seq1 = pF1KSDA0770.tfa, 2625 bp
seq2 = pF1KSDA0770/gi568815583r_42060757.tfa (gi568815583r:42060757_42308153), 247397 bp

>pF1KSDA0770 2625
>gi568815583r:42060757_42308153 (Chr15)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-139  (108193-108258)   100% ->
140-204  (116594-116658)   100% ->
205-247  (116987-117029)   100% ->
248-342  (118946-119040)   100% ->
343-441  (120298-120396)   100% ->
442-534  (120791-120883)   100% ->
535-718  (123454-123637)   100% ->
719-839  (129584-129704)   100% ->
840-960  (129816-129936)   100% ->
961-1090  (134302-134431)   100% ->
1091-1233  (138288-138430)   100% ->
1234-1377  (140617-140760)   100% ->
1378-1519  (141241-141382)   100% ->
1520-1606  (141505-141591)   100% ->
1607-1680  (141922-141995)   100% ->
1681-1779  (142338-142436)   100% ->
1780-1897  (143041-143158)   100% ->
1898-2026  (143668-143796)   100% ->
2027-2129  (144426-144528)   100% ->
2130-2175  (144759-144804)   100% ->
2176-2325  (145673-145822)   100% ->
2326-2460  (145988-146122)   100% ->
2461-2552  (146381-146472)   100% ->
2553-2625  (147325-147397)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATCGACTGTCTGGCTGCCTGGG         AGGAATGGCTTCTTGTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 AATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGGTG...CAGAGGAATGGCTTCTTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108211 GAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140        GTTGCAACAGATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108261 A...TAGGTTGCAACAGATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCTCCAAAAAGATTCAGCAG         ATCCATGTGGTTTCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 116637 CTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGGTA...CAGATCCATGTGGTTTCCCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAG         AAAATAACATTTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 117006 TTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGGTA...CAGAAAATAACATTTATGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTACGGTTTCAAAGGCAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118963 CATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTACGGTTTCAAAGGCAAAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAG         CACACAGAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 119013 AGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGGTA...CAGCACACAGAGACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 GTGAGGAGGTGTTACGGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120311 GTGAGGAGGTGTTACGGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAG         GGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 120361 TATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGTA...CAGGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 CTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120796 CTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 120846 TCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGGGTA...TAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123457 GATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123507 GCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123557 ATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGG         AGCACCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 123607 CTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGGTG...CAGAGCACCAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129594 TCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 AACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129644 AACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACCTCAGGAGG         ATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129694 ACCTCAGGAGGGTA...CAGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129846 TTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 129896 TTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGTA...TAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134302 GAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134352 CAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAG         ATCCCACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 134402 CCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGGTA...TAGATCCCACCCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 GTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138299 GTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138349 GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAG         AAACGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 138399 CTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGGTA...CAGAAACGAAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140626 CAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140676 GCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCAT         ACAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 140726 TCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATGTG...CAGACAAAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141247 GTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141297 CGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAG         CTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 141347 TCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGGTG...CAGCTCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141510 CAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 CGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGG         GCACAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 141560 CGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGTA...TAGGCACAGAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1616 ACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141931 ACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GAAGATGGCCTGAAG         ATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 141981 GAAGATGGCCTGAAGGTG...CAGATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 GGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142364 GGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1757 AGGGTCTGGCTATTCCTTATCTG         GAACACATCATCCATGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 142414 AGGGTCTGGCTATTCCTTATCTGGTA...CAGGAACACATCATCCATGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 TGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143059 TGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848 TGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143109 TGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1898          GCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143159 GTA...AAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 GGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143709 GGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 TGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATG         GCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 143759 TGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGTG...TAGGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 TCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144429 TCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2080 GCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144479 GCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130          GTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144529 GTA...CAGGTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 AAGAT         GTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144800 AAGATGTG...CAGGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 CCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145709 CCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145759 AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 TGGACACCACCAAG         GCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 145809 TGGACACCACCAAGGTC...TAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 CAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146015 CAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 ACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146065 ACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAAT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 TCCTGAGG         GTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 146115 TCCTGAGGGTA...CAGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2494 AAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146414 AAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2544 TGGGAACAG         TGCATTTGCAAGATACCCCAATGGAGTGGTCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 146464 TGGGAACAGGTG...CAGTGCATTTGCAAGATACCCCAATGGAGTGGTCG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :
   2585 TCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147357 TCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT