Result of SIM4 for
pF1KSDA0745
seq1 = pF1KSDA0745.tfa, 2715 bp
seq2 = pF1KSDA0745/gi568815590f_21866854.tfa (gi568815590f:21866854_22105085), 238232 bp
>pF1KSDA0745 2715
>gi568815590f:21866854_22105085 (Chr8)
1-18 (52918-52935) 100% ->
19-165 (100004-100150) 100% ->
166-259 (102630-102723) 100% ->
260-426 (103291-103457) 100% ->
427-492 (105023-105088) 100% ->
493-597 (107817-107921) 100% ->
598-763 (109503-109668) 100% ->
764-789 (110917-110944) 92% ->
790-925 (117851-117986) 100% ->
926-1031 (118733-118838) 100% ->
1032-1167 (120288-120423) 100% ->
1168-1241 (120931-121004) 100% ->
1242-1328 (122150-122235) 95% ->
1329-1386 (123497-123554) 100% ->
1387-1495 (123958-124066) 100% ->
1496-1602 (125015-125121) 100% ->
1603-1691 (127510-127598) 100% ->
1692-1799 (128639-128746) 100% ->
1800-1882 (131902-131984) 100% ->
1883-2097 (132238-132452) 100% ->
2098-2236 (132683-132821) 100% ->
2237-2397 (135259-135419) 100% ->
2398-2496 (136366-136464) 100% ->
2497-2624 (137050-137177) 100% ->
2625-2715 (138142-138232) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGATCATGTGCAG AGCCTGGCCCAACTAGAGAATCT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
52918 ATGGCGGATCATGTGCAGGTG...CAGAGCCTGGCCCAACTAGAGAATCT
50 . : . : . : . : . :
42 GTGCAAACAGCTGTATGAAACCACAGACACAACCACTCGACTCCAGGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100027 GTGCAAACAGCTGTATGAAACCACAGACACAACCACTCGACTCCAGGCAG
100 . : . : . : . : . :
92 AGAAAGCCTTGGTTGAATTTACCAACAGCCCTGATTGCCTGAGCAAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100077 AGAAAGCCTTGGTTGAATTTACCAACAGCCCTGATTGCCTGAGCAAGTGC
150 . : . : . : . : . :
142 CAGCTACTCCTCGAAAGAGGAAGT TCCTCTTACTCCCAGTT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
100127 CAGCTACTCCTCGAAAGAGGAAGTGTG...CAGTCCTCTTACTCCCAGTT
200 . : . : . : . : . :
183 ACTGGCAGCTACATGCCTTACCAAGCTTGTATCACGCACAAACAACCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102647 ACTGGCAGCTACATGCCTTACCAAGCTTGTATCACGCACAAACAACCCCC
250 . : . : . : . : . :
233 TACCATTGGAACAGCGAATAGATATTC GGAACTATGTGCTC
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
102697 TACCATTGGAACAGCGAATAGATATTCGTA...TAGGGAACTATGTGCTC
300 . : . : . : . : . :
274 AACTACCTTGCCACTCGGCCGAAGTTGGCTACTTTCGTGACACAAGCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103305 AACTACCTTGCCACTCGGCCGAAGTTGGCTACTTTCGTGACACAAGCACT
350 . : . : . : . : . :
324 TATTCAGTTATATGCCAGAATCACAAAACTGGGCTGGTTTGACTGTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103355 TATTCAGTTATATGCCAGAATCACAAAACTGGGCTGGTTTGACTGTCAGA
400 . : . : . : . : . :
374 AGGATGACTATGTCTTCAGAAATGCAATCACAGACGTCACAAGGTTTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103405 AGGATGACTATGTCTTCAGAAATGCAATCACAGACGTCACAAGGTTTTTA
450 . : . : . : . : . :
424 CAG GATAGTGTTGAATACTGCATCATTGGTGTCACAATTTT
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103455 CAGGTA...CAGGATAGTGTTGAATACTGCATCATTGGTGTCACAATTTT
500 . : . : . : . : . :
465 ATCTCAGCTAACCAATGAAATTAATCAA GCAGACACCACCC
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
