seq1 = pF1KSDA0668.tfa, 2151 bp
seq2 = pF1KSDA0668/gi568815576r_38636270.tfa (gi568815576r:38636270_38852628), 216359 bp

>pF1KSDA0668 2151
>gi568815576r:38636270_38852628 (Chr22)

(complement)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-286  (101256-101419)   100% ->
287-424  (101594-101731)   100% ->
425-520  (102309-102404)   100% ->
521-614  (102770-102863)   100% ->
615-685  (103846-103916)   100% ->
686-813  (106818-106945)   100% ->
814-1068  (110074-110328)   100% ->
1069-1146  (111058-111135)   100% ->
1147-1190  (111579-111622)   100% ->
1191-1356  (112197-112362)   100% ->
1357-1578  (112686-112907)   100% ->
1579-1663  (113203-113287)   100% ->
1664-1779  (113641-113756)   100% ->
1780-1947  (113875-114042)   99% ->
1948-2040  (114364-114456)   100% ->
2041-2151  (116249-116359)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGAAGAAGCCAGCGCCTCACGCGCTACTCCCAGGGTGACGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCGAAGAAGCCAGCGCCTCACGCGCTACTCCCAGGGTGACGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCAGCAGCAGCAGCGGAGGGAGCTCGGTGGCTGGGAGTCAGAGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCAGCAGCAGCAGCGGAGGGAGCTCGGTGGCTGGGAGTCAGAGCACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTTTAAAGACAGTCCTCTCAG         GACCTTGAAGAGGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 TGTTTAAAGACAGTCCTCTCAGGTA...CAGGACCTTGAAGAGGAAATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCAACATGAAGCGCCTGTCCCCAGCGCCACAGCTGGGCCCGTCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101275 AGCAACATGAAGCGCCTGTCCCCAGCGCCACAGCTGGGCCCGTCCTCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCACACACCTCCTACTACAGTGAGTCGCTGGTCCACGAGTCCTGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101325 TGCACACACCTCCTACTACAGTGAGTCGCTGGTCCACGAGTCCTGGTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CACCCAGGAGCTCCCTGGAGGAACTGCATGGTGACGCCAACTGGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101375 CACCCAGGAGCTCCCTGGAGGAACTGCATGGTGACGCCAACTGGGGTG..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287     GTGAGGACCTGCGGGTGCGGAGGAGGAGAGGCACGGGTGGCTCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101425 .CAGGTGAGGACCTGCGGGTGCGGAGGAGGAGAGGCACGGGTGGCTCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAGCAGCAGGGCCAGCGGGCTTGTGGGGCGCAAGGCCACCGAGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 GAGCAGCAGGGCCAGCGGGCTTGTGGGGCGCAAGGCCACCGAGGACTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGGCTCTTCCTCGGGCTACTCCTCTGAGGACGACTACGTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101690 TGGGCTCTTCCTCGGGCTACTCCTCTGAGGACGACTACGTGGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    425  GCTACTCGGATGTGGACCAGCAGAGTTCCAGCTCGCGGCTCCGAAGCGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102308 GGCTACTCGGATGTGGACCAGCAGAGTTCCAGCTCGCGGCTCCGAAGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGTCTCACGGGCGGGCTCCTTACTCTGGATGGTGGCCACTTCGCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102358 CGTCTCACGGGCGGGCTCCTTACTCTGGATGGTGGCCACTTCGCCAGGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    521       GCCGGCTCTTCAGACTTCTCTACTGGTGGGCTGGCACCACCTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102408 ...CAGGCCGGCTCTTCAGACTTCTCTACTGGTGGGCTGGCACCACCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TACCGCCTGACCACAGCTGCCTCCCTCCTTGACGTCTTCGTTTTAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102814 TACCGCCTGACCACAGCTGCCTCCCTCCTTGACGTCTTCGTTTTAACCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615          GCGCTTCTCGTCCCTGAAGACGTTCCTCTGGTTCCTGCTGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102864 GTG...CAGGCGCTTCTCGTCCCTGAAGACGTTCCTCTGGTTCCTGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGCTGCTCTTGCTGACGTGCCTGACGTATG         GTGCTTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103887 CGCTGCTCTTGCTGACGTGCCTGACGTATGGTG...CAGGTGCTTGGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCTACCCCTATGGGCTGCAGACATTCCACCCTGCTTTGGTTTCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106829 TTCTACCCCTATGGGCTGCAGACATTCCACCCTGCTTTGGTTTCCTGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGCAGCGAAGGACAGCAGGAGGCCGGATGAGGGCTGGGAAGCCAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106879 GGCAGCGAAGGACAGCAGGAGGCCGGATGAGGGCTGGGAAGCCAGAGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CATCGCCACATTTCCAG         GCTGAGCAGCGTGTTATGTCCCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106929 CATCGCCACATTTCCAGGTG...CAGGCTGAGCAGCGTGTTATGTCCCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTACACTCTCTGGAGCGGCGTCTGGAAGCTCTTGCTGCTGAATTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110098 GTACACTCTCTGGAGCGGCGTCTGGAAGCTCTTGCTGCTGAATTTTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAACTGGCAGAAGGAGGCCATGCGGCTGGAACGTCTGGAGCTGCGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110148 CAACTGGCAGAAGGAGGCCATGCGGCTGGAACGTCTGGAGCTGCGGCAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGGCTCCTGGCCAGGGAGGTGGTGGTGGCCTGAGCCACGAGGACACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110198 GGGCTCCTGGCCAGGGAGGTGGTGGTGGCCTGAGCCACGAGGACACCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GCGCTGCTGGAGGGGCTAGTGAGCCGCCGTGAAGCTGCCCTGAAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110248 