seq1 = pF1KSDA0662.tfa, 3303 bp
seq2 = pF1KSDA0662/gi568815589f_93476774.tfa (gi568815589f:93476774_93777673), 300900 bp

>pF1KSDA0662 3303
>gi568815589f:93476774_93777673 (Chr9)

45-123  (99911-99985)   93% ->
124-184  (153222-153282)   100% ->
185-299  (159638-159752)   100% ->
300-460  (168856-169016)   99% ->
461-602  (172298-172439)   100% ->
603-789  (176406-176592)   100% ->
790-952  (177640-177802)   100% ->
953-1040  (179161-179248)   100% ->
1041-1147  (179716-179822)   100% ->
1148-1239  (181372-181463)   100% ->
1240-1329  (182738-182827)   100% ->
1330-1698  (183419-183787)   100% ->
1699-1818  (186134-186253)   100% ->
1819-1937  (186744-186862)   100% ->
1938-2116  (188913-189091)   100% ->
2117-2187  (189217-189287)   100% ->
2188-2348  (190307-190467)   100% ->
2349-2626  (196812-197089)   100% ->
2627-2722  (198154-198249)   100% ->
2723-2832  (198907-199016)   100% ->
2833-3217  (199821-200190)   96% ->
3218-3303  (200815-200900)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     45 CGTTACCCGCCCCCGCGCGGCCCGGCCCCCGGCCCGGCCCGGACCGACCC
        ||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99911 CG    CCGCCCCCGCGCGGCCCGGCCCCCGGCCCGGCCCGGACCGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     95 GGGCAGCGCAGCGGCGGGGCCGAGCGACG         GCGCCCGACATC
        |||||||||||||||||||||||||| ||>>>...>>>||||||||||||
  99957 GGGCAGCGCAGCGGCGGGGCCGAGCGGCGGCG...GAGGCGCCCGACATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136 GACATATACCACTGCCCAAACTGTGAGAAAACCCATGGGAAGTCCACCT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 153234 GACATATACCACTGCCCAAACTGTGAGAAAACCCATGGGAAGTCCACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185         TAAAGAAGAAGCGGACCTGGCACAAACACGGCCCGGGGCAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153284 TA...CAGTAAAGAAGAAGCGGACCTGGCACAAACACGGCCCGGGGCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    227 CGCCTGACGTCAAGCCCGTGCAGAATGGCAGCCAGCTCTTCATCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159680 CGCCTGACGTCAAGCCCGTGCAGAATGGCAGCCAGCTCTTCATCAAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277 CTGCGGAGCCGGACCTTTCCCAG         GGCTGAAGACGTGGTGGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>> |||||||||||||||||
 159730 CTGCGGAGCCGGACCTTTCCCAGGTG...CAGTGCTGAAGACGTGGTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    318 CCGTGTGCCAGGAAGTCAGCTCACGCTGGGCTACATGGAGGAGCACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168874 CCGTGTGCCAGGAAGTCAGCTCACGCTGGGCTACATGGAGGAGCACGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    368 TCACCGAGCCCATCCTCGTCCCTAAGAAAGACGGGCTGGGTCTGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168924 TCACCGAGCCCATCCTCGTCCCTAAGAAAGACGGGCTGGGTCTGGCTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    418 CCGGCCCCCACGTTCTATGTCAGTGACGTCGAGAACTACGTGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 168974 CCGGCCCCCACGTTCTATGTCAGTGACGTCGAGAACTACGTGGGTA...T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    461   GGCCGGAACGGAGTGTGGATGTGACAGATGTCACCAAGCAGAAGGACT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172296 AGGGCCGGAACGGAGTGTGGATGTGACAGATGTCACCAAGCAGAAGGACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    509 GCAAGATGAAGCTGAAGGAGTTTGTGGACTATTACTACAGCACCAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172346 GCAAGATGAAGCTGAAGGAGTTTGTGGACTATTACTACAGCACCAACCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    559 AAGCGGGTCCTCAACGTCACCAACCTCGAGTTCTCTGACACCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 172396 AAGCGGGTCCTCAACGTCACCAACCTCGAGTTCTCTGACACCCGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603    AATGTCCAGCTTCGTGGAGCCACCTGACATTGTAAAGAAACTGTCAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176403 TAGAATGTCCAGCTTCGTGGAGCCACCTGACATTGTAAAGAAACTGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    650 GGGTAGAAAACTACTGGCCAGATGATGCATTGCTGGCCAAGCCCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176453 