105061 ATCTCAGCTAACCAATGAAATTAATCAAGTA...CAGGCAGACACCACCC
550 . : . : . : . : . :
506 ATCCTTTAACCAAGCACAGAAAAATAGCCTCTTCTTTTCGCGATTCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107830 ATCCTTTAACCAAGCACAGAAAAATAGCCTCTTCTTTTCGCGATTCATCA
600 . : . : . : . : . :
556 TTATTTGATATCTTCACACTTTCCTGCAATTTACTAAAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
107880 TTATTTGATATCTTCACACTTTCCTGCAATTTACTAAAACAGGTG...CA
650 . : . : . : . : . :
598 GCTTCAGGAAAGAATCTAAACTTGAATGATGAAAGTCAGCATGGCTTGC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109502 GGCTTCAGGAAAGAATCTAAACTTGAATGATGAAAGTCAGCATGGCTTGC
700 . : . : . : . : . :
647 TCATGCAACTGCTCAAGCTCACTCATAACTGCCTCAACTTTGACTTCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109552 TCATGCAACTGCTCAAGCTCACTCATAACTGCCTCAACTTTGACTTCATC
750 . : . : . : . : . :
697 GGCACTTCCACTGATGAGTCCTCAGACGACCTGTGTACAGTGCAGATTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109602 GGCACTTCCACTGATGAGTCCTCAGACGACCTGTGTACAGTGCAGATTCC
800 . : . : . : . : . :
747 CACCAGCTGGAGATCAG CCTTCTTAGATTCTTCAACCTTGC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
109652 CACCAGCTGGAGATCAGGTA...CAGCCTTCTTAGATTCTTCAACCTTGC
850 . : . : . : . : . :
788 AG CTGTCCACCATTGGGCGTTGTGAATATGAGAAGACGT
||-->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110941 AGCTGTT...CAGCTGTCCACCATTGGGCGTTGTGAATATGAGAAGACGT
900 . : . : . : . : . :
827 GTGCACTCCTCGTGCAGTTGTTTGACCAGTCGGCCCAGTCGTACCAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117888 GTGCACTCCTCGTGCAGTTGTTTGACCAGTCGGCCCAGTCGTACCAGGAG
950 . : . : . : . : . :
877 CTGCTACAGAGCGCCAGCGCAAGCCCAATGGACATTGCAGTGCAGGAGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
117938 CTGCTACAGAGCGCCAGCGCAAGCCCAATGGACATTGCAGTGCAGGAGGG
1000 . : . : . : . : . :
926 GAAGGCTGACATGGCTGGTTTACATTATTGGAGCAGTGATCG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117988 TG...CAGGAAGGCTGACATGGCTGGTTTACATTATTGGAGCAGTGATCG
1050 . : . : . : . : . :
968 GTGGCCGGGTTTCTTTTGCCAGCACTGATGAGCAAGACGCCATGGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118775 GTGGCCGGGTTTCTTTTGCCAGCACTGATGAGCAAGACGCCATGGATGGT
1100 . : . : . : . : . :
1018 GAGCTTGTCTGTCG GGTGCTCCAGCTGATGAACCTAACAGA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
118825 GAGCTTGTCTGTCGGTA...CAGGGTGCTCCAGCTGATGAACCTAACAGA
1150 . : . : . : . : . :
1059 TTCTCGTTTGGCCCAGGCGGGTAATGAGAAGCTAGAGTTGGCCATGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120315 TTCTCGTTTGGCCCAGGCGGGTAATGAGAAGCTAGAGTTGGCCATGCTGA
1200 . : . : . : . : . :
1109 GCTTTTTTGAACAGTTTCGTAAGATCTACATTGGGGACCAAGTGCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120365 GCTTTTTTGAACAGTTTCGTAAGATCTACATTGGGGACCAAGTGCAGAAA
1250 . : . : . : . : . :
1159 TCCTCTAAG CTGTACCGCCGACTCTCAGAAGTTCTGGGCTT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
120415 TCCTCTAAGGTA...CAGCTGTACCGCCGACTCTCAGAAGTTCTGGGCTT
1300 . : . : . : . : . :
1200 GAATGATGAGACCATGGTCCTAAGCGTCTTCATAGGAAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
