seq1 = pF1KSDA0694.tfa, 1779 bp
seq2 = pF1KSDA0694/gi568815596r_224762570.tfa (gi568815596r:224762570_225142374), 379805 bp

>pF1KSDA0694 1779
>gi568815596r:224762570_225142374 (Chr2)

(complement)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-243  (210707-210826)   100% ->
244-333  (225591-225680)   100% ->
334-416  (245998-246080)   100% ->
417-489  (255844-255916)   100% ->
490-612  (256190-256312)   100% ->
613-747  (256570-256704)   100% ->
748-931  (266154-266337)   100% ->
932-1017  (267624-267709)   100% ->
1018-1101  (268026-268109)   100% ->
1102-1257  (268224-268379)   100% ->
1258-1479  (277288-277509)   100% ->
1480-1602  (277700-277822)   100% ->
1603-1779  (279629-279805)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGTGAGCGGACCCGCAGGTTCACCCGGAGCCTGTTGAGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGTGAGCGGACCCGCAGGTTCACCCGGAGCCTGTTGAGACCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGCGGCCGAGCTCCGGCACAGCGCCGCGTCCGCCGCCGCGGTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGGCGGCCGAGCTCCGGCACAGCGCCGCGTCCGCCGCCGCGGTGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAGCAGCCGGCAGCAGCAGCGG         CAAGAAAAGCCTAGGCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 TCAGCAGCCGGCAGCAGCAGCGGGTG...CAGCAAGAAAAGCCTAGGCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCGAGCCTTTGGATTATGAGACTGTCATTGAAGAACTTGAAAAGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210725 CTCGAGCCTTTGGATTATGAGACTGTCATTGAAGAACTTGAAAAGACCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGGAATGATCCTCTTCAAGATCTCTTGTTCTTCCCCAGTGATGACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210775 CCGGAATGATCCTCTTCAAGATCTCTTGTTCTTCCCCAGTGATGACTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CA         GCAGCCACAGTTTCCTGGGATATCCGCACGTTGTACTCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210825 CAGTA...CAGGCAGCCACAGTTTCCTGGGATATCCGCACGTTGTACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAGTACCTGAAGATGCAGAGCACAAGGCAGAAAATTTACTGGTTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225630 ACAGTACCTGAAGATGCAGAGCACAAGGCAGAAAATTTACTGGTTAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         GCTTGTAAATTTTATAGTTCCCAGTGGCATGTGGTAAACT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225680 GGTA...CAGGCTTGTAAATTTTATAGTTCCCAGTGGCATGTGGTAAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAAATATGAACAATATTCTGGAGACATTCGACAGCTACCCCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 246038 ACAAATATGAACAATATTCTGGAGACATTCGACAGCTACCCCGGTA...C