GGGTAGAAAACTACTGGCCAGATGATGCATTGCTGGCCAAGCCCAAAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700 ACCAAGTACTGCCTAATCTGCGTGAAGGACAGTTACACCGACTTCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176503 ACCAAGTACTGCCTAATCTGCGTGAAGGACAGTTACACCGACTTCCACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    750 CGACTCTGGGGGCGCCTCTGCCTGGTACCACGTGCTCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 176553 CGACTCTGGGGGCGCCTCTGCCTGGTACCACGTGCTCAAGGTG...CAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    791 GGGAGAAGACCTTCTATCTCATCAGGCCGGCCTCGGCCAACATCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177641 GGGAGAAGACCTTCTATCTCATCAGGCCGGCCTCGGCCAACATCTCCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    841 TATGAGCGCTGGCGGTCTGCCTCTAACCACAGCGAGATGTTCTTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177691 TATGAGCGCTGGCGGTCTGCCTCTAACCACAGCGAGATGTTCTTTGCTGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    891 CCAGGTCGACAAATGCTACAAGTGCATCGTCAAGCAGGGCCAGACCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177741 CCAGGTCGACAAATGCTACAAGTGCATCGTCAAGCAGGGCCAGACCCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    941 TCATCCCCTCAG         GCTGGATCTACGCCACACTCACCCCTGTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 177791 TCATCCCCTCAGGTG...CAGGCTGGATCTACGCCACACTCACCCCTGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    982 GACTGCCTGGCCTTCGCGGGACATTTCCTCCACAGCCTGAGTGTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179190 GACTGCCTGGCCTTCGCGGGACATTTCCTCCACAGCCTGAGTGTGGAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1032 GCAGATGAG         AGCATATGAAGTGGAAAGGAGGTTGAAACTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 179240 GCAGATGAGGTA...TAGAGCATATGAAGTGGAAAGGAGGTTGAAACTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1073 GCAGCCTGACTCAGTTTCCCAACTTTGAAACTGCGTGCTGGTACATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179748 GCAGCCTGACTCAGTTTCCCAACTTTGAAACTGCGTGCTGGTACATGGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1123 AAGCACCTGCTGGAGGCATTCAAAG         GCTCTCACAAATCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 179798 AAGCACCTGCTGGAGGCATTCAAAGGTA...CAGGCTCTCACAAATCTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1164 GAAGCAGCTGCCCCCTCATCTAGTCCAAGGAGCTAAAATTCTCAATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181388 GAAGCAGCTGCCCCCTCATCTAGTCCAAGGAGCTAAAATTCTCAATGGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1214 CTTTCCGATCGTGGACGAAGAAGCAG         GCTTTGGCAGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 181438 CTTTCCGATCGTGGACGAAGAAGCAGGTA...CAGGCTTTGGCAGAGCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255 GAGGACGAGCTCCCGGAGCACTTCAAACCTTCACAGCTAATCAAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182753 GAGGACGAGCTCCCGGAGCACTTCAAACCTTCACAGCTAATCAAAGACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1305 GGCCAAAGAGATCCGGCTCAGTGAG         AATGCCTCCAAAGCCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 182803 GGCCAAAGAGATCCGGCTCAGTGAGGTG...CAGAATGCCTCCAAAGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1346 TCCGACCGGAAGTGAATACTGTCGCCTCGTCAGATGAGGTGTGTGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183435 TCCGACCGGAAGTGAATACTGTCGCCTCGTCAGATGAGGTGTGTGACGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1396 GACCGGGAGAAGGAGGAGCCCCCGTCTCCCATTGAGGCCACCCCGCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183485 GACCGGGAGAAGGAGGAGCCCCCGTCTCCCATTGAGGCCACCCCGCCTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1446 ATCCCTCCTGGAGAAAGTGTCCAAAAAAAAGACTCCCAAAACTGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183535 ATCCCTCCTGGAGAAAGTGTCCAAAAAAAAGACTCCCAAAACTGTGAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1496 TGCCCAAGCCATCCAAAATCCCCAAGCCCCCGAAGCCCCCTAAGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183585 TGCCCAAGCCATCCAAAATCCCCAAGCCCCCGAAGCCCCCTAAGCCCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546 