seq1 = pF1KSDA0642.tfa, 3960 bp
seq2 = pF1KSDA0642/gi568815596f_232635198.tfa (gi568815596f:232635198_232956857), 321660 bp

>pF1KSDA0642 3960
>gi568815596f:232635198_232956857 (Chr2)

1-41  (100001-100041)   100% ->
42-171  (112418-112547)   100% ->
172-267  (113790-113885)   100% ->
268-379  (121026-121137)   100% ->
380-491  (125283-125394)   100% ->
492-532  (126199-126239)   100% ->
533-598  (141215-141280)   100% ->
599-778  (151953-152132)   100% ->
779-996  (155501-155718)   100% ->
997-1159  (155811-155973)   100% ->
1160-1345  (156064-156249)   100% ->
1346-1542  (159551-159747)   100% ->
1543-1702  (160865-161024)   100% ->
1703-1869  (171294-171460)   100% ->
1870-1961  (174523-174614)   100% ->
1962-2069  (176047-176154)   100% ->
2070-2170  (177194-177294)   100% ->
2171-2271  (180440-180540)   100% ->
2272-2433  (181674-181835)   100% ->
2434-2592  (184630-184788)   100% ->
2593-2829  (197660-197896)   100% ->
2830-2952  (204652-204774)   100% ->
2953-3162  (208849-209058)   100% ->
3163-3368  (209172-209377)   100% ->
3369-3523  (210535-210689)   100% ->
3524-3747  (212151-212374)   100% ->
3748-3895  (215065-215212)   100% ->
3896-3960  (221596-221660)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCGGAAACGCAGACACTGAACTTTGGGCCTGAATG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100001 ATGGCAGCGGAAACGCAGACACTGAACTTTGGGCCTGAATGGTG...TAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTCCGAGCTCTGTCCAGTGGTGGGAGTATTACATCCCCTCCTCTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112418 GCTCCGAGCTCTGTCCAGTGGTGGGAGTATTACATCCCCTCCTCTTTCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGCATTGCCGAAGTATAAATTAGCAGATTATCGTTACGGCAGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112468 CAGCATTGCCGAAGTATAAATTAGCAGATTATCGTTACGGCAGAGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGTTAGCACTTTTCCTTAAAGACAACAAG         ATACCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112518 ATGTTAGCACTTTTCCTTAAAGACAACAAGGTA...CAGATACCTTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTTCTGGATAAAGAATTTCTGCCTATCCTCCAGGAGGAACCCCTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113801 CCTTCTGGATAAAGAATTTCTGCCTATCCTCCAGGAGGAACCCCTTCCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATTGGCTCTGGTACCCTTTACAGAAGAAGAACAG         AGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 113851 CATTGGCTCTGGTACCCTTTACAGAAGAAGAACAGGTT...CAGAGAAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTTCCATGTCTGTAAATAGTGCTGCTGTCCTGCGATTGACAGGACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121032 TTTTCCATGTCTGTAAATAGTGCTGCTGTCCTGCGATTGACAGGACGAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGGAGGAGGAACAGTGGTGGGGGCTCCTAGAGGTCGAAGTTCTTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121082 AGGAGGAGGAACAGTGGTGGGGGCTCCTAGAGGTCGAAGTTCTTCAAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGCGAG         GCAGAGGCAGAGGTGAATGTGGTTTCTACCAAAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121132 GGCGAGGTG...CAGGCAGAGGCAGAGGTGAATGTGGTTTCTACCAAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGTTTTGATGAAGTAGAGGGTGTTTTTGGTCGAGGAGGTGGCAGAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125318 AGTTTTGATGAAGTAGAGGGTGTTTTTGGTCGAGGAGGTGGCAGAGAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCATAGATCGCAGAGCTGGGAGGAAAG         GGGTGACAGACGTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125368 GCATAGATCGCAGAGCTGGGAGGAAAGGTA...CAGGGGTGACAGACGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGAAAAACCAGGACGAAAAGATGTAG         GAAAGAAGAATGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 126213 TTGAAAAACCAGGACGAAAAGATGTAGGTA...AAGGAAAGAAGAATGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 TATTATTGCATGTACTCACCAGTTCTTTTGCTGGGTCAGCCTTTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141229 TATTATTGCATGTACTCACCAGTTCTTTTGCTGGGTCAGCCTTTATGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AG         GGAGACCAAATTTTGAGGAAGGTGGACCAACATCAGTAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141279 AGGTA...TAGGGAGACCAAATTTTGAGGAAGGTGGACCAACATCAGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GGAGAAAGCATGAATTTATACGCTCAGAAAGTGAAAATTGGCGCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151992 GGAGAAAGCATGAATTTATACGCTCAGAAAGTGAAAATTGGCGCATCTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AGAGAGGAACAAAATGGAGAAGATGAAGATGGAGGTTGGCGACTAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152042 AGAGAGGAACAAAATGGAGAAGATGAAGATGGAGGTTGGCGACTAGCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ATCAAGGAGGGATGGAGAGAGGTGGCGACCTCACAGTCCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 152092 ATCAAGGAGGGATGGAGAGAGGTGGCGACCTCACAGTCCTGGTA...CAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATGGCCCTCGTTCTGCAGGCTGGCGGGAACACATGGAACGACGTCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155501 ATGGCCCTCGTTCTGCAGGCTGGCGGGAACACATGGAACGACGTCGGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTTGAGTTTGATTTTCGAGATAGAGATGATGAACGGGGTTACCGAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155551 TTTGAGTTTGATTTTCGAGATAGAGATGATGAACGGGGTTACCGAAGGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCGCTCTGGCAGTGGGAGCATAGATGATGACAGGGATAGCTTGCCCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155601 TCGCTCTGGCAGTGGGAGCATAGATGATGACAGGGATAGCTTGCCCGAAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GGTGCTTAGAGGATGCTGAAGAAGAAATGGGTACATTTGACTCATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155651 GGTGCTTAGAGGATGCTGAAGAAGAAATGGGTACATTTGACTCATCTGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCATTCCTTTCTCTAAAA         AAAGTACAGAAAGAGCCTATTCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 155701 GCATTCCTTTCTCTAAAAGTA...CAGAAAGTACAGAAAGAGCCTATTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGAAGAGCAGGAGATGGACTTCCGGCCTGTGGACGAAGGGGAGGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155834 AGAAGAGCAGGAGATGGACTTCCGGCCTGTGGACGAAGGGGAGGAGTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTGACTCTGAGGGTAGCCATAATGAAGAGGCCAAAGAACCCGATAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155884 