GCGCTGCTGGAGGGGCTAGTGAGCCGCCGTGAAGCTGCCCTGAAGGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTTCCGCAGGGAAACTGCTGCTCGCATCCAG         GAAGAACTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 110298 TTTCCGCAGGGAAACTGCTGCTCGCATCCAGGTA...CAGGAAGAACTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTGCCCTGAGAGCAGAGCATCAGCAAGACTCAGAAGACCTCTTCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111068 CTGCCCTGAGAGCAGAGCATCAGCAAGACTCAGAAGACCTCTTCAAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATCGTCCGGGCCTCCCAG         GAGTCCGAGGCTCGCATCCAGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 111118 ATCGTCCGGGCCTCCCAGGTC...CAGGAGTCCGAGGCTCGCATCCAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCTGAAGTCAGAGTGGCAAAG         CATGACCCAGGAGTCCTTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 111602 GCTGAAGTCAGAGTGGCAAAGGTA...CAGCATGACCCAGGAGTCCTTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGGAGAGCTCTGTGAAGGAGCTGAGGCGGCTGGAGGACCAGCTGGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112217 AGGAGAGCTCTGTGAAGGAGCTGAGGCGGCTGGAGGACCAGCTGGCCGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTGCAGCAGGAGCTGGCGGCTCTGGCACTGAAGCAGAGCTCGGTGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112267 CTGCAGCAGGAGCTGGCGGCTCTGGCACTGAAGCAGAGCTCGGTGGCGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGAAGTGGGCCTGCTGCCCCAGCAGATCCAGGCCGTGCGGGACGAC    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 112317 AGAAGTGGGCCTGCTGCCCCAGCAGATCCAGGCCGTGCGGGACGACGTG.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357      GTGGAATCTCAGTTCCCGGCCTGGATCAGTCAGTTCCTTGCCCGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112367 ..TAGGTGGAATCTCAGTTCCCGGCCTGGATCAGTCAGTTCCTTGCCCGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGTGGAGGGGGCCGCGTGGGGCTCCTTCAGAGAGAGGAGATGCAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112731 GGTGGAGGGGGCCGCGTGGGGCTCCTTCAGAGAGAGGAGATGCAAGCTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCTGCGAGAGCTGGAGAGCAAGATCCTCACCCATGTGGCAGAGATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112781 GCTGCGAGAGCTGGAGAGCAAGATCCTCACCCATGTGGCAGAGATGCAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCAAGTCGGCCAGGGAAGCCGCGGCCTCCCTGAGCCTGACGCTGCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112831 GCAAGTCGGCCAGGGAAGCCGCGGCCTCCCTGAGCCTGACGCTGCAGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GAAGGTGTGATTGGAGTGACAGAGGAG         CAGGTGCACCACAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 112881 GAAGGTGTGATTGGAGTGACAGAGGAGGTG...CAGCAGGTGCACCACAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CGTGAAGCAGGCCCTGCAGCGCTACAGTGAGGACCGCATCGGGCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113217 CGTGAAGCAGGCCCTGCAGCGCTACAGTGAGGACCGCATCGGGCTGGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ACTACGCCCTGGAGTCAGGAG         GGGCCAGCGTCATCAGCACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113267 ACTACGCCCTGGAGTCAGGAGGTA...CAGGGGCCAGCGTCATCAGCACC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CGATGTTCTGAGACCTACGAGACCAAGACGGCCCTCCTCAGCCTCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113661 CGATGTTCTGAGACCTACGAGACCAAGACGGCCCTCCTCAGCCTCTTCGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CATCCCCCTGTGGTACCACTCCCAGTCACCCCGAGTCATCCTCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 113711 CATCCCCCTGTGGTACCACTCCCAGTCACCCCGAGTCATCCTCCAGGTG.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780      CCAGATGTGCACCCAGGCAACTGCTGGGCCTTCCAGGGGCCACAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 113761 ..CAGCCAGATGTGCACCCAGGCAACTGCTGGGCCTTCCAGGGGCCACAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 GGCTTCGCCGTGGTCCGCCTCTCTGCCCGCATCCGCCCCACAGCCGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113920 GGCTTCGCCGTGGTCCGCCTCTCTGCCCGCATCCGCCCCACAGCCGTTAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CTTAGAGCATGTGCCCAAGGCCTTGTCACCCAACAGCACTATCTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113970 CTTAGAGCATGTGCCCAAGGCCTTGTCACCCAACAGCACTATCTCCAGTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCCCCAAGGACTTCGCCATCTTT         GGGTTTGACGAAGACCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 114020 CCCCCAAGGACTTCGCCATCTTTGTG...CAGGGGTTTGACGAAGACCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CAGCAGGAGGGGACACTCCTTGGCAAGTTCACTTACGATCAGGACGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114382 CAGCAGGAGGGGACACTCCTTGGCAAGTTCACTTACGATCAGGACGGCGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GCCTATTCAGACGTTTCACTTTCAG         GCCCCTACGATGGCCA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 114432 GCCTATTCAGACGTTTCACTTTCAGGTA...CAGGCCCCTACGATGGCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CGTACCAGGTGGTGGAGCTGCGGATCCTGACTAACTGGGGCCACCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116265 CGTACCAGGTGGTGGAGCTGCGGATCCTGACTAACTGGGGCCACCCCGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2107 TACACCTGCATCTACCGCTTCAGAGTGCATGGGGAGCCCGCCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116315 TACACCTGCATCTACCGCTTCAGAGTGCATGGGGAGCCCGCCCAC