seq1 = pF1KSDA0753.tfa, 2901 bp
seq2 = pF1KSDA0753/gi568815581r_6479750.tfa (gi568815581r:6479750_6735103), 255354 bp

>pF1KSDA0753 2901
>gi568815581r:6479750_6735103 (Chr17)

(complement)

1-93  (100001-100093)   98% ->
94-718  (106363-106987)   100% ->
719-825  (110243-110349)   100% ->
826-888  (111533-111595)   100% ->
889-1104  (112007-112222)   100% ->
1105-1315  (114106-114316)   100% ->
1316-1545  (122956-123185)   100% ->
1546-1712  (124944-125110)   100% ->
1713-1829  (126640-126756)   100% ->
1830-1919  (127834-127923)   100% ->
1920-2009  (128142-128231)   100% ->
2010-2088  (134646-134724)   100% ->
2089-2172  (135784-135867)   100% ->
2173-2358  (138761-138946)   100% ->
2359-2440  (140051-140132)   100% ->
2441-2561  (144474-144594)   99% ->
2562-2786  (145101-145325)   100% ->
2787-2901  (155240-155354)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACCAGGCCAGCCAGCTTCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACCAGGCCAGCCAGCTTCAACCTGTGTTCATCTAGCACCTAGGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAACTTGATGGGAGGAGTGACCCCAAAGTACTTCAGACCCAG       
        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 CCAACTTGATGGGAGGAGCGACCCCAAAGTACTTCAGACCCAGGTA...A

