seq1 = pF1KSDA0736.tfa, 2226 bp
seq2 = pF1KSDA0736/gi568815597r_149805017.tfa (gi568815597r:149805017_150013840), 208824 bp

>pF1KSDA0736 2226
>gi568815597r:149805017_150013840 (Chr1)

(complement)

1-622  (100001-100622)   100% ->
623-803  (101861-102041)   100% ->
804-955  (102864-103015)   100% ->
956-1089  (103138-103271)   100% ->
1090-1179  (103951-104040)   100% ->
1180-1290  (104270-104380)   100% ->
1291-1379  (104561-104649)   100% ->
1380-1544  (105635-105799)   100% ->
1545-1678  (106008-106141)   100% ->
1679-1885  (106985-107191)   100% ->
1886-2045  (107802-107961)   100% ->
2046-2226  (108644-108824)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAGGGCTTCCGAGACCGGGCAGCTTTCATCCGTGGGGCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAGGGCTTCCGAGACCGGGCAGCTTTCATCCGTGGGGCCAAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTGCTAAGGAAGTCAAAAAGCATGCGGCCAAGAAGGTGGTGAAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTGCTAAGGAAGTCAAAAAGCATGCGGCCAAGAAGGTGGTGAAGGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGACAGAGTCCAGGACGAATATTCCCGAAGATCGTACTCCCGCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGACAGAGTCCAGGACGAATATTCCCGAAGATCGTACTCCCGCTTTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGAGGATGATGATGATGACTTCCCTGCTCCCAGTGATGGTTATTACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGAGGATGATGATGATGACTTCCCTGCTCCCAGTGATGGTTATTACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGAGAAGGGACCCAGGATGAGGAGGAAGGTGGTGCATCCAGTGATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGAGAAGGGACCCAGGATGAGGAGGAAGGTGGTGCATCCAGTGATGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAGGGCCATGACGAGGATGATGAGATCTATGAAGGGGAATATCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAGGGCCATGACGAGGATGATGAGATCTATGAAGGGGAATATCAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTCCCCGGGCAGAGTCTGGGGGCAAAGGCGAGCGGATGGCAGATGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTCCCCGGGCAGAGTCTGGGGGCAAAGGCGAGCGGATGGCAGATGGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCCCTGGCTGGAGTAAGGGGGGGCTTGAGTGATGGGGAGGGTCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCCCTGGCTGGAGTAAGGGGGGGCTTGAGTGATGGGGAGGGTCCCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGGCCGGGGGGAGGCACAACGACGGAAAGAACGAGAAGAACTGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGGCCGGGGGGAGGCACAACGACGGAAAGAACGAGAAGAACTGGCCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGTATGAAGCCATCCTACGGGAGTGTGGCCACGGCCGCTTCCAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGTATGAAGCCATCCTACGGGAGTGTGGCCACGGCCGCTTCCAGTGGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTGTATTTTGTGCTTGGTCTGGCGCTGATGGCTGACGGTGTGGAGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTGTATTTTGTGCTTGGTCTGGCGCTGATGGCTGACGGTGTGGAGGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGTGGTGGGCTTCGTGCTGCCCAGCGCTGAGAAAGACATGTGCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGTGGTGGGCTTCGTGCTGCCCAGCGCTGAGAAAGACATGTGCCTGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACTCCAACAAAGGCATGCTAG         GCCTCATCGTCTACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100601 GACTCCAACAAAGGCATGCTAGGTA...CAGGCCTCATCGTCTACCTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CATGATGGTGGGAGCCTTCCTCTGGGGAGGTCTGGCTGACCGGCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101880 CATGATGGTGGGAGCCTTCCTCTGGGGAGGTCTGGCTGACCGGCTGGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGAGGCAGTGTCTGCTCATCTCGCTCTCAGTCAACAGCGTCTTCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101930 GGAGGCAGTGTCTGCTCATCTCGCTCTCAGTCAACAGCGTCTTCGCCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTCTCATCTTTTGTCCAGGGTTACGGCACTTTCCTCTTCTGCCGCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101980 TTCTCATCTTTTGTCCAGGGTTACGGCACTTTCCTCTTCTGCCGCCTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTCTGGGGTTGG         GATTGGAGGGTCCATCCCCATTGTCTTCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102030 TTCTGGGGTTGGGTG...CAGGATTGGAGGGTCCATCCCCATTGTCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCTATTTCTCCGAGTTTCTGGCCCAGGAGAAACGAGGGGAGCATTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102893 CCTATTTCTCCGAGTTTCTGGCCCAGGAGAAACGAGGGGAGCATTTGAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGGCTCTGCATGTTTTGGATGATTGGTGGCGTGTACGCAGCTGCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102943 TGGCTCTGCATGTTTTGGATGATTGGTGGCGTGTACGCAGCTGCTATGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CTGGGCCATCATCCCCCACTATG         GGTGGAGTTTTCAGATGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102993 CTGGGCCATCATCCCCCACTATGGTG...CAGGGTGGAGTTTTCAGATGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GTTCTGCCTACCAGTTCCACAGCTGGAGGGTCTTCGTCCTCGTCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103156 GTTCTGCCTACCAGTTCCACAGCTGGAGGGTCTTCGTCCTCGTCTGCGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTTCCTTCTGTGTTTGCCATTGGGGCTCTGACCACGCAGCCTGAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103206 TTTCCTTCTGTGTTTGCCATTGGGGCTCTGACCACGCAGCCTGAGAGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCGTTTCTTCCTAGAG         AATGGAAAGCATGATGAGGCCTGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103256 CCGTTTCTTCCTAGAGGTG...TAGAATGGAAAGCATGATGAGGCCTGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGGTGCTGAAGCAGGTCCATGATACCAACATGCGAGCCAAAGGACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103976 TGGTGCTGAAGCAGGTCCATGATACCAACATGCGAGCCAAAGGACATCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GAGCGAGTGTTCTCA         GTAACCCACATTAAGACGATTCATCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104026 GAGCGAGTGTTCTCAGTA...CAGGTAACCCACATTAAGACGATTCATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGAGGATGAATTGATTGAGATCCAGTCGGACACAGGGACCTGGTACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104296 GGAGGATGAATTGATTGAGATCCAGTCGGACACAGGGACCTGGTACCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCTGGGGGGTCCGGGCCTTGAGCCTAGGGGGGCAG         GTTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104346 GCTGGGGGGTCCGGGCCTTGAGCCTAGGGGGGCAGGTA...TAGGTTTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GGGAATTTTCTCTCCTGTTTTGGTCCCGAATATCGGCGCATCACTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104567 GGGAATTTTCTCTCCTGTTTTGGTCCCGAATATCGGCGCATCACTCTGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GATGATGGGTGTGTGGTTCACCATGTCATTCAG         CTACTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 104617 GATGATGGGTGTGTGGTTCACCATGTCATTCAGGTG...CAGCTACTATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GCCTGACCGTCTGGTTTCCTGACATGATCCGCCATCTCCAGGCAGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105643 GCCTGACCGTCTGGTTTCCTGACATGATCCGCCATCTCCAGGCAGTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TACGCATCCCGCACCAAAGTGTTCCCCGGGGAGCGCGTAGAGCATGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105693 TACGCATCCCGCACCAAAGTGTTCCCCGGGGAGCGCGTAGAGCATGTAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TTTTAACTTCACGTTGGAGAATCAGATCCACCGAGGCGGGCAGTACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105743 TTTTAACTTCACGTTGGAGAATCAGATCCACCGAGGCGGGCAGTACTTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 ATGACAA         GTTCATTGGGCTGCGGCTCAAGTCAGTGTCCTTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105793 ATGACAAGTA...CAGGTTCATTGGGCTGCGGCTCAAGTCAGTGTCCTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 GAGGATTCCCTGTTTGAAGAGTGTTATTTTGAGGATGTCACATCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106042 GAGGATTCCCTGTTTGAAGAGTGTTATTTTGAGGATGTCACATCCAGCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CACGTTTTTCCGCAACTGCACATTCATCAACACTGTGTTCTATAACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106092 CACGTTTTTCCGCAACTGCACATTCATCAACACTGTGTTCTATAACACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679          ACCTGTTCGAGTACAAGTTTGTGAACAGCCGTCTGATAAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106142 GTA...CAGACCTGTTCGAGTACAAGTTTGTGAACAGCCGTCTGATAAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AGTACATTCCTGCACAACAAGGAGGGCTGCCCGCTAGACGTGACAGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107026 AGTACATTCCTGCACAACAAGGAGGGCTGCCCGCTAGACGTGACAGGGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 GGGCGAAGGTGCCTACATGGTATACTTTGTGAGCTTCCTGGGGACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107076 GGGCGAAGGTGCCTACATGGTATACTTTGTGAGCTTCCTGGGGACACTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 CAGTGCTTCCTGGGAATATCGTGTCTGCCCTGCTCATGGACAAGATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107126 CAGTGCTTCCTGGGAATATCGTGTCTGCCCTGCTCATGGACAAGATCGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 AGGCTCAGAATGCTTG         CTGGCTCCAGCGTGATGTCCTGTGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107176 AGGCTCAGAATGCTTGGTA...CAGCTGGCTCCAGCGTGATGTCCTGTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 CTCCTGCTTCTTCCTGTCTTTTGGGAACAGTGAGTCGGCCATGATCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107827 CTCCTGCTTCTTCCTGTCTTTTGGGAACAGTGAGTCGGCCATGATCGCTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 TGCTCTGCCTTTTTGGCGGGGTCAGCATTGCATCCTGGAATGCGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107877 TGCTCTGCCTTTTTGGCGGGGTCAGCATTGCATCCTGGAATGCGCTGGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 GTGTTGACTGTTGAACTCTACCCCTCAGACAAGAG         GACCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107927 GTGTTGACTGTTGAACTCTACCCCTCAGACAAGAGGTA...CAGGACCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 AGCTTTTGGCTTCCTGAATGCCCTGTGTAAGCTGGCAGCTGTGCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108650 AGCTTTTGGCTTCCTGAATGCCCTGTGTAAGCTGGCAGCTGTGCTGGGGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 TCAGCATCTTCACATCCTTCGTGGGAATCACCAAGGCTGCACCCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108700 TCAGCATCTTCACATCCTTCGTGGGAATCACCAAGGCTGCACCCATCCTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 TTTGCCTCAGCTGCCCTTGCCCTTGGCAGCTCTCTGGCCCTGAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108750 TTTGCCTCAGCTGCCCTTGCCCTTGGCAGCTCTCTGGCCCTGAAGCTGCC

   2300     .    :    .    :    .
   2202 TGAGACCCGGGGGCAGGTGCTGCAG
        |||||||||||||||||||||||||
 108800 TGAGACCCGGGGGCAGGTGCTGCAG