CTGACTCTGAGGGTAGCCATAATGAAGAGGCCAAAGAACCCGATAAGACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AATAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGATAGAGTAGGAGTTG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 155934 AATAAGAAAGAAGGAGAGAAAACAGATAGAGTAGGAGTTGGTA...AAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TAGTGAGGAAACTCCCCAGACCTCATCATCATCTGCTAGACCAGGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156065 TAGTGAGGAAACTCCCCAGACCTCATCATCATCTGCTAGACCAGGTACTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CTTCAGACCATCAGTCTCAGGAAGCATCACAGTTTGAGAGGAAAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156115 CTTCAGACCATCAGTCTCAGGAAGCATCACAGTTTGAGAGGAAAGATGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CCAAAAACTGAGCAAACGGAAAAAGCTGAAGAGGAGACTCGGATGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156165 CCAAAAACTGAGCAAACGGAAAAAGCTGAAGAGGAGACTCGGATGGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TAGTCTACCAGCCAAAGTGCCCAGCAGAGGGGATG         AAATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 156215 TAGTCTACCAGCCAAAGTGCCCAGCAGAGGGGATGGTA...TAGAAATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TTGCTGATGTCCAGCAGCCCCTGTCGCAGATTCCTTCAGATACAGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159557 TTGCTGATGTCCAGCAGCCCCTGTCGCAGATTCCTTCAGATACAGCCTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCTCTTCTCATACTTCCACCTCCTGTTCCCAATCCTAGTCCTACTCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159607 CCTCTTCTCATACTTCCACCTCCTGTTCCCAATCCTAGTCCTACTCTCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GCCAGTTGAAACACCAGTTGTAGGTGCTCCTGGTATGGGCAGTGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159657 GCCAGTTGAAACACCAGTTGTAGGTGCTCCTGGTATGGGCAGTGTTTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CAGAACCTGATGATGAAGAAGGTCTCAAACATTTGGAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 159707 CAGAACCTGATGATGAAGAAGGTCTCAAACATTTGGAGCAGGTA...TAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CAAGCTGAGAAAATGGTGGCTTATCTCCAAGACAGTGCACTAGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160865 CAAGCTGAGAAAATGGTGGCTTATCTCCAAGACAGTGCACTAGATGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AAGATTGGCATCAAAACTGCAAGAGCACAGAGCTAAAGGAGTGTCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160915 AAGATTGGCATCAAAACTGCAAGAGCACAGAGCTAAAGGAGTGTCGATTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CATTGATGCATGAAGCAATGCAGAAGTGGTATTACAAAGATCCTCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160965 CATTGATGCATGAAGCAATGCAGAAGTGGTATTACAAAGATCCTCAGGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GAAATTCAAG         GTCCCTTCAATAATCAGGAGATGGCAGAATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 161015 GAAATTCAAGGCA...TAGGTCCCTTCAATAATCAGGAGATGGCAGAATG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GTTTCAGGCGGGCTATTTTACTATGTCTTTATTGGTGAAGAGAGCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171325 GTTTCAGGCGGGCTATTTTACTATGTCTTTATTGGTGAAGAGAGCGTGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ATGAAAGCTTCCAACCTCTTGGCGATATCATGAAAATGTGGGGAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171375 ATGAAAGCTTCCAACCTCTTGGCGATATCATGAAAATGTGGGGAAGGGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCCTTTTCTCCAGGTCCAGCTCCCCCTCCTCATATG         GGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 171425 CCCTTTTCTCCAGGTCCAGCTCCCCCTCCTCATATGGTA...TAGGGAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GCTGGACCAGGAACGACTGACCAGGCAGCAAGAACTCACAGCCTTATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174528 GCTGGACCAGGAACGACTGACCAGGCAGCAAGAACTCACAGCCTTATACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AGATGCAGCACCTGCAGTACCAGCAGTTTTTAATACA         ACAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 174578 AGATGCAGCACCTGCAGTACCAGCAGTTTTTAATACAGTA...AAGACAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CAATATGCACAGGTTTTGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACTGTCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176051 CAATATGCACAGGTTTTGGCCCAACAGCAGAAAGCAGCACTGTCTTCCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GCAGCAGCAGCAGTTGGCACTTCTTCTTCAACAGTTTCAGACCTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176101 GCAGCAGCAGCAGTTGGCACTTCTTCTTCAACAGTTTCAGACCTTGAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGAG         AATATCTGATCAGAACATCATTCCCTCAGTAACTAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176151 TGAGGTT...CAGAATATCTGATCAGAACATCATTCCCTCAGTAACTAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 TCTGTGTCCGTGCCAGATACTGGCTCTATCTGGGAGCTTCAGCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177231 TCTGTGTCCGTGCCAGATACTGGCTCTATCTGGGAGCTTCAGCCAACAGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 TTCACAGCCTACAG         TTTGGGAAGGTGGTAGTGTATGGGATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 177281 TTCACAGCCTACAGGTA...CAGTTTGGGAAGGTGGTAGTGTATGGGATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TTCCTCTGGACACCACGACACCAGGCCCTGCCCTGGAACAGCTTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180467 TTCCTCTGGACACCACGACACCAGGCCCTGCCCTGGAACAGCTTCAGCAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 CTAGAGAAGGCCAAAGCTGCAAAG         CTAGAGCAAGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 180517 CTAGAGAAGGCCAAAGCTGCAAAGGTC...CAGCTAGAGCAAGAGAGAAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 AGAGGCAGAAATGAGGGCAAAACGGGAAGAGGAAGAGCGAAAGAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181691 AGAGGCAGAAATGAGGGCAAAACGGGAAGAGGAAGAGCGAAAGAGGCAGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 AAGAACTCCGAAGACAACAGGAGGAAATTCTTCGGCGACAGCAGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181741 AAGAACTCCGAAGACAACAGGAGGAAATTCTTCGGCGACAGCAGGAAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GAAAGGAAAAGGCGAGAGGAAGAAGAACTTGCCCGAAGGAAACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 181791 GAAAGGAAAAGGCGAGAGGAAGAAGAACTTGCCCGAAGGAAACAGGTA..