AGGCCCCCCAAAACGCTGAAGCTCAAAGATGGAGGCAAGAAGAAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183635 AGGCCCCCCAAAACGCTGAAGCTCAAAGATGGAGGCAAGAAGAAAGGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1596 GAAGTCCCGGGAGTCAGCCTCACCCACCATCCCCAACCTGGACCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183685 GAAGTCCCGGGAGTCAGCCTCACCCACCATCCCCAACCTGGACCTGCTCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1646 AAGCCCACACCAAGGAGGCACTGACCAAGATGGAGCCGCCCAAGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183735 AAGCCCACACCAAGGAGGCACTGACCAAGATGGAGCCGCCCAAGAAGGGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1696 AAG         GCCACAAAGAGTGTCCTGAGTGTGCCCAACAAAGATGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183785 AAGGTG...TAGGCCACAAAGAGTGTCCTGAGTGTGCCCAACAAAGATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1737 GGTTCACATGCAGAATGATGTGGAGAGGCTGGAAATTCGAGAGCAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186172 GGTTCACATGCAGAATGATGTGGAGAGGCTGGAAATTCGAGAGCAAACCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1787 AGAGCAAGTCAGAGGCCAAGTGGAAGTACAAG         AACAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 186222 AGAGCAAGTCAGAGGCCAAGTGGAAGTACAAGGTG...CAGAACAGCAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1828 CCTGACTCCTTACTGAAGATGGAAGAGGAGCAGAAGCTAGAGAAGTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186753 CCTGACTCCTTACTGAAGATGGAAGAGGAGCAGAAGCTAGAGAAGTCGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1878 TCTAGCTGGAAACAAAGACAATAAGTTCTCTTTTTCTTTCTCCAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186803 TCTAGCTGGAAACAAAGACAATAAGTTCTCTTTTTCTTTCTCCAACAAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1928 AACTCCTCGG         CTCCAAGGCTCTCAGGCCCCCGACGAGCCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 186853 AACTCCTCGGGTA...TAGCTCCAAGGCTCTCAGGCCCCCGACGAGCCCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1969 GGTGTGTTCGGGGCCTTGCAGAACTTCAAGGAGGACAAGCCCAAGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188944 GGTGTGTTCGGGGCCTTGCAGAACTTCAAGGAGGACAAGCCCAAGCCCGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2019 GCGGGATGAGTATGAGTACGTGTCGGATGACGGTGAGCTCAAGATCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188994 GCGGGATGAGTATGAGTACGTGTCGGATGACGGTGAGCTCAAGATCGACG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2069 AGTTTCCCATCAGGAGGAAGAAAAACGCCCCGAAAAGGGACTTGTCCT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 189044 AGTTTCCCATCAGGAGGAAGAAAAACGCCCCGAAAAGGGACTTGTCCTGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2117        TCTTGTTGGATAAGAAGGCTGTGCTGCCCACGCCTGTCACGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189094 G...CAGTCTTGTTGGATAAGAAGGCTGTGCTGCCCACGCCTGTCACGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2160 GCCAAAGCTGGACTCGGCAGCGTACAAG         AGTGATGACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 189260 GCCAAAGCTGGACTCGGCAGCGTACAAGGTG...CAGAGTGATGACTCCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 CGGACGAGGGTTCGCTGCACATCGACACAGACACCAAGCCCGGCCGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190320 CGGACGAGGGTTCGCTGCACATCGACACAGACACCAAGCCCGGCCGCAAT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251 GCCAGAGTCAAGAAGGAGAGTGGGAGCTCGGCAGCTGGCATCTTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190370 GCCAGAGTCAAGAAGGAGAGTGGGAGCTCGGCAGCTGGCATCTTGGACCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2301 GCTGCAGGCCAGTGAGGAGGTTGGCGCGCTGGAGTACAACCCCAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 190420 GCTGCAGGCCAGTGAGGAGGTTGGCGCGCTGGAGTACAACCCCAGCAGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2349        CCAGCCCCCGGCCTCCCCCAGCACACAGGAAGCCATTCAGGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190470 G...TAGCCAGCCCCCGGCCTCCCCCAGCACACAGGAAGCCATTCAGGGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2392 ATGCTGTCCATGGCCAACCTGCAGGCCTCCGACTCCTGCCTGCAGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196855 