAAAGTAAGAAAAGCATCCCGAAGGTA...CAGCTTCCAGTGTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGGTCTACCTCTAAAAGGCCTAAGGCTGATGAGGAAGAGGAAGTGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291191 AGGTCTACCTCTAAAAGGCCTAAGGCTGATGAGGAAGAGGAAGTGTCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGAAGTCGATGGGGCAGAGGTCCCTAACCCCGACTCAGTCACAGATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291241 TGAAGTCGATGGGGCAGAGGTCCCTAACCCCGACTCAGTCACAGATGACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCAAGGTCAGTGAAAAGTCAGAAGCAGCAGTGAAGCTGAGGAACACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291291 TCAAGGTCAGTGAAAAGTCAGAAGCAGCAGTGAAGCTGAGGAACACAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GCATCTTCAGAAGAAGAGTCATCTGCTAGCAGGATGCAGGTGGAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291341 GCATCTTCAGAAGAAGAGTCATCTGCTAGCAGGATGCAGGTGGAGCAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TTTATCAGATCATATCAAACTCTCAG         GAAACAGCTGCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 291391 TTTATCAGATCATATCAAACTCTCAGGTG...CAGGAAACAGCTGCTTAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GTACATCTGTAACAGAAGACATAAAAACTGAGGATGACAAAGCTTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293371 GTACATCTGTAACAGAAGACATAAAAACTGAGGATGACAAAGCTTATGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TATAGAAGTGTACCTTCTATATCCAGTGAGGCTGATGATTCCATTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293421 TATAGAAGTGTACCTTCTATATCCAGTGAGGCTGATGATTCCATTCCATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GTCTACTGGCTATGAGAAGCCCGAGAAATCAGACCCATCCGAGCTTTCAT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293471 GTCTAGTGGCTATGAGAAGCCCGAGAAATCAGACCCATCCGAGCTTTCAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GGCCAAAGTCACCTGAGTCATGCTCATCAGTGGCAGAGAGTAATGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293521 GGCCAAAGTCACCTGAGTCATGCTCATCAGTGGCAGAGAGTAATGGTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TTAACAGAGGGAGAAGAGAGTGATGTGGAGAGCCATGGGAATGGCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293571 TTAACAGAGGGAGAAGAGAGTGATGTGGAGAGCCATGGGAATGGCCTTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 ACCTGGGGAAATCCCAGCGGTCCCCAGTGGAGAGAGAAATAGCTTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293621 ACCTGGGGAAATCCCAGCGGTCCCCAGTGGAGAGAGAAATAGCTTCAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TCCCCAGT         ATAGCAGAGGGAGAGAACAAAACCTCTAAGAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 293671 TCCCCAGTGTA...TAGATAGCAGAGGGAGAGAACAAAACCTCTAAGAGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 TGGCGCCATCCACTTAGCAGGCCTCCAGCAAGATCTCCGATGACTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 297461 TGGCGCCATCCACTTAGCAGGCCTCCAGCAAGATCTCCGATGACTCTTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GAAGCAGCAGGCGCCAAGTGATGAAG         AATTGCCTGAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 297511 GAAGCAGCAGGCGCCAAGTGATGAAGGTG...AAGAATTGCCTGAGGTTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGTCCATTGAGGAGGAAGTGGAAGAAACAGAGTCTTGGGCGAAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318725 TGTCCATTGAGGAGGAAGTGGAAGAAACAGAGTCTTGGGCGAAACCTCTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 ATCCACCTTTGGCAGACGAAGTCCCCTAACTTCGCAGCTGAGCAAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318775 ATCCACCTTTGGCAGACGAAGTCCCCTAACTTCGCAGCTGAGCAAGAGTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TAATGCAACAGTGGCCAGGATGAAGCCACACTGTGCCATCTGCACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 318825 TAATGCAACAGTGGCCAGGATGAAGCCACACTGTGCCATCTGCACTCTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TCATGCCGTACCACAAG         CCAGATAGCAGCAATGAAGAAAAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 318875 TCATGCCGTACCACAAGGTA...CAGCCAGATAGCAGCAATGAAGAAAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GATGCTAGATGGGAGACAAAATTAGATGAAGTCGTTACATCGGAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320824 GATGCTAGATGGGAGACAAAATTAGATGAAGTCGTTACATCGGAGGGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 GACTAAGCCCCTCATACCAGAGATGTGTTTTATTTATAGTGAAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320874 GACTAAGCCCCTCATACCAGAGATGTGTTTTATTTATAGTGAAGAAAATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TAGAATATTCTCCACCCAATGCCTTCCTTGAAGAGGATGGAACAAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320924 TAGAATATTCTCCACCCAATGCCTTCCTTGAAGAGGATGGAACAAGTCTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CTTATTTCCTGTGCAAAGTGCTGCGTACGGGTTCATGCAA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 