seq1 = pF1KSDA0752.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KSDA0752/gi568815593f_177938838.tfa (gi568815593f:177938838_178147118), 208281 bp

>pF1KSDA0752 930
>gi568815593f:177938838_178147118 (Chr5)

1-28  (97173-97199)   96% ->
29-108  (100001-100080)   100% ==
205-215  (100476-100486)   100% ==
503-529  (100548-100574)   100% ->
530-600  (102856-102926)   98% ==
640-648  (103296-103304)   100% ==
702-733  (103357-103388)   93% ->
734-771  (107577-107614)   100% ->
772-839  (108035-108102)   100% ->
840-930  (108191-108281)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGACAAAGACACAGAGAGAGACA         TTGAGATGAAACG
        |-||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  97173 A GGTGGACAAAGACACAGAGAGAGACAGTA...TAGTTGAGATGAAACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCAACTACGGCGACTACGGGAGCTCCACCTATACAGCACATGGAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 GCAACTACGGCGACTACGGGAGCTCCACCTATACAGCACATGGAAGAAGT

    100     .    :    .
     92 ACCAAGAGGCGATGAAG
        |||||||||||||||||
 100064 ACCAAGAGGCGATGAAG

      0     .    :
    205 GTGAAGAAAAG
        |||||||||||
 100476 GTGAAGAAAAG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    503 AGACATCCTTGGGAGTTCCACAACGTG         GTGACCTGGAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100548 AGACATCCTTGGGAGTTCCACAACGTGGTA...TAGGTGACCTGGAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544 CTGGAGGAGCATGTGCCAGGGCAGACAGTCTCTGAGGAAGCCACAGGGGT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102870 CTGGAGGAGCATCTGCCAGGGCAGACAGTCTCTGAGGAAGCCACAGGGGT

    100     .
    594 TCACATG
        |||||||
 102920 TCACATG

      0     .
    640 GAAGACCTG
        |||||||||
 103296 GAAGACCTG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    702 GATGCAGGTGGACCCAGCCACACTGGCAAAGC         AATTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||| >>>...>>>|||||||||
 103357 GATGCAGGTGGACCCAGCCACACCGGCAAAGAGTA...CAGAATTGGAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    743 ACTCCACCATTACAGGCAGCCACCAGCAG         ATGTCAGCAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107586 ACTCCACCATTACAGGCAGCCACCAGCAGGTA...CAGATGTCAGCAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784 CCTTCCTCTGCACCTGCAGAAGAAGCAACAGAAAAGACCAAAGTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108047 CCTTCCTCTGCACCTGCAGAAGAAGCAACAGAAAAGACCAAAGTGGAAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    834 GGAAGT         GAAAACCAGAAAGCCCAAGAAGAAAACCAGGAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108097 GGAAGTGTG...CAGGAAAACCAGAAAGCCCAAGAAGAAAACCAGGAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    875 CCAGCAAGAAAAGCCGGTGGAATGTCCTGAAATGTTGGGACATTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108226 CCAGCAAGAAAAGCCGGTGGAATGTCCTGAAATGTTGGGACATTTTTAAT

    250     .
    925 ATATTT
        ||||||
 108276 ATATTT