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434     GAAGAGGCTCTGCGTCGCCAGCGGGAGCAAGAAATTGCATTAAGGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181841 .TAGGAAGAGGCTCTGCGTCGCCAGCGGGAGCAAGAAATTGCATTAAGGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 GACAGCGAGAAGAGGAAGAAAGACAGCAGCAAGAAGAAGCTCTTAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184676 GACAGCGAGAAGAGGAAGAAAGACAGCAGCAAGAAGAAGCTCTTAGAAGA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CTGGAAGAGAGGAGAAGAGAAGAGGAAGAAAGGCGGAAGCAGGAAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184726 CTGGAAGAGAGGAGAAGAGAAGAGGAAGAAAGGCGGAAGCAGGAAGAATT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2580 GTTACGCAAACAG         GAAGAGGAGGCTGCAAAATGGGCCCGGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 184776 GTTACGCAAACAGGTG...AAGGAAGAGGAGGCTGCAAAATGGGCCCGGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 AAGAAGAAGAAGCCCAGCGTCGATTAGAGGAGAACCGGCTGCGGATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197688 AAGAAGAAGAAGCCCAGCGTCGATTAGAGGAGAACCGGCTGCGGATGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 GAGGAGGCAGCCAGACTCCGGCATGAGGAAGAAGAACGGAAGAGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197738 GAGGAGGCAGCCAGACTCCGGCATGAGGAAGAAGAACGGAAGAGAAAGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2721 GCTGGAGGTCCAGCGGCAGAAGGAGTTAATGCGCCAGAGGCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197788 GCTGGAGGTCCAGCGGCAGAAGGAGTTAATGCGCCAGAGGCAGCAGCAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2771 AAGAGGCTCTCCGGAGGTTGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197838 AAGAGGCTCTCCGGAGGTTGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCTGGCG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2821 CAGATGAAG         CTTCCTTCTTCTTCAACGTGGGGCCAGCAGTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 197888 CAGATGAAGGTA...TAGCTTCCTTCTTCTTCAACGTGGGGCCAGCAGTC