120963 GAATGATGAGACCATGGTCCTAAGCGTCTTCATAGGAAAAATGTA...CA
1350 . : . : . : . : . :
1242 CATCACCAACTTGAAGTACTGGGGCCGTTGTGAACCAATCACCTCCAAG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122149 GCATCACCAACTTGAAGTACTGGGGCCGTTGTGAACCAATCACCTCCAAG
1400 . : . : . : . : . :
1291 ACACTACAGCTTCTCAATGACCTGTCCATTGGGTA CAG TA
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||-|-->>>...>>>||
122199 ACACTACAGCTTCTCAATGACCTGTCCATTGGATATC CTT...CAGTA
1450 . : . : . : . : . :
1331 GCGTAAGGAAGCTAGTGAAGCTTAGTGCGGTACAGTTCATGCTGAACAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123499 GCGTAAGGAAGCTAGTGAAGCTTAGTGCGGTACAGTTCATGCTGAACAAT
1500 . : . : . : . : . :
1381 CACACG AGCGAGCACTTTTCATTTTTGGGTATTAACAATCA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
123549 CACACGGTG...TAGAGCGAGCACTTTTCATTTTTGGGTATTAACAATCA
1550 . : . : . : . : . :
1422 GTCCAACCTGACAGACATGCGGTGTCGGACTACCTTCTACACAGCACTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123993 GTCCAACCTGACAGACATGCGGTGTCGGACTACCTTCTACACAGCACTTG
1600 . : . : . : . : . :
1472 GGCGTCTCCTCATGGTGGATTTAG GAGAGGATGAAGATCAG
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
124043 GGCGTCTCCTCATGGTGGATTTAGGTA...CAGGAGAGGATGAAGATCAG
1650 . : . : . : . : . :
1513 TATGAGCAGTTCATGCTGCCACTCACAGCAGCATTTGAGGCTGTGGCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125032 TATGAGCAGTTCATGCTGCCACTCACAGCAGCATTTGAGGCTGTGGCCCA
1700 . : . : . : . : . :
1563 GATGTTTAGCACCAATAGTTTCAACGAGCAGGAGGCAAAG C
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
125082 GATGTTTAGCACCAATAGTTTCAACGAGCAGGAGGCAAAGGTG...CAGC
1750 . : . : . : . : . :
1604 GAACTCTAGTTGGCCTAGTAAGAGACCTGAGAGGGATCGCTTTCGCTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127511 GAACTCTAGTTGGCCTAGTAAGAGACCTGAGAGGGATCGCTTTCGCTTTC
1800 . : . : . : . : . :
1654 AATGCCAAGACCAGCTTCATGATGCTCTTTGAATGGAT ATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
127561 AATGCCAAGACCAGCTTCATGATGCTCTTTGAATGGATGTA...CAGATA
1850 . : . : . : . : . :
1695 TCCATCCTATATGCCAATTCTCCAACGGGCAATTGAGCTCTGGTACCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128642 TCCATCCTATATGCCAATTCTCCAACGGGCAATTGAGCTCTGGTACCATG
1900 . : . : . : . : . :
1745 ATCCAGCCTGTACTACACCTGTACTCAAGTTGATGGCTGAATTGGTTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128692 ATCCAGCCTGTACTACACCTGTACTCAAGTTGATGGCTGAATTGGTTCAT
1950 . : . : . : . : . :
1795 AATAG GTCCCAGCGACTCCAGTTTGATGTCTCTTCCCCCAA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
128742 AATAGGTA...CAGGTCCCAGCGACTCCAGTTTGATGTCTCTTCCCCCAA
2000 . : . : . : . : . :
1836 TGGCATCTTACTCTTCCGAGAAACCAGCAAGATGATAACAATGTATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
131938 TGGCATCTTACTCTTCCGAGAAACCAGCAAGATGATAACAATGTATGGTA
2050 . : . : . : . : . :
1883 GCAATCGCATCCTGACACTAGGAGAGGTCCCAAAGGATCAGGTC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131988 ...CAGGCAATCGCATCCTGACACTAGGAGAGGTCCCAAAGGATCAGGTC
2100 . : . : . : . : . :
1927 TATGCTCTGAAGCTCAAGGGCATCTCCATCTGCTTCTCCATGCTGAAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132282 TATGCTCTGAAGCTCAAGGGCATCTCCATCTGCTTCTCCATGCTGAAGGC
