seq1 = pF1KSDA0663.tfa, 2430 bp
seq2 = pF1KSDA0663/gi568815592f_65202522.tfa (gi568815592f:65202522_65404954), 202433 bp

>pF1KSDA0663 2430
>gi568815592f:65202522_65404954 (Chr6)

1-2430  (100001-102433)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCCACATGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100001 ATGCCTAATCAAGGAGAAGACTGCTATTTTTTTTTCTATTCTACATGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAGGCGACAGCTGCCCATTCCGTCACTGTGAAGCTGCAATAGGAAATG
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
 100051 CAAAGGTGACAGCTGCCCATTCCGTCACTGTGAAGCTGCACTAGGCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACAGGTGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100101 AAACTGTTTGCACATTATGGCAAGAAGGGCGCTGTTTTCGACGGGTGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGTTTCGGCACATGGAGATTGATAAAAAACGCAGTGAAATTCCTTGTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTGGGAAAATCAGCCAACAGGATGTCAAAAATTAAACTGCGCTTTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTGGGAAAATCAGCCAACAGGATGTCAAAAATTAAACTGCGCTTTCCATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100251 ACAATAGAGGACGATATGTTGATGGCCTTTTCCTACCTCCGAGCAAAAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGTTGCCCACTGTGCCTGAGTCACCAGAAGAGGAAGTGAAGGCTAGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTTTCAGTTCAGCAGAACAAATTGTCTGTCCAGTCCAATCCTTCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTTTCAGTTCAGCAGAACAAATTGTCTGTCCAGTCCAATCCTTCCCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCTAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGCGGAGCGTTATGAAAGTAGAAAGTTCCGAAAATGTTCCTAGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCATCCACCAGTTGTAATTAATGCTGCAGATGATGATGAAGATGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGATCAGTTTTCTGAGGAAGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGATCAGTTTTCTGAGGAAGGTGATGAAACCAAAACACCTACCCTGCAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCCGGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAACTCCTGAAGTTCACAATGGATTACGAGTGACTTCTGTCCGGAAACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGAATTTTGGAATAAAAACTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100601 GCAGTCAATATAAAGCAAGGTGAATGTTTGCATTTTGGAATAAAAACTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGGAAATTAAGTCAAAGAAAATGAAGGAAAAATCTAAGAAGCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
 100651 TGAGGAAATTAAGTCAAAGAAAATGAAGGAAAAATCTGAGGAGCAAGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGAGCCCGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100701 AGGGTTCTTCAGGAGTTTCCAGTCTTTTACTCCACCCTGAGCCTGTTCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGTCCTGAAAAAGAAAATGTCAGGACTGTGGTGAGGACAGTAACTCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACCAAACAAGGAGAAGAACCCTTGGTTAGATTGAGTCTTACTGAGAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||
 100801 CACCAAACAAGGAGAAGAACCCTTGGTTAGATTGGGCCTTACTGAGACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGGGAAACGAAAATTTTC AGCAGGCGGTGACAGTGATCCTCCATTAAA
        |||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGGGAAACGAAAATTTTCGA CAGGCGGTGACAGTGATCCTCCATTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 GCGTAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100900 GCGCAGCCTGGCACAGAGGCTAGGGAAGAAAGTTGAAGCTCCAGAAACTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950 ACATTGACAAAACACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAG
        ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100950 ACACTGACGAAACACCAAAGAAAGCTCAAGTTTCCAAGTCTCTTAAGGAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000 CGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAGATAATGAGGATGCAACAGATAAAGT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
 101000 CGATTAGGCATGTCAGCTGATCCAAATAATGAGGACGCAACAGATAAAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1050 TAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATTCTTCTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 101050 TAATAAAGTTGGTGAGATCCATGTGAAGACATTAGAAGAAATGCTTCTTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1100 AAAGAGCCAGTCAGAAACGTGGAGAATTGCAAACTAAACTCAAGACAGAA
        |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||
 101100 AAAGAGCCAGTCAGAAACATGGGGAATCGCAAACTAAACTCAAGACAGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1150 GGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGCAAGAAGCTCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101150 GGACCTTCAAAAACTGATGATTCTACTTCAGGAGCAAGAAGCTCCTCCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1200 TATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAAAAAAACATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||