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2862 CAATACAACAGCATGTCAGTCCCAGGCCACGCTGTCGTTGGCTGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204684 CAATACAACAGCATGTCAGTCCCAGGCCACGCTGTCGTTGGCTGAAATCC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2912 AAAAACTAGAGGAAGAACGAGAACGGCAGCTTCGAGAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 204734 AAAAACTAGAGGAAGAACGAGAACGGCAGCTTCGAGAAGAGGTA...CAG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 CAAAGGCGCCAGCAGAGGGAGTTGATGAAAGCTCTTCAGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208849 CAAAGGCGCCAGCAGAGGGAGTTGATGAAAGCTCTTCAGCAGCAGCAGCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 ACAGCAACAGCAGAAACTCTCAGGTTGGGGGAATGTCAGCAAACCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208899 ACAGCAACAGCAGAAACTCTCAGGTTGGGGGAATGTCAGCAAACCTTCAG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 GTACCACGAAATCTCTTCTGGAGATCCAGCAGGAAGAGGCCAGGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208949 GTACCACGAAATCTCTTCTGGAGATCCAGCAGGAAGAGGCCAGGCAAATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3103 CAAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCAGCAACCAAACAGAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208999 CAAAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACACCAGCAACCAAACAGAGCTCG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 TAACAATACG         CATTCCAACCTGCACACCAGCATTGGGAATT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 209049 TAACAATACGGTG...CAGCATTCCAACCTGCACACCAGCATTGGGAATT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3194 CTGTTTGGGGCTCTATAAATACTGGTCCTCCTAACCAGTGGGCATCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209203 CTGTTTGGGGCTCTATAAATACTGGTCCTCCTAACCAGTGGGCATCTGAC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3244 CTAGTCAGTAGTATTTGGAGTAATGCTGACACTAAAAACTCCAACATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209253 CTAGTCAGTAGTATTTGGAGTAATGCTGACACTAAAAACTCCAACATGGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3294 ATTCTGGGATGATGCAGTGAAAGAGGTGGGACCTAGGAATTCAACAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209303 ATTCTGGGATGATGCAGTGAAAGAGGTGGGACCTAGGAATTCAACAAATA

