seq1 = pF1KSDA0704.tfa, 2661 bp
seq2 = pF1KSDA0704/gi568815591r_24700186.tfa (gi568815591r:24700186_24992472), 292287 bp

>pF1KSDA0704 2661
>gi568815591r:24700186_24992472 (Chr7)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-213  (120404-120520)   100% ->
214-267  (120678-120731)   100% ->
268-381  (121628-121741)   100% ->
382-549  (126236-126403)   100% ->
550-673  (127008-127131)   100% ->
674-777  (128874-128977)   100% ->
778-870  (129181-129273)   100% ->
871-1027  (130704-130860)   100% ->
1028-1158  (139839-139969)   100% ->
1159-1266  (143297-143404)   100% ->
1267-1401  (150060-150194)   100% ->
1402-1495  (151690-151783)   100% ->
1496-1746  (157737-157987)   100% ->
1747-1884  (161568-161705)   100% ->
1885-1948  (172235-172298)   100% ->
1949-2027  (175785-175863)   100% ->
2028-2172  (177270-177414)   100% ->
2173-2317  (182522-182666)   100% ->
2318-2444  (185571-185697)   100% ->
2445-2567  (188036-188158)   100% ->
2568-2661  (192194-192287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGTGATGAGAAGAACCTTGGTGTGTCCCAAAAATTGGTATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGTGATGAGAAGAACCTTGGTGTGTCCCAAAAATTGGTATCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAAGGAGCACAAGTAGCTGCTCTTCCAAGCAAGGAAGTCGACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 TTCAAGGAGCACAAGTAGCTGCTCTTCCAAGCAAGGAAGTCGACAGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GACAGCTGGGAAGTGGTGGAAGGACTGAGGGGGGAGATGAATTAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGACAGCTGGGAAGTGGTGGAAGGACTGAGGGGGGAGATGAATTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCAGGAGCCACCAGTTCAGAAAGGATTTTTGCTGAAAAAGAGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120449 ACCCAGGAGCCACCAGTTCAGAAAGGATTTTTGCTGAAAAAGAGGAAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCCTTAAAAGGCTGGCATAAG         AGATTCTTCTATCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 120499 GCCCTTAAAAGGCTGGCATAAGGTA...CAGAGATTCTTCTATCTGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGGAATCTTGAAATATGCCAAGAGCCAAACCGAT         ATAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 120697 AAGGAATCTTGAAATATGCCAAGAGCCAAACCGATGTA...CAGATAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGAGAGAAGCTGCATGGCTGCATTGATGTCGGGCTCTCAGTGATGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121634 AGAGAGAAGCTGCATGGCTGCATTGATGTCGGGCTCTCAGTGATGTCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGAAGTCATCAAAATGCATAGACCTTGACACCGAGGAGCACATCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121684 AAAGAAGTCATCAAAATGCATAGACCTTGACACCGAGGAGCACATCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTGAAG         GTCAAGTCAGAAGAAGTCTTTGATGAGTGGGTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 121734 ATCTGAAGGTG...TAGGTCAAGTCAGAAGAAGTCTTTGATGAGTGGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGAAACTTCGCCACCACAGAATGTATCGTCAGAATGAAATTGCCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126269 TCGAAACTTCGCCACCACAGAATGTATCGTCAGAATGAAATTGCCATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCACATGAAGTTAACCACTTTTTCTCAGGGTCCACCATCACAGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126319 TCCACATGAAGTTAACCACTTTTTCTCAGGGTCCACCATCACAGACTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CATCTGGGGTGTTTGACTCCATTTCAAGTAGGAAG         CGTAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 126369 CATCTGGGGTGTTTGACTCCATTTCAAGTAGGAAGGTA...CAGCGTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGTATATCAAAGCAGAATTTATTTCAAACTGGAAGCAATGTATCATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127014 AGTATATCAAAGCAGAATTTATTTCAAACTGGAAGCAATGTATCATTTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTGTGGTGGTGAGACACGAGTTCCATTATGGTTACAGTCTTCAGAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127064 TTGTGGTGGTGAGACACGAGTTCCATTATGGTTACAGTCTTCAGAGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAAAAATGCTCCAAAG         ACCTGGCGCACTGTCATGCCTAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 127114 TGGAAAAATGCTCCAAAGGTA...CAGACCTGGCGCACTGTCATGCCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGGTAGAAATGAGCCAGCTCCTGCAAAGCATGGACGTCCTGCATCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128897 CTGGTAGAAATGAGCCAGCTCCTGCAAAGCATGGACGTCCTGCATCGGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ATACTCGGCACCAGCTATCAACGCCATCCAG         GGTGGATCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 128947 ATACTCGGCACCAGCTATCAACGCCATCCAGGTG...AAGGGTGGATCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTGAAAGTCCCAAAAAGGAAAAAAGATCGCACAGGAGGTGGCGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129191 TTGAAAGTCCCAAAAAGGAAAAAAGATCGCACAGGAGGTGGCGGTCCAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCTATTGGCAAAGATGCTAAAGGAACACTGCAG         GTCCCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 129241 GCTATTGGCAAAGATGCTAAAGGAACACTGCAGGTA...CAGGTCCCGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ACCTTTTTCTGGCCCAGTAAGACTACACTCCTCCAATCCTAATTTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130712 ACCTTTTTCTGGCCCAGTAAGACTACACTCCTCCAATCCTAATTTGTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CACTAGATTTTGGAGAAGAGAAAAATTATTCTGATGGCTCTGAAACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130762 CACTAGATTTTGGAGAAGAGAAAAATTATTCTGATGGCTCTGAAACCTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TCAGAGTTTTCTAAAATGCAAGAAGATCTGTGTCATATTGCCCATAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 130812 TCAGAGTTTTCTAAAATGCAAGAAGATCTGTGTCATATTGCCCATAAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1028         TTTACTTCACTTTAAGGTCAGCTTTTAATATCATGTCAGCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130862 TA...TAGTTTACTTCACTTTAAGGTCAGCTTTTAATATCATGTCAGCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGAGAGAGAAACTGAAGCAGCTGATGGAGCAGGATGCCTCCTCCTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139881 AGAGAGAGAAACTGAAGCAGCTGATGGAGCAGGATGCCTCCTCCTCCCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TCTGCTCAGGTCATTGGTCTGAAGAACGCCCTGTCATCC         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 139931 TCTGCTCAGGTCATTGGTCTGAAGAACGCCCTGTCATCCGTA...CAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CCTAGCACAAAACACAGATCTTAAAGAACGCTTACGCAGAATCCATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143299 CCTAGCACAAAACACAGATCTTAAAGAACGCTTACGCAGAATCCATGCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGTCTCTGCTCCTCGACTCCCCCGCTGTCGCCAAGTCGGGTGACAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143349 AGTCTCTGCTCCTCGACTCCCCCGCTGTCGCCAAGTCGGGTGACAATCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCAGAG         GAAAACTCCAGAGATGAAAACCGAGCTCTAGTTCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143399 GCAGAGGTG...TAGGAAAACTCCAGAGATGAAAACCGAGCTCTAGTTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TCAGCTTTCTAATGAAAGTAGACTCTCCATCACTGACTCCCTTTCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150095 TCAGCTTTCTAATGAAAGTAGACTCTCCATCACTGACTCCCTTTCTGAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTTTTGATGCTCAGGAAGTTCTGTTATCTCCAAGCTCTTCAGAAAACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150145 TTTTTGATGCTCAGGAAGTTCTGTTATCTCCAAGCTCTTCAGAAAACGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402          ATTTCTGATGATGACTCATATGTCAGTGACATAAGTGATAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150195 GTT...TAGATTTCTGATGATGACTCATATGTCAGTGACATAAGTGATAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCTTTCCTTAGATAATCTCAGTAATGATTTAGATAATGAGAGACAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151731 TCTTTCCTTAGATAATCTCAGTAATGATTTAGATAATGAGAGACAGACCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TGG         GGCCTGTCCTTGATAGTGGTCGGGAAGCGAAGTCCCGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151781 TGGGTA...CAGGGCCTGTCCTTGATAGTGGTCGGGAAGCGAAGTCCCGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AGAAGAACGTGCCTGCCGGCGCCCTGCCCGAGCAGCAGTAACATCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157775 AGAAGAACGTGCCTGCCGGCGCCCTGCCCGAGCAGCAGTAACATCAGCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GTGGAACATCCTGAGGAACAACATCGGGAAGGACCTGTCCAAGGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157825 GTGGAACATCCTGAGGAACAACATCGGGAAGGACCTGTCCAAGGTGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TGCCGGTGGAGCTGAACGAGCCCCTGAACACGCTGCAGAGGCTCTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157875 TGCCGGTGGAGCTGAACGAGCCCCTGAACACGCTGCAGAGGCTCTGCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GAGCTGGAGTACAGCGAGCTCCTGGACAAGGCCGCGCAGATTCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157925 