320974 CTTATTTCCTGTGCAAAGTGCTGCGTACGGGTTCATGCAAGTA...TAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TTGTTATGGTATTCCTTCTCATGAGATCTGTGATGGATGGCTGTGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 322866 TTGTTATGGTATTCCTTCTCATGAGATCTGTGATGGATGGCTGTGTGCCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 GGTGCAAAAGAAATGCGTGGACAGCA         GAATGCTGTCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 322916 GGTGCAAAAGAAATGCGTGGACAGCAGTA...CAGGAATGCTGTCTCTGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 AATTTGAGAGGAGGTGCTCTTAAGCAAACGAAGAACAATAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 353889 AATTTGAGAGGAGGTGCTCTTAAGCAAACGAAGAACAATAAGTA...TAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GTGGGCCCATGTCATGTGCGCCGTTGCGGTCCCAGAAGTTCGATTCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356104 GTGGGCCCATGTCATGTGCGCCGTTGCGGTCCCAGAAGTTCGATTCACTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 ATGTCCCAGAAAGGACACAAATAGATGTAGGCAGAATACCTTTACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 356154 ATGTCCCAGAAAGGACACAAATAGATGTAGGCAGAATACCTTTACAGAGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 TTAAAATTG         AAATGCATCTTCTGCAGACACCGGGTTAAGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 356204 TTAAAATTGGTG...CAGAAATGCATCTTCTGCAGACACCGGGTTAAGAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 GGTCTCTGGAGCCTGCATCCAGTGTTCCTACGGTCGCTGCCCGGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410729 GGTCTCTGGAGCCTGCATCCAGTGTTCCTACGGTCGCTGCCCGGCCTCCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TCCATGTCACTTGTGCCCATGCTGCTGGGGTACTGATGGAGCCTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 410779 TCCATGTCACTTGTGCCCATGCTGCTGGGGTACTGATGGAGCCTGATGAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 TGGCCTTATGTGGTGAACATTACATGCTTTCGACATAAGGTCAACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410829 TGGCCTTATGTGGTGAACATTACATGCTTTCGACATAAGGTCAACCCCAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 CGTG         AAGTCCAAGGCTTGCGAGAAGGTCATTTCCGTGGGTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 410879 CGTGGTA...TAGAAGTCCAAGGCTTGCGAGAAGGTCATTTCCGTGGGTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 AAACGGTCATCACGAAGCATCGGAACACCCGGTATTACAGTTGCAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 435115 AAACGGTCATCACGAAGCATCGGAACACCCGGTATTACAGTTGCAGAGTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 ATGGCTGTGACATCGCAGACCTTCTATGAGGTCATGTTTGATGATGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 435165 ATGGCTGTGACATCGCAGACCTTCTATGAGGTCATGTTTGATGATGGCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2748 CTTTAGCAGAGACACATTTCCTGAGGATATCGTG         AGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 435215 CTTTAGCAGAGACACATTTCCTGAGGATATCGTGGTA...CAGAGCCGAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 ACTGTCTGAAGCTGGGCCCACCTGCTGAGGGAGAAGTCGTCCAAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 472257 ACTGTCTGAAGCTGGGCCCACCTGCTGAGGGAGAAGTCGTCCAAGTCAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2839 TGGCCCGATGGCAAACTCTATGGAGCAAAATATTTTGGATCAAATATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 472307 TGGCCCGATGGCAAACTCTATGGAGCAAAATATTTTGGATCAAATATTGC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2889 CCACATGTACCAG         GTTGAGTTTGAAGATGGATCCCAGATAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 472357 CCACATGTACCAGGTG...TAGGTTGAGTTTGAAGATGGATCCCAGATAG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 CAATGAAGAGAGAGGACATCTACACTTTAGATGAAGAGTTACCCAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476838 CAATGAAGAGAGAGGACATCTACACTTTAGATGAAGAGTTACCCAAGAGA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2980 GTGAAAGCTCGATTTGTAAGTGCTGGCAGATGCCACTTGGGGACCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476888 GTGAAAGCTCGATTTGTAAGTGCTGGCAGATGCCACTTGGGGACCTGCCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3030 AGTGAATTCCTTGTCCTCACCTCATGTTTCCCAAGCCCAGCAGGAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476938 AGTGAATTCCTTGTCCTCACCTCATGTTTCCCAAGCCCAGCAGGAAACAT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3080 ACTTGGGCTTTTGGATTAATTCTAAAAAAAGCCAATGCAACATTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 476988 ACTTGGGCTTTTGGATTAATTCTAAAAAAAGCCAATGCAACATTTTCCTT

   3300     .    :
   3130 AGTGGAACCTAT
        ||||||||||||
 477038 AGTGGAACCTAT