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   AACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106361 AGAACCAGCTGCAGTTTAATAGGAATGTTCCTACACATTCAAGCAACTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGATCCGATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106411 GCGATCCGATATTCTTGCCCACATGCCATTAGAATTGAAAAACTGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGATGCAGATTGTAGAGTTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106461 CTCATACAATGAATCATACCATTGTAAAGATGCAGATTGTAGAGTTGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106511 CTGACCTGGGCAGTTCTGTTTCATTTTCCGTCATATCCCAAGAGAGACTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCTATGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106561 AGCTATGCTGTCCACCTAGCCAGAAGAGATGTGAAACGAAGACAATTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAAGTCAGCCTCAAAGCTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106611 AAAACATATAAAAGAACATCATCTCAGAAGTCAGCCTCAAAGCTCTCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106661 AGTGTGGACATACTAAGTATAAAATACCCGACCACAGGGTGGAAAGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAATCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106711 GAATCAAAGAGTCAAGCAGCCTGTCAGTGTAGCCACCAGCCATCCAAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGAAATCTCCAGCTCTGGTGCCAAAGTATACCTTTACTCATCTCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106761 AGAAATCTCCAGCTCTGGTGCCAAAGTATACCTTTACTCATCTCATCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106811 GCCAGTCAGATCTTACTGTGCCAAATTCGCCACCCACCCATGATCCGGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106861 CTTCAGCCTCATCCCAGGATAGGTGACCACAAAAACATAAGTGAACAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTCCAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106911 AAGCCTGCTAGAAGTCCAGCGACTCCAGAAAGAACTGAGCAGTTGTATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAG         ATAGACTAGAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 106961 ACAAAATTGAAGAGGTAACTAAAAAAGGTG...CAGATAGACTAGAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCTTTGGATCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110257 GCTTTGGATCCAGATGAAGAACGTCGAATCCGTATCAGGAGACAGGAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCCTCCAGCAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 110307 AGCTGCTCGCTCTGCCCGAATGCTCTACGTCCTCCAGCAGCAGGTG...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    826   GTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111531 AGGTAAAAGAAATCCAGGAAGAATTGGATAAATTGAGTCCACATAAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAACACACTAAGAAG         TCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 111581 AAACACACTAAGAAGGTA...CAGTCATGGGCAATGTCTAAGCTGGCGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112033 TGCCCATCGAGGAGCCATTCGGGCCTTACAGATGTTTGTCACTCAGTTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112083 CTGACCGAGGGGAGCATCCACTTCCTGCTCGGTGTAAGGAACTGGGCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTTATTCGCCAGCTTTCACTTTGTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112133 CTTATTCGCCAGCTTTCACTTTGTTCTGTCAAGCTGGATGCAGACCCTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112183 TGTTCCTGATGTGGTTATAGATATTCTGCAACAAATTGAGGTA...CAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CTTTGGAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114107 CTTTGGAATCTCTCCTGGAAAAGAAACTGTCACCAAAAAAGGTGAAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCCTATCGGTAGCCAAAAGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114157 TGTTTCAGTGAAATTCGGAGCAGATTTCCTATCGGTAGCCAAAAGGCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114207 GGAGAGATGGCCAAGTACATCACCAAAGGGTGAGAGGAGGCCCCTCACAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CAAAGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114257 CAAAGGACACATTCCCACAGGAAACAAGTCGACCTTCTGTAGCAAAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CTTCTTGCCG         ATAAGTATCAGCCCGATACGGAGCTTCCGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 114307 CTTCTTGCCGGTA...TAGATAAGTATCAGCCCGATACGGAGCTTCCGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122987 GACCCAGAGGTTGCAGAGTGAGCTTGATGTATTAGATGCGGATATAGTTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TGGAAGAAGGACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123037 TGGAAGAAGGACCATTTATTCTAGACCAAAGTGCAAGCTTCAAAGACGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAAAGAAGCCTGTGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123087 GTGTTAGCCGTGGCAAAAACAAAAGCAGGGAAAAAGAAGCCTGTGACTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 123137 GAATGTGCCGTTTAGGAAGAAAGATACTCTGGCGCCAGCAAGACAGCAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546         GGACTCCGCAAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123187 TA...CAGGGACTCCGCAAAGCTGAAAGAGGTAGACAAAGCCAACCTCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 AGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATTAAAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124986 AGTAAAAGCAGAGTGCAGCAGACAACAGTTTCATCCAGATTAAAAATGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125036 CCGGCAGCCTGTGAAAGACCGCAAGGCACCATGGATACCCCCAAACCCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CATCCCCACCAGCGTCTCCTAAATG         TGCTGCATGGCTAAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 125086 CATCCCCACCAGCGTCTCCTAAATGGTA...CAGTGCTGCATGGCTAAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126656 GTGAAAACTAGCCCCAGAGATGCCACAAAAGAGCCTCTCCAGCAAGAAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126706 TCCTCAAGAGGAAAGTCACCTGACAGGTGCTGTTGAGCATGAAGCAGCCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 G         GCTCGCTTGGCTTGATGCTGAAACTTCCAAAAGATTGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126756 GGTT...TAGGCTCGCTTGGCTTGATGCTGAAACTTCCAAAAGATTGAAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127874 GAACTAGAAGAGTTAAAAGCCAAGGAAATTGACAGCATGCAAAAACAGAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920          GCTTGATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127924 GTA...TAGGCTTGATTGGCTTGATGCTGAAACTTCTAGAAGAACAAAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 AACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTCCAACAATTGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128183 AACTGAATGAGCTCAAAGCTGAAGAAATGTATAGACTCCAACAATTGAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2010         TGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128233 TA...TAGTGTTTCTGCCACCCACTTAGCAGACAAGGTAGAGGAGGCAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 TCTGGATCGTTTGAAGCCTCTCTTGGTCAAGGCCCAG         AGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 134688 TCTGGATCGTTTGAAGCCTCTCTTGGTCAAGGCCCAGGTA...TAGAGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135788 TCAATTCTACTACAGAAGCAAATATTCATTTGAAAGATGGCTCGTCAGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 AACACAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAG         GTTGCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 135838 AACACAGCGAAAGCCCAGCCTGCACAGGAGGTA...TAGGTTGCAGCTGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138772 TGATTTTGAATCCAACAACATTCGTCAGCTTGATGATTTTTTGGAAGATT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 GTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138822 GTGCCAGTGAGCTCTGGGCTGTGACTCATGCTAAGATCTTGGGGTCTGAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2284 ACCTTAGCCACCGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138872 ACCTTAGCCACCGTTGAGGACAGCAAGGATAGCCCAGATCTGGAGATCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2334 GATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAA         AAATACCAGGAGTCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 138922 GATGCGCCGAATGGAAGAGATGGAAGTA...AAGAAATACCAGGAGTCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140067 TTCGTCAAAGATATAATAAAATCGCATATGCTGATCCTCGACTTTGGATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 CAGGAAGAAAACAATG         ACCAAAAAATCTCAGCAATAGGTGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| ||||
 140117 CAGGAAGAAAACAATGGTG...TAGACCAAAAAATCTCAGCAATAAGTGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2466 AAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144499 AAAGCCTCTATCTCCTCATCCAATCAGAATCACGAAGACAGTGGATCGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 AGGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 144549 AGGATCCAGCCGTGAACATCATGTTAGAAAGGCCCTGTAATGGCAAGTA.

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2562      TTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCAGAGAAAAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144599 ..CAGTTCCCTGGATGAAAGTGTGGGAACAGAGGAAGGATCAGAGAAAAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 AGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145146 AGAGGCCCCTCTTCTCTCCCTAGCCGAAGATTCTCAACAGAAAGAAGGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2657 GAGCTCCCCTCTTTGTCCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145196 GAGCTCCCCTCTTTGTCCCACCGGGTATGCAGCACAGCATCGGTGACTAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 TGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATGAGGCTGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145246 TGTAGTCGTTTTGAGCAGTACCTTCGGATCATATCTCATGAGGCTGTAGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 CTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAG         CTTTTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 145296 CTCCTTCAACCCGTGGCTGATAGCTGAAAGGTC...CAGCTTTTCAGAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2798 AGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155251 AGCTGGTAGATGAAGCTCTGGGTGCTGTGGCTGCTGAACTTCAGGATATG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2848 TGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155301 TGCGAAGATTATGCAGAAGCTGTGTTCACCTCAGAATTCTTAGAGGCTGC

   3050 
   2898 TACA
        ||||
 155351 TACA