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    417   AGCAGAATACAAACCAGAGAAGCTTCCTTCACATTCCTTTGAGATTGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 255842 AGAGCAGAATACAAACCAGAGAAGCTTCCTTCACATTCCTTTGAGATTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCATGAAGATGCTGATAAGGATGAA         GATACCACTTCCCACT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 255892 CCATGAAGATGCTGATAAGGATGAAGTA...CAGGATACCACTTCCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CGTCTTCCAAGGGGGGTGGAGGAGCGGGAGGAACTGGTGTTTTCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256206 CGTCTTCCAAGGGGGGTGGAGGAGCGGGAGGAACTGGTGTTTTCAAGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGCTGGCTCTACAAGGGGAATTTTAACAGCACCGTGAACAACACCGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256256 GGCTGGCTCTACAAGGGGAATTTTAACAGCACCGTGAACAACACCGTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTTCGG         TCATTCAAAAAGCGCTACTTCCAGCTGACTCAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256306 TGTTCGGGTA...TAGTCATTCAAAAAGCGCTACTTCCAGCTGACTCAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TACCAGATAACTCCTACATTATGAACTTTTACAAAGATGAGAAAATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256604 TACCAGATAACTCCTACATTATGAACTTTTACAAAGATGAGAAAATATCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAAGAACCCAAAGGATGCATCTTTTTGGATTCCTGTACAGGAGTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256654 AAAGAACCCAAAGGATGCATCTTTTTGGATTCCTGTACAGGAGTGGTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         AATAACAGACTAAGAAAATATGCCTTTGAATTGAAAATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 256704 GGTG...CAGAATAACAGACTAAGAAAATATGCCTTTGAATTGAAAATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATGATCTGACCTATTTTGTGCTGGCAGCTGAAACAGAGTCAGATATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266194 ATGATCTGACCTATTTTGTGCTGGCAGCTGAAACAGAGTCAGATATGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAATGGATCCACACCCTCAACCGCATTCTGCAAATCAGTCCTGAGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266244 GAATGGATCCACACCCTCAACCGCATTCTGCAAATCAGTCCTGAGGGGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTCCAAGGGAGGAGGAGCACAGAGCTCACTGATCTGGGTCTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 266294 CCTCCAAGGGAGGAGGAGCACAGAGCTCACTGATCTGGGTCTGGGTG...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    932    ATTCGCTGGATAATTCTGTAACTTGTGAATGCACGCCAGAGGAAACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 267621 AAGATTCGCTGGATAATTCTGTAACTTGTGAATGCACGCCAGAGGAAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GATTCTTCAGAGAACAACCTACACGCAGACTTTGCAAAG         TA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 267671 GATTCTTCAGAGAACAACCTACACGCAGACTTTGCAAAGGTA...TAGTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCTCACAGAAACAGAAGATACTGTAAAAACAACTCGAAACATGGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268028 CCTCACAGAAACAGAAGATACTGTAAAAACAACTCGAAACATGGAGAGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TAAATCTGTTCTCTCTAGATCCAGACATAGAT         ACCTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 268078 TAAATCTGTTCTCTCTAGATCCAGACATAGATGTA...TAGACCTTGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CTTCAAAAAAAAGATCTCTTGGAACCTGAGTCTGTGATCAAACCATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268233 CTTCAAAAAAAAGATCTCTTGGAACCTGAGTCTGTGATCAAACCATTTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGAAAAAGCTGCCAAGAGAATCATGATCATCTGTAAAGCCCTCAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268283 AGAAAAAGCTGCCAAGAGAATCATGATCATCTGTAAAGCCCTCAACTCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ATCTTCAGGGATGTGTTACGGAGAATGAAAATGATCCGATAACGAAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 268333 ATCTTCAGGGATGTGTTACGGAGAATGAAAATGATCCGATAACGAATGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1258       ATTGAGCCTTTTTTTGTGAGTGTGGCACTTTATGACCTCAGAGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268383 ...CAGATTGAGCCTTTTTTTGTGAGTGTGGCACTTTATGACCTCAGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAGCAGGAAGATTTCTGCTGATTTTCATGTGGATCTAAACCATGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277332 CAGCAGGAAGATTTCTGCTGATTTTCATGTGGATCTAAACCATGCTGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TCAGACAGATGCTCTTGGGGGCTTCTGTGGCTTTGGAAAATGGCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277382 TCAGACAGATGCTCTTGGGGGCTTCTGTGGCTTTGGAAAATGGCAACATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GACACCATCACTCCAAGACAATCAGAAGAACCTCACATCAAGGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277432 GACACCATCACTCCAAGACAATCAGAAGAACCTCACATCAAGGGACTTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AGAGGAATGGCTAAAATTTCCAAAGCAG         GCTGTATTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 277482 AGAGGAATGGCTAAAATTTCCAAAGCAGGTG...CAGGCTGTATTTTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 TAAGCAATCCACATTCTGAAATTGTTTTGGTGGCCAAAATCGAAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277713 TAAGCAATCCACATTCTGAAATTGTTTTGGTGGCCAAAATCGAAAAAGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 TTGATGGGAAACATTGCAAGTGGTGCCGAACCTTATATTAAGAACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 277763 TTGATGGGAAACATTGCAAGTGGTGCCGAACCTTATATTAAGAACCCAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CTCCAACAAG         TATGCACAAAAGATACTAAAATCCAACAGAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 277813 CTCCAACAAGGTA...TAGTATGCACAAAAGATACTAAAATCCAACAGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AATTCTGCAGCAAATTGGGAAAATACCGTATGCCTTTTGCTTGGGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279660 AATTCTGCAGCAAATTGGGAAAATACCGTATGCCTTTTGCTTGGGCAGTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 AGGTATGTTGACAGTTGCAGCCAACAGACTAGAAATACATTTAATGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279710 AGGTATGTTGACAGTTGCAGCCAACAGACTAGAAATACATTTAATGGTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1734 CATTGGAAGCTTCAGTTTTGAACGTTTTTGTGTTGCCTATTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279760 CATTGGAAGCTTCAGTTTTGAACGTTTTTGTGTTGCCTATTATTTT