ATGCTGTCCATGGCCAACCTGCAGGCCTCCGACTCCTGCCTGCAGACCAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2442 GTGGGGAGCTGGCCAGGCCAAGGGGAGCTCGCTGGCTGCCCATGGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196905 GTGGGGAGCTGGCCAGGCCAAGGGGAGCTCGCTGGCTGCCCATGGTGCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492 GGAAGAATGGGGGTGGCAGTGGCAAGAGTGCAGGCAAACGACTGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196955 GGAAGAATGGGGGTGGCAGTGGCAAGAGTGCAGGCAAACGACTGCTGAAG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2542 AGGGCTGCCAAGAACAGTGTCGACCTGGACGACTACGAGGAAGAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197005 AGGGCTGCCAAGAACAGTGTCGACCTGGACGACTACGAGGAAGAGCAGGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2592 CCACCTGGATGCCTGCTTCAAGGACTCAGACTACG         TTTACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 197055 CCACCTGGATGCCTGCTTCAAGGACTCAGACTACGGTG...TAGTTTACC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2633 CCTCACTGGAGTCAGATGAAGACAACCCCATCTTTAAGTCCCGGTCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198160 CCTCACTGGAGTCAGATGAAGACAACCCCATCTTTAAGTCCCGGTCGAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2683 AAAAGGAAAGGCTCAGACGACGCTCCCTACAGCCCAACAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 198210 AAAAGGAAAGGCTCAGACGACGCTCCCTACAGCCCAACAGGTA...CAGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2724 AAGGGTCGGCCCATCGGTGCCAAGACAGGACAGGCCTGTGCGTGAGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198908 AAGGGTCGGCCCATCGGTGCCAAGACAGGACAGGCCTGTGCGTGAGGGTA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2774 CACGGGTGGCTTCCATCGAGACCGGGCTGGCGGCTGCTGCAGCTAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198958 CACGGGTGGCTTCCATCGAGACCGGGCTGGCGGCTGCTGCAGCTAAGTTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2824 TCCCAGCAG         GAGGAGCAGAAAAGCAAGAAAAAAAAGAGTGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 199008 TCCCAGCAGGTG...AAGGAGGAGCAGAAAAGCAAGAAAAAAAAGAGTGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2865 CAAGAGGAAGCTGACTCCTAACACCACCTCCCCTTCCACCTCCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199853 CAAGAGGAAGCTGACTCCTAACACCACCTCCCCTTCCACCTCCACCTCCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2915 TCTCTGCCGGCACCACCTCCACCTCCACCACGCCAGCCTCTACCACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||--------
 199903 TCTCTGCCGGCACCACCTCCACCTCCACCACGCCAGCCTCTA        

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2965 GCCTCCACCACACCGGCCTCCACCACCCCGGCCTCCACCAGCACGGCCAG
        ----|||-|-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199945     CCA C C CCGGCCTCCACCACCCCGGCCTCCACCAGCACGGCCAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3015 CAGCCAGGCCTCGCAGGAGGGCAGCTCGCCAGAGCCCCCGCCTGAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199988 CAGCCAGGCCTCGCAGGAGGGCAGCTCGCCAGAGCCCCCGCCTGAGTCGC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3065 ATAGCAGCAGCCTGGCGGACCATGAGTACACAGCCGCTGGCACCTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200038 ATAGCAGCAGCCTGGCGGACCATGAGTACACAGCCGCTGGCACCTTCACC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3115 GGGGCCCAGGCTGGCCGCACCTCCCAGCCCATGGCCCCTGGGGTCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200088 GGGGCCCAGGCTGGCCGCACCTCCCAGCCCATGGCCCCTGGGGTCTTTCT

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3165 CACACAGAGGCGGCCCTCCGCATCGTCTCCAAACAACAACACCGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200138 CACACAGAGGCGGCCCTCCGCATCGTCTCCAAACAACAACACCGCTGCCA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3215 AAG         GAAAACGTACGAAAAAGGGCATGGCGACCGCCAAGCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200188 AAGGTA...TAGGAAAACGTACGAAAAAGGGCATGGCGACCGCCAAGCAG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   3256 AGGCTTGGGAAAATTTTGAAAATTCATCGGAACGGGAAACTACTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200853 AGGCTTGGGAAAATTTTGAAAATTCATCGGAACGGGAAACTACTCCTT