GAGCTGGAGTACAGCGAGCTCCTGGACAAGGCCGCGCAGATTCCCAGCCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCTGGAAAGGATG         GTATATGTGGCAGCCTTTGCCATATCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 157975 CCTGGAAAGGATGGTG...TAGGTATATGTGGCAGCCTTTGCCATATCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 CGTATGCATCTAGCTACTACCGAGCTGGAAGCAAGCCATTTAATCCGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161596 CGTATGCATCTAGCTACTACCGAGCTGGAAGCAAGCCATTTAATCCGGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTTGGAGAAACATATGAATGTATTCGGGAGGACAAGGGCTTCCAGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161646 CTTGGAGAAACATATGAATGTATTCGGGAGGACAAGGGCTTCCAGTTTTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TTCAGAACAG         GTCAGCCACCATCCGCCTATCTCTGCGTGTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 161696 TTCAGAACAGGTA...CAGGTCAGCCACCATCCGCCTATCTCTGCGTGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGCTGAGTCTAGAAATTTTGTTTTCTGGCAAG         ATGTGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 172266 ATGCTGAGTCTAGAAATTTTGTTTTCTGGCAAGGTA...CAGATGTGAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 TGGAAAAACAAATTCTGGGGCAAATCCATGGAAATTGTTCCAATTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175793 TGGAAAAACAAATTCTGGGGCAAATCCATGGAAATTGTTCCAATTGGCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AACCCATGTGACTCTGCCAGT         TTTTGGGGATCATTTTGAGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 175843 AACCCATGTGACTCTGCCAGTGTA...TAGTTTTGGGGATCATTTTGAGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 GGAACAAAGTGACCTCTTGCATCCATAACATCTTAAGCGGGCAGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177290 GGAACAAAGTGACCTCTTGCATCCATAACATCTTAAGCGGGCAGAGGTGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 ATTGAGCACTATGGAGAGATTGTCATCAAGAACCTGCATGATGATTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177340 ATTGAGCACTATGGAGAGATTGTCATCAAGAACCTGCATGATGATTCCTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTACTGCAAAGTGAATTTTATAAAG         GCAAAATACTGGAGCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 177390 CTACTGCAAAGTGAATTTTATAAAGGTA...TAGGCAAAATACTGGAGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 CTAATGCCCATGAGATTGAAGGCACAGTGTTTGACAGGAGTGGAAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182538 CTAATGCCCATGAGATTGAAGGCACAGTGTTTGACAGGAGTGGAAAAGCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 GTTCATCGGCTGTTTGGGAAATGGCATGAAAGCATCTACTGTGGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182588 GTTCATCGGCTGTTTGGGAAATGGCATGAAAGCATCTACTGTGGCGGCGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 CTCCTCTTCTGCCTGTGTATGGAGAGCAA         ATCCTATGCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 182638 CTCCTCTTCTGCCTGTGTATGGAGAGCAAGTG...TAGATCCTATGCCGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 AAGGCTACGAGCAATACTATAGCTTCACACAGTTTGCGCTGGAATTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185583 AAGGCTACGAGCAATACTATAGCTTCACACAGTTTGCGCTGGAATTAAAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GAAATGGATCCATCATCAAAGTCTTTATTGCCACCTACTGACACTCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185633 GAAATGGATCCATCATCAAAGTCTTTATTGCCACCTACTGACACTCGATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 TAGGCCAGACCAGAG         GTTTCTAGAGGAAGGGAACTTAGAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 185683 TAGGCCAGACCAGAGGTA...CAGGTTTCTAGAGGAAGGGAACTTAGAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 AAGCTGAAATACAAAAGCAGAGGATTGAACAACTGCAGAGAGAAAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188062 AAGCTGAAATACAAAAGCAGAGGATTGAACAACTGCAGAGAGAAAGGCGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 CGGGTCTTAGAAGAAAATCATGTGGAGCACCAGCCTCGGTTTTTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 188112 CGGGTCTTAGAAGAAAATCATGTGGAGCACCAGCCTCGGTTTTTCAGGTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2568       GAAATCCGACGATGACTCTTGGGTGAGCAACGGCACCTATTTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188162 ...CAGGAAATCCGACGATGACTCTTGGGTGAGCAACGGCACCTATTTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 AACTTAGAAAAGATCTTGGTTTTTCCAAACTGGACCATCCTGTCTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192238 AACTTAGAAAAGATCTTGGTTTTTCCAAACTGGACCATCCTGTCTTATGG