 101200 TATCCGTATCAAAACCTTCTCTGAGGTCCTGGCTGAAGAAGAACATAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1250 AGCAGGAAGCAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101250 AGCAGGAAGCAGAGAGACAAAAAAGCAAAAAGGATACAACTTGCATCAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1300 CTAAAGATTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTAGTTTTGCCACCCATTGT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101300 CTAAAGACTGATAGTGAAATTAAAAAAACAGTAGTTTTGCCACCCATTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1350 TGCCAGCAGAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCTATGC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 101350 TGCCAGCAAAGGACAATCAGAGGAGCCTGCAGGTAAAACAAAGTCCATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1400 AGGAGGTGCACATCAAGACGCTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTG
        ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 101400 AGGAGGTGCACATGAAGACGGTGGAAGAAATTAAACTGGAGAAGGCACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1450 AGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCAGCTCCCCGTCTCAACACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 101450 AGGGTGCAGCAGAGCTCTGAGAGCAGCACCAGCTCCCCGTCTCAACATGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1500 GGCCACTCCAGGGGCAAGGCGGCTGCTGCGAATCACCAAAAGAACAGGGA
        |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||
 101500 GGCCACTCCAGGGGCAAGGTTGCTACTGCGAATCACCAAAAGAACATGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1550 TGAAAGAAGAGAAGAACCTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTCTCAGAGC
         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||
 101550 GGAAAGAAGAGAAGAAACTTCAGGAAGGAAATGAAGTTGATTTTCTGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1600 AGTATTAGAACAGAAGCTAAAGAGGCTTCAGGTGAGACCACAGGAGTTGA
         || ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
 101600 CGTGTTAGAATGGAAGCTACAGAGGCTTCAGTTGAGACCACAGGAGTTGA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1650 CATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGACCATGAGAGAGAAGCACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||
 101650 CATCACTAAAATTCAAGTCAAGAGATGTGAGATCATGAGAGAGACGCGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1700 TGCAGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 101700 TGCAGAAACAGCAGGAGAGGGAAAAATCAGTCTTGACACCTCTTCAGGGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1750 GATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTGGCAGAGAAACCAGTGCTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101750 GATGTAGCCTCTTGCAATACCCAAGTGGCAGAGAAACCAGTGCTCACTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1800 TGTGCCAGGAATCACACGGCACCTGACCAAGCGGCTTCCCACAAAGTCAT
        |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101800 TGTGCCAGGAATCACATGGCACCTGACCAAGCAGCTTCCCACAAAGTCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1850 CCCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGGAGACTCATTATTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 101850 CCCAGAAGGTGGAGGTAGAAACCTCAGGGATTGCAGACTCATTATTGAAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1900 GTGAAATG TGCAGCACAGACCTTGGAAAAAAGGGGTAAAGCTAAACCCA
        ||||||||-|-|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101900 GTGAAATGGT CAGCACAGACCTTGGAAAAAAGGGGTGAAGCTAAACCCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1949 AAGTGAACGTGAAGCCATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG
         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101949 CAGTGAACGTGAAGCAATCTGTGGTTAAAGTTGTGTCATCCCCCAAATTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1999 GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACGCTGCTGTCATTGCCGCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
 101999 GCCCCAAAACGTAAGGCAGTGGAGATGCACCCTGCTGTCACTGCCGCTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2049 GAAGCCACTCAGCTCCAGCAGTGTCCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 102049 GAAGCCACTCAGCTCCAGCAGCGTCCTACAGGAACCCCCAGCCAAAAAGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2099 CAGCTGTGG   CTGTTGTCCCGCTTGTCTCTGAGGACAAATCAGTCACT
        |||||||||---||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 102099 CAGCTGTGGATGCTGTTGTCCTGCTTGTCTCTGAGGACAAATCAGTCACT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2146 GTGCCTGAAGCAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCCAACCCA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 102149 GTGCCTGAAACAGAAAATCCTAGAGACAGTCTTGTGCTGCCTCTAACCCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2196 GTCCTCTTCAGATTCCTCACCCCCGGAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102199 GTCCTCTTCAGATTCCTCACCCCCGGAGGTGTCTGGCCCTTCCTCATCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2246 AAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102249 AAATGAGCATGAAAACTCGCCGACTCAGCTCTGCCTCAACAGGAAAGCCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2296 CCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAATATGGGAGATTTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 102299 CCACTCTCTGTGGAGGATGATTTTGAGAAACTAACATGGGAGATTTCAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2346 AGGCAAATTGGAAGCTGAGATTGACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102349 AGGCAAATTGGAAGCTGAGATTGACCTGGATCCTGGGAAAGATGAAGATG

   2400     .    :    .    :    .    :    .
   2396 ACCTTCTGCTTGAGCTATCAGAAATGATTGATAGC
        |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
 102399 ACCTTCCGCTTGAGCTATGAGAAATGATTGATAGC