2150 . : . : . : . : . :
1977 TGCTCTCAGTGGGAGTTACGTCAATTTCGGAGTCTTTCGTCTCTATGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132332 TGCTCTCAGTGGGAGTTACGTCAATTTCGGAGTCTTTCGTCTCTATGGAG
2200 . : . : . : . : . :
2027 ACGATGCCCTGGACAATGCTCTGCAGACCTTCATCAAGCTGCTCCTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132382 ACGATGCCCTGGACAATGCTCTGCAGACCTTCATCAAGCTGCTCCTCTCT
2250 . : . : . : . : . :
2077 ATTCCTCACAGTGATCTCTTG GATTACCCCAAGCTCAGCCA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
132432 ATTCCTCACAGTGATCTCTTGGTA...CAGGATTACCCCAAGCTCAGCCA
2300 . : . : . : . : . :
2118 GTCTTATTATTCACTACTGGAAGTCCTGACCCAGGACCATATGAACTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132703 GTCTTATTATTCACTACTGGAAGTCCTGACCCAGGACCATATGAACTTTA
2350 . : . : . : . : . :
2168 TTGCAAGCCTGGAACCTCACGTCATCATGTATATTCTCTCTTCCATTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132753 TTGCAAGCCTGGAACCTCACGTCATCATGTATATTCTCTCTTCCATTTCT
2400 . : . : . : . : . :
2218 GAAGGACTTACTGCACTTG ACACCATGGTATGCACAGGCTG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
132803 GAAGGACTTACTGCACTTGGTA...CAGACACCATGGTATGCACAGGCTG
2450 . : . : . : . : . :
2259 CTGCTCCTGCCTGGACCACATTGTGACATACCTCTTCAAGCAGCTGTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135281 CTGCTCCTGCCTGGACCACATTGTGACATACCTCTTCAAGCAGCTGTCAC
2500 . : . : . : . : . :
2309 GTAGCACCAAGAAGAGGACCACACCCCTGAACCAGGAGAGCGACCGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135331 GTAGCACCAAGAAGAGGACCACACCCCTGAACCAGGAGAGCGACCGCTTT
2550 . : . : . : . : . :
2359 CTGCACATCATGCAGCAGCATCCAGAGATGATCCAGCAG AT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
135381 CTGCACATCATGCAGCAGCATCCAGAGATGATCCAGCAGGTA...CAGAT
2600 . : . : . : . : . :
2400 GCTGTCCACGGTGCTGAACATCATCATCTTTGAAGACTGTAGGAACCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136368 GCTGTCCACGGTGCTGAACATCATCATCTTTGAAGACTGTAGGAACCAGT
2650 . : . : . : . : . :
2450 GGTCTATGTCCCGACCACTACTTGGCTTGATATTGCTTAATGAAAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
136418 GGTCTATGTCCCGACCACTACTTGGCTTGATATTGCTTAATGAAAAGGTG
2700 . : . : . : . : . :
2497 TATTTTTCTGACCTAAGAAACAGTATTGTGAACAGCCAGCCACC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136468 ...CAGTATTTTTCTGACCTAAGAAACAGTATTGTGAACAGCCAGCCACC
2750 . : . : . : . : . :
2541 GGAGAAGCAGCAGGCCATGCACCTGTGTTTTGAGAACCTGATGGAAGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137094 GGAGAAGCAGCAGGCCATGCACCTGTGTTTTGAGAACCTGATGGAAGGCA
2800 . : . : . : . : . :
2591 TCGAGCGAAATCTTCTTACGAAAAACAGAGACAG GTTCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
137144 TCGAGCGAAATCTTCTTACGAAAAACAGAGACAGGTG...CAGGTTCACC
2850 . : . : . : . : . :
2632 CAGAACCTGTCAGCATTCCGTCGAGAAGTCAACGACTCAATGAAGAATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138149 CAGAACCTGTCAGCATTCCGTCGAGAAGTCAACGACTCAATGAAGAATTC
2900 . : . : . :
2682 CACTTATGGCGTGAATAGCAATGACATGATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||
138199 CACTTATGGCGTGAATAGCAATGACATGATGAGC