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3344 AAAATAAAAACAACGCCAGTCTCAG         TAAATCTGTAGGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 209353 AAAATAAAAACAACGCCAGTCTCAGGTA...TAGTAAATCTGTAGGTGTG

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3385 TCTAACCGGCAGAATAAGAAAGTAGAAGAAGAAGAAAAGTTGCTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210551 TCTAACCGGCAGAATAAGAAAGTAGAAGAAGAAGAAAAGTTGCTGAAGCT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3435 CTTTCAGGGAGTAAATAAAGCCCAAGATGGATTTACGCAGTGGTGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210601 CTTTCAGGGAGTAAATAAAGCCCAAGATGGATTTACGCAGTGGTGTGAAC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3485 AGATGCTTCATGCCCTTAATACGGCAAATAACTTGGATG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 210651 AGATGCTTCATGCCCTTAATACGGCAAATAACTTGGATGGTA...CAGTT

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3526 CCCACATTTGTTTCTTTCCTGAAAGAAGTAGAATCTCCTTATGAGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212153 CCCACATTTGTTTCTTTCCTGAAAGAAGTAGAATCTCCTTATGAGGTCCA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3576 TGATTATATCAGGGCCTATTTAGGAGATACTTCTGAGGCCAAGGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212203 TGATTATATCAGGGCCTATTTAGGAGATACTTCTGAGGCCAAGGAGTTTG

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3626 CCAAGCAGTTCCTTGAGCGCCGTGCCAAACAGAAAGCCAACCAGCAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212253 CCAAGCAGTTCCTTGAGCGCCGTGCCAAACAGAAAGCCAACCAGCAGCGT

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3676 CAGCAGCAGCAGCTGCCACAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212303 CAGCAGCAGCAGCTGCCACAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCACAGCAGCC

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3726 GCCACAGCAGCCACAACAGCAG         GACTCTGTGTGGGGGATGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 212353 GCCACAGCAGCCACAACAGCAGGTA...CAGGACTCTGTGTGGGGGATGA

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3767 ACCACAGTACACTCCATTCAGTATTTCAGACCAATCAAAGCAACAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215084 ACCACAGTACACTCCATTCAGTATTTCAGACCAATCAAAGCAACAACCAA

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3817 CAATCCAATTTTGAGGCTGTGCAGAGTGGCAAGAAGAAGAAAAAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215134 CAATCCAATTTTGAGGCTGTGCAGAGTGGCAAGAAGAAGAAAAAGCAGAA

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3867 GATGGTCCGAGCAGATCCCAGTTTATTAG         GATTTTCAGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 215184 GATGGTCCGAGCAGATCCCAGTTTATTAGGTG...CAGGATTTTCAGTCA

   4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3908 ATGCATCATCGGAGCGACTCAACATGGGTGAAATCGAGACGTTGGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 221608 ATGCATCATCGGAGCGACTCAACATGGGTGAAATCGAGACGTTGGATGAC

   4200 
   3958 TAC
        |||
 221658 TAC